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血清嘌呤能受体P2X7及YTH结构域N6-甲基腺苷RNA结合蛋白2与急性缺血性脑卒中患者静脉溶栓后出血转化的关系研究
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作者 陈静 张淼 +2 位作者 张彧 胡月梅 董素娟 《中国医药》 2025年第1期58-62,共5页
目的探讨血清嘌呤能受体P2X7(P2RX7)及YTH结构域N6-甲基腺苷RNA结合蛋白2(YTHDF2)与急性缺血性脑卒中(AIS)患者静脉溶栓后出血转化的关系。方法选取2020年1月至2023年12月陕西省康复医院收治的192例AIS患者作为AIS组(溶栓后又分为出血... 目的探讨血清嘌呤能受体P2X7(P2RX7)及YTH结构域N6-甲基腺苷RNA结合蛋白2(YTHDF2)与急性缺血性脑卒中(AIS)患者静脉溶栓后出血转化的关系。方法选取2020年1月至2023年12月陕西省康复医院收治的192例AIS患者作为AIS组(溶栓后又分为出血转化组和非出血转化组),另选取同时段150名体检健康者作为对照组。采用酶联免疫吸附试验法检测血清P2RX7、YTHDF2水平。以静脉溶栓后出血转化为因变量,建立Logistic回归模型,确定AIS患者静脉溶栓后出血转化的相关因素,绘制受试者工作特征曲线,评价血清P2RX7、YTHDF2水平对出血转化的预测价值。结果AIS组血清P2RX7、YTHDF2水平均高于对照组[(1.6±0.3)μg/L比(1.2±0.3)μg/L、(1.32±0.26)μg/L比(1.03±0.16)μg/L](均P<0.001)。出血转化组血清P2RX7、YTHDF2水平高于非出血转化组(均P<0.001)。多因素Logistic回归分析模型结果显示,美国国立卫生研究院卒中量表评分高、心源性栓塞、P2RX7水平高、YTHDF2水平高为AIS患者静脉溶栓后出血转化的独立危险因素(均P<0.05)。血清P2RX7联合YTHDF2预测出血转化的曲线下面积为0.886,大于P2RX7、YTHDF2单独预测的0.780、0.784(均P<0.001)。结论血清P2RX7、YTHDF2水平升高是AIS患者静脉溶栓后出血转化的独立危险因素,血清P2RX7联合YTHDF2检测对其有较高的预测价值。 展开更多
关键词 急性缺血性脑卒中 嘌呤能受体P2X7 YTH结构域N6-甲基腺苷rna结合蛋白2 静脉溶栓 出血转化
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抑制lncRNA TUG1下调核苷酸结合寡聚结构域样受体蛋白1炎症小体在延缓阿尔茨海默病进展的作用 被引量:1
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作者 马婷婷 陈建红 +1 位作者 刘爱翠 李海宁 《解剖学报》 CAS CSCD 2024年第1期32-42,共11页
目的探讨敲低长链非编码RNA(lncRNA)牛磺酸上调基因1(TUG1)抑制核苷酸结合寡聚结构域样受体蛋白1(NLRP1)炎症小体在缓解阿尔茨海默病进展中的作用。方法选取9~10周龄遗传背景为C57/BL6的野生型小鼠(WT组,10只)或淀粉样前体蛋白(APP)/早... 目的探讨敲低长链非编码RNA(lncRNA)牛磺酸上调基因1(TUG1)抑制核苷酸结合寡聚结构域样受体蛋白1(NLRP1)炎症小体在缓解阿尔茨海默病进展中的作用。方法选取9~10周龄遗传背景为C57/BL6的野生型小鼠(WT组,10只)或淀粉样前体蛋白(APP)/早老素1(PS1)转基因小鼠(30只)。APP/PS1转基因小鼠随机分为模型(model)组,模型+敲低lncRNA TUG1组[model+lncRNA TUG1短发夹RNA(shRNA)组]和model+shRNA非靶标(NT)组,每组10只。分别采集12周龄第1天(3月龄)和32周龄第1天(8月龄)小鼠外周血和脑皮质组织,并分离皮质中的原代小胶质细胞和原代星形胶质细胞,每个时间点每组5只小鼠。Real-time PCR分别测定3月龄和8月龄上述4个分组小鼠脑皮质组织和原代小胶质细胞中lncRNA TUG1和巨噬细胞移动抑制因子(MIF)mRNA的水平,以及原代星形胶质细胞中补体蛋白C1r和C1s mRNA的水平。ELISA法测定其外周血浆中MIF含量。对3月龄和8月龄小鼠脑皮质原代小胶质细胞和原代星形胶质细胞共培养。CCK-8法测定上述2种细胞的增殖能力。Western blotting分别测定3月龄和8月龄上述4个分组小鼠脑皮质组织中MIF、白细胞介素1β前体(pro-IL-1β)、凋亡相关斑点样蛋白(ASC)、Caspase-1(p20)、Caspase-1(full)、NLRP1及NLRP3蛋白的表达水平。采用免疫荧光染色法测定8月龄各分组小鼠脑皮质组织中β淀粉样蛋白(Aβ)表达。结果3月龄和8月龄时,与WT组小鼠相比,model组小鼠脑皮质组织和原代小胶质细胞中lncRNA TUG1和MIF相对表达水平显著上调,原代小胶质细胞和原代星形胶质细胞增殖能力增强(P<0.05)。与model组相比,model+lncRNA TUG1 shRNA组小鼠脑皮质组织和原代小胶质细胞中lncRNA TUG1和MIF的相对表达水平显著降低,原代小胶质细胞和原代星形胶质细胞增殖能力降低(P<0.05)。与WT组相比,model组小鼠外周血浆中MIF含量显著升高;小鼠脑皮质组织中pro-IL-1β、ASC、Caspase-1(p20)、Caspase-1(full)、NLRP1以及NLRP3的蛋白表达水平显著升高;Aβ免疫荧光强度明显增强(P<0.05)。与model组相比,model+lncRNA TUG1 shRNA组小鼠外周血浆中MIF含量显著降低;小鼠脑皮质组织中pro-IL-1β、ASC、Caspase-1(p20)、Caspase-1(full)和NLRP1的蛋白表达水平显著降低,Aβ免疫荧光强度明显降低(P<0.05),而NLRP3蛋白质的表达水平无明显变化(P>0.05)。与model组相比,model+shRNA NT组小鼠上述所有检测指标差异均无显著性(P>0.05)。结论APP/PS1转基因小鼠脑皮质组织和原代小胶质细胞中lncRNA TUG1和MIF因子表达上调与脑皮质内NLRP1炎症小体激活成正相关,敲低lncRNA TUG1可缓解阿尔茨海默病的进展。 展开更多
