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棉花MNP标记位点开发及其在DNA指纹图谱构建中的应用
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作者 艾莎 李莎 +11 位作者 方治伟 李论 李甜甜 高利芬 陈利红 肖华锋 万人静 闫多子 武星廷 彭海 韩瑞玺 周俊飞 《作物学报》 CAS CSCD 北大核心 2024年第9期2267-2278,共12页
棉花是重要的经济作物,棉属植物基因组复杂,分子标记开发困难且滞后于其他二倍体农作物。本研究利用多态性好、准确性高的MNP (multiple nucleotide polymorphisms, MNP)标记法,构建我国棉花主栽品种指纹图谱,为品种鉴定、遗传多样性分... 棉花是重要的经济作物,棉属植物基因组复杂,分子标记开发困难且滞后于其他二倍体农作物。本研究利用多态性好、准确性高的MNP (multiple nucleotide polymorphisms, MNP)标记法,构建我国棉花主栽品种指纹图谱,为品种鉴定、遗传多样性分析、分子育种等提供技术指导和数据支撑。本研究根据现有棉花基因组数据开发了940个MNP位点,对98份棉花样品进行多重PCR扩增,构建文库并测序,提取每个样品中940个MNP标记的基因型,构建棉花品种指纹图谱。对98个样品进行两两比对,获得每2个样品之间的遗传差异。利用遗传差异比例对98个棉花样品绘制系统发育树。940个MNP位点在98份棉花样品中均获得有效扩增产物,扩增产物长度分布在163~274 bp,平均长度270 bp。在98份样品中平均区分度(discriminative power, DP)为0.46,任意2个品种间两两比较遗传差异,平均有410.26个MNP位点存在差异,平均差异为44.84%。从98份棉花品种的系统发育树可以看出,利用MNP标记可以依据地理分布将其分为3个类群,大致分布于黄河流域、长江流域和新疆地区。本研究开发的940个MNP标记可以对棉花品种进行精准分型,利用940个棉花MNP标记构建的98份棉花品种DNA指纹图谱,可为品种鉴定、品种权保护及种质创新提供技术支撑。 展开更多
关键词 棉花 分子标记 MNP 指纹图谱 品种鉴定
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UCD研究进展、热点与趋势分析 被引量:5
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作者 武星廷 陈永康 刘梦非 《包装工程》 CAS 北大核心 2022年第16期274-283,共10页
目的 利用文献计量学对UCD设计方法的研究现状进行可视化分析,探索UCD的研究热点及未来前沿趋势。方法 以WebofScience核心合集数据为分析样本,利用Citespace、VOSviewer将该研究主题的文献发文量、国家和组织合作、学科领域分布、关键... 目的 利用文献计量学对UCD设计方法的研究现状进行可视化分析,探索UCD的研究热点及未来前沿趋势。方法 以WebofScience核心合集数据为分析样本,利用Citespace、VOSviewer将该研究主题的文献发文量、国家和组织合作、学科领域分布、关键词、高被引文献、核心作者等内容生成可视化知识图谱,并结合相关参数进行综合分析解读。结论 检索范围内文献产量呈逐年升高趋势。北美、北欧等发达国家的文献产量处于该领域前列,机构合作现状呈现出区域内研究合作紧密、跨区域合作较为分散的现象。在学科分布方面,UCD呈现出多学科交叉融合的态势,不仅在设计学、计算机科学领域有所应用,而且在医学、心理学、教育学等领域也有交叉应用。关键词聚类共呈现出五大研究热点,分别为数字医疗、可用性工程、人机交互、以用户为中心的设计、设计评估,聚类呈现出从传统关注于产品本身到关注于人的转变态势。其中高被引文献形成了5大聚类,提供了众多UCD的关键性方法理论,构成了UCD设计方法的闭环流程。未来在设计流程、方法工具、设计范围等方面将对UCD人员及其设计团队提出更高的要求。 展开更多
关键词 UCD 以用户为中心的设计 人机交互 知识图谱 CITESPACE VOSviewer 文献计量
