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Clustered Regularly Interspaced Short Palindromic Repeats(CRISPR):A critical overview on the most promising applications of molecular scissors in oral medicine 被引量:1
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作者 MARCO TATULLO LUISA LIMONGELLI +3 位作者 ROSA MARIA MARANO ALESSANDRA VALLETTA ANGELA TEMPESTA SANDRO RENGO 《BIOCELL》 SCIE 2022年第8期1837-1842,共6页
The scientific community is continuously working to translate the novel biomedical techniques into effective medical treatments.CRISPR-Cas9 system(Clustered Regularly Interspaced Short Palindromic Repeats-9),commonly ... The scientific community is continuously working to translate the novel biomedical techniques into effective medical treatments.CRISPR-Cas9 system(Clustered Regularly Interspaced Short Palindromic Repeats-9),commonly known as the“molecular scissor”,represents a recently developed biotechnology able to improve the quality and the efficacy of traditional treatments,related to several human diseases,such as chronic diseases,neurodegenerative pathologies and,interestingly,oral diseases.Of course,dental medicine has notably increased the use of biotechnologies to ensure modern and conservative approaches:in this landscape,the use of CRISPR-Cas9 system may speed and personalize the traditional therapies,ensuring a good predictability of clinical results.The aim of this critical overview is to provide evidence on CRISPR efficacy,taking into specific account its applications in oral medicine. 展开更多
关键词 clustered regularly interspaced short palindromic repeats(crispr) DENTISTRY Stem cells
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CRISPR/Cas9技术:探索lncRNA的自身功能以及在癌症进程中的作用
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作者 李欣 胡莹 王玉明 《中国生物化学与分子生物学报》 北大核心 2025年第3期364-375,共12页
CRISPR/Cas系统的出现极大推动了基因编辑领域的进步,特别是CRISPR/Cas9系统,已成为生物医学研究的核心工具。长非编码RNA(lncRNA)在基因调控、细胞分化和多种疾病的发展过程中发挥关键作用,尤其在癌症研究中,lncRNA作为癌症生物标志物... CRISPR/Cas系统的出现极大推动了基因编辑领域的进步,特别是CRISPR/Cas9系统,已成为生物医学研究的核心工具。长非编码RNA(lncRNA)在基因调控、细胞分化和多种疾病的发展过程中发挥关键作用,尤其在癌症研究中,lncRNA作为癌症生物标志物和治疗靶点,具有重要的应用前景。然而,由于lncRNA普遍具有低丰度和保守性差等特点,限制了传统手段对其功能的研究。CRISPR/Cas9技术为lncRNA的研究提供了一个高效、灵活且精确的工具,显著加速了该领域的进展。本文首先回顾了CRISPR/Cas9系统的基本原理及其在基因编辑中的广泛应用,包括CRISPR敲除、敲入、干扰和激活等多种功能系统。这些技术不仅可以筛选特定生物过程中的关键lncRNA,还能够用于基因功能研究,探索其在疾病中的作用。本文重点分析了CRISPR/Cas9技术在研究lncRNA功能和调控机制,以及其在肿瘤研究中的关键应用。此外,文章还总结了通过CRISPR/Cas9进行全基因组筛选以识别功能性lncRNA的方法,并探讨了这些lncRNA在癌症细胞增殖、迁移、侵袭以及耐药性中的作用。CRISPR/Cas9敲除系统可以高效敲除lncRNA基因,揭示其在基因调控中的具体功能。同时,CRISPR激活和干扰技术为非编码基因的研究提供了新的思路,通过调控lncRNA的表达水平,进一步探索其在癌症等疾病中的临床应用。文章还探讨了CRISPR技术在未来lncRNA研究中的潜力,尤其是在解决基因组复杂性、靶向效率和脱靶效应等技术难题方面的进展。综上所述,CRISPR/Cas9技术不仅为研究lncRNA提供了强有力的工具,也为未来开发新的癌症诊断和治疗手段提供了新的思路和机会。 展开更多
