基于正则表达式的生物序列检索方法 被引量：1

1

作者 郑珂晖 宁正元 王健 《莆田学院学报》 2009年第5期43-46,共4页

提出利用正则表达式进行生物序列检索时应先确定该正则表达式的最优NFA,然后再转化为相应的算法步骤,进而提高生物序列的检索效率。并给出了一个具体的序列检索实例。

关键词 正则表达式 序列检索 模式匹配

在线阅读 下载PDF 职称材料

融合CNN和二进制生成对抗网络的多元时间序列检索 被引量：1

2

作者 汤丽君 关东海 +2 位作者 汪子璇 袁伟伟 燕雪峰 《小型微型计算机系统》 CSCD 北大核心 2023年第2期281-287,共7页

多元时间序列在日常生活中普遍存在,给定当前的时间序列片段,如何高效且精确地从历史时间片段中找出其相似的时间片段极为重要.本文提出了一种全新的基于CNN和深度非监督二进制生成对抗网络(UCBGAN)来进行多元时间序列检索,它可以有效... 多元时间序列在日常生活中普遍存在,给定当前的时间序列片段,如何高效且精确地从历史时间片段中找出其相似的时间片段极为重要.本文提出了一种全新的基于CNN和深度非监督二进制生成对抗网络(UCBGAN)来进行多元时间序列检索,它可以有效地获取多元时间序列的二进制表示.该网络由3部分构成—一个解码器,一个编码器和一个鉴别器,其中鉴别器和编码器除了最后一层外,共享参数.此外,本文引入了时序相似矩阵,通过构建时序相似矩阵,能进一步提高二进制编码的可鉴别性.在训练过程中,本文引入了对抗损失,相似对损失和重构损失.在多个数据集上的实验结果表明,该方法能有效提高多元时间序列检索的准确度.所以,该方法对于多元时间序列检索是有效的. 展开更多

关键词 多元时间序列检索 非监督学习 二进制编码 卷积神经网络 生成对抗式学习

在线阅读 下载PDF 职称材料

网上序列类似性检索

3

作者 胡德华 方平 《医学信息（医学与计算机应用）》 2001年第2期68-70,共3页

随着人类基因组及其他模式生物基因组大规模测序的顺利实施 ,核酸和蛋白质序列数据库的序列数量和碱基个数呈指数增长 ,序列类似性检索成为继序列数据库记录检索之后 ,使用得最多的网上序列分析作业。现在 ,序列类似性检索的类型和软件... 随着人类基因组及其他模式生物基因组大规模测序的顺利实施 ,核酸和蛋白质序列数据库的序列数量和碱基个数呈指数增长 ,序列类似性检索成为继序列数据库记录检索之后 ,使用得最多的网上序列分析作业。现在 ,序列类似性检索的类型和软件工具多种多样。 展开更多

关键词 序列类似性检索 INTERNET 人类基因组 序列生物信息学分析

在线阅读 下载PDF 职称材料

最优化数据库检索序列

4

作者 王克明 《北京高校图书馆》 1993年第1期72-77,共6页

关键词 情报检索 检索序列 数据库 检索决策 最优化

在线阅读 下载PDF 职称材料

一种面向密文基因数据的子序列外包查询方法 被引量：1

5

作者 王占兵 宋伟 +3 位作者 彭智勇 杨先娣 崔一辉 申远 《计算机科学》 CSCD 北大核心 2018年第6期51-56,共6页

精准医疗是一种强烈依赖病人基因组分析结果的医疗模式,而子串检索是执行基因组分析的重要方法。近年来,基因数据的数据量急剧增长,其存储代价和处理复杂度已远超医疗方可承受的范围。于是,利用云服务提供商廉价的存储设备和强大的计算... 精准医疗是一种强烈依赖病人基因组分析结果的医疗模式,而子串检索是执行基因组分析的重要方法。近年来,基因数据的数据量急剧增长,其存储代价和处理复杂度已远超医疗方可承受的范围。于是,利用云服务提供商廉价的存储设备和强大的计算能力,将基因数据托管至云服务提供商成为切实可行的解决方案。考虑到云服务提供商并不完全可信,在数据上传至云端之前执行数据加密是保证数据安全性和隐私性的有效方法。然而,如何基于加密数据执行序列检索成为亟待解决的问题。针对这一问题,对基因数据处理和密文检索领域进行调研,提出采用q-gram技术对序列数据的定长窗口创建前缀签名的方案,并在执行查询时在每个窗口中完成前缀查询的解决方案。在子序列查询过程中,云端并不能获取用户数据明文。最后通过实验验证了所提方案具有较好的性能和存储开销,例如当窗口大小为100且q取6时,对100000长序列串执行构建索引耗时15.06s。与GPSE相比,所提方法的性能更优。 展开更多

