目的明确福建地区乙肝病毒(hepatitis B virus,HBV)基因型的分布情况及其特征。方法通过巢式PCR法分片段扩增慢性乙肝患者HBV全基因组序列,构建系统发育树确定福建地区乙型肝炎病毒主要基因型、血清型;同时结合HBV-DNA载量、血清标志物...目的明确福建地区乙肝病毒(hepatitis B virus,HBV)基因型的分布情况及其特征。方法通过巢式PCR法分片段扩增慢性乙肝患者HBV全基因组序列,构建系统发育树确定福建地区乙型肝炎病毒主要基因型、血清型;同时结合HBV-DNA载量、血清标志物等检测结果分析福建地区乙肝基因型分布特征。结果从147例血清样本中成功扩增126例HBV完整基因序列;系统进化树分析表明,126例血清样本中B基因型78例(61.90%),C基因型42例(33.33%),B/C混合型6例(4.76%),未检测到其他基因型。血清型以adw2和adrq+为主,分别占63.49%和36.51%;不同基因型的分布与患者年龄、性别、HBV-DNA载量、所在地区均无相关性(P>0.05),而与患者血清标志物HBe Ag的阳性率、HBV血清型具有一定的相关性(P<0.05)。结论福建地区乙肝基因型主要以B型和C型为主,另见少量B/C混合型。B、C不同基因型的分布与患者血清标志物HBe Ag的阳性率及HBV的血清型具有一定相关性。展开更多
目的了解福建省流行的麻疹野病毒基因型别及特征。方法应用B95a细胞[Epstein-Barr(EB)Virus-Transformed,Marmoset B Lymphoblastoid Cell Line,埃泼斯坦-巴尔病毒转化的绒猴淋巴母细胞]或Vero/SLAM细胞[Vero Cells Transfected to Expr...目的了解福建省流行的麻疹野病毒基因型别及特征。方法应用B95a细胞[Epstein-Barr(EB)Virus-Transformed,Marmoset B Lymphoblastoid Cell Line,埃泼斯坦-巴尔病毒转化的绒猴淋巴母细胞]或Vero/SLAM细胞[Vero Cells Transfected to Express the Human Signaling Lymphocyte Activation Molecule(SLAM),淋巴信号激活因子转染的非洲绿猴肾细胞],从疑似麻疹病例的咽拭子或尿液标本分离麻疹病毒,用逆转录-聚合酶链反应(Reverse Transcription-Polymerase Chain Reaction,RT-PCR)扩增分离株病毒的核蛋白(Nucleoprotein,N)基因3'端450个核苷酸片段,分析其基因型别及遗传特征。结果 2002年、2006～2009年,共从6个设区的市分离了24株麻疹野病毒,均为H1基因型、H1a基因亚型,未分离到其他型别的毒株。福建株间核苷酸同源性为97.8%～100.0%,在遗传树图中属于4个独立分支谱系(Lineage),Lineage4分支病毒出现了3个新的氨基酸突变位点。福建株中来自不同地区和年份的MV(Measles Virus,麻疹病毒)07-29FZ(Fuzhou,福州)、MV07-20ND(Ningde,宁德)、MV07-47ND和MV08-78QZ(Quanzhou,泉州)、MV06-32LY(Longyan,龙岩)、MV07-30FZ、MV07-39FZ和MV07-46ND的N基因3'端的450核苷酸同源性均为100.0%。福建株与H1基因型中国代表株、H2基因型及疫苗株S(Shanghai,上海)191相比,与S191疫苗株的A基因组差异最大(核苷酸同源性90.1%～93.3%,氨基酸同源性86.8%～91.4%)。结论 H1a为福建省本土麻疹野病毒优势基因亚型,未发现其他基因亚型。近3年的分离株出现了新的氨基酸位点突变。不同地区或同一地区内存在多传播链同时循环,也存在同一野病毒株在不同地区、不同年份持续循环。展开更多
文摘目的明确福建地区乙肝病毒(hepatitis B virus,HBV)基因型的分布情况及其特征。方法通过巢式PCR法分片段扩增慢性乙肝患者HBV全基因组序列,构建系统发育树确定福建地区乙型肝炎病毒主要基因型、血清型;同时结合HBV-DNA载量、血清标志物等检测结果分析福建地区乙肝基因型分布特征。结果从147例血清样本中成功扩增126例HBV完整基因序列;系统进化树分析表明,126例血清样本中B基因型78例(61.90%),C基因型42例(33.33%),B/C混合型6例(4.76%),未检测到其他基因型。血清型以adw2和adrq+为主,分别占63.49%和36.51%;不同基因型的分布与患者年龄、性别、HBV-DNA载量、所在地区均无相关性(P>0.05),而与患者血清标志物HBe Ag的阳性率、HBV血清型具有一定的相关性(P<0.05)。结论福建地区乙肝基因型主要以B型和C型为主,另见少量B/C混合型。B、C不同基因型的分布与患者血清标志物HBe Ag的阳性率及HBV的血清型具有一定相关性。
