应用专一性寡核苷酸微阵列可靠地检测结核分枝杆菌利福平耐药性 被引量：6

1

作者 乐军 曾而良 +3 位作者 谢建平 李瑶 刘丽蓉 王洪海 《中国生物化学与分子生物学报》 CAS CSCD 北大核心 2004年第2期264-269,共6页

DNA微阵列代表聚合酶链反应产物诊断测序的发展方向 .根据结核分枝杆菌rpoB基因利福平抗药性决定区域内点突变及其它重排的特征 .研制一种快速地鉴定结核分枝杆菌利福平耐药菌株的中等密度微阵列方法 .利福平抗药性通过使荧光标记扩增... DNA微阵列代表聚合酶链反应产物诊断测序的发展方向 .根据结核分枝杆菌rpoB基因利福平抗药性决定区域内点突变及其它重排的特征 .研制一种快速地鉴定结核分枝杆菌利福平耐药菌株的中等密度微阵列方法 .利福平抗药性通过使荧光标记扩增遗传物质与微阵列杂交测定 .检测5 3株利福平耐药结核分枝杆菌和 15株利福平敏感结核分枝杆菌 .微阵列方法的检测结果与药物敏感性试验和DNA测序结果完全一致 .临床标本PCR扩增后仅 1 5h可检出利福平耐药临床分离株 .表明寡核苷酸微阵列是高效的、专一性的方法 。 展开更多

关键词 结核分枝杆菌 微阵列 利福平 耐药性 寡核苷酸微阵列

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一种基于寡核苷酸微阵列芯片的多重可扩增探针杂交技术 被引量：3

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作者 刘和平 王宏 +3 位作者 陆祖宏 刘小平 夏昆 夏家辉 《Acta Genetica Sinica》 SCIE CAS CSCD 北大核心 2004年第2期119-124,共6页

多重可扩增探针杂交技术 (multiplexamplifiableprobehybridization ,MAPH)是近年来发展起来的一种用于基因组中DNA拷贝数检测的新技术。并发展了一种基于寡核苷酸微阵列芯片的MAPH技术。该方法根据所检测的DNA序列 ,制备若干具有通用... 多重可扩增探针杂交技术 (multiplexamplifiableprobehybridization ,MAPH)是近年来发展起来的一种用于基因组中DNA拷贝数检测的新技术。并发展了一种基于寡核苷酸微阵列芯片的MAPH技术。该方法根据所检测的DNA序列 ,制备若干具有通用引物的PCR产物作为可扩增探针组 ,与固定在尼龙膜上待测的基因组DNA杂交。用磁珠回收特异性杂交的探针 ,经生物素标记的通用引物扩增后 ,与相应的寡核苷酸微阵列芯片杂交。该特异性的寡核苷酸微阵列芯片包括 10个抗肌营养不良基因的外显子探针和阴性、阳性探针。杂交清冼后 ,链霉亲和素 Cy3染色用芯片扫描仪得到杂交的荧光图像。分析荧光信号的强度差异给出特定基因片段拷贝数的变化。该方法用微阵列技术代替MAPH中的电泳检测技术 ,可大幅度增加检测的通量。选择了一个正常男性、一个正常女性和一个肌营养不良症患者的基因组DNA来进行验证。结果表明 。 展开更多

关键词 基因拷贝数变化 MAPH DMD/BMD 链霉亲和素-Cy3 多重PCR 寡核苷酸微阵列芯片

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寡核苷酸微阵列芯片在人乳头瘤病毒基因分型检测中的应用评估