关键词 阿尔茨海默病 长链非编码rna 牛磺酸上调基因1 巨噬细胞移动抑制因子 核苷酸结合寡聚结构域样受体蛋白1 免疫印迹法 小鼠
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敲低YTH结构域N^6甲基腺嘌呤(m^6A)RNA结合蛋白2(YTHDF2)抑制宫颈癌细胞增殖并促进其凋亡 被引量:10
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作者 李子玮 罗清雅 +4 位作者 王浩丞 刘毅 冯小玲 李真子 易萍 《细胞与分子免疫学杂志》 CAS CSCD 北大核心 2020年第3期255-263,共9页
目的探讨敲低YTH结构域N^6甲基腺嘌呤(m^6A)RNA结合蛋白2(YTHDF2)对人宫颈癌细胞增殖、周期和凋亡的影响。方法利用人蛋白图谱(Human Protein Atlas)数据库分析YTHDF2在宫颈癌中表达及与生存时间的关系。收集宫颈癌和正常宫颈组织各31例... 目的探讨敲低YTH结构域N^6甲基腺嘌呤(m^6A)RNA结合蛋白2(YTHDF2)对人宫颈癌细胞增殖、周期和凋亡的影响。方法利用人蛋白图谱(Human Protein Atlas)数据库分析YTHDF2在宫颈癌中表达及与生存时间的关系。收集宫颈癌和正常宫颈组织各31例,采用免疫组织化学法检测YTHDF2的蛋白表达差异;利用敲低YTHDF2的短发夹RNA(shRNA)及空载质粒包装慢病毒,并感染至宫颈癌HeLa细胞和SiHa细胞,实时荧光定量PCR及Western blot法检测YTHDF2的mRNA及蛋白水平,敲低YTHDF2后,采用CCK-8法检测细胞增殖活性,集落形成实验检测细胞集落形成能力;流式细胞术检测细胞周期和细胞凋亡情况。结果检测数据库发现YTHDF2在宫颈癌中表达越高生存时间越短,与正常宫颈组织相比,YTHDF2在宫颈癌组织高表达。敲低YTHDF2后,抑制宫颈癌细胞增殖,促进细胞凋亡,使细胞阻滞于S期。结论YTHDF2在宫颈癌组织中高表达,敲低后抑制宫颈癌细胞增殖并促进其凋亡。 展开更多
关键词 YTH结构域N^6甲基腺嘌呤rna结合蛋白2(YTHDF2) 宫颈癌 HeLa/SiHa细胞 细胞增殖 细胞凋亡
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水稻双链RNA结合蛋白同源基因OsRBP的克隆及其表达的分析 被引量:17
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作者 唐向荣 吴昊 +2 位作者 贾明 余旭红 何玉科 《植物生理与分子生物学学报》 CAS CSCD 2002年第1期41-45,共5页
在基因数据库中发现两个水稻EST片段与大白菜BcpLH基因的双链RNA结合结构域 (dsRBD)有同源的区域 ,根据同源片段的位置特征设计引物 ,用RT-RCR扩增粳稻 (Oryzasativasubsp .japonica)愈伤组织的cDNA ,得到大小为 1.8kb的DNA片段。该cDN... 在基因数据库中发现两个水稻EST片段与大白菜BcpLH基因的双链RNA结合结构域 (dsRBD)有同源的区域 ,根据同源片段的位置特征设计引物 ,用RT-RCR扩增粳稻 (Oryzasativasubsp .japonica)愈伤组织的cDNA ,得到大小为 1.8kb的DNA片段。该cDNA片段含完整的编码区 ,有两个典型的dsRBD ,分别与BcpLH的dsRBD在氨基酸水平上同源性为 75 %左右 ,故将其命名为OsRBP。RT -PCR表达分析显示该基因在未成熟的种子和愈伤组织中表达 ,在根、茎、叶、穗、成熟种子及胚芽鞘中没有表达信号 ,由此推测该基因的表达可能与种子和胚的早期发育相关。该研究首次从水稻中分离到双链RNA结合蛋白基因 ,并初步研究了其表达方式 。 展开更多
关键词 水稻 双链rna结合蛋白 RT-PCR OsRBP 基因克隆 基因表达
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拟南芥AtGrp7 RRM结构域的纯化及其结构与结合的初步分析(英文)
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作者 迟秀娟 乔晓亚 +4 位作者 刘颖 刘惠丽 陈雷 王际辉 艾选军 《波谱学杂志》 CAS 北大核心 2019年第1期1-14,共14页
富含甘氨酸的RNA结合蛋白AtGrp7是拟南芥(Arabidopsis thaliana)调节生物钟负反馈回路的组分.在使用常规方法纯化AtGrp7 RRM结构域的初始试验中,观察到烟草蚀纹病毒(TEV)酶切后AtGrp7 RNA识别基序(RRM)结构域的紫外吸收峰为蛋白和杂质... 富含甘氨酸的RNA结合蛋白AtGrp7是拟南芥(Arabidopsis thaliana)调节生物钟负反馈回路的组分.在使用常规方法纯化AtGrp7 RRM结构域的初始试验中,观察到烟草蚀纹病毒(TEV)酶切后AtGrp7 RNA识别基序(RRM)结构域的紫外吸收峰为蛋白和杂质的混合信号峰.为解决常规纯化中的杂质问题,对AtGrp7_(1-90)应用了变性-复性两步纯化方法. AtGrp7 RRM结构域的~1H-^(15)N HSQC指纹谱和CS-Rosetta模型结构表明快速稀释重折叠后其结构完全恢复.等温滴定量热法(ITC)和核磁共振(NMR)滴定实验进一步证实,重折叠后AtGrp7_(1-90) RRM结构域具有正确结合RNA/DNA的功能. 展开更多
