肠杆菌基因间重复共有序列及ERIC-PCR 被引量：15

ERIC Sequence and ERIC-PCR

在线阅读下载PDF

导出

摘要 ERIC序列是近年来发现的存在于原核生物基因组中一类短的重复序列。该序列在染色体上的分布和拷贝数具种间特异性 ,根据序列中心高度保守的 4 4bp的ERIC核心序列设计反向引物 ,可扩增出反映细菌基因组结构特征的谱带。由于ERIC PCR快速简便 ,图谱重复性好 ,并可作为分子标记用于细菌的分类鉴定 ,所以 ,该方法已广泛应用到了科研和生产实践中。

作者孙永艳申泉李艳琴

机构地区山西大学生物技术研究所

出处《生命的化学》 CAS CSCD 2004年第4期288-290,共3页 Chemistry of Life

基金山西省自然科学基金资助项目 (No .2 0 0 2 10 80)

关键词 ERIC ERIC核心序列 ERIC-PCR

分类号 Q933 [生物学—微生物学]

引文网络
相关文献

参考文献20

1Sharples GJ et al. Nucleic Acids Res, 1990, 18: 6503-6508
2Hulton CS et al. Mol Microbiol, 1991, 5: 825-834
3Bachellier S et al. Res Microbiol, 1999, 150: 627-639
4Versalovic J et al. Nucleic Acids Res, 1991, 19(24): 6823-6831
5Dalla-Costa LM et al. J Med Microbiol, 1998, 47(3): 227-234
6Houf K et al. Appl Environ Microbiol, 2002, 68(5): 2172-2178
7Shang Kuan YH et al. Appl Microbiol, 1997, 82: 335-344
8Gillings M et al. Lett Appl Microbiol, 1997, 25: 17-21
9de Bruun FJ. Appl Environ Microbiol, 1992, 58: 2180-2187
10Jerek B et al. Lett Appl Microbiol, 1996, 23: 55-60

二级参考文献27

1萨姆布鲁克J 费里奇EF.分子克隆实验指南（第2版）[M].北京:科学出版社,1993.474-489.
2J 萨姆布鲁克 E F佛李奇等.分子克隆实验指南（第二版）[M].北京:科学出版社,1996.965.
3SAMBROOK J 金冬雁（译）.分子克隆实验指南，第二版[M].北京:科学出版社,1996..
4[1]Hunter PR,Gaston MA.Numerical index of the discriminatory ability of typing systems: an application of Simpon′s index of diversity[J].J Clin Microbiol,1988,26: 2465-2466.
5[2]Lecler JE,Baoguang LI,William LP.High mutation frequencies among Escherichia coli and Salmonella pathogens[J].Science,1996,274: 1208-1211.
6[3]Grattard FP,Reyrolle BM.Molecular typing of nosocomial strains of Legionella pneumophila by arbitrarily primed PCR[J].J Clin Microbiol,1996,34: 1595-1598.
7[4]Van Belkum A.Molecular typing methods for epidemiological studies in medical microbiology[J].Med Microbiol Lett,1996,5: 271-283.
8[5]Olive DM,Bean P.Principles and applications of methods for DNA-based typing of microbial organisms[J].J Clin Microbiol,1999,37: 1661-1669.
9SHARPLES G J,LLOYD R G.A novel repeated DNA sequence locatedintheintergenic regions of bacterial chromosome[J].Nucl Acids Res,1990,18:6503-6508.
10HULTON C S,HIGGINS C F.ERIC sequences:a novel family of repetitive elements in the genomes of Escherichia coli,Salmonella typhimurium and other enterobacteria[J].Mol Microbiol,1991,5:825-834.