关键词 精准医疗 子序列检索 密文查询 全文检索

在线阅读 下载PDF 职称材料

基于期限的多请求数据检索问题研究 被引量：1

6

作者 贺萍 《计算机应用研究》 CSCD 北大核心 2016年第7期2091-2095,共5页

给定一个包含多条信道的集合以及一个包含多个请求的集合,其中每一个请求包含多个请求数据项并且希望在一定期限内下载到,基于期限的多请求数据检索问题指当客户配有多条天线时寻找一个在期限内下载多个请求的数据检索序列,使得所有天... 给定一个包含多条信道的集合以及一个包含多个请求的集合,其中每一个请求包含多个请求数据项并且希望在一定期限内下载到,基于期限的多请求数据检索问题指当客户配有多条天线时寻找一个在期限内下载多个请求的数据检索序列,使得所有天线的最大访问延迟最小化。基于此,提出一种多请求的数据检索算法,以调度合适的天线检索这些请求并找到关于这些请求的检索序列,从而平衡在各天线上的访问延迟。针对单请求的数据检索,采用最大团思想寻找下载该请求中所有请求数据项的访问模式,使得检索该请求的访问延迟以及期限丢失率最小化。实验结果表明所提出的方法具有较好的性能。 展开更多

关键词 无线数据广播 数据检索 多请求 访问延迟 期限丢失率 检索序列

在线阅读 下载PDF 职称材料

基于改进SDIF算法的雷达脉冲信号分选技术研究 被引量：11

7

作者 安琦 李勇华 +1 位作者 杨建文 何子述 《火力与指挥控制》 CSCD 北大核心 2018年第7期42-46,共5页

基于电子对抗等非协作电子环境,针对抖动脉冲重复周期(Pulse Repetition Interval,PRI)信号,在SDIF的基础上提出了一种改进的算法。该方法主要从潜在PRI的估计和序列检索方法入手,提出了一种潜在PRI估计值的筛选方法和一种新的序列检索... 基于电子对抗等非协作电子环境,针对抖动脉冲重复周期(Pulse Repetition Interval,PRI)信号,在SDIF的基础上提出了一种改进的算法。该方法主要从潜在PRI的估计和序列检索方法入手,提出了一种潜在PRI估计值的筛选方法和一种新的序列检索方法,有效提高了雷达脉冲信号的分选准确率,并降低了整个分选过程的计算量。仿真结果验证了该方法的有效性。 展开更多

关键词 雷达脉冲信号 信号分选 SDIF算法 序列检索

在线阅读 下载PDF 职称材料

生物信息数据库简介及在农业上的应用 被引量：5

8

作者 简兴 苗永美 《农业网络信息》 2004年第4期27-29,共3页

随着生物技术与生物信息学的不断发展 ,生物信息数据库中信息呈指数增长 ,理解其中所包含的生物学知识、揭示生物内在规律将成为今后自然科学研究中的重要课题。本文介绍了近几年来世界生物信息数据库发展的状况 。

关键词 生物信息学 基本数据库 复合数据库 二次数据库 BioSino数据库 SRS序列检索系统 Entrez系统 FASTA程序 DNAMAN软件 农业应用

在线阅读 下载PDF 职称材料

葡萄基因电子表达分析平台的验证与应用

9

作者 上官凌飞 韩键 +3 位作者 任国慧 王西成 孙欣 房经贵 《植物资源与环境学报》 CAS CSCD 北大核心 2012年第3期80-86,共7页

为了验证作者建立的葡萄(Vitis vinifera L.)基因电子表达分析平台在葡萄果实发育相关基因的表达预测及特定序列快速检索等方面的应用效果,利用NCBI上公布的大量葡萄EST序列及半定量PCR和RT-PCR技术,对葡萄不同器官中VvANR、VvCHI、VvC... 为了验证作者建立的葡萄(Vitis vinifera L.)基因电子表达分析平台在葡萄果实发育相关基因的表达预测及特定序列快速检索等方面的应用效果,利用NCBI上公布的大量葡萄EST序列及半定量PCR和RT-PCR技术,对葡萄不同器官中VvANR、VvCHI、VvCHS2和VvDFR基因的表达分析预测结果进行验证,并对该平台具有的特定序列快速检索功能进行了简介。预测结果表明:葡萄各器官中VvANR、VvCHI、VvCHS2和VvDFR基因的无冗余EST序列数量均较多,分别为33条、36条、55条和46条;4个基因的表达量有一定差异,VvANR在花序和芽中表达量较高,VvCHI在花序、果实和芽中表达量较高,VvCHS2在果实、芽、花序和花中表达量较高,VvDFR在花序、芽、花、果实和根中表达量均较高。半定量PCR和RT-PCR实验结果显示:VvANR主要在花序、花和小果中表达;VvCHI主要在小果、花、茎和花序中表达;VvCHS2主要在茎、花序、花和小果中表达;VvDFR在各组织中表达量从高至低依次排序为花、花序、茎、叶、小果、中果、大果。验证结果表明:采用葡萄基因电子表达分析平台识别表达量较高的组织时,平台的预测结果与实验结果基本一致;而在预测一些表达量较低的组织时效果较差。应用该平台、通过5个步骤,可以简便、快速检索出特定组织或特定状况下的特定cDNA文库信息。 展开更多