关键词 变性-复性 快速稀释 核磁共振(NMR) AtGrp7 rna识别基序(RRM)结构域 结合分析
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双链RNA结合蛋白ILF3在神经系统疾病中的研究进展
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作者 贾晋婧 孙静 薛群 《中国血液流变学杂志》 CAS 2021年第4期587-592,共6页
白介素增强结合因子3(ILF3)通过双链RNA结合序(dsRBM)及其他结构域与RNA进行结合,参与了RNA转录、翻译、编辑和运输等相关过程,基是重要的RNA调控蛋白。在神经系统相关领域的研究中发现,ILF3与胚胎神经系统的发生、正常结构和功能的维... 白介素增强结合因子3(ILF3)通过双链RNA结合序(dsRBM)及其他结构域与RNA进行结合,参与了RNA转录、翻译、编辑和运输等相关过程,基是重要的RNA调控蛋白。在神经系统相关领域的研究中发现,ILF3与胚胎神经系统的发生、正常结构和功能的维持存在密切联系,同时与众多神经系统疾病如退行性病变、缺血缺氧损伤、病毒感染、肿瘤或精神障碍等也具有相关性。该文着重回顾了ILF3蛋白在神经领域中的研究进展,希望对相关神经系统疾病的干预研究提供思路。 展开更多
关键词 ILF3 双链rna结合基序 神经系统
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真核蛋白质中G-patch结构域的结构和功能研究
7
作者 雷燕 张彦 《生命的化学》 CAS CSCD 北大核心 2008年第1期47-50,共4页
G-patch是广泛存在真核生物蛋白质中的保守结构域,含有六个高度保守的甘氨酸残基,推测它是一种RNA结合结构域,其功能与RNA代谢有关。
关键词 G—patch rna结合结构域
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lncRNA HAGLR促卵巢癌细胞生长和上皮-间充质转化的机制研究 被引量:1
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作者 李俊 王晓黎 +1 位作者 俞岩 周俏苗 《局解手术学杂志》 2024年第6期491-496,共6页
目的研究长链非编码RNA同源盒D基因簇反义生长相关长链非编码RNA(lncRNA HAGLR)通过调控核苷酸结合寡聚化结构域样受体家族pyrin结构域蛋白3(NLRP3)炎症小体对卵巢癌细胞生长和上皮-间充质转化(EMT)的调控作用。方法培养卵巢正常细胞IOS... 目的研究长链非编码RNA同源盒D基因簇反义生长相关长链非编码RNA(lncRNA HAGLR)通过调控核苷酸结合寡聚化结构域样受体家族pyrin结构域蛋白3(NLRP3)炎症小体对卵巢癌细胞生长和上皮-间充质转化(EMT)的调控作用。方法培养卵巢正常细胞IOSE-80(IOSE-80组)以及卵巢癌细胞A2780(A2780组)。然后将A2780随机分为lncRNA HAGLR沉默组(siHAGLR组)、沉默阴性对照组(siNC组)、siHAGLR联合NLRP3抑制剂MCC950处理组(siHAGLR+MCC950组)。qRT-PCR法检测lncRNA HAGLR的表达。Western blot检测NLRP3炎症小体相关蛋白NLRP3、caspase-1、ASC和EMT相关蛋白Vimentin、Snail1、α-SMA、Twist1的表达。CCK-8法检测A2780细胞的增殖活性。Transwell法检测A2780细胞的迁移和侵袭能力。细胞克隆形成实验检测A2780细胞的生长能力。TUNEL染色检测A2780细胞的凋亡。结果与IOSE-80组相比,A2780组lncRNA HAGLR、Vimentin、Snail1、α-SMA、Twist1表达均上调(P<0.05),但NLRP3、caspase-1、ASC的表达均下调(P<0.05)。与siNC组相比,siHAGLR组的lncRNA HAGLR、Vimentin、Snail1、α-SMA、Twist1表达均下调(P<0.05),但NLRP3、caspase-1、ASC的表达均上调(P<0.05),细胞增殖率、细胞克隆数以及迁移和侵袭数均明显减少(P<0.05),细胞凋亡数则增加(P<0.05)。与siHAGLR组相比,siHAGLR+MCC950组的lncRNA HAGLR表达无明显变化(P>0.05),而Vimentin、Snail1、α-SMA、Twist1表达均上调(P<0.05),但NLRP3、caspase-1、ASC的表达均下调(P<0.05),细胞增殖率、细胞克隆数以及迁移和侵袭数均显著增加(P<0.05),细胞凋亡数则减少(P<0.05)。结论lncRNA HAGLR通过抑制NLRP3炎症小体促进卵巢癌细胞的生长和EMT。 展开更多
关键词 长链非编码rna同源盒D基因簇反义生长相关长链非编码rna 核苷酸结合寡聚化结构域样受体家族pyrin结构域蛋白3 炎症小体 卵巢癌细胞 上皮-间充质转化
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多聚胞嘧啶结合蛋白结构与功能研究进展 被引量:1
