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关于Mapmaker/Exp遗传作图中标记分群和排序操作技术的讨论 被引量:14
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作者 邢光南 赵团结 盖钧镒 《作物学报》 CAS CSCD 北大核心 2008年第2期217-223,共7页
Mapmaker/Exp(3.0)是国内外广泛使用的遗传连锁数据分析软件,在分子标记数量大时(多于500个)往往出现所绘制连锁图谱图距偏大的现象。本文从标记分群和标记排序两个遗传作图环节分析原因并概括出以下两个实施要点:(1)标记分群不应强求同... Mapmaker/Exp(3.0)是国内外广泛使用的遗传连锁数据分析软件,在分子标记数量大时(多于500个)往往出现所绘制连锁图谱图距偏大的现象。本文从标记分群和标记排序两个遗传作图环节分析原因并概括出以下两个实施要点:(1)标记分群不应强求同一LOD值,对特殊的连锁群可试用不同LOD值;(2)在标记排序时,一次order命令后用ripple命令反复梳理有时并不能获得最佳排列顺序,而应多次使用order,每次order后用ripple反复梳理,经反复比较才能得出最佳排列顺序,必要时还须结合人工调整。通过大豆遗传作图实例比较了软件推荐思路2的通常用法和作者建议的新用法所构建的遗传图谱及相应QTL定位的差异,认为新用法具有更好的效果。 展开更多
关键词 Mapmaker/Exp(3.0) 遗传连锁图谱 作图技术 标记分群 标记排序
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分子标记多位点排序的并行计算
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作者 蒋安纳 徐逸卿 +1 位作者 董程玲 童春发 《计算机应用研究》 CSCD 北大核心 2015年第1期75-79,84,共6页
为了对一组连锁的分子标记位点获得正确的排序进而构建生物遗传连锁图谱,提出了并行算法PMMASLH,针对F2作图群体,通过基于消息传递接口并行最大最小蚂蚁系统求解连锁的多个分子标记位点排序,使用隐马尔可夫模型计算一列有序标记位点所... 为了对一组连锁的分子标记位点获得正确的排序进而构建生物遗传连锁图谱,提出了并行算法PMMASLH,针对F2作图群体,通过基于消息传递接口并行最大最小蚂蚁系统求解连锁的多个分子标记位点排序,使用隐马尔可夫模型计算一列有序标记位点所获得的极大似然值作为排序的目标函数。计算机模拟结果表明,该算法执行效率高、计算稳定,排序的功效优于著名的连锁作图软件Mapmaker。 展开更多
关键词 分子标记排序 并行计算 最大最小蚂蚁系统 隐马尔可夫模型 F2群体
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基于间隔准则的优化排序多标记学习算法
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作者 金亚洲 张正军 +1 位作者 颜子寒 王雅萍 《计算机工程》 CAS CSCD 北大核心 2020年第7期104-109,共6页
针对多标记学习分类问题,算法适应方法将其转化为排序问题,并将输出标记按照其与示例的相关性进行排序,该类方法取得了较好的分类效果。基于间隔准则提出一种多标记学习算法,通过优化模型在示例的相关标记集合中最小输出与不相关标记集... 针对多标记学习分类问题,算法适应方法将其转化为排序问题,并将输出标记按照其与示例的相关性进行排序,该类方法取得了较好的分类效果。基于间隔准则提出一种多标记学习算法,通过优化模型在示例的相关标记集合中最小输出与不相关标记集合中最大输出的间隔损失来进行标记排序。在此基础上,为充分利用全部标记信息,提出一种改进的优化排序多标记学习算法,分别优化模型在示例的相关标记集合中平均输出与不相关标记集合中最大输出的间隔损失,以及优化模型在相关标记集合中最小输出与不相关标记集合中平均输出的间隔损失,从而实现标记排序。在模型的参数学习过程中,使用改进的次梯度Pegasos算法进行优化。将所提2种算法与ML-RBF、BP-MLL、ML-KNN多标记学习算法在4个多标记数据集上进行对比实验,结果表明,在HL、RL等5种不同的评价准则下,2种算法均能与对比算法取得相近的分类性能。 展开更多
关键词 标记学习 算法适应 标记排序 平均输出 间隔准则 Pegasos算法
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结合局部标记序关系的弱监督标记分布学习
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作者 秦天 滕齐发 贾修一 《智能系统学报》 CSCD 北大核心 2023年第1期47-55,共9页
标记分布学习(label distribution learning,LDL)是一种用于解决标记多义性的新颖学习范式。现有的LDL方法大多基于完整数据信息进行设计,然而由于高昂的标注成本以及标注人员水平的局限性,很难获取到完整标注数据信息,且会导致传统LDL... 标记分布学习(label distribution learning,LDL)是一种用于解决标记多义性的新颖学习范式。现有的LDL方法大多基于完整数据信息进行设计,然而由于高昂的标注成本以及标注人员水平的局限性,很难获取到完整标注数据信息,且会导致传统LDL算法性能的下降。为此,本文提出了一种新型的结合局部序标记关系的弱监督标记分布学习算法,通过维持尚未缺失标记之间的相对关系,并利用标记相关性来恢复缺失的标记,在数据标注不完整的情况下提升算法性能。在14个数据集上进行了大量的实验来验证算法的有效性。 展开更多
关键词 标记分布学习 标记多义性 弱监督学习 标记排序 弱监督标记分布学习 标记学习 标记相关性 局部标记序关系
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基于改进A*的三维航迹快速规划方法 被引量:7
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作者 张大巧 鲜勇 +1 位作者 许立军 王剑 《弹箭与制导学报》 CSCD 北大核心 2010年第5期59-62,共4页
针对导弹航迹规划的高时效性要求,提出了一种基于改进A*的快速航迹规划方法。该方法针对A*算法计算过程的主要耗时点,采用了基于双向链表的OPEN表标记插入排序方法;针对导弹飞行三维约束条件,引入了基于简化运动学方程的空间节点高效扩... 针对导弹航迹规划的高时效性要求,提出了一种基于改进A*的快速航迹规划方法。该方法针对A*算法计算过程的主要耗时点,采用了基于双向链表的OPEN表标记插入排序方法;针对导弹飞行三维约束条件,引入了基于简化运动学方程的空间节点高效扩展方法。仿真结果证明,改进A*算法在没有改变航迹规划结果质量的同时,有效的提高了航迹的搜索速度。 展开更多
关键词 航迹规划 A*算法 标记插入排序 高效搜索空间
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