3

作者 汪圣强 杭莉虹 +2 位作者 钱盼盼 高杰 胡守旺 《分子诊断与治疗杂志》 2009年第4期227-229,共3页

目的探讨寡核苷酸微阵列芯片技术在人乳头瘤病毒(HPV)检测中的实用价值。方法使用HPV寡核苷酸微阵列芯片试剂盒对227例宫颈拭子样本进行16种高危型(HPV-16,18,31,33,35,39,45,51,52,53,56,58,59,66,68,CP8304)和5种低危型(6,11,42,43和... 目的探讨寡核苷酸微阵列芯片技术在人乳头瘤病毒(HPV)检测中的实用价值。方法使用HPV寡核苷酸微阵列芯片试剂盒对227例宫颈拭子样本进行16种高危型(HPV-16,18,31,33,35,39,45,51,52,53,56,58,59,66,68,CP8304)和5种低危型(6,11,42,43和44)检测,所检测的样本为HC2探针捕捉法检测所得到的HPV高危型和低危型样本,用以评估该DNA微阵列试剂的性能。结果190例经HC2法检测为高危型HPV阳性以及30例被HC2法检测为低危型的样品被寡核苷酸微阵列芯片试剂盒检测出具体的高危和低危HPV型别,总共检测出13种高危型和5种低位危型HPV亚型,在高危亚型中,各型检出率分别是16型26.01%、58型20.18%、52型14.71%、68型7.59%、31型7.13%、33型6.37%、66型6.24%、18型4.05%、59型2.18%、39型1.10%、56型1.50%、45型1.40%、51型1.07%;在低危亚型中,各型检出率分别为6型45.43%、11型29.70%、42型14.11%、43型5.89%和44型5.00%。单一HPV亚型感染及2种、3种HPV亚型混合感染分别为60.46%、29.89%、9.65%。7例经HC2检测为高危型,但寡核苷酸微阵列芯片试剂盒未能检测出HPV的具体型别,寡核苷酸微阵列芯片试剂盒与HC2法高危型HPV检测结果的符合率为96.92%(220/227)。结论HPV寡核苷酸微阵列芯片试剂盒与HC2法高危型HPV检测阳性符合率高,并可以明确具体分析21种HPV型别,是一种准确、高效、经济的HPV型别检测方法,可用于HPV的常规基因型分型诊断及人群筛查。 展开更多

关键词 HPV 基因分型 寡核苷酸微阵列芯片试剂盒

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一种高密度寡核苷酸微阵列芯片的制备技术

4

作者 陆祖宏 《中国家禽》 北大核心 2001年第21期17-17,共1页

21世纪,生命科学将成为整个科学领域带动性学科,生物技术将成为人类解决食物、能源、环境等重大经济和社会问题的关键技术,生物产业仍以医药生物技术产业化为“龙头”,农业生物技术为核心,环境与海洋生物技术为两翼,成为世人关注的焦点... 21世纪,生命科学将成为整个科学领域带动性学科,生物技术将成为人类解决食物、能源、环境等重大经济和社会问题的关键技术,生物产业仍以医药生物技术产业化为“龙头”,农业生物技术为核心,环境与海洋生物技术为两翼,成为世人关注的焦点。本期栏目刊发此类文章,目的在于:一方面向广大读者介绍未来生物技术领域一些基本常识;另一方面,希望加快中国家禽业生物技术的研究与应用。 展开更多

关键词 基因芯片 高密度寡核苷酸微阵列芯片 制备技术

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寡核苷酸微阵列快速检测常见食源性致病菌初步研究

5

作者 陈岳明 余道军 +1 位作者 张卫英 童文娟 《浙江检验医学》 2010年第2期12-15,共4页

目的探索运用寡核苷酸微阵列技术建立一种快速、简便的检测食源性致病菌方法。方法基于细菌16srDNA序列设计并合成寡核苷酸探针,制备寡核苷酸微阵列,对7种常见细菌进行检测。同时,采用培养和微阵列对40份腹泻患者粪便进行了检测。结果 ... 目的探索运用寡核苷酸微阵列技术建立一种快速、简便的检测食源性致病菌方法。方法基于细菌16srDNA序列设计并合成寡核苷酸探针,制备寡核苷酸微阵列,对7种常见细菌进行检测。同时,采用培养和微阵列对40份腹泻患者粪便进行了检测。结果 7种食源性致病菌用细菌16srDNA序列通用引物扩增后,均得到900bp左右的PCR产物,产物分别在寡核苷酸微阵列上进行杂交时,均只和相对应的检测探针产生明显的杂交信号。在模板为1.0pg/ml时,PCR未能扩增出明显的条带,然而该产物经微阵列杂交后可见较明显的检测信号。40份腹泻患者粪便采用培养法结合血清凝集试验和寡核苷酸微阵列进行检测比较,发现大肠埃希菌与志贺菌属检测探针也能杂交,霍乱弧菌与副溶血性弧菌检测探针也能杂交,其余5种细菌检测符合率为为100%。结论基于细菌16srDNA序列的寡核苷酸微阵列技术检测食源性致病菌,方法简单、实用、快速、高通量,并可以直接检测标本而不需培养,但是采用该技术部分细菌只能实现初步快速鉴定,仍需要结合培养等才能最后鉴定。 展开更多

