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水稻加工品质数量性状基因座(QTLs)分子定位研究 被引量:34
1
作者 梅捍卫 罗利军 +4 位作者 郭龙彪 王一平 余新桥 应存山 黎志康 《Acta Genetica Sinica》 SCIE CAS CSCD 北大核心 2002年第9期791-797,共7页
检测了Lemont/特青RI群体 2 12个株系的糙米率 (BR)、精米率 (MR)和整精米率 (HR)等 3项加工品质性状 ,利用RFLP连锁图和线性模型的复合区间作图方法 (QTLMapperV1.0 )进行QTL定位研究。群体呈连续分布 ,双向超亲现象明显 ,HR较BR、MR... 检测了Lemont/特青RI群体 2 12个株系的糙米率 (BR)、精米率 (MR)和整精米率 (HR)等 3项加工品质性状 ,利用RFLP连锁图和线性模型的复合区间作图方法 (QTLMapperV1.0 )进行QTL定位研究。群体呈连续分布 ,双向超亲现象明显 ,HR较BR、MR变异范围更大并偏向低值方向 ;分别检测到 1个MR、4个HR主效QTL ,其中QHr6和QHr7等 2个基因座具有较大遗传效应 ;分别检测到 12对影响BR、5对影响MR、16对影响HR的上位性基因座 ,上位性效应的影响大于主效QTLs。 展开更多
关键词 水稻 加工品质 数量性状基因 分子定位
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玉米叶部性状的QTL定位与候选基因分析
2
作者 郭爽 聂蕾 +9 位作者 何玥 王栋 涂亮 刘鹏飞 蒋喻林 郭向阳 王安贵 祝云芳 吴迅 陈泽辉 《江苏农业学报》 CSCD 北大核心 2024年第10期1777-1786,共10页
叶片在玉米生长过程中发挥着重要作用,它能够有效地进行光合作用,为玉米提供营养物质,通过影响耐密性等影响产量提升。本研究选用QR273和T32为亲本,构建150份F2、F2∶3家系材料,结合基因型和不同环境中叶部性状的表型评价数据,利用完备... 叶片在玉米生长过程中发挥着重要作用,它能够有效地进行光合作用,为玉米提供营养物质,通过影响耐密性等影响产量提升。本研究选用QR273和T32为亲本,构建150份F2、F2∶3家系材料,结合基因型和不同环境中叶部性状的表型评价数据,利用完备区间作图法进行数量性状座位(QTL)定位。结果发现,2个环境下共检测到85个叶部性状相关QTL,其中有12个全株叶片数相关QTL、14个穗上叶片数相关QTL、22个叶长相关QTL、17个叶宽相关QTL、20个叶夹角相关QTL。结合公共数据库和生物信息学分析方法共筛选出7个候选基因。其中Zm00001d013612编码微管蛋白,参与调控细胞骨架结构组成;Zm00001d053543参与油菜素甾醇介导的信号通路;Zm00001d031291编码的蛋白质具有组蛋白乙酰化功能;Zm00001d031292参与富含羟脯氨酸糖蛋白家族基因表达的调控;Zm00001d031296调控钾离子跨膜转运蛋白活性;Zm00001d031300、Zm00001d031303参与碳水化合物代谢过程。蛋白质功能分析结果表明,这7个候选基因均参与细胞分化,与植物的生长发育息息相关。本研究结果将为深度揭示玉米叶部性状变异的遗传基础提供更丰富的理论支持。 展开更多
关键词 玉米 叶部性状 数量性状座位(qtl) 候选基因
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数量性状基因座(QTL)定位的研究进展 被引量:4
3
作者 李宏 《渝州大学学报(自然科学版)》 2002年第3期8-13,共6页
对数量性状基因座 (QTL)的几种主要定位方法的统计学原理进行了综述 ,总结了每种方法的优缺点及其发展动态 ,特别是对新发展的多区间作图和多性状作图进行了较详细的介绍 。
关键词 研究进展 数量性状基因 基因定位 分子标记 遗传图谱 多区间作图 性状作图
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水稻上部节间长度等数量性状基因的定位及其遗传效应分析 被引量:45
4
作者 谭震波 沈利爽 +4 位作者 况浩池 陆朝福 陈英 周开达 朱立煌 《Acta Genetica Sinica》 SCIE CAS CSCD 1996年第6期439-446,共8页