关键词 成簇的规则间隔短回文重复序列(crispr/Cas9) 长非编码RNA 基因调控 癌症
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基于CRISPR/Cas9技术创制高维生素C番茄材料
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作者 安煊森 王雁伟 +2 位作者 田文超 任亚娟 艾鹏飞 《中国生物化学与分子生物学报》 北大核心 2025年第3期460-469,共10页
组成型光形态建成9信号复合体的5B亚基(subunit 5B of constitutively photomorphogenic 9 signalosome,CSN5B)是植物中L-半乳糖途径合成维生素C的抑制因子。为了获得高维生素C番茄突变体,本文构建双靶点载体pKSE402-SlCSN5B并对番茄育... 组成型光形态建成9信号复合体的5B亚基(subunit 5B of constitutively photomorphogenic 9 signalosome,CSN5B)是植物中L-半乳糖途径合成维生素C的抑制因子。为了获得高维生素C番茄突变体,本文构建双靶点载体pKSE402-SlCSN5B并对番茄育种亲本“1912”进行了遗传转化。通过分子生物学鉴定和DNA序列分析,17株转基因阳性植株中6株发生编辑,编辑效率为35.3%;其中csn5b-6和csn5b-8为纯合突变体,分别缺失了180 bp和3 bp。对这2种缺失纯合体T 1代中无外源T-DNA插入的株系分别进行生物学观测,在植株和果实的表型上无明显差异;在果实红熟期,对其进行生理指标测定,csn5b-6的T 1代株系在GMPase活力、维生素C和过氧化氢含量变化显著,分别比野生型提高43%、37.8%和降低25.9%,而可溶性固形物含量无明显差异;csn5b-8的T 1代株系与野生型一致。采用基因表达分析和蛋白质结构预测发现,csn5b-6-11中SlCSN5B基因表达量正常,但其编码的蛋白质由于较大的肽段丢失引起结构的改变,从而影响其功能,这可能是引起维生素C含量提高的原因。以上结果表明,利用CRISPR/Cas9技术编辑SlCSN5B基因可以提高番茄果实中维生素C的含量,为后续培育优质番茄新品种提供材料。 展开更多
关键词 crispr/Cas9 番茄 SlCSN5B 维生素C
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CRISPR/Cas9基因编辑系统在结直肠癌中的应用进展 被引量:2
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作者 沈伟男 谢阳阳 +5 位作者 范晓翔 戴晓宇 余永明 赵坚培 于骅 周海萍 《医学综述》 2018年第24期4852-4857,共6页
结直肠癌(CRC)是常见的恶性肿瘤,在我国发病率有上升趋势。近年来,从基因水平研究结肠癌的发生、发展及预后,寻找更有效的治疗方法已成为热点。成簇规律间隔的短回文重复序列/CRISPR相关蛋白酶9(CRISPR/Cas9)已成为编辑生物体基因的一... 结直肠癌(CRC)是常见的恶性肿瘤,在我国发病率有上升趋势。近年来,从基因水平研究结肠癌的发生、发展及预后,寻找更有效的治疗方法已成为热点。成簇规律间隔的短回文重复序列/CRISPR相关蛋白酶9(CRISPR/Cas9)已成为编辑生物体基因的一项有力工具。它首次在细菌和古生菌内作为适应性免疫系统的一部分被发现,CRISPR/Cas9已广泛用于编辑基因组以及激活或抑制基因的表达。因此,CRISPR/Cas9通过提供有效的技术来分析肿瘤发生机制,鉴定靶向基因药物,有望加快癌症研究。 展开更多
关键词 结直肠癌 成簇规律间隔的短回文重复序列/crispr相关蛋白酶9 基因编辑
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CRISPR/Cas9技术在感染性疾病中的应用 被引量:2
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作者 张雨超 郝瑞栋 徐建青 《微生物与感染》 2016年第5期317-320,共4页
成簇的规律间隔的短回文重复序列及其相关蛋白9〔clustered regularly interspaced short palindromic repeat(CRISPR)/CRISPR-associated protein 9(Cas9),CRISPR/Cas9〕是一种新兴的基因编辑技术,与以前的三大基因编辑技术——归巢核... 成簇的规律间隔的短回文重复序列及其相关蛋白9〔clustered regularly interspaced short palindromic repeat(CRISPR)/CRISPR-associated protein 9(Cas9),CRISPR/Cas9〕是一种新兴的基因编辑技术,与以前的三大基因编辑技术——归巢核酸内切酶、锌指核酸酶和转录激活因子样效应物核酸酶技术相比,其在靶向特异性、操作简便性、治疗彻底性、应用广泛性等方面具有更大的优势和发展潜力。艾滋病、乙型肝炎、疟疾等感染性疾病的治疗一直是医学上的重大难题,科学家正努力尝试利用CRISPR/Cas9技术解决这些医学难题。本文主要综述了CRISPR/Cas9技术在这些感染性疾病中应用的研究进展。 展开更多