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作者 徐荣发 周阳 +1 位作者 刘海涛 施海峰 《生物学杂志》 CAS CSCD 2015年第5期76-79,共4页
Poly(c)-结合蛋白[Poly(c)-binding proteins,PCBPs]是RNA结合蛋白的重要分支,包含与核不均一蛋白hnRNP K同源的KH(the K homology domain)结构域,该结构域可识别并结合RNA。以PCBP1为例,它的KH结构域内,KH1与KH2之间的连接区均存在相... Poly(c)-结合蛋白[Poly(c)-binding proteins,PCBPs]是RNA结合蛋白的重要分支,包含与核不均一蛋白hnRNP K同源的KH(the K homology domain)结构域,该结构域可识别并结合RNA。以PCBP1为例,它的KH结构域内,KH1与KH2之间的连接区均存在相对集中的纯化选择位点。PCBP能够在转录水平调控多种基因的表达并调控mRNA的稳定性,如对遗传性乳腺卵巢癌易感基因brca1(breast cancer 1,early onset)、细胞周期依赖性激酶抑制因子p21等的调控。近年来,PCBP作为铁的分子伴侣,与铁蛋白(Ferritin)、二价金属转运因子(DMT1)、铁转运蛋白(Ferroportin)、脱氧辅蛋白羟化酶(Deoxyhypusine hydroxylase,DOHH)相互作用,参与细胞内铁代谢成为研究热点。对PCBP调节多个基因转录、mRNA稳定性及在铁代谢中的最新研究进展进行综述。 展开更多
关键词 rna结合蛋白 KH结构域 mrna DMT1 铁代谢
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直肠癌组织中YTHDF2、lncRNA TUSC7表达与上皮间质转化的关系及预后意义
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作者 郭庆金 任维聃 +2 位作者 刘桂伟 冶浩鹏 杨立胜 《国际检验医学杂志》 CAS 2024年第14期1775-1779,共5页
目的研究直肠癌组织中YTH结构域N6-甲基腺嘌呤RNA结合蛋白2(YTHDF2)、长链非编码RNA抑癌候选基因7(lncRNA TUSC7)表达与上皮间质转化(EMT)的关系及临床预后意义。方法选取该院自2018年5月至2020年5月诊治的98例直肠癌患者。采用实时荧... 目的研究直肠癌组织中YTH结构域N6-甲基腺嘌呤RNA结合蛋白2(YTHDF2)、长链非编码RNA抑癌候选基因7(lncRNA TUSC7)表达与上皮间质转化(EMT)的关系及临床预后意义。方法选取该院自2018年5月至2020年5月诊治的98例直肠癌患者。采用实时荧光定量PCR检测直肠癌组织和癌旁组织中YTHDF2、lncRNA TUSC7表达及EMT相关指标β-连环素(β-catenin)、E-钙黏蛋白(E-cad)、N-钙黏蛋白(N-cad)mRNA的表达。采用Pearson法分析YTHDF2 mRNA、lncRNA TUSC7与EMT相关指标的相关性。采用Kaplan-Meier曲线分析YTHDF2、lncRNA TUSC7表达对直肠癌无瘤生存预后的影响。采用多因素COX回归分析直肠癌无瘤生存预后的影响因素。结果直肠癌组织中YTHDF2、β-catenin、N-cad mRNA相对表达水平高于癌旁组织,而lncRNA TUSC7、E-cad mRNA相对表达水平低于癌旁组织(均P<0.05)。直肠癌组织中YTHDF2 mRNA与β-catenin、N-cad mRNA表达呈正相关(均P<0.05),与E-cad mRNA表达呈负相关(均P<0.05);lncRNA TUSC7与β-catenin、N-cad mRNA表达呈负相关(均P<0.05),与E-cad mRNA表达呈正相关(均P<0.05)。直肠癌组织中YTHDF2 mRNA与lncRNA TUSC7表达呈负相关(P<0.05)。直肠癌组织中YTHDF2 mRNA、lncRNA TUSC7与TNM分期Ⅲ期、肿瘤分化程度及淋巴结转移有关(均P<0.05)。YTHDF2高、低表达组3年无瘤生存率分别为59.57%(28/47)、88.24%(45/51)。lncRNA TUSC7高、低表达组3年无瘤生存率分别为88.00%(44/50)、60.42%(29/48)。YTHDF2高表达组3年累积无瘤生存率低于YTHDF2低表达组(Log Rankχ^(2)=11.370,P=0.001)。lncRNA TUSC7高表达组3年累积无瘤生存率高于lncRNA TUSC7低表达组(Log Rankχ^(2)=11.880,P=0.001)。TNM分期Ⅲ期、低分化程度、合并淋巴结转移、YTHDF2高表达、lncRNA TUSC7低表达是直肠癌患者无瘤生存预后的独立危险因素(均P<0.05)。结论直肠癌组织中YTHDF2表达上调,lncRNA TUSC7表达下调,二者与不良临床病理特征及EMT有关,是新的评估直肠癌患者预后的标志物。 展开更多
关键词 直肠癌 YTH结构域N6-甲基腺嘌呤rna结合蛋白2 长链非编码rna抑癌候选基因7 上皮间质转化 预后
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番茄双链RNA绑定蛋白(SlDRB)基因家族鉴定及抗TYLCV防御反应分析
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作者 黄鑫 方远鹏 +3 位作者 岳宁波 张龙 吴丹 李云洲 《核农学报》 CAS CSCD 北大核心 2022年第2期291-301,共11页
