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SARS-Cov-2实验室检测技术的应用及展望 被引量：14
1
作者 肖斌 周泉 +2 位作者 雷婷 何咏茵 李林海 《南方医科大学学报》 CAS CSCD 北大核心 2020年第4期601-605,共5页
新型冠状病毒肺炎疫情爆发以来,我国的病毒检测能力不断提高,检测技术也在不断地发展和创新。以实时荧光定量PCR(qRT-PCR)和宏基因组测序为代表的病毒检测技术在辅助疾病确诊、监测病毒变异等方面发挥了关键作用;基于血清/血浆IgM/IgG... 新型冠状病毒肺炎疫情爆发以来,我国的病毒检测能力不断提高,检测技术也在不断地发展和创新。以实时荧光定量PCR(qRT-PCR)和宏基因组测序为代表的病毒检测技术在辅助疾病确诊、监测病毒变异等方面发挥了关键作用;基于血清/血浆IgM/IgG抗体的检测技术是辅助确诊的重要方法;高特异性的逆转录环介导等温扩增技术、能够核酸定量的数字PCR和灵敏度更高的SHERLOCK技术也极具特色与发展潜力。以上检测技术代表了病原微生物检测技术的现在及未来发展方向。本文对新型冠状病毒检测技术的基本原理、技术特点及应用现状进行探讨。 展开更多
关键词 新型冠状病毒 QRT-PCR 抗体 数字PCR SHERLOCK
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CRISPR/Cas9文库筛选技术的发展及在肿瘤研究中的应用 被引量：7
2
作者 雷婷 肖斌 +3 位作者 何咏茵 曲璟 孙朝晖 李林海 《南方医科大学学报》 CAS CSCD 北大核心 2019年第11期1381-1386,共6页
近年兴起的CRISPR/Cas9[Clustered regularly interspaced short palindromic repeats(CRISPR)/CRISPR-associated(Cas)9]技术因其能快速、简便、精准地实现基因敲除、敲入、激活、干扰等编辑功能而成为一种强大的遗传筛选工具,目前已... 近年兴起的CRISPR/Cas9[Clustered regularly interspaced short palindromic repeats(CRISPR)/CRISPR-associated(Cas)9]技术因其能快速、简便、精准地实现基因敲除、敲入、激活、干扰等编辑功能而成为一种强大的遗传筛选工具,目前已在各类细胞系和小鼠及斑马鱼等多种动物模型中得到大规模运用。利用CRISPR系统构建基因组文库进行高通量筛选,是研究疾病特别是肿瘤靶标基因的主要策略。本文就CRISPR/Cas9文库筛选技术的原理和发展,脱靶效应的改进方案,文库筛选的基本流程以及近年来该技术在肿瘤研究中的应用进行总结。 展开更多
关键词 CRISPR/Cas9 高通量筛选 文库 肿瘤
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锌指蛋白ZNF652在乳腺癌组织和细胞中的高表达可促进乳腺癌的发生发展 被引量：4
3
作者 雷婷 肖斌 +2 位作者 何咏茵 孙朝晖 李林海 《南方医科大学学报》 CAS CSCD 北大核心 2020年第12期1732-1739,共8页
目的揭示锌指蛋白ZNF652在乳腺癌组织和细胞中的表达水平及其对乳腺癌细胞增殖、侵袭和迁移的影响。方法利用TCGA数据库挖掘ZNF652在乳腺癌组织与癌旁组织中的表达差异,分析ZNF652的表达与分子分型、病理类型、TNM分级和临床分期等临床... 目的揭示锌指蛋白ZNF652在乳腺癌组织和细胞中的表达水平及其对乳腺癌细胞增殖、侵袭和迁移的影响。方法利用TCGA数据库挖掘ZNF652在乳腺癌组织与癌旁组织中的表达差异,分析ZNF652的表达与分子分型、病理类型、TNM分级和临床分期等临床病理特征的相关性;RT-qPCR和Western blot鉴定ZNF652在MCF-7、MDA-MB-231、SK-BR-3、UACC-812和BT-474乳腺癌细胞系中的表达;通过慢病毒系统构建稳定表达ZNF652的乳腺癌细胞株,利用siRNA敲低ZNF652的表达;通过CCK-8实验和克隆形成实验分析过表达及敲低ZNF652对乳腺癌细胞增殖和集落形成能力的影响;通过Transwell细胞迁移、侵袭实验以及伤口愈合实验阐明过表达及敲低ZNF652对乳腺癌细胞体外迁移和侵袭的影响;采用免疫荧光实验明确ZNF652的亚细胞定位。结果ZNF652在乳腺癌组织中表达显著上调(P<0.001);对于不同乳腺癌分子分型,ZNF652在TNBC型乳腺癌组织中表达下调,而在HER2+型、Luminal A型及Luminal B型乳腺癌组织中表达升高(P<0.01或P<0.001);除粘液癌外,ZNF652在不同病理类型乳腺癌组织中的表达均较癌旁组织升高(P<0.05);高表达ZNF652与乳腺癌远处转移、恶性程度显著相关(P<0.01或P<0.001);ZNF652在5种乳腺癌细胞系中的mRNA和蛋白表达水平均高于正常乳腺细胞(P<0.05或P<0.001);过表达ZNF652促进乳腺癌细胞的增殖、侵袭和迁移,而敲低ZNF652后作用相反;ZNF652定位于细胞核。结论ZNF652在乳腺癌组织和细胞中高表达,促进乳腺癌发生发展,有望作为乳腺癌诊断和治疗的潜在分子靶标。 展开更多