关键词 成簇的规律间隔的短回文重复序列及其相关蛋白9 共价闭合环状DNA 锌指核酸酶 转录激活因子样效应物核酸酶 单导向RNA
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非病毒纳米载体递送CRISPR/Cas9的研究进展
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作者 吕丹 谭志霞 +2 位作者 许龙 吴秀山 叶湘漓 《生命科学研究》 CAS 2023年第4期371-376,共6页
成簇规则间隔的短回文重复序列及其相关蛋白9(clustered regularly interspaced short palindromic repeat/CRISPR-associated protein 9,CRISPR/Cas9)技术目前广泛应用于生命医学领域的基础研究及临床应用研究。由于载体在CRISPR/Cas9... 成簇规则间隔的短回文重复序列及其相关蛋白9(clustered regularly interspaced short palindromic repeat/CRISPR-associated protein 9,CRISPR/Cas9)技术目前广泛应用于生命医学领域的基础研究及临床应用研究。由于载体在CRISPR/Cas9技术中发挥了重要的作用,如何进一步开发和优化载体系统具有重要的意义。传统的载体大多以病毒载体为主,其递送的效率高,但亦存在插入片段的大小有限、免疫反应、致癌、难以大规模生产甚至脱靶等缺陷;而非病毒纳米载体在一定程度上可解决基因编辑过程中由病毒载体所带来的潜在毒性和容量限制等问题,可能具有更广阔的应用前景。本文主要综述了目前用于CRISPR/Cas9系统递送的非病毒纳米载体,探讨了非病毒纳米载体在递送CRISPR/Cas9系统时可能遇到的主要困难,提出了相应的解决方案和策略,以期为基因治疗和药物研发提供新的参考依据。 展开更多
关键词 成簇规则间隔的短回文重复序列及其相关蛋白9(crispr/Cas9) 非病毒纳米载体 病毒载体 基因编辑 基因治疗
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CRISPR-Cas9高通量文库筛选技术在胶质瘤中的应用进展
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作者 濮蓓 张旭 +2 位作者 熊晓星 简志宏 曾智 《医学综述》 CAS 2023年第13期2568-2573,共6页
胶质瘤是最常见的神经系统肿瘤,其治疗以手术切除、术后辅助放化疗为主,但效果不理想,预后较差。成簇间隔规律短回文重复序列(CRISPR)-CRISPR相关蛋白9(Cas9)高通量文库筛选技术以合成致死治疗策略为基础,通过CRISPR-Cas9技术对胶质瘤... 胶质瘤是最常见的神经系统肿瘤,其治疗以手术切除、术后辅助放化疗为主,但效果不理想,预后较差。成簇间隔规律短回文重复序列(CRISPR)-CRISPR相关蛋白9(Cas9)高通量文库筛选技术以合成致死治疗策略为基础,通过CRISPR-Cas9技术对胶质瘤细胞进行基因编辑,将单向导RNA转入细胞中,在全基因组范围内干扰基因功能并筛选目的表型,以获得一系列与肿瘤发生发展机制及治疗相关的靶基因。目前,CRISPR-Cas9高通量文库筛选技术在胶质瘤中被广泛研究,已在细胞模型、动物模型等模型中获得了一系列与胶质瘤增殖、药物敏感性及耐药相关的靶基因,这可为后续临床胶质瘤的个体化靶向治疗提供新的指导方向,以得到更好的临床治疗效果。 展开更多
关键词 胶质瘤 成簇间隔规律短回文重复序列-crispr相关蛋白9 合成致死 高通量文库筛选
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Combination of CRISPR/Cas9 System and CAR-T Cell Therapy:A New Era for Refractory and Relapsed Hematological Malignancies 被引量:2
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作者 Ke-jia HU Elaine Tan Su YIN +1 位作者 Yong-xian HU He HUANG 《Current Medical Science》 SCIE CAS 2021年第3期420-430,共11页
Chimeric antigen receptor T(CAR-T)cell therapy is the novel treatment strategy for hematological malignancies such as acute lymphoblastic leukemia(ALL),lymphoma and multiple myeloma.However,treatment-related toxicitie... Chimeric antigen receptor T(CAR-T)cell therapy is the novel treatment strategy for hematological malignancies such as acute lymphoblastic leukemia(ALL),lymphoma and multiple myeloma.However,treatment-related toxicities such as