关键词 食源性致病菌 寡核苷酸微阵列 核酸杂交

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应用寡核苷酸微阵列检测肺癌样品中的P53和K-ras基因点突变 被引量：3

6

作者 刘军波 解纪攀 +3 位作者 邹宗亮 陈琳洁 李龙芸 王升启 《生物工程学报》 CAS CSCD 北大核心 2002年第4期447-451,共5页

对影响寡核苷酸微阵列检测点突变的敏感性和特异性的各种因素 ,如杂交液、杂交温度、标记引物浓度及其比例等 ,进行了研究。采用不对称PCR扩增有利于敏感性提高 ;多重不对称PCR不影响杂交的特异性 ,且敏感性有所增加。对 30例肺癌标本... 对影响寡核苷酸微阵列检测点突变的敏感性和特异性的各种因素 ,如杂交液、杂交温度、标记引物浓度及其比例等 ,进行了研究。采用不对称PCR扩增有利于敏感性提高 ;多重不对称PCR不影响杂交的特异性 ,且敏感性有所增加。对 30例肺癌标本进行寡核苷酸微阵列检测 ,发现 12例标本发生了P5 3基因点突变 ,K ras突变有 5例。与测序结果相比 ,P5 3基因突变符合率达到 80 %。由于检测样本较少且检测位点不完全 ,因而未得到K ras和P5 3基因突变与肿瘤的种类、病期及吸烟之间的明显相关性。 展开更多

关键词 寡核苷酸微阵列 检测 肺癌样品 P53 K-RAS基因点突变

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应用寡核苷酸微阵列检测基因突变

7

作者 祝骥 段俊 梁承邺 《广西农业生物科学》 CSCD 2003年第3期221-224,共4页

寡核苷酸阵列技术是一种高度集成化、快速的基因分析手段,已广泛用于基因突变检测、序列测定、基因表达分析、疾病诊断等。本文主要介绍应用该技术进行基因突变检测的三种方法:杂交信号增益法、杂交信号消减法与微测序分析。三种方法各... 寡核苷酸阵列技术是一种高度集成化、快速的基因分析手段,已广泛用于基因突变检测、序列测定、基因表达分析、疾病诊断等。本文主要介绍应用该技术进行基因突变检测的三种方法:杂交信号增益法、杂交信号消减法与微测序分析。三种方法各有优势,通过选择适当的方法,将为基因突变检测提供更佳的分析途径。 展开更多

关键词 寡核苷酸微阵列 基因突变 杂交信号增益 杂交信号消减

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寡核苷酸微阵列快速检测常见食源性致病菌初步研究

8

作者 陈岳明 余道军 +1 位作者 张卫英 童文娟 《中国卫生检验杂志》 CAS 2010年第9期2131-2133,共3页

目的:探索运用寡核苷酸微阵列技术建立一种快速、简便的检测食源性致病菌方法。方法:基于细菌16s rDNA序列设计并合成寡核苷酸探针,制备寡核苷酸微阵列,对7种常见细菌进行检测。同时,采用培养和微阵列对40份腹泻患者粪便进行了检测。结... 目的:探索运用寡核苷酸微阵列技术建立一种快速、简便的检测食源性致病菌方法。方法:基于细菌16s rDNA序列设计并合成寡核苷酸探针,制备寡核苷酸微阵列,对7种常见细菌进行检测。同时,采用培养和微阵列对40份腹泻患者粪便进行了检测。结果:7种食源性致病菌用细菌16s rDNA序列通用引物扩增后,均得到900 bp左右的PCR产物,产物分别在寡核苷酸微阵列上进行杂交时,均只和相对应的检测探针产生明显的杂交信号。在模板为1.0 pg/ml时,PCR未能扩增出明显的条带,然而该产物经微阵列杂交后可见较明显的检测信号。40份腹泻患者粪便采用培养法结合血清凝集试验和寡核苷酸微阵列进行检测比较,发现大肠埃希菌与志贺菌属检测探针也能杂交,霍乱弧菌与副溶血性弧菌检测探针也能杂交,其余5种细菌检测符合率为为100%。结论:基于细菌16s rDNA序列的寡核苷酸微阵列技术检测食源性致病菌,方法简单、实用、快速、高通量,并可以直接检测标本而不需培养,但是采用该技术部分细菌只能实现初步快速鉴定,仍需要结合培养等才能最后鉴定。 展开更多