关键词 乳腺癌 ZNF652 锌指蛋白 促癌基因
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锌指蛋白家族在乳腺癌发生发展中的作用及机制 被引量：3
4
作者 雷婷(综述) 肖斌 +2 位作者 何咏茵 孙朝晖 李林海(审校) 《福建医科大学学报》 2021年第1期76-81,共6页
转录因子(transcription factor,TF)在真核生物中广泛存在,是一类能与特异DNA序列结合的核内蛋白质因子,可与启动子顺式元件作用或与其他TF的功能区域相互作用来调控基因的转录表达。根据不同的DNA结合基序,TF主要分为经典锌指、同源域... 转录因子(transcription factor,TF)在真核生物中广泛存在,是一类能与特异DNA序列结合的核内蛋白质因子,可与启动子顺式元件作用或与其他TF的功能区域相互作用来调控基因的转录表达。根据不同的DNA结合基序,TF主要分为经典锌指、同源域和基本的螺旋-环-螺旋。近期研究表明,大量锌指蛋白在乳腺癌组织和细胞中异常表达,与乳腺癌发生、侵袭和转移等进程相关[1-3]。因此,揭示锌指蛋白在乳腺癌发生、发展中的作用机制有助于开发乳腺癌新的诊断或治疗靶点。本研究旨在探讨锌指蛋白的结构、分类及其在乳腺癌发生发展中的作用机制。 展开更多
关键词 锌指蛋白 乳腺癌 转录因子 基因调控
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SCN2A和ABCB1与CYP2C19*3单核苷酸多态性与抑郁症遗传易感性的关联分析 被引量：1
5
作者 张婷 饶庆敏 +3 位作者 何咏茵 蔡金泰 刘海英 林裕龙 《中华预防医学杂志》 CAS CSCD 北大核心 2022年第3期287-294,共8页
目的遗传因素可增加抑郁症的发病风险,本研究通过分析13个候选基因与抑郁症的关联,探讨中国汉族人群抑郁症的遗传风险因子。方法采用病例对照研究。选择2020年2月至2021年9月在广州医科大学附属脑科医院情感障碍科、成人精神科和老年科... 目的遗传因素可增加抑郁症的发病风险,本研究通过分析13个候选基因与抑郁症的关联,探讨中国汉族人群抑郁症的遗传风险因子。方法采用病例对照研究。选择2020年2月至2021年9月在广州医科大学附属脑科医院情感障碍科、成人精神科和老年科住院的439例抑郁症患者作为病例组,男性158例、女性281例,年龄为(29.84±14.91)岁;464名体检健康者作为对照组,男性196名、女性268名,年龄为(30.65±12.63)岁。应用基质辅助激光解吸电离飞行时间(Matrix-Assisted Laser Desorption/Ionization Time of Flight,MALDI-TOF)质谱仪分析所有受检对象的13个候选基因20个位点。性别比较采用Pearson卡方检验,年龄和基因型分布的比较采用独立样本t检验。采用PLINK软件中“哈迪-温伯格”和“等位基因频率”程序用于分析哈迪-温伯格平衡与基因频率,采用PLINK软件中“标准病例/对照关联测试”、“Max(T)置换”和“Bonferroni多次测试校正”程序用于分析基因与疾病的关联。结果PLINK分析显示,Bonferroni校正前SCN2A rs17183814、ABCB1 rs1045642与CYP2C19*3 rs4986893、NAT2*5A rs1799929与抑郁症有关联(χ^(2)=10.340,P=0.001;χ^(2)=11.010,P=0.001;χ^(2)=9.781,P=0.002;χ^(2)=4.481,P=0.034)。以上位点在对照组中的较小等位基因频率分别为12.07%、43.64%、2.59%和3.88%;病例组中较小等位基因频率分别为17.43%、35.99%、5.47%和6.04%;比值比(odds ratio,OR)分别为1.538、0.726、2.178和1.592。采用Max(T)置换程序经1000000次置换测试后上述4个位点的差异仍有统计学意义,经验P值(EMP1)分别为0.002、0.001、0.003和0.042。Bonferroni校正后,只有SCN2A rs17183814、ABCB1 rs1045642与CYP2C19*3 rs4986893位点的差异有统计学意义,校正后P值分别为0.026、0.018和0.035。结论SCN2A rs17183814、ABCB1 rs1045642与CYP2C19*3 rs4986893位点与抑郁症易感性有关,其中SCN2A rs17183814与CYP2C19*3 rs4986893的A等位基因可能是中国汉族人群抑郁症的危险因素,而ABCB1 rs1045642的T等位基因可能为中国汉族人群抑郁症的保护因素。 展开更多