共引文献121

1张奇志.DNA探针和PCR技术在食品检测中的应用[J].广东农工商职业技术学院学报,2007,23(2):53-56. 被引量：7
2李艳琴,孙永艳,崔丽方,申泉.ERIC-PCR在人工混合菌体系中的检出灵敏度[J].微生物学通报,2004,31(4):61-64. 被引量：15
3马丽华,张道方,黄民生,谢冰.活性污泥微生物分子生态学研究与应用进展[J].净水技术,2005,24(1):33-35. 被引量：5
4温亚丽,曹晖,潘迎捷.ERIC技术在紫木耳亲缘关系鉴定上的应用研究[J].菌物学报,2005,24(1):53-60. 被引量：15
5阚欢,王伟.PCR技术在食品检测领域的最新应用进展[J].粮食与食品工业,2004,11(3):58-60. 被引量：8
6姬广海,何月秋,张世光,钱君.水稻白叶枯病原菌遗传和致病型多样性分析[J].华南农业大学学报,2005,26(2):26-30. 被引量：9
7张美玲,周志华,赵立平.粪便样品中大肠杆菌多态性分子研究[J].微生物学通报,2005,32(2):5-9. 被引量：10
8陈晶.微生物多样性的研究方法概况[J].生物技术,2005,15(4):85-87. 被引量：7
9丁德忠,庞小燕,华修国,崔立,赵立平.SPF仔猪肠道菌群结构的分子分析[J].上海交通大学学报（农业科学版）,2005,23(3):256-260. 被引量：4
10范圣第,权春善.环境DNA的提取和纯化方法的研究[J].大连民族学院学报,2005,7(5):1-4. 被引量：7

同被引文献210

1陈文芳,唐梦君,周倩,张小燕,唐修君,陆俊贤.江苏省225株鸡源弯曲杆菌分离株的MLST分析[J].中国家禽,2022,44(5):47-54. 被引量：3
2杨月莲,李娜,王丽珩,李健.分子分型技术在空肠弯曲菌鉴定中的应用[J].预防医学论坛,2019,0(12):956-959. 被引量：6
3张新宇,高燕宁.PCR引物设计及软件使用技巧[J].生物信息学,2004,2(4):15-18. 被引量：103
4翟如波,张昊,吴秋梅,孙跃岭,邱广斌.2008-2010年医院感染肺炎克雷伯菌临床分布及耐药性变迁分析[J].中华临床医师杂志（电子版）,2011,5(22):6785-6787. 被引量：8
5李艳琴,孙永艳,崔丽方,申泉.ERIC-PCR在人工混合菌体系中的检出灵敏度[J].微生物学通报,2004,31(4):61-64. 被引量：15
6乔德才,陈敬,魏桂芳,王凌华,赵立平.采用DNA指纹图谱技术分析中长跑运动员肠道菌群结构特征[J].中国运动医学杂志,2004,23(5):517-521. 被引量：20
7鲁海峰,魏桂芳,李仲逵,李红,王爱善,顾建萍,金会宇,孙强,赵立平.ERIC-PCR分子杂交技术分析大熊猫肠道菌群结构[J].中国微生态学杂志,2005,17(2):81-84. 被引量：37
8梁仲惠,梅永红.肠道菌群失调与消化系疾病[J].华南国防医学杂志,2005,19(3):37-40. 被引量：9
9蔡炯.食源性疾病的现状与防制[J].中国卫生检验杂志,2005,15(9):1150-1152. 被引量：51
10丁德忠,庞小燕,华修国,崔立,赵立平.SPF仔猪肠道菌群结构的分子分析[J].上海交通大学学报（农业科学版）,2005,23(3):256-260. 被引量：4

引证文献15

1刘佳妍,金莉莉,王秋雨.细菌基因组重复序列PCR技术及其应用[J].微生物学杂志,2006,26(3):90-93. 被引量：37
2林朝洪,倪学勤,曾东,周小秋.重复序列ERIC(IRU)研究进展[J].微生物学报,2007,47(2):370-373. 被引量：18
3方伟,杨杏芬,柯昌文.ERIC-PCR在肠道致病菌基因分型和流行病学中的应用[J].国外医学（卫生学分册）,2009,36(1):46-50. 被引量：6
4李晓霞,于爱莲,邱玉玉,张海涛,于广福,陈秀春,庄东明.海产品中沙门氏菌的分离及其ERIC-PCR指纹分析[J].中国病原生物学杂志,2010,5(3):164-167. 被引量：3
5余小利,苏丹萍,贺东生.副猪嗜血杆菌的分型技术研究进展[J].广东畜牧兽医科技,2010,35(4):13-16. 被引量：8
6刘博婷.ERIC-PCR的研究进展[J].畜牧与饲料科学,2010,31(8):49-51. 被引量：2
7杨柳,张邑帆,郑华,李大军,杨金龙,杨睿,付利芝.ERIC-PCR及其指纹图谱技术的研究[J].中国微生态学杂志,2010,22(9):845-847. 被引量：7
8张淑红,吴清平,徐晓可,张菊梅,郭伟鹏.Sau-PCR分子分型技术及应用[J].中国食品卫生杂志,2012,24(2):180-184.
9陆水英,陈维贤.细菌分子生物学分型技术进展[J].国际检验医学杂志,2012,33(14):1716-1718. 被引量：4
10王芳,高梦,孙杰,冯洁,伦永志.应用ERIC-PCR技术分析多药耐药肺炎克雷伯菌的基因分型[J].中华临床医师杂志（电子版）,2013,7(6):114-116. 被引量：2

