-
题名生物信息领域软件体系结构的研究与应用
被引量：1
- 1
-
-
作者
蔡传政
张家军
王翼飞
-
机构
上海大学理学院
-
出处
《计算机工程与设计》
CSCD
北大核心
2006年第24期4638-4641,共4页
-
基金
国家863高技术研究发展计划基金项目(2002AA234021)
-
文摘
生物信息领域软件体系结构是生物信息领域应用软件系统中构件及构件关系的描述。依照域工程的方法过程,分析了生物信息应用领域,给出了领域概念模型。随后以领域概念模型为基础分别提出了独立系统和开放分布式系统的生物信息领域软件体系结构参考模型,最后简要介绍了应用实例,并提出了一些领域内有待研究的问题。
-
关键词
生物信息学
特定领域软件体系结构
域分析
域模型
体系结构描述语言
-
Keywords
bioinformatics
DSSA
domain analysis
domain model
ADL
-
分类号
TP311
[自动化与计算机技术—计算机软件与理论]
-
-
题名基因调控网络中的延滞动力学
- 2
-
-
作者
张家军
蔡传政
王翼飞
-
机构
上海大学数学系
-
出处
《应用科学学报》
CAS
CSCD
北大核心
2007年第1期85-90,共6页
-
基金
国家"973"重点基础研究发展计划资助项目(001CB510205)
-
文摘
由于基因调控网络中生物化学反应的时间多尺度性,如DNA与蛋白质结合以及蛋白质聚合等快速反应、转录翻译和降解等慢速反应,延滞现象在基因调控网络中普遍存在.文中提出一种延滞基因调控网络的随机模型,并且从矩方程和改进的Gillespie算法对模型进行探讨.还分别考虑了单基因延滞自调控网络和双基因延滞调控网络的例子,计算机模拟计算结果表明,基因调控网络中的延滞可以诱发调控产物浓度的随机振荡,这与实验结果相当吻合.
-
关键词
基因调控网络
主方程
延滞
Gillespie算法
-
Keywords
gene regulatory network
master equation
time delay
GiUespie algorithm
-
分类号
Q612
[生物学—生物物理学]
-
