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培养组学在动物肠道微生物应用的研究进展 被引量:3
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作者 邱菲 韩依辛 +5 位作者 魏琦麟 唐兴刚 袁明贵 董博 向蓉 徐志宏 《中国畜牧兽医》 CAS CSCD 北大核心 2023年第2期598-605,共8页
肠道微生物被称为动物的“隐藏免疫器官”,不仅能参与宿主代谢还能影响宿主的免疫系统,对维持机体健康至关重要。作者主要介绍了培养组学的发展历程及其对动物肠道微生物研究的重要意义、传统微生物培养方法和分子生物学方法在研究微生... 肠道微生物被称为动物的“隐藏免疫器官”,不仅能参与宿主代谢还能影响宿主的免疫系统,对维持机体健康至关重要。作者主要介绍了培养组学的发展历程及其对动物肠道微生物研究的重要意义、传统微生物培养方法和分子生物学方法在研究微生物时各自的优、缺点。培养组学是基于传统微生物培养方法同时采用多种培养条件进行微生物培养,再辅以基质辅助激光解吸电离飞行时间质谱(MALDI-TOF MS)和16S rRNA基因测序技术建立的一种新型微生物分离、鉴定方法,该方法将传统微生物培养技术与分子生物学技术的优点融为一体。该方法在挖掘“新微生物”的研究中,具有发现、找到并获得的优势;在微生物的研究中可定制分离目标菌株进行验证,并能通过丰富注释清楚地了解肠道微生物组。此外,分析了培养组学分别在家禽肠道、猪肠道、反刍动物肠道等动物肠道的研究应用现状,提出了环境条件对肠道微生物的影响,如人类接触对肠道菌群的影响、同物种不同性别肠道菌群的差异,以期为培养组学在动物肠道微生物的研究运用中提供参考。 展开更多
关键词 动物肠道微生物 培养组学 消化道 分子生物
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Disruption of bacterial balance in the gut of Portunus trituberculatus induced by Vibrio alginolyticus infection 被引量:4
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作者 XIA Mengjie PEI Feng +2 位作者 MU Changkao YE Yangfang WANG Chunlin 《Journal of Oceanology and Limnology》 SCIE CAS CSCD 2018年第5期1891-1898,共8页
A bstract Gut microbiota impacts the health of crustaceans. V ibrio alginolyticus is a main causative pathogen that induces the vibriosis in farmed swimming crabs, Portunus trituberculatus. However, it remains unknown... A bstract Gut microbiota impacts the health of crustaceans. V ibrio alginolyticus is a main causative pathogen that induces the vibriosis in farmed swimming crabs, Portunus trituberculatus. However, it remains unknown whether gut bacteria perform functions during the progression of vibriosis. In this study, 16 SrRNA gene amplicon sequencing was used to investigate temporal alteration of gut bacterial community in swimming crabs in response to 72-h V. alginolyticus challenge. Our results show that V. alginolyticus infection resulted in dynamic changes of bacterial community composition in swimming crabs. Such changes were highlighted by the overwhelming overabundance of V ibrio and a significant fluctuation in the gut bacteria including the bacteria with high relative abundance and especially those with low relative abundance. These findings reveal that crab vibriosis gradually develops with the infection time of V. alginolyticus and tightly relates to the dysbiosis of gut bacterial community structure. This work contributes to our appreciation of the importance of the balance of gut bacterial community structure in maintaining the health of crustaceans. 展开更多
关键词 Portunus trituberculatus Vibrio alginolyticus gut bacterial community composition 16S rRNA gene amplicon sequencing
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