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基于线粒体DNA 12S rRNA和COⅢ基因序列研究中国沿海7个长蛸(Octopus variabilis)野生群体的遗传多样性 被引量:13

GENETIC DIVERSITY OF SEVEN POPULATIONS OF OCTOPUS VARIABILIS IN CHINA’S COASTAL WATERS BASED ON THE 12S rRNA AND COⅢ GENE ANALYSIS
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摘要 基于线粒体DNA的12S rRNA和COⅢ基因序列对我国沿海重要经济头足类长蛸不同群体(大连、烟台、青岛、连云港、舟山、温州、厦门)进行了遗传多样性和遗传结构的分析。由PCR扩增获得80个个体的12SrRNA基因416bp、COⅢ基因512bp的部分序列,两者多态性遗传参数统计显示,80个个体分别检出64(12S)和27(COⅢ)个单倍型,总群体单倍型多样性指数(Hd)分别为0.984(12S)和0.909(COⅢ),核苷酸多样性指数(Pi)分别为0.028(12S)和0.034(COⅢ),平均核苷酸差异数(K)分别为9.403(12S)和17.265(COⅢ),显示出较丰富的遗传多样性。两种基因遗传分析结果均显示厦门群体与其它群体的显著分化。初步分析长蛸各群体遗传分化的原因之一可能是洋流格局的形成阻隔了群体间的基因交流。 In this study, the genetic diversity and genetic structure of seven wild populations of Octopus variabilis in China's coastal waters (Dalian, Yantai, Qingdao, Lianyungang, Zhoushan, Wenzhou and Xiamen) were analyzed using the mitochondrial gene sequencing technology (12S rRNA and CO Ⅲ). The result revealed 64 haplotypes using the 12S rRNA gene and 27 haplotypes using the CO Ⅲ gene for total 80 individuals obtained using PCR method. The haplotype diversi- ties (Hd) were 0.9840 (12S) and 0.9092 (CO Ⅲ), respectively; the nucleotide diversities (Pi) were 0.0277 (12S) and 0.0337 (COⅢ), respectively; and the average nucleotide differences (K) were 9.403 (12S) and 17.265 (COIn), respectively, showing high genetic diversity among populations. The genetic distances between the Xiamen population and other populations were up to 0.072 (12S) and 0.102 (COⅢ), respectively, showing considerable genetic differentiation, which is probably caused by different hydrological conditions in the Xiamen site than other sites.
出处 《海洋与湖沼》 CAS CSCD 北大核心 2011年第3期387-396,共10页 Oceanologia Et Limnologia Sinica
基金 国家高技术研究发展计划(863计划)项目"名贵头足类苗种规模繁育关键技术" 2010AA10A404号 国家海洋公益性行业科研专项 201005013号 海洋渔业科学与技术浙江省重中之重学科开放课题 20100105号 浙江海洋学院人才引进启动项目 21135011509号
关键词 长蛸 12S rRNA COⅢ 遗传多样性 分子标记技术 Octopus variabilis, 12S rRNA, COⅢ, Genetic diversity, Molecule marker technology
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