对水稻籼粳杂交(窄叶青8号×京系17)F_1的花药进行离体培养,建立一个含133个DH系的作图群体,通过构建分子连锁图谱,对水稻上部节间长度、株高和抽穗期的QTL进行区间作图,定位了影响上部节间长度的12个QTL... 对水稻籼粳杂交(窄叶青8号×京系17)F_1的花药进行离体培养,建立一个含133个DH系的作图群体,通过构建分子连锁图谱,对水稻上部节间长度、株高和抽穗期的QTL进行区间作图,定位了影响上部节间长度的12个QTL、株高的4个QTL和抽穗期的1个QTL。对这些QTL的遗传效应分析的结果表明,控制抽穗期的1个QTL即Hd8a为主效基因,其余的16个QTL为微效基因。控制上部节间长度单个的QTL对表型的贡献率介于8-18%,其加性效应可使所控制的节间长度增加大约1.6-3.6cm。值得注意的是,一些控制相关性状的、作用方向相同的QTL定位于同一染色体的相同或邻近区段上。这一结果揭示了这些性状相关的遗传基础,在水稻育种中运用这些QTL将有助于对株高进行精细的遗传调控。 展开更多
关键词 水稻 节间长度 数量性状基因 遗传效应 基因定位
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家禽数量性状基因座定位的研究进展 被引量:8
5
作者 黄银花 李宁 +1 位作者 孙汉 黄路生 《遗传》 CAS CSCD 北大核心 2001年第6期588-592,共5页
近二十年来 ,各种DNA标记技术及相关生物技术的发展和完善为高密度、覆盖面广的连锁图谱的构建及QTL的定位奠定了基础 ,本文就目前世界上建立的几个较有影响的资源家系、各种DNA标记技术、家禽中定位的QTL及存在问题等方面作一综述。
关键词 家禽 数量性状 基因定位 研究进展
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水稻抽穗期数量性状基因的定位及遗传效应分析 被引量:14
6
作者 郭晶心 陈忠正 刘耀光 《分子植物育种》 CAS CSCD 2004年第6期788-794,共7页
本研究利用特早抽穗粳稻品种石狩白毛和籼稻品种明恢63杂交的F2分离群体共116株,构建了含88个共显性分子标记的连锁图谱,对水稻(OryzasativaL.)抽穗期进行基因定位。利用2种分析软件MAP-MAKER/QTL和QTLMapper进行分析,共检测到3个抽穗... 本研究利用特早抽穗粳稻品种石狩白毛和籼稻品种明恢63杂交的F2分离群体共116株,构建了含88个共显性分子标记的连锁图谱,对水稻(OryzasativaL.)抽穗期进行基因定位。利用2种分析软件MAP-MAKER/QTL和QTLMapper进行分析,共检测到3个抽穗期的数量性状基因座(QTLs)。2个软件共同发现第7染色体上RM214与A5106标记区间内存在1个主效QTL Hd7a(Hd7c),来自明恢63的这个位点的等位基因可使抽穗期延迟。其余2个QTLs分别位于第7、9染色体上。同时检测到有5对位点间存在上位性作用,但相对贡献率较小,表明上位性效应也是影响抽穗期的遗传基础。 展开更多
关键词 水稻 抽穗期 数量性状基因 基因定位 遗传效应 上位性效应
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微卫星标记与奶牛数量性状QTL定位 被引量:6
7
作者 储明星 叶素成 陈国宏 《遗传》 CAS CSCD 北大核心 2003年第3期337-340,共4页
本文对奶牛产奶性能(产奶量、乳脂率、乳脂量、蛋白率、蛋白量)、乳房炎及体细胞数、繁殖性能、生产寿命等数量性状QTL定位研究进展进行了综述。
关键词 微卫星标记 奶牛 数量性状 qtl定位 产奶性能 乳房炎 体细胞数 遗传标记 繁殖性状
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家畜数量性状基因定位研究进展 被引量:8
8
作者 王勇强 张沅 张勤 《中国畜牧杂志》 CAS 北大核心 2000年第1期41-42,共2页
关键词 家畜 数量性状 基因定位 qtl定位 研究进展
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猪2、7和8号染色体上影响血常规指标的数量性状基因座(QTL)检测 被引量:5
9
作者 巩元芳 卢昕 +3 位作者 王志鹏 李珊 邱小田 张勤 《生物化学与生物物理进展》 SCIE CAS CSCD 北大核心 2008年第11期1291-1297,共7页