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苦瓜DNA分子标记研究进展 被引量:5
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作者 苏国钊 李嫒嫒 +4 位作者 陈宇华 韩贝贝 武星廷 邓超 徐振江 《中国瓜菜》 CAS 北大核心 2023年第6期10-15,共6页
我国苦瓜品种资源较丰富,南北各地均有分布与栽培,多见于南方各省市。苦瓜DNA分子标记研究开展相对较晚,标记类型应用较少,分子标记辅助育种成果鲜有报道。总结了RAPD、AFLP、SSR、ISSR、SRAP及SNP等第二代和第三代DNA分子标记在苦瓜品... 我国苦瓜品种资源较丰富,南北各地均有分布与栽培,多见于南方各省市。苦瓜DNA分子标记研究开展相对较晚,标记类型应用较少,分子标记辅助育种成果鲜有报道。总结了RAPD、AFLP、SSR、ISSR、SRAP及SNP等第二代和第三代DNA分子标记在苦瓜品种和种子纯度鉴定、亲缘关系分析、遗传图谱构建、QTL定位等方面的研究进展,以期为苦瓜遗传育种等研究提供参考依据。同时在苦瓜现有研究基础上进行展望,认为应加快挖掘功能性基因,开发功能性分子标记及全基因组SNP芯片,这对后续研究具有重大意义。 展开更多
关键词 苦瓜 品种资源 DNA分子标记
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基于SSR分子标记的154份桃品种遗传多样性分析 被引量:2
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作者 殷纪伟 韩贝贝 +5 位作者 马莹雪 武星廷 徐振江 姜建福 陈昌文 韩瑞玺 《江苏农业科学》 北大核心 2023年第16期18-26,共9页
利用简单重复序列(SSR)分子标记对桃种质资源的遗传多样性和群体结构进行分析,构建桃品种的分子数据库,为桃品种的鉴定提供技术依据。利用10个SSR标记对154份桃品种进行指纹采集,通过聚类分析和群体结构分析研究其遗传多样性。结果表明... 利用简单重复序列(SSR)分子标记对桃种质资源的遗传多样性和群体结构进行分析,构建桃品种的分子数据库,为桃品种的鉴定提供技术依据。利用10个SSR标记对154份桃品种进行指纹采集,通过聚类分析和群体结构分析研究其遗传多样性。结果表明,10对SSR引物共检测出140个等位变异,变异范围为8~27;共获得304个基因型,变化范围为17~59;引物多态性信息含量(PIC)变化范围为0.5109~0.8242,申请品种保护和登记的品种遗传多样性较已知品种低。根据Nei’s遗传距离进行非加权组平均法(UPGMA)聚类分析,供试品种可划分为5个大类,各品种间的遗传距离在0.0293~1.0000之间,其中2对品种未区分开。对供试品种进行群体结构分析,发现可以划分为4个亚群,大部分材料的亲缘关系比较单一。方差分析结果表明,10%的遗传变异来自群体间,72%的遗传变异来自群体内部,群体内的变异大于群体间。154份桃品种的遗传多样性水平适中,群体间的遗传分化程度处于中等水平,同一育种单位的品种遗传距离较近。研究结果可为不同类型桃育种创新、分子指纹数据库的构建及品种鉴定提供参考依据。 展开更多
关键词 SSR 遗传多样性 群体结构
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基于文献计量学的情感化设计研究进展、热点与趋势分析 被引量:19
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作者 陈永康 江雨豪 +1 位作者 何人可 武星廷 《包装工程》 CAS 北大核心 2022年第6期32-40,共9页