cytokine release syndrome(CRS)and immune effector cell-associated neurotoxicity syndrome(ICANS)have become significant hurdles to CAR-T treatment.Multiple strategies were established to alter the CAR structure on the genomic level to improve efficacy and reduce toxicities.Recently,the innovative gene-editing technology-clustered regularly interspaced short palindromic repeats(CRISPR)/CRISPR-associated nuclease9(Cas9)system,which particularly exhibits preponderance in knock-in and knockout at specific sites,is widely utilized to manufacture CAR-T products.The application of CRISPR/Cas9 to CAR-T cell therapy has shown promising clinical results with minimal toxicity.In this review,we summarized the past achievements of CRISPR/Cas9 in CAR-T therapy and focused on the potential CAR-T targets. 展开更多
关键词 chimeric antigen receptor T cell treatment clustered regularly interspaced short palindromic repeats(crispr)/crispr-associated nuclease9 gene editing IMMUNOTHERAPY hematologic malignancy
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CRISPR/Cas9基因编辑技术在致瘤病毒感染研究中的应用
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作者 王玉 徐维祯 钟照华 《微生物与感染》 2017年第2期107-112,共6页
成簇的规律间隔的短回文重复序列及其相关蛋白9〔clustered regularly interspaced short palindromic repeat(CRISPR)/CRISPR-associated protein 9(Cas9),CRISPR/Cas9〕基因编辑技术的发现源于真细菌和古细菌中CRISPR/Cas系统介导的... 成簇的规律间隔的短回文重复序列及其相关蛋白9〔clustered regularly interspaced short palindromic repeat(CRISPR)/CRISPR-associated protein 9(Cas9),CRISPR/Cas9〕基因编辑技术的发现源于真细菌和古细菌中CRISPR/Cas系统介导的适应性免疫机制研究。该技术利用特异性向导RNA识别靶点基因,引导核酸内切酶Cas9对其切割,并通过同源重组或非同源末端连接完成对目的 DNA的编辑。某些病毒感染机体后,可将其基因组整合到宿主细胞基因组中或潜伏于组织中而无法被彻底清除,从而引起持续性感染。本文参考2013年以来CRISPR/Cas9基因组编辑技术的最新相关研究报道,重点综述其在人类免疫缺陷病毒1型(human immunodeficiency virus type 1,HIV-1)、人乳头瘤病毒(human papillomavirus,HPV)、乙型肝炎病毒(hepatitis B virus,HBV)、Epstein-Barr病毒(Epstein-Barr virus,EBV)等致瘤病毒感染相关疾病研究中的应用,并概括其作用于这些病毒的有效靶点。 展开更多
关键词 成簇的规律间隔的短回文重复序列及其相关蛋白9 基因编辑 病毒
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CRISPR/Cas9基因编辑技术与神经系统疾病的基础研究及临床应用进展
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作者 吴文 薛彤瑶 +1 位作者 孙阁 王庆浩 《医学综述》 CAS 2023年第5期839-844,共6页
规律间隔成簇短回文重复序列及其相关蛋白9(CRISPR/Cas9)系统是一种由获得性免疫系统在微生物中开发的基因组编辑技术,它根据互补碱基配对原理在特定位点插入或移除基因,或修复致病基因突变,具有高效、简便、低廉的特点,在基础研究和疾... 规律间隔成簇短回文重复序列及其相关蛋白9(CRISPR/Cas9)系统是一种由获得性免疫系统在微生物中开发的基因组编辑技术,它根据互补碱基配对原理在特定位点插入或移除基因,或修复致病基因突变,具有高效、简便、低廉的特点,在基础研究和疾病治疗领域显示出巨大的潜力。近年来,CRISPR/Cas9基因编辑技术发展迅速,在多种神经疾病模型的构建、致病基因筛选和靶向治疗等方面具有极大的应用潜力,被评估为神经相关类型疾病研究和治疗的一种有前途的方法。未来,对CRISPR/Cas9基因编辑技术进行深入研究有望为神经系统相关疾病提供有效的治疗方法。 展开更多