关键词 食源性致病菌 寡核苷酸微阵列 核酸杂交

原文传递

应用微阵列芯片检测与2型糖尿病相关的单核苷酸多态性 被引量：5

9

作者 陈琰 刘桂锋 +2 位作者 刘霞 张桂珍 王振新 《高等学校化学学报》 SCIE EI CAS CSCD 北大核心 2013年第5期1078-1083,共6页

基于三维(3D)寡核苷酸微阵列芯片的荧光检测法,研制了一种用于筛选能检测2型糖尿病的特定寡核苷酸探针.使用第4代(G4)聚(酰胺-胺)(PAMAM)树枝状大分子修饰的载玻片为基底,以氨基修饰的寡核苷酸为固定探针构建3D寡核苷酸微阵列芯片.采用... 基于三维(3D)寡核苷酸微阵列芯片的荧光检测法,研制了一种用于筛选能检测2型糖尿病的特定寡核苷酸探针.使用第4代(G4)聚(酰胺-胺)(PAMAM)树枝状大分子修饰的载玻片为基底,以氨基修饰的寡核苷酸为固定探针构建3D寡核苷酸微阵列芯片.采用荧光化合物Cy5修饰的寡核苷酸为检测探针获得荧光信号.以2型糖尿病易感基因TCF7L2的rs7903146位点为研究对象,通过对含有16种(8对)寡核苷酸的寡核苷酸文库的筛选,获得了1对能用于2型糖尿病检测的寡核苷酸探针.通过单核苷酸多态性和等位基因分析证明,该寡核苷酸探针对靶标寡核苷酸检测具有高特异性,并能准确检测低至2%的等位基因频率. 展开更多

关键词 寡核苷酸微阵列 2型糖尿病 等位基因频率 核苷酸探针

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寡核苷酸阵列比较基因组杂交技术在肿瘤研究中作用 被引量：4

10

作者 康雪玲 邹泓 李锋 《临床与实验病理学杂志》 CAS CSCD 北大核心 2009年第2期201-204,共4页

关键词 寡核苷酸微阵列 比较基因组杂交 肿瘤/遗传学

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寡核苷酸阵列比较基因组杂交技术及其应用

11

作者 彭翼飞 马文丽 《中国生物工程杂志》 CAS CSCD 北大核心 2006年第10期46-51,共6页

阵列-比较基因组杂交技术(arraycomparativegenomichybridization,arrayCGH)能在全基因组水平和/或高分辨率基础上检测染色体拷贝数的变化,主要应用于遗传学和肿瘤学研究。ArrayCGH中微阵列探针通常是PCR扩增的BAC克隆或cDNA分子。最近... 阵列-比较基因组杂交技术(arraycomparativegenomichybridization,arrayCGH)能在全基因组水平和/或高分辨率基础上检测染色体拷贝数的变化,主要应用于遗传学和肿瘤学研究。ArrayCGH中微阵列探针通常是PCR扩增的BAC克隆或cDNA分子。最近几年,寡核苷酸阵列比较基因组杂交(oligonucleotidearrayCGH,oaCGH)逐渐开始应用。oaCGH与BACarrayCGH比较,具有操作更简便、探针设计更灵活、分辨率更高等多项优点,预计oaCGH将逐步取代利用BAC克隆片段或cDNA分子的arrayCGH。oaCGH的应用及其与其它高通量检测技术的结合将促进新的癌症相关基因、肿瘤耐药基因的发现。综述了现有主要oaCGH平台在空间分辨率、探针长度、灵敏度、特异性等方面的特点及其应用,概括了oaCGH近年来的进展。 展开更多

关键词 比较基因组杂交 寡核苷酸微阵列 拷贝数多态性

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寡核苷酸表达谱揭示异烟肼耐药对结核分支杆菌致病性的影响 被引量：5