番茄生产是现代蔬菜生产的主导产业,因经济价值高,成为乡村振兴的优势产业。然而番茄生产大多面临番茄黄化曲叶病毒(TYLCV)和其他病毒的严重威胁。最新研究发现双链RNA结合蛋白(DRB)在植物RNA干扰(RNAi)抗病毒通路中发挥重要作用。为探... 番茄生产是现代蔬菜生产的主导产业,因经济价值高,成为乡村振兴的优势产业。然而番茄生产大多面临番茄黄化曲叶病毒(TYLCV)和其他病毒的严重威胁。最新研究发现双链RNA结合蛋白(DRB)在植物RNA干扰(RNAi)抗病毒通路中发挥重要作用。为探究番茄DRB(SlDRB)基因抗TYLCV防御反应,本研究通过生物信息学方法鉴定并分析番茄DRB基因的基础性质,包括DRB基因家族进化树、基因结构和基因染色体上的位置、保守基序、组织特异性表达等,同时利用实时荧光定量(qRT-PCR)技术检测SlDRB基因家族对TYLCV的防御反应。结果表明,番茄含有8个SlDRB基因家族成员,分布于6条染色体上,其中3个SlDRB基因位于1号染色体。番茄DRB家族可分出3个亚族,即DRB2/3、DRB6/7和DRB1/4/5/8,不同的亚族内含子数量和蛋白结构分布有所差异。亚细胞定位结果表明SlDRB1、SlDRB5、SlDRB6、SlDRB7和SlDRB8定位于胞外,SlDRB2和SlDRB3定位于细胞质,SlDRB4定位于细胞核。不同SlDRB基因的组织特异性表达差异明显,但是在叶片组织中大多数SlDRB基因表达相对适中,在根、花、果组织中多数基因表达水平相对较高。所有SlDRB基因在番茄受TYLCV侵染后表达水平均有升高,根据表达趋势分为四类:第一类基因SlDRB7、SlDRB8,表达水平持续上调;第二类基因SlDRB2、SlDRB3,在病毒接种第7天表达上调,在第14天下调;第三类基因SlDRB1、SlDRB4,仅在病毒侵染7 d表达上调;第四类基因SlDRB5、SlDRB6,仅在病毒侵染14 d表达上调。本研究在番茄上鉴定了8个SlDRB基因,并明确了该基因参与植株抗病毒的防御反应,为研究SlDRB在番茄RNAi抗病毒中的功能与作用奠定了基础。 展开更多
关键词 番茄 抗病毒 双链rna结合蛋白(DRB) 生物信息学 表达分析
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血清circSHKBP1、SOX3 mRNA表达与晚期胃癌患者临床病理特征及化疗疗效的关系
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作者 刘鑫佳 王凯瑞 +2 位作者 杨光 杨静 张燕 《疑难病杂志》 CAS 2024年第12期1460-1465,共6页
目的研究环状RNA SH3结构域激酶结合蛋白1(circSHKBP1)、SRY-box转录因子3(SOX3)mRNA表达与晚期胃癌患者化疗疗效和预后的关系。方法选取2019年1月—2021年2月空军军医大学唐都医院肿瘤科收治的晚期胃癌患者104例为研究组,根据化疗疗效... 目的研究环状RNA SH3结构域激酶结合蛋白1(circSHKBP1)、SRY-box转录因子3(SOX3)mRNA表达与晚期胃癌患者化疗疗效和预后的关系。方法选取2019年1月—2021年2月空军军医大学唐都医院肿瘤科收治的晚期胃癌患者104例为研究组,根据化疗疗效分为化疗敏感亚组64例和化疗抵抗亚组40例;选取同期健康体检者50例为健康对照组。采用实时荧光定量PCR检测各组血清circSHKBP1、SOX3 mRNA水平;分析血清circSHKBP1、SOX3 mRNA表达与晚期胃癌患者临床病理特征的关系;多因素Logistic回归分析影响化疗疗效的因素;受试者工作特征(ROC)曲线分析血清circSHKBP1、SOX3 mRNA对晚期胃癌患者化疗疗效的评估价值。结果研究组血清circSHKBP1、SOX3 mRNA表达高于健康对照组(t/P=65.118/<0.001、51.471/<0.001)。肿瘤分期Ⅳ期、低分化晚期胃癌患者血清circSHKBP1、SOX3 mRNA表达高于肿瘤分期ⅢB期、高中分化的患者(circSHKBP1:t/P=37.283/<0.001、31.545/<0.001;SOX3:t/P=19.169/<0.001、26.334/<0.001)。化疗抵抗亚组肿瘤分期Ⅳ期百分比,血清circSHKBP1、SOX3 mRNA表达高于化疗敏感亚组(t/P=10.037/0.002,48.609/<0.001,26.775/<0.001)。肿瘤分期Ⅳ期及血清circSHKBP1、SOX3 mRNA高表达是影响晚期胃癌化疗抵抗的危险因素[OR(95%CI)=1.594(1.252~2.028),1.306(1.144~1.492),1.603(1.190~2.160)]。circSHKBP1、SOX3 mRNA及二者联合预测晚期胃癌患者化疗疗效的AUC分别为0.844、0.851、0.922,二者联合优于各自单独预测效能(Z/P=4.745/<0.001、4.310/<0.001)。结论晚期胃癌患者血清circSHKBP1、SOX3 mRNA表达升高,且均与肿瘤分化程度,肿瘤分期及化疗疗效有关,两者联合对晚期胃癌患者化疗疗效有较好的评估价值。 展开更多
关键词 胃癌晚期 环状rna SH3结构域激酶结合蛋白1 SRY-box转录因子3 化疗疗效
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真核生物中锌指蛋白的结构与功能 被引量:35
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作者 李晓波 张俊武 《中国生物化学与分子生物学报》 CAS CSCD 北大核心 2009年第3期206-211,共6页