关键词 神经系统疾病 规律间隔成簇短回文重复序列及其相关蛋白9 基因编辑
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利用CRISPR/Cas9技术敲除XPO1基因对胰腺癌细胞株生物学功能的影响
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作者 黄娴娴 李苑华 +2 位作者 黄凤婷 张世能 庄燕妍 《岭南现代临床外科》 2020年第3期280-284,290,共6页
目的利用CRISPR/Cas9技术构建XPO1基因敲除的胰腺癌细胞株MIA-Paca2,初步探讨XPO1敲除对细胞生物学功能的影响。方法构建sgRNA-XPO1质粒,包装成慢病毒感染MIA-Paca2细胞,用合适浓度的嘌呤霉素筛选获得XPO1敲除的稳转株,DNA测序及蛋白质... 目的利用CRISPR/Cas9技术构建XPO1基因敲除的胰腺癌细胞株MIA-Paca2,初步探讨XPO1敲除对细胞生物学功能的影响。方法构建sgRNA-XPO1质粒,包装成慢病毒感染MIA-Paca2细胞,用合适浓度的嘌呤霉素筛选获得XPO1敲除的稳转株,DNA测序及蛋白质印迹法检测XPO1敲除效率;流式细胞分析及CCK8实验分别检测细胞凋亡、细胞周期及其对吉西他滨的半数抑制浓度(IC_(50))。结果 DNA测序显示编码XPO1蛋白的基因序列发生移码突变,蛋白质印迹法、流式细胞技术及CCK8结果显示XPO1基因敲除后的MIA-Paca2细胞株XPO1蛋白表达量明显降低,细胞凋亡增多,G2/M期细胞比例增加,对吉西他滨IC50降低。结论利用CRISPR/Cas9成功构建XPO1基因敲除的MIA-Paca2细胞株,XPO1基因敲除可促进细胞凋亡,引起细胞周期G2/M期阻滞,增强吉西他滨化疗敏感性。 展开更多
关键词 crispr/Cas9 XPO1 基因敲除 胰腺癌
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CRISPR/Cas9基因编辑非病毒递送系统
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作者 盛劲菡 郑琪臻 汪铭 《高等学校化学学报》 SCIE EI CAS CSCD 北大核心 2023年第3期156-166,共11页
规律间隔成簇短回文重复序列及相关蛋白9(CRISPR/Cas9)系统的基因编辑技术为哺乳细胞基因组的精准修饰与编辑研究提供了高效、快捷的工具,但其化学生物学应用依然面临着CRISPR基因编辑工具Cas9蛋白和gRNA的细胞及活体递送等问题.近年来... 规律间隔成簇短回文重复序列及相关蛋白9(CRISPR/Cas9)系统的基因编辑技术为哺乳细胞基因组的精准修饰与编辑研究提供了高效、快捷的工具,但其化学生物学应用依然面临着CRISPR基因编辑工具Cas9蛋白和gRNA的细胞及活体递送等问题.近年来,研究人员通过开发多种非病毒递送载体,实现了编码CRISPR/Cas9基因编辑工具的DNA和信使RNA(mRNA)以及Cas9/gRNA核糖核蛋白(RNP)复合物的递送,并应用于靶基因的化学修饰与编辑调控.本文主要概述了近期CRISPR/Cas9基因编辑递送的研究进展,并对其化学生物学应用前景进行了展望. 展开更多
关键词 规律间隔成簇短回文重复序列及相关蛋白9(crispr/Cas9) 基因编辑 药物递送 非病毒载体 纳米颗粒
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化学调控CRISPR/Cas9基因编辑技术的研究进展 被引量:1
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作者 肖珩 李永奎 邢曦雯 《高等学校化学学报》 SCIE EI CAS CSCD 北大核心 2023年第3期1-9,共9页
规律间隔成簇短回文重复序列及其相关蛋白9(Clustered regularly interspaced short palindromic repeats(CRISPR)/CRISPR-associated protein 9,CRISPR/Cas9)基因编辑技术作为一项基因工程领域革新式的技术,为癌症、遗传性疾病及感染... 规律间隔成簇短回文重复序列及其相关蛋白9(Clustered regularly interspaced short palindromic repeats(CRISPR)/CRISPR-associated protein 9,CRISPR/Cas9)基因编辑技术作为一项基因工程领域革新式的技术,为癌症、遗传性疾病及感染性疾病等多种重大疾病的治疗提供了极大的帮助.但如何在特定细胞和组织中实现时空调控的精准基因编辑,进而避免脱靶效应,依然是该技术在临床转化领域面临的重要挑战.近年来,通过化学分子和反应实现对CRISPR/Cas9活性的调控已经成为提升这项基因编辑技术效率的重要手段之一.本文综合评述了一些最近报道的化学调控CRISPR/Cas9基因编辑的方法,并对其在临床医学领域的应用前景进行了展望. 展开更多
关键词 化学调控 小分子 规律间隔成簇短回文重复序列及其相关蛋白9 基因编辑
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CRISPR/Cas9技术在组蛋白去甲基化酶Kdm^(2)b基因大片段敲除小鼠模型构建中的应用
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作者 陈素珠 笪琳萃 +3 位作者 黄志清 巍巍 黄鹏宇 郑备红 《山东医药》 CAS 2021年第27期47-50,共4页