12

作者 乐军 李瑶 +3 位作者 谢建平 徐永忠 梁莉 王洪海 《中华医院感染学杂志》 CAS CSCD 2004年第12期1336-1340,共5页

目的研究结核分支杆菌异烟肼耐药菌株与H37Rv异烟肼敏感菌株感染巨噬细胞后差异表达的基因。方法利用高密度cDNA芯片检测巨噬细胞U937感染结核分支杆菌异烟肼耐药菌株与H37Rv后的基因表达谱的差异。结果两者诱导巨噬细胞的差异表达基因... 目的研究结核分支杆菌异烟肼耐药菌株与H37Rv异烟肼敏感菌株感染巨噬细胞后差异表达的基因。方法利用高密度cDNA芯片检测巨噬细胞U937感染结核分支杆菌异烟肼耐药菌株与H37Rv后的基因表达谱的差异。结果两者诱导巨噬细胞的差异表达基因有53条,异烟肼耐药菌株比敏感菌株诱导多种趋化因子和细胞免疫增强的细胞因子表达上调和免疫抑制细胞因子IL10等表达下调。结论异烟肼耐药对细菌毒力有明显的影响,异烟肼耐药菌株的致病力下降,异烟肼耐药菌株容易被宿主免疫系统清除;结果为耐多药结核病控制提供依据;骨桥接素和巨噬细胞趋化因子等,在抗异烟肼耐药结核分支杆菌感染免疫中的作用值得深入研究。 展开更多

关键词 寡核苷酸微阵列 结核分支杆菌 异烟肼 表达谱 致病性

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病毒感染相关基因微阵列的制备及其在HBV感染应答基因筛选中的应用 被引量：2

13

作者 杨静 姚军 +3 位作者 杨宁敏 张毅 伯晓晨 王升启 《病毒学报》 CAS CSCD 北大核心 2004年第3期218-224,共7页

为筛选乙型肝炎(乙肝)病毒(HBV)感染应答基因,探讨HBV感染分子机理,采用生物信息学分析、筛选宿主细胞中与乙肝病毒、丙型肝炎(丙肝)病毒、流行性感冒(流感)病毒等感染密切相关的基因,设计并合成寡核苷酸探针,制备了含231种病毒感染相... 为筛选乙型肝炎(乙肝)病毒(HBV)感染应答基因,探讨HBV感染分子机理,采用生物信息学分析、筛选宿主细胞中与乙肝病毒、丙型肝炎(丙肝)病毒、流行性感冒(流感)病毒等感染密切相关的基因,设计并合成寡核苷酸探针,制备了含231种病毒感染相关基因的寡核苷酸微阵列。利用此微阵列比较HepG2细胞、HepG2 2 15细胞之间的基因表达谱差异,筛选乙肝病毒感染候选应答基因,从分子水平对乙肝病毒感染作用机理进行初步研究。制备的病毒感染相关基因表达谱微阵列的监测结果显示,阳性对照和看家基因探针出现较强信号,空白点样液和阴性对照探针未出信号,大部分基因探针信号强度在可分析范围内,上矩阵和下矩阵反映的基因表达情况一致,证明微阵列的特异性、敏感性、重复性都较好。HepG2 2 15与HepG2细胞基因表达谱比较结果显示,28个宿主基因在HepG2 2 15细胞中高表达,包括ASGR1、AFP、Fibronectin、APOC等基因;4个基因低表达,包括RRM1、ICSBP等基因。初步筛选获得HBV感染候选应答基因。此结果表明,制备的微阵列敏感性、特异性、重复性好,可为研究病毒宿主相互作用关系提供技术平台,应用此微阵列筛选获得的HBV候选应答基因可为揭示HBV感染的分子致病机理提供新的信息,为抗HBV药物研究提供潜在的作用靶点。 展开更多