关键词 葡萄 基因电子表达分析平台 表达序列标签 序列检索 预测

在线阅读 下载PDF 职称材料

一种高效的雷达信号综合分选算法 被引量：2

10

作者 成文海 卢伟 +2 位作者 刘毅 晁坤 张群英 《电波科学学报》 CSCD 北大核心 2023年第2期298-305,共8页

雷达信号分选是雷达对抗研究的重点问题,其性能直接影响雷达对抗系统的效能.脉冲重复间隔(pulse repetition interval,PRI)变换分选算法是一种经典的雷达信号分选算法,其对PRI抖动和脉冲缺失有良好的适应性,但存在计算量大,无法满足实... 雷达信号分选是雷达对抗研究的重点问题,其性能直接影响雷达对抗系统的效能.脉冲重复间隔(pulse repetition interval,PRI)变换分选算法是一种经典的雷达信号分选算法,其对PRI抖动和脉冲缺失有良好的适应性,但存在计算量大,无法满足实时计算的需求以及无法分选PRI值相同或相近的脉冲序列的问题.本文提出一种高效的雷达信号综合分选算法有效解决了上述问题.算法首先利用基于聚类的直方图算法估计出潜在PRI值集合,然后采用PRI识别准则筛选潜在PRI值,进一步利用PRI变换算法估计真实的PRI值,最后采用改进的序列检索算法完成脉冲序列的分离.仿真实验表明,在PRI抖动率为±10%、脉冲缺失率为10%时,算法能正确分选同时到达的四部雷达信号,验证了所提分选算法的有效性与先进性. 展开更多

关键词 雷达信号分选 脉冲重复间隔(PRI)变换 PRI识别准则 序列检索

在线阅读 下载PDF 职称材料

基于双参数可变阈值的雷达脉冲分选算法 被引量：3

11

作者 刘孟红 吕镜清 罗懋康 《电子信息对抗技术》 2007年第4期5-8,27,共5页

介绍了一种改进的累积差值直方图(CDIF)算法,该算法基于脉冲到达时间和载频,并采用可变动的阈值。仿真结果表明该算法具有同时分选多部雷达脉冲的能力,能有效抑制漏选和错选,实时性好。

关键词 脉冲重复间隔 参差雷达 序列检索

在线阅读 下载PDF 职称材料

基于局部差分隐私的物联网敏感数据泄露控制 被引量：8

12

作者 朱丹红 程烨 《计算机仿真》 北大核心 2021年第2期472-476,共5页

为了有效提高物联网数据安全性,提高敏感数据加密保护范围,提出基于局部差分隐私的物联网敏感数据泄露控制方法。对物联网数据链进行简化,估计数据链距离,设计基于链距离估计的物联网数据挖掘方法。将挖掘到的物联网数据转化为文档,对... 为了有效提高物联网数据安全性,提高敏感数据加密保护范围,提出基于局部差分隐私的物联网敏感数据泄露控制方法。对物联网数据链进行简化,估计数据链距离,设计基于链距离估计的物联网数据挖掘方法。将挖掘到的物联网数据转化为文档,对文档中数据分词部分进行处理,建立规范化的检索格式,构建敏感数据检索序列对数据库中的数据进行检索,得到物联网敏感数据集。以物联网敏感数据集为基础,通过数据初始化、基于局部差分隐私的数据扰动、明文加密、私钥生成、解密等多个步骤实现物联网隐私数据泄露控制。实验结果表明,研究方法的物联网敏感数据检索查全率与查准率较高,具有较高的数据加密覆盖度与风险访问事件定位精度。 展开更多