二级引证文献103

1贺炎娜,范丽丽,张琦,张云鲜,王丹.利用选择性培养基快速初步鉴定食品中的致病微生物[J].食品安全质量检测学报,2020,11(1):258-261. 被引量：1
2李雪,金莉莉,王秋雨.病原微生物分子分型技术研究进展[J].中国公共卫生,2007,23(3):373-374. 被引量：14
3何培新,刘伟,程雁,郭恒,申进文.ERIC-PCR技术在平菇菌株鉴定中的应用[J].河南农业大学学报,2007,41(6):659-663. 被引量：5
4何培新,刘伟,郭恒,程雁,申进文.REP-PCR技术在平菇栽培菌株鉴定中的应用[J].河南农业科学,2008,37(2):78-81. 被引量：8
5董雪,王秋雨,金莉莉,李继耀,李欣,景怀琦.副溶血性弧菌分子分型和检测研究进展[J].中国卫生检验杂志,2008,18(2):379-381. 被引量：16
6杨凤环,李正楠,姬惜珠,冉隆贤.BOX-PCR技术在微生物多样性研究中的应用[J].微生物学通报,2008,35(8):1282-1286. 被引量：23
7倪学勤,郑晓丽,曾东,Joshua Gong,宋振银.采用AFLP和ERIC-PCR技术研究规模化鸡场健康鸡群中产气荚膜梭菌的遗传多样性[J].畜牧兽医学报,2009,40(5):717-724. 被引量：8
8王庆忠,娄峥,宣瑛.病原菌分子分型方法研究进展[J].检验医学,2009,24(5):397-400. 被引量：10
9宗春辉,吴尚为.分型技术在医院感染监测中的应用[J].中华医院感染学杂志,2009,19(13):1767-1770.
10王志红,韩英,王继恒,张静.几种肠道疾病患者肠道菌群结构特征的DNA指纹图谱分析[J].解放军医学杂志,2009,34(11):1326-1327. 被引量：8

1李犹平,倪学勤.ERIC-PCR技术特点及其应用[J].安徽农业科学,2007,35(18):5358-5360. 被引量：18
2李海鹏,赵春贵,陈涛.枯草芽孢杆菌TY_(7210)菌株的ERIC-PCR快速鉴别[J].山西大学学报（自然科学版）,2006,29(1):89-92. 被引量：5
3方伟,杨杏芬,柯昌文.ERIC-PCR在肠道致病菌基因分型和流行病学中的应用[J].国外医学（卫生学分册）,2009,36(1):46-50. 被引量：6
4曹又方,赵立平.ERIC序列在不同细菌基因组中分布的分析[J].山西大学学报（自然科学版）,2002,25(4):354-357. 被引量：19
5毕胜男,于家峰,任景,王吉华.基于同义密码子使用的原核生物基因组大、小染色体及质粒进化特征分析[J].生物物理学报,2015,31(3):272-285. 被引量：2
6曲艳玲,廖永红,汪苹,牟文亨.不同细胞裂解方法提取活性污泥总DNA研究[J].北京工商大学学报（自然科学版）,2007,25(2):13-16. 被引量：8
7包其郁,杨焕明.原核生物基因组DNA链组成的非对称性[J].微生物学报,2002,42(6):755-758. 被引量：1
8钱方,朱斌琳,章军.蛋白质组学研究在赤潮藻研究中的应用[J].海洋科学,2006,30(5):83-86. 被引量：3
9李娜,朱力,王恒樑.原核生物中小RNA的功能及研究进展[J].生物技术通讯,2009,20(5):699-702.
10庾太林,陆祖军,李飞龙,武杰,黄永兰,李玉燕.白颈长尾雉圈养种群大肠杆菌耐药性及其耐药基因[J].基因组学与应用生物学,2014,33(3):543-550. 被引量：3

生命的化学

2004年第4期

浏览历史

内容加载中请稍等...