关键词 病毒性疾病 病毒感染相关基因 HBV 寡核苷酸微阵列 表达谱 乙型肝炎病毒

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cDNA微阵列在子宫内膜癌中的运用 被引量：1

14

作者 何晓英 蔡斌 万小平 《实用肿瘤学杂志》 CAS 2004年第6期477-480,共4页

关键词 CDNA微阵列 子宫内膜癌 基因芯片 疾病相关基因 未知基因 药物筛选 基因诊断 寡核苷酸微阵列 生物芯片 序列

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微阵列数据处理平台设计与实现 被引量：1

15

作者 孙显赫 郭云波 +2 位作者 刘娜 马骊 邓亲恺 《南方医科大学学报》 CAS CSCD 北大核心 2011年第4期610-614,共5页

目的研制一个基于高性能计算机和Linux下运行的采用B/S模式的微阵列数据处理平台。方法构建以Apache服务器为平台的WEB服务器,采用Perl语言编程,整合R语言与Bioconductor中的微阵列数据分析软件包,满足寡核苷酸微阵列和双色点样微阵列... 目的研制一个基于高性能计算机和Linux下运行的采用B/S模式的微阵列数据处理平台。方法构建以Apache服务器为平台的WEB服务器,采用Perl语言编程,整合R语言与Bioconductor中的微阵列数据分析软件包,满足寡核苷酸微阵列和双色点样微阵列实验数据的处理和分析,用户可在网页上提交数据和设置参数,结果通过网页以图形化的方式返回。结果该平台可处理寡核苷酸微阵列和双色点样微阵列的数据,实现了数据质量评估、预处理、注释、统计分析等功能,操作简单,分析速度快。运用本平台处理了结核杆菌不同临床分型的人类巨噬细胞寡核苷酸微阵列数据,即潜伏期、结核病、结核性脑膜炎,为识别结核杆菌的敏感基因提供了线索。利用本平台还分析不同条件下用异烟肼处理结核分支杆菌的效果,例如低氧条件和敲除katG基因的条件所获得的相关cDNA微阵列数据,发现用异烟肼处理的对数生长期调节的基因将不会在休眠期模型中被差异调节;并且在休眠期,被差异调节的基因总数将减少。结论该平台功能资源整合较全面,克服了当前微阵列数据分析软件或工具包在操作使用方面的不足,应用界面友好,结果显示直观,为生物学家开展微阵列数据分析提供了方便。针对结核分支杆菌的案例研究验证了平台的有效性。 展开更多

关键词 微阵列 生物信息学 寡核苷酸微阵列 双色点样微阵列 R语言 BIOCONDUCTOR 结核分支杆菌 结核性脑膜炎 异烟肼

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寡核苷酸DNA Microarray用于HLA DRB1基因分型的研究 被引量：17

16

作者 陈君男 李瑶 +5 位作者 李亚莉 秦红友 李荣宇 曹慧敏 谢毅 毛裕民 《Acta Genetica Sinica》 SCIE CAS CSCD 北大核心 2001年第10期887-894,共8页

对寡核苷酸DNAMicroarray用于HLADRB1基因分型的技术进行研究。常规的酚 /氯仿法提取标准血样基因组DNA ,在DRB1的exon 2区域设计一对引物 ,经PCR扩增基因组相应区段并用Cy5 dCTP进行标记。设计寡核苷酸分型探针 ,将探针固定在APS PDC... 对寡核苷酸DNAMicroarray用于HLADRB1基因分型的技术进行研究。常规的酚 /氯仿法提取标准血样基因组DNA ,在DRB1的exon 2区域设计一对引物 ,经PCR扩增基因组相应区段并用Cy5 dCTP进行标记。设计寡核苷酸分型探针 ,将探针固定在APS PDC法制作的DNAMicroarray上 ,用标记的PCR产物与之杂交 ,扫描仪对杂交结果进行扫描 ,Imagene软件对杂交图象进行分析。共检测了 33例标准血样的HLADRB1基因型。检测结果证明研制的DNAMicroarray准确、灵敏。DNAMicroarray技术可以有效地检测DRB1等位基因 ,对比常规的PCR SSP和PCR SSO方法、分型基因芯片方法更为直观 。 展开更多

关键词 HLA DRB1 等位基因 基因分型 寡核苷酸DNA微阵列 PCR-SSP PCR-SSO 基因分型

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安捷伦科技推出新一代全基因组水稻微阵列

17

《生物工程学报》 CAS CSCD 北大核心 2008年第2期238-238,共1页

安捷伦科技公司（NYSE：A）于2008年1月30日推出新一代水稻寡核苷酸微阵列44K RAP-DB。该微阵列以日本国家农业生物科学研究所（NIAS）注释的水稻基因组信息为基础，可以帮助研究者同时研究水稻中成千上万个与生长发育过程和应激反应相... 安捷伦科技公司（NYSE：A）于2008年1月30日推出新一代水稻寡核苷酸微阵列44K RAP-DB。该微阵列以日本国家农业生物科学研究所（NIAS）注释的水稻基因组信息为基础，可以帮助研究者同时研究水稻中成千上万个与生长发育过程和应激反应相关的基因。 展开更多