目的观察CRISPR/Cas9技术在组蛋白去甲基化酶Kdm^(2)b基因大片段敲除小鼠模型构建中的应用效果。方法首先,在Kdm^(2)b基因第7个外显子的5’端和第9个外显子的3’端各设计两个向导RNA(sgRNA),分别插入PX459载体构建重组质粒;将四种sgRNA... 目的观察CRISPR/Cas9技术在组蛋白去甲基化酶Kdm^(2)b基因大片段敲除小鼠模型构建中的应用效果。方法首先,在Kdm^(2)b基因第7个外显子的5’端和第9个外显子的3’端各设计两个向导RNA(sgRNA),分别插入PX459载体构建重组质粒;将四种sgRNA的重组质粒两两组合(sgRNA3-1和sgRNA5-1、sgRNA3-1和sgRAN5-2、sgRNA3-2和sgRNA5-1、sgRNA3-2和sgRAN5-2),然后转染入小鼠NIH3T3细胞,筛选出sgRNA3-2和sgRAN5-2为Kdm^(2)b基因敲除的最佳组合。对3~6周龄C57BL/6母鼠进行诱导排卵,使之与公鼠交配,授精成功后处死母鼠,取出受精卵,放入培养液中培养。最后,利用细胞质显微注射技术在小鼠原核期胚胎中注射sgRNA3-2、sgRAN5-2和Cas9的mRNA,将存活的胚胎移植到假孕母鼠输卵管壶腹部。待小鼠出生1周左右,剪取尾尖,用酚/氯仿法抽提尾尖中的基因组DNA,并进行琼脂糖凝胶电泳及基因测序;纯合子小鼠在出生4周后,观察其表型。结果最终获得13只小鼠。经过基因鉴定,Kdm^(2)b基因大片段缺失的纯合子小鼠1只,杂合子小鼠3只,另外9只Kdm^(2)b基因未见改变;纯合子小鼠鼠尾组织中Kdm^(2)b基因中的外显子7至外显子9基因序列缺失。纯合子小鼠在初生4周后,出现卷尾。结论应用CRISPR/Cas9技术成功构建了去甲基化酶Kdm^(2)b基因大片段敲除的小鼠模型。 展开更多
关键词 crispr/Cas9技术 组蛋白去甲基化酶 Kdm^(2)b基因 基因敲除小鼠
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Review: Plant Genome Editing Targeted by RNA-Guided DNA Endonuclease CRISPR/Cas9
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作者 Norimoto Murai 《American Journal of Plant Sciences》 2017年第13期3460-3474,共15页
This review chronicles the development of the research on CRISPR/Cas9 (Clustered Regularly Interspaced Short Palindromic Repeat/CRISPR associated protein 9) during the last 30 years from the discovery of CRISPR sequen... This review chronicles the development of the research on CRISPR/Cas9 (Clustered Regularly Interspaced Short Palindromic Repeat/CRISPR associated protein 9) during the last 30 years from the discovery of CRISPR sequence, of biological significance and of the molecular mechanism for adaptive bacterial immunity. It describes recent works on structural and functional diversity of CRISPR/Cas systems, and on three-dimensional structure-based improvements of on-target specificity of CRISPR/Cas9 and Cpf1 endonucleases. The review ends with the application of CRISPR/Cas9 to targeted editing of plant genomes. Importantly, plant commodities modified by CRISPR-Cas9 have not been considered as genetically modified organisms (GMO) as long as foreign DNAs from plant pests were not introduced, according to the recent determination by the USDA. 展开更多
关键词 crispr/Cas9 (clustered regularly interspaced short palindromic repeat/crispr Associated Protein 9) on- and off-Target Sequences PAM (Protospacer ADJACENT Motif)
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应用CRISPR/Cas9基因编辑系统对HEK293细胞系TSC1基因稳定敲除效果的实验鉴定