关键词 抑郁症 等位基因 风险因子 遗传学 易感性
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外周血非编码RNA在乳腺癌诊断中的研究进展 被引量：6
6
作者 何咏茵 肖斌 +3 位作者 雷婷 曲璟 李林海 孙朝晖 《中华检验医学杂志》 CAS CSCD 北大核心 2019年第9期803-806,共4页
真核生物转录组中含有大量非编码RNA(non-coding RNA,ncRNA),ncRNA在基因表达调控和各种细胞生理、病理进程中发挥着重要作用。近年来,ncRNA在肿瘤早期诊断领域的研究是热点。本文将以ncRNA中的微小RNA(microRNA,miRNA)、长链非编码RNA(... 真核生物转录组中含有大量非编码RNA(non-coding RNA,ncRNA),ncRNA在基因表达调控和各种细胞生理、病理进程中发挥着重要作用。近年来,ncRNA在肿瘤早期诊断领域的研究是热点。本文将以ncRNA中的微小RNA(microRNA,miRNA)、长链非编码RNA(long non-coding RNA,lncRNA)和环状RNA(circular RNA,circRNA)为代表,阐述3种ncRNAs作为乳腺癌外周血诊断标志物的研究进展,展望ncRNA在乳腺癌临床研究及临床转化中的前景,以期为乳腺癌早期诊断标志物的发现及诊治过程的监控提供思路。 展开更多
关键词 乳腺肿瘤 RNA 未翻译 微RNAS RNA 长链非编码 循环微RNA 生物标记 肿瘤
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miR-1825在乳腺癌患者术前和术后血清中表达水平的研究 被引量：2
7
作者 何咏茵 肖斌 +3 位作者 邱家豪 雷婷 李林海 孙朝晖 《中华预防医学杂志》 CAS CSCD 北大核心 2021年第5期691-697,共7页
通过检测乳腺癌患者术前、术后和健康体检者的血清中miR-1825相对表达水平,评估血清miR-1825对乳腺癌患者术前和术后的临床应用价值。采用回顾性研究,收集2018年10月至2021年3月南部战区总医院住院的乳腺癌术前患者血清92例、乳腺癌术... 通过检测乳腺癌患者术前、术后和健康体检者的血清中miR-1825相对表达水平,评估血清miR-1825对乳腺癌患者术前和术后的临床应用价值。采用回顾性研究,收集2018年10月至2021年3月南部战区总医院住院的乳腺癌术前患者血清92例、乳腺癌术后患者血清64例和健康体检者血清60例,年龄(49.6±11.7)岁,运用实时荧光定量PCR技术,检测miR-1825在乳腺癌患者术前、术后和健康体检者血清中的相对表达水平;结合相关临床病理资料,分析其表达与血清糖类抗原15-3(cancer antigen 15-3,CA15-3)、血清糖类抗原125(cancer antigen 125,CA-125)、癌胚抗原(carcinoembryonic antigen,CEA)的相关性;运用受试者工作特征曲线(receiver operating characteristic curve,ROC)评价miR-1825、CA15-3单独及两两联合检测对乳腺癌诊断价值。采用Mann-Whitney U检验比较两组间指标水平差异,采用Krudkal-Wallis H检验比较多组间指标水平差异。相关性分析采用Spearman法。miR-1825在乳腺癌患者术前血清中的相对表达水平1.290(0.705,1.793)比健康对照组0.18(-0.876,0.725)显著增高,而在乳腺癌患者术后化疗-0.080(-0474,0.405)中显著降低(H=92.300,P<0.001);临床病理特征分析发现,处于Ⅲ~Ⅳ期、组织分化程度低、肿瘤≥2 cm的患者miR-1825表达水平更高[Ⅰ~Ⅱ期:0.975(0.458,1.380),Ⅲ~Ⅳ期:1.955(1.663,2.535),U=98.000,P<0.001;低分化:1.685(1.448,2.143),高/中分化:0.700(0.395,0.898),U=15.500,P<0.001;肿瘤<2 cm:0.935(0.438,1.370),肿瘤≥2 cm:1.915(1.580,2.288),U=215.500,P<0.001]。相关性分析发现乳腺癌患者血清miR-1825表达与CEA(r=0.274,P=0.008)、CA15-3(r=0.587,P<0.001)表达呈线性相关性;ROC曲线结果显示,血清miR-1825用于区别乳腺癌术前患者与健康者和术后患者时,均具有较好的诊断价值,其用于分析乳腺癌术前患者和术后患者时的AUC最高(AUC=0.914,95%CI:0.872~0.956)。miR-1825可能是辅助诊断乳腺癌以及治疗效果监测的血清标志物之一。 展开更多
关键词 乳腺癌 血清 循环肿瘤标志物 microRNA-1825
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