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题名硒处理下冰菜的转录组响应及相关基因功能分析
被引量：1
- 1
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作者
姚运法
练冬梅
林碧珍
赖正锋
洪建基
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机构
福建省农业科学院亚热带农业研究所
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出处
《西南农业学报》
CSCD
北大核心
2021年第12期2737-2747,共11页
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基金
福建省公益类项目(2019R1030-2)
漳州市自然科学基金(ZZ2019J21)。
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文摘
【目的】探索外源硒对冰菜转录组相应机制影响及相关功能基因挖掘。【方法】利用高通量测序技术,构建冰菜硒响应转录组数据库。【结果】硒处理对冰菜植物激素信号转导途径影响:除油菜素类固醇外,其它7个激素代谢途径均产生重要影响。硒处理浓度的增加,能够促进生长素信号转导,激活下游基因表达;细胞分裂素信号转导途径中,AHP对硒处理敏感,A-ARR受硒处理呈显著上调作用,但均对硒浓度变化不敏感;硒处理浓度增加,使得赤霉素信号转导下游TF得到激活;脱落酸信号转导途径中,低硒处理(10 mmol/L)导致SnRK2表达量显著降低,抑制气孔关闭,导致冰菜易脱水;硒处理(100 mmol/L)SnRK2蛋白表达量显著恢复;乙烯信号转导途径中ETR和ERF1/2表达量随着硒处理浓度的提高而降低;硒处理(10 mmol/L)促进茉莉酸信号途径中JAZ和MYC2表达量上调,调节硒对冰菜的逆境胁迫,硒处理(10 mmol/L)对JAZ和MYC2表达量影响不显著;水杨酸信号转导途径中TGA和PR-1在硒处理(10 mmol/L)表达量无上下调表达,硒处理(100 mmol/L)TGA表达量下调,PR-1表达量上调,激活冰菜硒响应能力。经实时定量PCR分析,7个DEGs相对表达量与转录组表达谱分析趋势完全一致。【结论】本研究为冰菜硒关键基因挖掘和遗传育种奠定了一定基础。
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关键词
冰菜
转录组
差异表达基因
植物激素信号转导途径
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Keywords
Ice plant
Transcriptome
Function annotation
DEGs
Plant hormone signal transduction pathway
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分类号
S641.9
[农业科学—蔬菜学]
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题名甲基磺酸乙酯对蒲公英胚性细胞基因表达的影响
- 2
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作者
冯薇
孟然
李赵嘉
吴哲
鲁雪林
陈悦
王秀萍
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机构
河北省农林科学院滨海农业研究所
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出处
《中草药》
北大核心
2025年第6期2111-2121,共11页
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基金
河北省农林科学院基本科研业务费项目(2023010101)
河北省重点研发项目(21326312D-8)
河北省农林科学院科技创新专项课题资助(2022KJCXZX-BHS-4)。
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文摘
目的对甲基磺酸乙酯(ethyl methanesulfonate,EMS)诱变下蒲公英Taraxacum mongolicum胚性细胞进行转录组测序,探究EMS诱变对蒲公英基因表达的影响。方法利用Illumina HiSeq 2500高通量测序技术对对照(CK)、0.15%EMS处理8 h后的蒲公英胚性细胞进行测序并建立cDNA数据库,经拼接后得到Unigene,并进一步开展生物信息学分析。结果共获得Unigene 45551条,分别有32954、12923、21752、28115、9764条被非冗余数据库(non-redundant protein sequence database,NR)、基因本体(gene ontology,GO)、Swiss-Prot、eggNOG、京都基因与基因组数据库(Kyoto encyclopedia of genes and genomes,KEGG)等数据库注释,GO富集分析发现,蒲公英胚性细胞的DEGs在GO功能注释中主要集中于细胞过程、代谢过程、结合蛋白、氧化还原、催化活性等功能。KEGG途径富集结果表明,EMS诱变下DEGs显著富集在植物激素信号转导、光合作用、光合生物的固碳作用及光合作用-天线蛋白、胡萝卜素合成、不饱和脂肪酸代谢以及淀粉和糖代谢途径。EMS诱变能引起蒲公英胚性细胞植物激素信号转导途径关键酶基因的表达上调,响应胁迫。结论通过转录组测序,初步表明EMS诱变下蒲公英胚性细胞差异基因的表达,并调控蒲公英胚性细胞中植物激素信号转导途径的相关酶基因,以期为从分子基因方面培育优质蒲公英提供参考和依据。
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关键词
蒲公英
甲基磺酸乙酯
转录组测序
胡萝卜素
植物激素信号转导途径
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Keywords
Taraxacum mongolicum Hand.-Mazz.
ethyl methanesulfonate
transcriptome sequencing
carotene
plant hormone signaling pathway
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分类号
R286.12
[医药卫生—中药学]
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题名水稻穗发育的分子生物学研究进展
被引量：15
- 3
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作者
卢寰
时振英
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机构
中国科学院上海生命科学研究院植物生理生态研究所
中国科学院大学
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出处
《植物生理学报》
CAS
CSCD
北大核心
2013年第2期111-121,共11页
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基金
转基因生物新品种培育重大专项(2011ZX08009-003-003)
"十二五"农村领域国家科技计划(2012AA10A302-2)
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文摘
穗型是水稻株型的重要组成部分之一,也是影响水稻产量的关键农艺性状之一。穗的形成过程是一个涉及腋生分生组织发育、花序结构建成和籽粒发育的复杂生理生化过程,是众多基因参与调控的一个复杂有序的网络系统。本文简介了水稻穗发育的一般过程,总结了近年来同水稻穗发育相关的基因的研究情况,分类叙述了这些基因调控穗型的机理以及可能存在的相互关系,讨论了植物激素信号途径的相关基因和miRNA参与调控植物穗发育的机制。
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关键词
水稻
穗型
腋生分生组织
植物激素信号途径
miRNA
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Keywords
rice
panicle architecture
axillary meristem
plant hormone signaling pathway
miRNA
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分类号
S511
[农业科学—作物学]
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