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作者 王晶 高倩 +1 位作者 陈健康 刘家云 《现代检验医学杂志》 CAS 2021年第4期129-131,161,共4页
目的利用成簇规律间隔短回文重复序列/成簇规律间隔短回文重复序列相关蛋白(clustered regularly interspaced short palindromic repeat/CRISPR-associated protein,CRISPR/Cas9)基因编辑系统在HEK293细胞系中对TSC1基因稳定敲除,并对... 目的利用成簇规律间隔短回文重复序列/成簇规律间隔短回文重复序列相关蛋白(clustered regularly interspaced short palindromic repeat/CRISPR-associated protein,CRISPR/Cas9)基因编辑系统在HEK293细胞系中对TSC1基因稳定敲除,并对其敲除效果进行鉴定。方法根据TSC1基因的序列设计sgRNA,将sgRNA克隆到载体lentilCRISPRv2上,将连接产物转化至Stbl3感受态细胞,对菌液进行测序鉴定。将鉴定成功的lentiCRISPRV2-sgTSC1质粒转染至HEK293细胞,加入嘌呤霉素进行筛选,挑选单细胞克隆进行PCR鉴定,选取条带单一的细胞株用Western blot鉴定TSC1基因的表达。结果成功构建lentiCRISPRV2-sgTSC1-1/2重组质粒,并利用该质粒完成对TCS1基因的定点切割,Western blot结果显示细胞中无TSC1表达。结论用CRISPR/Cas9系统成功构建TSC1基因敲除的稳定细胞株,为后续实验奠定了基础。 展开更多
关键词 成簇规律间隔短回文重复序列(crispr)/crispr相关蛋白9(Cas9) 结节性硬化症 基因敲除 结节性硬化症1基因
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The Applications of CRISPR Screening in Aging Research
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作者 XU Jia-Xin JING Yao-Bin +1 位作者 QU Jing LIU Guang-Hui 《中国生物化学与分子生物学报》 CAS CSCD 北大核心 2024年第9期1186-1196,共11页
The advancement of Clustered Regularly Interspaced Short Palindromic Repeats(CRISPR)gene editing technology has revolutionized the comprehension of human genome,propelling molecular and cellular biology research into ... The advancement of Clustered Regularly Interspaced Short Palindromic Repeats(CRISPR)gene editing technology has revolutionized the comprehension of human genome,propelling molecular and cellular biology research into unexplored realms and accelerating progress in life sciences and medicine.CRISPR-based gene screening,recognized for its efficiency and practicality,is widely utilized across diverse biological fields.Aging is a multifaceted process governed by a myriad of genetic and epigenetic factors.Unraveling the genes regulating aging holds promise for understanding this intricate phenomenon and devising strategies for its assessment and intervention.This review provides a comprehensive overview of the progress in CRISPR screening and its applications in aging research,while also offering insights into future directions.CRISPR-based genetic-manipulation tools are positioned as indispensable instruments for mitigating aging and managing age-related diseases. 展开更多
关键词 clustered regularly interspaced short palindromic repeats(crispr) genetic screening AGING
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嗜热链球菌中CRISPR序列的检测与同源性分析 被引量:9