目的系统认识国际范围内情感化设计研究的全局特征,把握当前情感化设计的研究热点及理论基础,并根据当前研究热点探究未来发展新趋势。方法以Web of Science收录的情感化设计相关文献作为数据源,以科学文献计量的方法综合运用VOSviewer... 目的系统认识国际范围内情感化设计研究的全局特征,把握当前情感化设计的研究热点及理论基础,并根据当前研究热点探究未来发展新趋势。方法以Web of Science收录的情感化设计相关文献作为数据源,以科学文献计量的方法综合运用VOSviewer和CiteSpace从文献的年份产出分布、国家、研究机构、作者、参考文献共被引情况和关键词聚类等方面绘制科学知识图谱,进行可视化分析以梳理研究脉络。结论结果表明检索范围内文献数量整体呈上升趋势,中美等国处于研究的领先地位,研究热点主要集中在情感计算、感性工学、人机多通道交互、用户体验和设计评估等方面。研究现状较为成熟,形成了以三层次理论、感性工学和情感计算为主的理论体系。用户个性化、差异化情绪的识别与表达成为未来发展的新趋势。研究机构与作者合作不紧密,以及高产量作者不多是现阶段研究的主要局限。 展开更多
关键词 情感化设计 感性工学 知识图谱 文献计量 VOSviewer
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基于DUS测试性状的207份冬瓜种质遗传多样性分析
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作者 丁成芸 殷纪伟 +5 位作者 武星廷 冯艳芳 韩瑞玺 徐振江 谢大森 江院 《中国瓜菜》 2025年第3期45-60,共16页
为明确冬瓜种质资源表型遗传多样性,采用主成分分析、聚类分析和相关性分析等方法,对207份冬瓜种质资源的31个表型性状进行遗传多样性分析。结果表明,207份冬瓜种质资源表现出丰富的遗传多样性。31个性状的遗传多样性指数变化范围在0.25... 为明确冬瓜种质资源表型遗传多样性,采用主成分分析、聚类分析和相关性分析等方法,对207份冬瓜种质资源的31个表型性状进行遗传多样性分析。结果表明,207份冬瓜种质资源表现出丰富的遗传多样性。31个性状的遗传多样性指数变化范围在0.25~2.14,其中果形指数的遗传多样性指数最高(2.14),其次是果肉厚度(2.03),雌花连续性最低(0.25)。6个数量性状的变异系数变化范围在27.01%~75.83%,均大于20%,变异系数最大的是果实质量,果实横径最小。主成分分析提取了8个主成分,累积贡献率达68.78%,其中果实质量、果肉厚度、果实纵径、果皮斑点颜色、果实瓜瓤、种子边缘棱的有无、果柄长度、叶片裂刻深浅、果蒂端形状、果肉颜色、雌花柱头颜色及果蒂端凹陷程度等12个性状贡献率较高,能够涵盖207份冬瓜种质外部形态特征的描述。在465个相关系数中,有55个相关系数绝对值>0.50,其中22个相关系数绝对值>0.70,说明各性状间表现出不同程度的相关性。聚类分析将试材分成4组,其中第Ⅰ组节瓜和小冬瓜居多,果型较小,果肉有硬度,质脆,符合广东消费者食量和口味,第Ⅲ组为大果型冬瓜,具有高产潜质,这两组可作为筛选优异种质和品种创新改良的育种材料。本研究结果为冬瓜新品种选育和特异种质资源挖掘提供了一定的理论指导。 展开更多
关键词 冬瓜 种质资源 DUS测试 遗传多样性 相关性分析
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南瓜主要性状的功能基因定位及分子标记研究进展
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作者 邹佳龙 殷纪伟 +5 位作者 武星廷 刘雪景 马莹雪 李浪 荆若男 徐振江 《中国蔬菜》 2025年第4期27-37,共11页
本文综述了南瓜果实、花、籽粒、长短蔓和抗逆等相关性状的功能基因定位和分子标记开发的最新研究成果,并在此基础上,对功能基因和分子标记在辅助选择育种和种质资源鉴定与创制中的应用及发展方向进行展望,为推进南瓜分子生物学、基因... 本文综述了南瓜果实、花、籽粒、长短蔓和抗逆等相关性状的功能基因定位和分子标记开发的最新研究成果,并在此基础上,对功能基因和分子标记在辅助选择育种和种质资源鉴定与创制中的应用及发展方向进行展望,为推进南瓜分子生物学、基因定位及分子标记辅助选择育种等研究提供参考。 展开更多
关键词 南瓜 功能基因 性状定位 分子标记
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