关键词 寡核苷酸微阵列 安捷伦科技公司 全基因组 水稻 生长发育过程 基因组信息 科学研究所 农业生物

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微阵列结合聚类分析家禽肠炎沙门菌的抗药性基因

18

作者 吕玲 《中国家禽》 北大核心 2009年第7期67-67,共1页

美国食品和药品管理局毒理学研究中心的科研人员采用775个基因探针的寡核苷酸微阵列对分离自屠宰前家禽的34株肠炎沙门菌进行了研究。结果发现，除一株海德堡沙门菌外，所有分离沙门菌都具有四环素抗性基因tevA、tetC、tetR。16株具有... 美国食品和药品管理局毒理学研究中心的科研人员采用775个基因探针的寡核苷酸微阵列对分离自屠宰前家禽的34株肠炎沙门菌进行了研究。结果发现，除一株海德堡沙门菌外，所有分离沙门菌都具有四环素抗性基因tevA、tetC、tetR。16株具有硫代异恶唑抗性的细菌中11株具有sul 1基因。在携带氨基糖苷类抗性基因的海德堡沙门菌、森夫顿沙门菌和未分型沙门菌中发现了aadA、aadA 1、aadA 2、strA或strB基因。 展开更多

关键词 寡核苷酸微阵列 抗药性基因 沙门菌 聚类分析 肠炎 家禽 美国食品和药品管理局 抗性基因

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安捷伦科技充分利用水稻基因组注释数据库，推出新一代全基因组水稻微阵列

19

《现代仪器》 2008年第2期79-79,共1页

2008年1月30日，安捷伦科技公司宣布推出一款新的水稻寡核苷酸微阵列44K RAP-DB。该微阵列以日本国家农业生物科学研究所（NIAS）编制的基因组信息为基础。NIAS由日本农林水产省资助建立，设立水稻基因资源中心以帮助研究者探索改良这... 2008年1月30日，安捷伦科技公司宣布推出一款新的水稻寡核苷酸微阵列44K RAP-DB。该微阵列以日本国家农业生物科学研究所（NIAS）编制的基因组信息为基础。NIAS由日本农林水产省资助建立，设立水稻基因资源中心以帮助研究者探索改良这种主要的农作物的基因组学方法。 展开更多

关键词 寡核苷酸微阵列 安捷伦科技公司 基因组注释 水稻 全基因组 数据库 基因组学方法 基因组信息

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癌症诊断芯片的癌-睾丸基因的寡核苷酸探针的设计

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作者 刘丽 丁洪 +3 位作者 刘丹 陆群 Sophie Rousseaux 吴芳 《四川大学学报（医学版）》 CAS CSCD 北大核心 2009年第2期330-333,336,共5页

目的设计用于专门进行肿瘤内睾丸特定基因—癌-睾丸（cancer-testis，CT）基因转录分析的微阵列的探针系列．以阐明CT基因在肿瘤发生过程中的作用并检测它们在肿瘤细胞或肿瘤样本中的表达。方法通过二个探针设计工具，IDT和MEDIANTE的... 目的设计用于专门进行肿瘤内睾丸特定基因—癌-睾丸（cancer-testis，CT）基因转录分析的微阵列的探针系列．以阐明CT基因在肿瘤发生过程中的作用并检测它们在肿瘤细胞或肿瘤样本中的表达。方法通过二个探针设计工具，IDT和MEDIANTE的结合使用，设计出CT基因的寡核苷酸探针。同时，应用“Oligonucleotide Properties Calculator寡核苷酸性质计算软件”和“OligoAnalyzer 3．0”检测探针的解链温度（Tm）、GC含量和可能形成的次级结构等特性。结果为CT基因家族的44个成员成功设计了113个50mers左右的寡核苷酸探针。其Tm值分布在63．2℃～67．5℃之间，GC百分含量为35．3％～51．5％。结论结合IDT和MEDIANTE两个探针设计软件，能有效的进行CT基因寡核苷酸探针的设计。 展开更多

关键词 癌-睾丸基因 寡核苷酸探针探针设计微阵列

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