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作者 邓凯波 霍贵成 《食品科学》 EI CAS CSCD 北大核心 2013年第3期153-157,共5页
为探明内蒙古的8株嗜热链球菌的CRISPR,用PCR方法扩增了其CRISPR序列,并采用生物信息学方法分析和预测了重复序列(direct repeat,DR)的同源性及二级结构。结果表明:除S4只含有一个CRISPR结构外,其余7株嗜热链球菌均检测出3条CRISPR序列... 为探明内蒙古的8株嗜热链球菌的CRISPR,用PCR方法扩增了其CRISPR序列,并采用生物信息学方法分析和预测了重复序列(direct repeat,DR)的同源性及二级结构。结果表明:除S4只含有一个CRISPR结构外,其余7株嗜热链球菌均检测出3条CRISPR序列,远高于CRISPR database公布细菌中具有该结构的比例(46.4%),且分别具特异性的重复序列(DR1~DR3);CRISPR最长达2853bp,最短仅101bp。对DR的二级结构预测发现,DR1~DR3均能形成回文结构,但茎环大小会有差异;在同源性比对中发现,除多数同属或同种外,供试DR还与个别远缘菌种具有高同源性,这种现象证明了供试菌株的CRISPR序列同样存在的水平基因转移,并可能存在其他的进化进程。 展开更多
关键词 嗜热链球菌 clustered regularly interspaced short palindromic repeats(crispr)检测 同源性
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AKT三种亚型基因敲除对小鼠胚胎干细胞自我更新和分化的影响
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作者 杨淇 汤帅 +5 位作者 张林林 唐午阳 豆澳祥 张宇航 李丕顺 郑晓峰 《中国生物化学与分子生物学报》 北大核心 2025年第3期426-436,共11页
AKT,又称为蛋白质激酶B(protein kinase B, PKB),在细胞增殖和代谢过程中发挥关键作用。AKT有3种亚型:AKT1、AKT2和AKT3,这3种亚型对小鼠胚胎干细胞(mouse embryonic stem cells, mESCs)多能性和分化的影响尚不明确。本研究旨在探讨AKT... AKT,又称为蛋白质激酶B(protein kinase B, PKB),在细胞增殖和代谢过程中发挥关键作用。AKT有3种亚型:AKT1、AKT2和AKT3,这3种亚型对小鼠胚胎干细胞(mouse embryonic stem cells, mESCs)多能性和分化的影响尚不明确。本研究旨在探讨AKT亚型缺失对小鼠胚胎干细胞自我更新和分化的影响。本文利用CRISPR/Cas9基因编辑技术建立AKT的3种亚型基因敲除的细胞系,通过蛋白质印迹(Western blot)、流式细胞术、qRT-PCR、CCK-8、碱性磷酸酶(alkaline phosphatase, AP)染色和RNA-seq对其表型和分子变化进行分析。Akt的3种亚型基因敲除的细胞系构建成功,Akt1和Akt2的缺失会抑制小鼠胚胎干细胞的增殖,Akt任意一种亚型的缺失不会影响多能性基因在mRNA水平和蛋白质水平的表达,但在拟胚体形成过程中,Akt的3种亚型的缺失均会影响3个胚层基因的mRNA水平表达。转录物组分析结果表明,与野生型mESCs相比,Akt1、Akt2和Akt3缺失后分别有995、547和429个差异表达基因(|log2FC|≧1,P<0.05),这3种亚型调控的差异表达基因存在部分重叠。综上,Akt的3种亚型的独立缺失不影响小鼠胚胎干细胞干性的维持,但是他们对于分化至关重要。Akt的3种亚型可以共同调控基因的表达,同时也保留了各自的调控特异性。本研究为理解Akt的3种亚型在干细胞生物学中的独特和重叠作用提供了基础,突显了它们在维持干细胞功能和分化中的重要性。 展开更多
关键词 小鼠胚胎干细胞 AKT亚型 多能性 crispr/Cas9 RNA测序
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乳酸菌CRISPR-Cas系统同源性分析
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作者 李婉 张丹青 +1 位作者 王娜娜 霍贵成 《食品工业科技》 CAS CSCD 北大核心 2016年第11期134-140,146,共8页
CRISPR-Cas系统为乳酸菌抵抗噬菌体等外源基因元件提供获得性免疫,利用生物信息学方法分析了CRISPR序列及cas基因在乳酸菌种间的同源性关系。利用生物信息学方法预测NCBI中已测序的部分乳酸菌所含CRISPRCas系统,并对重复序列和Cas蛋白... CRISPR-Cas系统为乳酸菌抵抗噬菌体等外源基因元件提供获得性免疫,利用生物信息学方法分析了CRISPR序列及cas基因在乳酸菌种间的同源性关系。利用生物信息学方法预测NCBI中已测序的部分乳酸菌所含CRISPRCas系统,并对重复序列和Cas蛋白序列进行系统发生学分析。结果显示,嗜热链球菌、德氏乳杆菌和瑞士乳杆菌标准菌株均含不同数目的 CRISPR-Cas系统,各类型的重复序列高度保守,Cas蛋白序列同源性较高。CRISPR-Cas系统的同源性与其亚型密切相关,而与菌种亲缘关系有较大差异,证明了CRISPR-Cas系统能够通过基因水平转移传播这一结论。 展开更多
关键词 乳酸菌 clustered regularly interspaced short palindromic repeats(crispr)-Cas系统 同源性 重复序列 间隔序列
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