真核生物中的许多蛋白质分子包含锌指结构区,这类蛋白称为锌指蛋白.锌指蛋白因其包含特殊的指状结构,在对DNA、蛋白质和RNA的识别和结合中起重要作用.许多锌指蛋白的锌指结构域包含能与DNA特异结合的区域,并与某些效应结构域(如KRAB、S... 真核生物中的许多蛋白质分子包含锌指结构区,这类蛋白称为锌指蛋白.锌指蛋白因其包含特殊的指状结构,在对DNA、蛋白质和RNA的识别和结合中起重要作用.许多锌指蛋白的锌指结构域包含能与DNA特异结合的区域,并与某些效应结构域(如KRAB、SCAN、BTB/POZ、SNAG、SANT和PLAG等)相连,这类锌指蛋白常作为转录因子起作用,可调控靶基因的转录.一些锌指蛋白包含蛋白质识别结构域(如LIM锌指、MYND锌指、PHD锌指和RING锌指等),它们能够特异地介导蛋白质之间的相互作用,因此被称作蛋白适配器.此外,某些锌指蛋白还可以结合RNA,起转录后调控作用.本文就锌指蛋白与DNA、RNA以及蛋白质分子间的相互作用作一综述. 展开更多
关键词 锌指蛋白 功能结构域 转录因子 蛋白质适配器 rna结合
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lncRNA SH3BP5-AS1单核苷酸多态性与中国汉族人缺血性中风血瘀证显著相关 被引量:3
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作者 古联 陈敏丽 +5 位作者 郭晓婧 林爱桃 宋潇宵 陈卓 黄先利 苏莉 《中华中医药学刊》 CAS 北大核心 2022年第4期6-10,共5页
目的研究旨在探讨中国汉族人群中lncRNA SH3BP5-AS1多态性rs11713836与缺血性中风(ischemic stroke,IS)遗传易感性及中医证候的关系。方法研究包括774例IS患者和793例对照组。采用Massarray SNP基因分型方法进行基因分型。采用《中风病... 目的研究旨在探讨中国汉族人群中lncRNA SH3BP5-AS1多态性rs11713836与缺血性中风(ischemic stroke,IS)遗传易感性及中医证候的关系。方法研究包括774例IS患者和793例对照组。采用Massarray SNP基因分型方法进行基因分型。采用《中风病中医辨证诊断标准》量表对IS患者进行中医证候鉴定。所有统计分析采用SPSS 17.0统计软件进行。结果在隐性模型下,lncRNA SH3BP5-AS1多态性rs11713836与缺血性中风血瘀证显著相关[OR(95%CI)=0.52(0.29-0.93),P=0.028],在校正了包括性别和年龄在内的协变量后,结果依然有统计学意义;而rs11713836与缺血性中风易感性及风、痰、火热、气虚证等中医证候易感性无相关性。此外,rs11713836与血清APO-B[隐性模型:OR(95%CI)=0.09(0.02-0.17),P=0.032]、VLDL[加性模型:OR(95%CI)=0.09(0.04-0.14),P<0.001;显性模型:OR(95%CI)=0.09(0.02-0.16),P=0.011;隐性模型:OR(95%CI)=0.19(0.09-0.30),P<0.001]、TG[加性模型:OR(95%CI)=0.15(0.05-0.24),P=0.003;显性模型:OR(95%CI)=0.14(0.01-0.27),P=0.041;隐性模型:OR(95%CI)=0.31(0.11-0.50),P=0.003]、FIB[显性模型:OR(95%CI)=0.20(0.04-0.35),P=0.012]显著相关,调整性别年龄后以上关联依然有统计学意义。结论lncRNA SH3BP5-AS1多态性rs11713836可能影响缺血性中风血瘀证的发生,有望作为缺血性中风血瘀证的生物标志物与潜在治疗靶点,并且可能影响缺血性中风患者的血脂代谢和凝血功能。 展开更多
关键词 SH3结构域结合蛋白5反义rna1 缺血性中风 单核苷酸多态性 中医证候 同病异证
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用酵母单杂交系统筛选人IL-2Rα基因NIRS元件结合蛋白的cDNA
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作者 盛德乔 陆瑜 +2 位作者 李宏帆 吴宁华 沈珝琲 《基础医学与临床》 CSCD 北大核心 2005年第3期214-218,共5页
目的筛选与白细胞介素2受体(IL2R)α基因NIRS元件相互作用的结合蛋白。方法采用酵母单杂交体系从HTLV1转化的人外周血淋巴细胞MATCHMAKERcDNA文库中筛选与NIRS相互作用的蛋白。结果经过筛选并排除假阳性后有9个阳性克隆仍保持His+表型和... 目的筛选与白细胞介素2受体(IL2R)α基因NIRS元件相互作用的结合蛋白。方法采用酵母单杂交体系从HTLV1转化的人外周血淋巴细胞MATCHMAKERcDNA文库中筛选与NIRS相互作用的蛋白。结果经过筛选并排除假阳性后有9个阳性克隆仍保持His+表型和βgal活性;测序后分析发现它们分别属于4个不同蛋白的cDNA克隆。其中一个是已知的反式作用因子Ku抗原,另一个是RNA聚合酶Ⅰ的转录终止因子。它们的C末端分别含有SAP和SANTDNA结合结构域。结论在Jurkat细胞中存在与NIRS元件相互作用的结合蛋白,相关的研究正在进行中。 展开更多
关键词 NIRS 结合蛋白 人IL-2 筛选 Ra基因 杂交系统 酵母 白细胞介素2受体 人外周血淋巴细胞 DNA结合结构域 Jurkat细胞 相互作用 HTLV-1 cDNA文库 cDNA克隆 反式作用因子 rna聚合酶 阳性克隆 Ku抗原 杂交体 gal 假阳性 SAP C末端
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RNA和蛋白质的相互作用 被引量:1