以3个品种(长白猪、大白猪、松辽黑猪)16个公猪家系共计368头仔猪组成资源群体,在猪2、7和8号染色体上共选取35个微卫星标记,采用基于线性混合模型的方差组分分析方法,对影响与猪白细胞、红细胞和血小板相关的共计18项血常规指标的数量... 以3个品种(长白猪、大白猪、松辽黑猪)16个公猪家系共计368头仔猪组成资源群体,在猪2、7和8号染色体上共选取35个微卫星标记,采用基于线性混合模型的方差组分分析方法,对影响与猪白细胞、红细胞和血小板相关的共计18项血常规指标的数量性状基因座(quantitative trait loci,QTL)进行了检测.通过似然比检验,并以自由度为2的卡方分布作为检验统计量的分布,共发现22个在P<5%水平下显著的QTL,其中在2号染色体上有9个,分别影响白细胞总数、中性粒细胞数、平均红细胞体积、血红蛋白含量、平均红细胞血红蛋白浓度、血小板总数、平均血小板体积、血小板分布宽度和血小板压积,在7号染色体有7个,分别影响白细胞总数、中性粒细胞数、平均红细胞血红蛋白浓度、血红蛋白含量、血小板总数、平均红细胞体积和红细胞分布宽度变异,在8号染色体上有6个,分别影响中性粒细胞百分比、淋巴细胞百分比、平均红细胞血红蛋白浓度、血小板总数、血小板压积和平均红细胞体积.为尽可能地避免由于多重检验所造成的假阳性率的升高,我们采用了控制假检出率(false discovery rate,FDR)的方法来对这22个QTL进行进一步检验,发现有14个达到FDR<5%显著水平,其中又有9个达到FDR<1%显著水平. 展开更多
关键词 血常规指标 数量性状基因座(qtl) 方差组分分析 假检出率(FDR)
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水稻异株克生抗杂草的数量性状及其基因定位研究 被引量:6
10
作者 徐正浩 余柳青 +4 位作者 赵明 张旭 魏兴华 郭龙彪 叶元林 《植物保护》 CAS CSCD 北大核心 2002年第5期40-42,共3页
水稻异株克生抗杂草的特性是受数量性状控制的。异株克生抗靶杂草水稻材料与非异株克生抗靶杂草的杂种二代 (F2 )经生物检测 ,靶杂草的根或芽长的表型呈现正态分布。通过常规育种很难获得更强的异株克生作用亲本的杂种 ,因与水稻异株克... 水稻异株克生抗杂草的特性是受数量性状控制的。异株克生抗靶杂草水稻材料与非异株克生抗靶杂草的杂种二代 (F2 )经生物检测 ,靶杂草的根或芽长的表型呈现正态分布。通过常规育种很难获得更强的异株克生作用亲本的杂种 ,因与水稻异株克生相关的效应基因数不多。目前唯一的有关水稻异株克生基因定位的研究报道表明 ,有 4个数量性状位点 (QTLs)分别位于第 2、3、3、8条染色体上。异株克生主效应的QTLs与根形态的主效应不在同一个位点。对产生异株克生物质的酶作定位标记 ,可对QTLs作进一步精细定位 。 展开更多
关键词 异株克生 基因定位 水稻 异株克生抗杂草 数量性状
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植物数量性状基因的定位与克隆 被引量:7
11
作者 张磊 张宝石 《植物学通报》 CSCD 北大核心 2007年第4期553-560,共8页
作物的许多重要农艺性状属于数量性状,鉴定和发掘控制数量性状的基因及其优异的等位变异,并使之快速应用于育种实践是新时期作物科学家和育种学家所面临的重大课题。本文从QTL作图、QTL的精细定位与图位克隆、QTL近等基因系和染色体片... 作物的许多重要农艺性状属于数量性状,鉴定和发掘控制数量性状的基因及其优异的等位变异,并使之快速应用于育种实践是新时期作物科学家和育种学家所面临的重大课题。本文从QTL作图、QTL的精细定位与图位克隆、QTL近等基因系和染色体片断代换系的建立以及基于LD的关联分析等方面对植物数量性状的研究进展进行了讨论,提出了以植物基因组学技术为平台,将QTL作图与关联分析方法相结合,是进行数量性状遗传机理研究同时服务于作物育种实践的有效途径。 展开更多
关键词 关联分析 基因发掘 qtl克隆 qtl作图 数量性状
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猪繁殖性状QTL基因定位研究进展 被引量:2
12
作者 王爱华 赵志辉 李宁 《中国兽医学报》 CAS CSCD 北大核心 2002年第4期415-417,共3页
关键词 基因定位 繁殖性状 qtl 候选基因