关键词 局部差分隐私 物联网 敏感数据 泄露控制 链距离估计 检索序列

在线阅读 下载PDF 职称材料

集成化医药平台智慧医药网简介

13

作者 胡先勇 袁辉 《中国发明与专利》 2014年第3期52-53,共2页

智慧医药网是一个医药信息服务的平台,它集成了医药相关的各类数据,包括专利、论文、法规、标准和医药工具书以及各种词表数据等,通过先进的计算机技术实现了对这些数据的加工处理,其中医药专利数据还进行了人工深度加工,使得这些数据... 智慧医药网是一个医药信息服务的平台,它集成了医药相关的各类数据,包括专利、论文、法规、标准和医药工具书以及各种词表数据等,通过先进的计算机技术实现了对这些数据的加工处理,其中医药专利数据还进行了人工深度加工,使得这些数据能够提供各种类型的检索方式,特别是包括了如方剂检索、生物序列检索、化学物质检索等特色检索途径。另外,对能够关联数据还进行了关联,使得在各种数据间检索变得更加方便和容易。 展开更多

关键词 药物平台 专利检索 方剂检索 结构检索 生物序列检索 扩展检索 中药材检索 化学物质检索 关联检索 词表 智慧医药网

在线阅读 下载PDF 职称材料

英特网上生物信息资源的利用

14

作者 王勇生 刘福柱 《饲料广角》 2002年第18期29-31,共3页

20世纪90年代诞生的英特网及随之而来的信息高速公路计划,标志着信息时代的到来,在这一时代之初,生物科学与时俱进,表现出了惊人的发展速度,生物信息量呈指数增长.人们可以通过计算机网络很容易的就可获得所需的大量生物信息资源.生物... 20世纪90年代诞生的英特网及随之而来的信息高速公路计划,标志着信息时代的到来,在这一时代之初,生物科学与时俱进,表现出了惊人的发展速度,生物信息量呈指数增长.人们可以通过计算机网络很容易的就可获得所需的大量生物信息资源.生物学、计算机、网络的相互结合孕育出了新的科学--生物信息学.在此文中,本人就结合自己所了解的有关生物信息学及查阅的有关文献和浏览的一些生物领域网站的资料,介绍一下利用计算机网络来获取生物信息的几种主要的方式. 展开更多

关键词 英特网 资源利用 序列数据库检索 生化文献检索 生物信息

在线阅读 下载PDF 职称材料

基于多层感知学习的工程档案大数据检索系统设计 被引量：4

15

作者 蒋贞慧 《自动化与仪器仪表》 2022年第2期69-72,共4页

针对现有工程档案大数据检索系统检索结果不精确的问题,提出一种基于多层感知学习的工程档案大数据检索系统。该系统整体分为商用库、感知层、分类器以及实时库,并详细针对分类器型号和结构进行设计;软件中结合MLP模型对系统档案数据库... 针对现有工程档案大数据检索系统检索结果不精确的问题,提出一种基于多层感知学习的工程档案大数据检索系统。该系统整体分为商用库、感知层、分类器以及实时库,并详细针对分类器型号和结构进行设计;软件中结合MLP模型对系统档案数据库中特征进行辨识,完成工程档案数据分类;设计实际使用过程中的检索序列,对系统在真正执行检索任务中工作模块调用顺序进行规划。在系统性能测试中,利用检索过程中查准率和查全率作为评价指标对设计系统和传统系统性能进行比较,实验结果表明,设计系统检索性能的综合评价结果更准确。 展开更多

关键词 多层感知学习 工程档案大数据 检索系统 分类器 检索序列 拉格朗日寻优

原文传递

洪水演算的参数自适应马斯京根法 被引量：7

16

作者 罗军刚 解建仓 张刚 《水力发电学报》 EI CSCD 北大核心 2011年第3期57-64,共8页

由于不同洪水所估计的马斯京根模型的参数值各不相同,采用相同的参数值势必对洪水演算的精度产生较大的影响。本文提出了一种用于洪水演算的参数自适应马斯京根法,采用数据挖掘中的时间序列相似性搜索方法搜索与当前洪水最相似的洪水过... 由于不同洪水所估计的马斯京根模型的参数值各不相同,采用相同的参数值势必对洪水演算的精度产生较大的影响。本文提出了一种用于洪水演算的参数自适应马斯京根法,采用数据挖掘中的时间序列相似性搜索方法搜索与当前洪水最相似的洪水过程,利用该相似洪水进行模型参数的最优估计,然后根据所估计的参数进行洪水演算。同时,针对参数估计中所存在的求解复杂、精度差等问题,提出了一种基于免疫克隆选择的马斯京根模型参数估计算法。该方法具有求解精度高,计算速度快、适应性强等特点,能够很好的解决马斯京根模型的参数最优估计问题。仿真实验表明参数自适应马斯京根法具有更高的演算精度,应用实例验证了该方法可行性和有效性。 展开更多

关键词 洪水演算 马斯京根模型 时间序列相似性检索 参数估计 免疫克隆选择算法

原文传递