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作者 张庆硕 王恩多 《生物化学与生物物理进展》 SCIE CAS CSCD 北大核心 1999年第2期121-121,共1页
RNA与蛋白质的相互作用是许多基本的细胞生理过程得以实现的决定性因素.近年来,随着技术的改进和新方法的建立,RNA和蛋白质的相互作用研究取得了长足进步.目前科研人员已经鉴定了许多RNA上的蛋白质结合位点,也发现了许多... RNA与蛋白质的相互作用是许多基本的细胞生理过程得以实现的决定性因素.近年来,随着技术的改进和新方法的建立,RNA和蛋白质的相互作用研究取得了长足进步.目前科研人员已经鉴定了许多RNA上的蛋白质结合位点,也发现了许多蛋白质中的RNA结合结构域,并对它们的结构特征进行了比较详细的研究.这些都为最终探明RNA和蛋白质相互作用的分子机制,从而从本质上认识相关的细胞生理过程打下了坚实的基础. 展开更多
关键词 识别 结构域 rna结合蛋白 细胞生理
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dsRNA激活肝癌细胞中TLR3-TRIF信号介导的凋亡作用 被引量:1
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作者 周虹 陈莉 《南通大学学报(医学版)》 2015年第3期178-181,共4页
目的 :利用RNAi技术下调Toll样受体(Toll-like receptor 3,TLR3)信号通路中β干扰素TIR结构域衔接蛋白(TIR-domain-containing adaptor inducing interferon-β,TRIF)的表达,探讨双链RNA(double-stranded RNA,ds RNA)激活肝细胞肝癌(hep... 目的 :利用RNAi技术下调Toll样受体(Toll-like receptor 3,TLR3)信号通路中β干扰素TIR结构域衔接蛋白(TIR-domain-containing adaptor inducing interferon-β,TRIF)的表达,探讨双链RNA(double-stranded RNA,ds RNA)激活肝细胞肝癌(hepatocellular carcinoma,HCC)细胞株(SMMC-7721)中TLR3-TRIF信号通路介导的凋亡作用。方法:分别构建靶向TRIF的小干扰RNA(small interfering RNA,si RNA)(si TRIF),激活TLR3的ds RNA(BM-06)。用BM-06和BM-06联合si TRIF(BM-06+si TRIF)分别转染SMMC-7721细胞作为实验组,同时用Poly(I:C)作为阳性对照组、未处理细胞作为阴性对照组。Western Blot检测各组靶基因TRIF的表达,实时定量聚合酶链反应(real-time quantitative polymerase chain reaction,q RT-PCR)检测凋亡相关基因Caspase3、8、9的表达,AnnexinⅤ-FITC/PI双染流式细胞术检测和Hoechst染色检测细胞凋亡率。结果:与未处理细胞相比,BM-06组和Poly(I:C)组中靶基因TRIF蛋白表达均显著增高(P<0.05),凋亡相关基因Caspase3、8 m RNA水平和细胞凋亡率显著增加(均P<0.05);Caspase9 m RNA水平略有增加,但差异无统计学意义(P>0.05);上述各结果在BM-06组和Poly(I:C)组间差异无统计学意义(P>0.05),在BM-06+si TRIF组和未处理细胞间比较差异无统计学意义(P>0.05)。结论:ds RNA激活HCC细胞中TLR3信号通路介导的细胞凋亡作用依赖于TRIF。 展开更多
关键词 肝细胞肝癌 双链rna TOLL样受体3 β干扰素TIR结构域衔接蛋白 凋亡
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锌指核糖核酸结合蛋白在恶性肿瘤相关研究中的进展 被引量:1
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作者 朱晨辉 金凤 刘歆农 《实用临床医药杂志》 CAS 2020年第12期120-124,共5页
锌指核糖核酸结合蛋白(ZFR)是一种古老的蛋白质。ZFR结构特殊,在原核生物中分布广泛。近年来,ZFR相关研究证实了ZFR是在各种恶性肿瘤中发挥作用的关键基因,其参与了恶性肿瘤的发生、进展和免疫应答等。在结直肠癌、肝细胞肝癌以及胰腺... 锌指核糖核酸结合蛋白(ZFR)是一种古老的蛋白质。ZFR结构特殊,在原核生物中分布广泛。近年来,ZFR相关研究证实了ZFR是在各种恶性肿瘤中发挥作用的关键基因,其参与了恶性肿瘤的发生、进展和免疫应答等。在结直肠癌、肝细胞肝癌以及胰腺导管腺癌中,ZFR已经被鉴定为癌症候选驱动基因。本研究对ZFR与恶性肿瘤关系的相关研究进展进行综述,分析ZFR过表达在各类癌症的恶性进展和转移扩散中的作用机制。 展开更多
关键词 锌指核糖核酸结合蛋白 恶性肿瘤 免疫应答 结构域 肝癌环状非编码rna 抑癌基因
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lncRNA MALAT1调节miR-22-3p/NLRP3轴对LPS诱导的急性肺损伤的影响 被引量:1
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作者 王小花 林坚 +4 位作者 邢东文 王华 游海星 李平 赵光峰 《广东医学》 CAS 2023年第3期297-306,共10页