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棉花数量性状遗传与QTL定位研究进展 被引量:3
13
作者 周仲华 陈金湘 《中国农学通报》 CSCD 2005年第10期36-40,共5页
棉花许多重要的性状多为数量性状。现代分子生物技术的发展为植物数量性状基因的定位、分离等研究提供了条件。从数量性状基因座(QTL)作图群体类型及其特点,QTL定位方法,QTL精细定位、克隆、利用等方面进行了综述,并对今后QTL研究进行... 棉花许多重要的性状多为数量性状。现代分子生物技术的发展为植物数量性状基因的定位、分离等研究提供了条件。从数量性状基因座(QTL)作图群体类型及其特点,QTL定位方法,QTL精细定位、克隆、利用等方面进行了综述,并对今后QTL研究进行了展望。 展开更多
关键词 棉花 数量性状 数量性状基因座(qtl) 精确定位 克隆 利用 数量性状遗传 定位研究 qtl 棉花 数量性状基因 分子生物技术 群体类型 定位方法 精细定位
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林木数量性状基因定位中的若干问题 被引量:4
14
作者 易能君 尹佟明 +1 位作者 黄敏仁 朱立煌 《生物工程进展》 CSCD 1998年第3期19-24,共6页
随着DNA分子标记技术的迅速发展,QTL定位已成为当前生物学研究领域的前沿。迄今已对许多种动、植物定位了许多重要性状的QTL。这些研究促进了遗传学的发展,并将作为育种的新策略应用。与作物相比,林木QTL定位有其特性。... 随着DNA分子标记技术的迅速发展,QTL定位已成为当前生物学研究领域的前沿。迄今已对许多种动、植物定位了许多重要性状的QTL。这些研究促进了遗传学的发展,并将作为育种的新策略应用。与作物相比,林木QTL定位有其特性。本文详细讨论了林木的生物学特性对QTL定位的影响、QTL定位的系谱设计和统计分析方法。 展开更多
关键词 数量性状 基因位点 远交系谱 基因定位 林木
全文增补中
德系黑白花奶牛数量性状基因定位研究初报 被引量:8
15
作者 徐宁迎 傅衍 《浙江农业大学学报》 CSCD 北大核心 1999年第1期107-110,共4页
在德系黑白花奶牛中,对产奶量、乳蛋白量、乳脂量和奶中体细胞数四个数量性状进行基因定位,试验采用祖孙女设计法。试验动物为16个父系半同胞家系共755头种公牛,试验共测定了8对染色体上的64颗微卫星,父代公牛四个性状的育... 在德系黑白花奶牛中,对产奶量、乳蛋白量、乳脂量和奶中体细胞数四个数量性状进行基因定位,试验采用祖孙女设计法。试验动物为16个父系半同胞家系共755头种公牛,试验共测定了8对染色体上的64颗微卫星,父代公牛四个性状的育种值由孙代母牛估算得到。连锁分析采用回归间距定位法,临界F值由置换试验法得到。 展开更多
关键词 数量性状 祖孙女设计法 基因定位 黑白花奶牛
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基因型错误对数量性状精细定位的哈迪-温伯格不平衡指数的效应 被引量:3
16
作者 李玉梅 陈湘定 邓红文 《生物数学学报》 CSCD 北大核心 2007年第2期259-264,共6页
使用紧密相邻的标记位点且与标记基因频率无关的哈迪-温伯格不平衡(HWD)指数被用来对数量性状位点(QTL)进行精细定位.本文讨论了当存在基因型错误时HWD指数的性质.文章指出,当存在基因型错误时,对于在群体的标记基因频率已知的情形使用... 使用紧密相邻的标记位点且与标记基因频率无关的哈迪-温伯格不平衡(HWD)指数被用来对数量性状位点(QTL)进行精细定位.本文讨论了当存在基因型错误时HWD指数的性质.文章指出,当存在基因型错误时,对于在群体的标记基因频率已知的情形使用的两个HWD指数尽管受基因型错误的影响但仍然有效;而仅仅极端样本的标记基因频率已知的情形下使用的两个HWD指数同时与基因型错误和标记基因频率有关.计算机模拟表明,仅仅极端样本的标记基因频率已知的情形下使用的两个HWD指数在精细定位时会产生偏差,不适宜作精细定位. 展开更多
关键词 基因型错误 效应 哈迪-温伯格不平衡 精细定位 数量性状位点
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基于最小二乘估计的数量性状基因座的复合区间定位法 被引量:25
17
作者 吴为人 李维明 卢浩然 《福建农业大学学报》 CSCD 1996年第4期394-399,共6页