目的探究长链非编码RNA MALAT1通过miR-22-3p/NLRP3信号轴促进脂多糖(lipopolysaccharide,LPS)诱导的急性肺损伤(acute lung injury,ALI)的分子机制。方法将SD大鼠随机分为假手术组、ALI组、sh-NC组、sh-MALAT1组,每组9只。通过气管内灌... 目的探究长链非编码RNA MALAT1通过miR-22-3p/NLRP3信号轴促进脂多糖(lipopolysaccharide,LPS)诱导的急性肺损伤(acute lung injury,ALI)的分子机制。方法将SD大鼠随机分为假手术组、ALI组、sh-NC组、sh-MALAT1组,每组9只。通过气管内灌注LPS法建立ALI大鼠模型,假手术组气管内灌注等量的PBS作为阴性对照,sh-NC组、sh-MALAT1组在LPS诱导前48 h,通过静脉分别注射2×10^(7) TU/mL的sh-NC慢病毒或相同剂量的sh-MALAT1慢病毒。通过HE染色法观察肺组织的组织病理学改变;通过TUNEL染色法观察肺组织的细胞凋亡情况。通过双荧光素酶报告基因系统验证MALAT1与miR-22-3p、NLRP3与miR-22-3p的调控关系;通过实时荧光定量PCR技术和免疫印记技术检测肺组织和细胞中MALAT1、miR-22-3p、NLRP3、ASC、caspase-1的表达水平;通过酶联免疫吸附试验检测支气管肺泡灌洗液和细胞培养基中白细胞介素(IL)-1β、IL-18、肿瘤坏死因子-α(TNF-α)的分泌情况;通过CCK-8技术检测A549细胞增殖情况;通过流式细胞术检测A549细胞凋亡情况。结果与假手术组相比,LPS诱导的ALI大鼠肺组织和A549细胞中MALAT1、NLRP3、ASC、caspase-1的mRNA水平显著升高,miR-22-3p水平显著降低(P<0.05)。此外,与假手术组相比,LPS诱导的ALI大鼠肺组织的组织病理损伤水平、炎症反应和细胞凋亡率升高(P<0.05)。与ALI组、sh-NC组相比,抑制MALAT1表达可改善LPS诱导的ALI大鼠肺组织和细胞中的炎症反应和细胞凋亡(P<0.05)。双荧光素酶实验结果显示,MALAT1与miR-22-3p、NLRP3与miR-22-3p存在相互调控关系。与ALI组、sh-NC组相比,sh-MALAT1组肺组织中MALAT1、NLRP3、ASC、caspase-1 mRNA水平降低(P<0.05),miR-22-3p水平升高(P<0.05)。同时,BALF上清液中IL-1β、IL-18、TNF-α水平降低(P<0.05)。此外,下调MALAT1的同时抑制miR-22-3p表达后,细胞中miR-22-3p和Bcl-2表达水平显著降低,细胞增殖水平亦显著降低(P<0.05)。结论降低MALAT1的表达可通过促进miR-22-3p的表达,从而抑制NLRP3的蛋白水平,并最终抑制LPS诱导的ALI模型中的炎症反应和细胞凋亡。 展开更多
关键词 长链非编码rna 转移相关肺腺癌转录本1 微小rna-22-3p 核苷酸结合寡聚化结构域样受体蛋白3 肺泡上皮细胞 炎症损伤 凋亡
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慢阻肺患者外周血单个核细胞lncRNA SNHG5的表达与炎症因子水平相关性研究 被引量:3
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作者 胡玉兰 赵杰 +2 位作者 卢立国 潘海洋 巢玉琼 《北华大学学报(自然科学版)》 CAS 2022年第4期489-493,共5页
目的探讨慢阻肺(COPD)患者外周血单个核细胞lncRNA SNHG5的表达与炎症因子水平相关性.方法选取COPD稳定期患者80例,急性加重期患者80例,健康志愿者80名为对照组.分离外周血单个核细胞,RT-PCR检测lncRNA SNHG5、核苷酸结合寡聚化结构域1(... 目的探讨慢阻肺(COPD)患者外周血单个核细胞lncRNA SNHG5的表达与炎症因子水平相关性.方法选取COPD稳定期患者80例,急性加重期患者80例,健康志愿者80名为对照组.分离外周血单个核细胞,RT-PCR检测lncRNA SNHG5、核苷酸结合寡聚化结构域1(NOD1)、核苷酸结合寡聚化结构域样受体蛋白3(NLRP3)的mRNA表达;Western blot检测NOD1、NLRP3的蛋白表达;酶联免疫吸附法检测血清C反应蛋白、肿瘤坏死因子α、白细胞介素-6(IL-6)表达水平.结果COPD急性加重期组lncRNA SNHG5的表达水平明显低于COPD稳定期组和对照组,COPD稳定期组明显低于对照组(P<0.05).COPD急性加重期组NOD1、NLRP3的mRNA和蛋白表达水平明显高于COPD稳定期组和对照组,COPD稳定期组明显高于对照组(P<0.05).COPD急性加重期组血清C反应蛋白、肿瘤坏死因子α、IL-6水平明显高于COPD稳定期组和对照组,COPD稳定期组明显高于对照组(P<0.05).Pearson相关性分析显示:COPD患者外周血单核细胞中lncRNA SNHG5表达与血清C反应蛋白、肿瘤坏死因子α、IL-6呈负相关关系(r=-0.719、-0.734、-0.760,均P<0.001).COPD患者外周血单核细胞中NOD1、NLRP3表达与血清C反应蛋白、肿瘤坏死因子α、IL-6呈正相关关系(r=0.736、0.750、0.728,均P<0.001;r=0.765、0.792、0.780,均P<0.001).结论慢阻肺患者外周血单核细胞中lncRNA SNHG5、NOD1、NLRP3可能通过调控炎症因子C反应蛋白、肿瘤坏死因子α、IL-6的表达参与COPD病情的发生与进展,其结果可用于临床诊断和预后评估. 展开更多
关键词 慢性阻塞性肺疾病 单个核细胞 长链非编码rna SNHG5 核苷酸结合寡聚化结构域1 核苷酸结合寡聚化结构域样受体蛋白3
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