数量性状基因座(QTL)的复合区间定位法是区间定位法的1种改进方法,它大大提高了QTL定位的准确性,但计算上比较复杂和费时.由于其似然比统计量的联合分布未知,故准确的显著性测验临界值必须采用排列测验法或模拟抽样法进行... 数量性状基因座(QTL)的复合区间定位法是区间定位法的1种改进方法,它大大提高了QTL定位的准确性,但计算上比较复杂和费时.由于其似然比统计量的联合分布未知,故准确的显著性测验临界值必须采用排列测验法或模拟抽样法进行估计,但其复杂费时的计算使得这些经验方法显得不实用.本文给出基于最小二乘估计的复合区间定位法,它保持了复合区间定位的基本性质,但在计算上要比基于最大似然估计的方法简单和快速得多.由于它对性状的分布无需特殊的要求,因而有更广的适用范围.通过消除模型中冗余的标记,可使数值计算速度进一步提高.这样,用经验方法估计显著临界值就变得可行了.另外,消除冗余标记还可提高QTL定位的准确性,改进QTL效应的估值. 展开更多
关键词 数量性状基因 复合区间定位 最小二乘法
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数量性状基因定位与作物杂种优势 被引量:2
18
作者 倪中福 孙其信 陈希勇 《作物杂志》 CSCD 北大核心 1996年第3期14-16,共3页
数量性状基因定位与作物杂种优势倪中福,孙其信,陈希勇(中国农业大学植物遗传育种系北京100094)(河北省农科院石家庄050031)作物重要的农艺性状属数量性状。决定数量性状的基因是微效多基因。深入研究数量性状基因位... 数量性状基因定位与作物杂种优势倪中福,孙其信,陈希勇(中国农业大学植物遗传育种系北京100094)(河北省农科院石家庄050031)作物重要的农艺性状属数量性状。决定数量性状的基因是微效多基因。深入研究数量性状基因位点,了解其基因的数目、位置及作用方... 展开更多
关键词 作物 杂种优势 数量性状 基因定位
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畜禽数量性状基因座位的精细定位 被引量:7
19
作者 鲁绍雄 连林生 《中国牛业科学》 2006年第1期38-42,共5页
数量性状基因座位(QTL)的精细定位是实施QTL克隆及标记辅助选择(MAS)的重要基础。然而就目前畜禽QTL定位的结果来看,除了通过候选基因法识别的少数基因外,大多数QTL定位的精度仍无法满足实际应用的要求。为进一步提高QTL定位的精度,缩小... 数量性状基因座位(QTL)的精细定位是实施QTL克隆及标记辅助选择(MAS)的重要基础。然而就目前畜禽QTL定位的结果来看,除了通过候选基因法识别的少数基因外,大多数QTL定位的精度仍无法满足实际应用的要求。为进一步提高QTL定位的精度,缩小QTL定位的置信区间,人们相继提出并发展了一系列新的QTL定位方法。本文在分析畜禽QTL定位的基本方法及影响畜禽QTL定位精度的主要因素基础上,对提高QTL定位精确性的策略和方法进行了相应的探讨。 展开更多
关键词 畜禽 数量性状基因座位 精细定位 标记辅助选择 qtl
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运用混合线性模型定位复杂数量性状基因的方法 被引量:76
20
作者 朱军 《浙江大学学报(自然科学版)》 CSCD 1999年第3期327-335,共9页
运用混合线性模型分析原理,提出了复杂数量性状基因定位的方法,可以分析QTL复杂的遗传效应及QTL×环境互作效应.采用混合线性模型随机效应的无偏预测方法,可以预测基因型值和基因型×环境互作效应值,再运用区间作图... 运用混合线性模型分析原理,提出了复杂数量性状基因定位的方法,可以分析QTL复杂的遗传效应及QTL×环境互作效应.采用混合线性模型随机效应的无偏预测方法,可以预测基因型值和基因型×环境互作效应值,再运用区间作图法或复合区间作图法间接分析QTL的加性、显性遗传主效应及其与环境的互作效应,还能定位在特定发育阶段表达的QTL.基于混合模型的复合区间作图法(MCIM法)可以分析多环境的遗传实验资料,直接分析包括上位性效应的遗传主效应及其与环境的互作效应.Markov链蒙特卡罗(MCMC)分析方法可用于推断QTL的统计特征. 展开更多
关键词 数量性状基因 混合线性模型 数量遗传 基因定位
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