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牙周病与类风湿关节炎的竞争性内源RNA调控网络构建及免疫相关性分析
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作者 赵晓雪 张欣然 张婷婷 《山东医药》 2025年第2期25-29,共5页
目的构建牙周病(PD)与类风湿关节炎(RA)的竞争性内源RNA(ceRNA)调控网络,并分析二者的免疫相关性。方法从美国国立生物技术信息中心建立的基因表达综合数据库获取PD与RA的数据集,通过筛选两疾病的差异基因、加权基因共表达网络分析及免... 目的构建牙周病(PD)与类风湿关节炎(RA)的竞争性内源RNA(ceRNA)调控网络,并分析二者的免疫相关性。方法从美国国立生物技术信息中心建立的基因表达综合数据库获取PD与RA的数据集,通过筛选两疾病的差异基因、加权基因共表达网络分析及免疫数据集取交集获得关键基因。用受试者工作特征曲线(ROC)、基因相关性分析、单样本基因集富集分析对关键基因进行功能富集及外部数据集验证。用关键基因及数据库预测靶基因构建ceRNA调控网络,用免疫浸润分析网站分析PD与RA的免疫相关性。结果共筛选出4个关键基因(白细胞介素10受体A、RAS相关的C3肉毒毒素底物2、布鲁顿酪氨酸激酶、F2型跨膜蛋白信号淋巴细胞活化分子家族受体),对PD与RA诊断价值较高,且基因间具有高相关性。4个关键基因参与了PD与RA的不同通路。4个关键基因和2个关键基因的靶miRNA(hsa-miR-1271-5p、hsa-let-7e-5p),分别获得9个PD的DElncRNA、16个RA的DElncRNA,构建两种疾病的ceRNA网络。PD、RA患者与正常对照者免疫细胞比例存在差异。PD患者外周血浆细胞比例较正常对照者高。而PD患者表面表达CD8亚群的细胞毒性T淋巴细胞(CD8+T淋巴细胞)、活化的自然杀伤细胞(NK细胞)、M2型巨噬细胞、静息的树突状细胞、静息的肥大细胞比例低。与正常对照者比较,RA患者滑膜中浆细胞、γδT淋巴细胞、M1型巨噬细胞的比例高。PD患者静息状态下的树突状细胞与浆细胞呈负相关;RA患者中静息状态下肥大细胞与活化肥大细胞呈负相关,M1型巨噬细胞与单核细胞呈负相关,γδT淋巴细胞与单核细胞呈负相关,M1型巨噬细胞与γδT淋巴细胞呈正相关。结论成功筛选出4个关键基因并分别构建了PD与RA的ceRNA调控网络,PD与RA有部分免疫应答机制相同。 展开更多
关键词 牙周病 类风湿关节炎 竞争性内源rna 基因调控网络 免疫浸润
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竞争性内源RNA(ceRNAs)研究进展——RNA对话的新机制 被引量:6
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作者 汤锋 刘昆梅 +1 位作者 李润乐 奚涛 《中国药科大学学报》 CAS CSCD 北大核心 2012年第6期481-485,共5页
microRNAs(miRNAs)是一类长度约为22 nt的非编码单链小RNA分子,通过其种子序列与靶基因的3'UTR互补并引导沉默复合体(RISC)降解或抑制靶基因的翻译,在转录后水平调控靶基因的表达。一个miRNA可调控多个靶基因,同一个靶基因也可以受... microRNAs(miRNAs)是一类长度约为22 nt的非编码单链小RNA分子,通过其种子序列与靶基因的3'UTR互补并引导沉默复合体(RISC)降解或抑制靶基因的翻译,在转录后水平调控靶基因的表达。一个miRNA可调控多个靶基因,同一个靶基因也可以受多个miRNA调控。最新的研究发现mRNA之间可以通过miRNAs反应原件(MREs)达到相互调控的目的,这种新的调控机制被称作竞争性内源RNA(ceRNAs)假说,这种RNA之间新的对话机制的出现不仅在转录组学水平赋予了mRNAs、长链非编码RNA及假基因的转录产物新的生物学功能,扩大人类基因组中的功能性遗传信息,并且绘制了一个更庞大的miRNAs与mRNA相互调控的网络,为深入研究肿瘤等疾病的发病机制提供新的理论依据。本文从ceRNAs调控网络的成员、ceRNAs调控机制的作用基础、作用方式及ceRNAs与肿瘤等多方面对ceRNAs调控机制的研究进展进行综述。 展开更多
关键词 竞争性内源rna 微小rna 基因表达调控 肿瘤
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肺缺血-再灌注核心基因介导的竞争性内源性RNA网络的构建
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作者 李晓凤 唐明政 +4 位作者 刘禧禧 宋子晴 张国欣 杨开银 张凌云 《器官移植》 CSCD 北大核心 2024年第1期70-81,共12页
目的分析肺缺血-再灌注损伤发生的核心基因并构建竞争性内源性RNA(ceRNA)网络。方法从基因表达综合(GEO)数据库下载GSE145989的原始数据当作训练集,GSE172222和GSE9634数据集作为验证集,并鉴定差异表达基因(DEG)。进行基因本体(GO)、京... 目的分析肺缺血-再灌注损伤发生的核心基因并构建竞争性内源性RNA(ceRNA)网络。方法从基因表达综合(GEO)数据库下载GSE145989的原始数据当作训练集,GSE172222和GSE9634数据集作为验证集,并鉴定差异表达基因(DEG)。进行基因本体(GO)、京都基因与基因组百科全书(KEGG)富集分析。构建蛋白质-蛋白质相互作用(PPI)网络,筛选核心基因并分析核心基因的诊断价值、免疫细胞的免疫浸润水平。构建并验证ceRNA网络。分析基于ceRNA网络的靶向药物。结果共检测到179个DEG,其中61个下调基因,118个上调基因。GO分析结果显示,DEG与细胞迁移、分化和调节等生物学过程有关;与内吞囊泡膜、浆膜和膜筏等细胞成分有关;与趋化因子受体、G蛋白偶联受体、免疫受体活性和抗原结合等分子功能有关。KEGG分析显示DEG参与肿瘤坏死因子(TNF)、Wnt、白细胞介素(IL)-17和核因子(NF)-κB等信号通路。PPI网络提示CD8A、IL2RG、STAT1、CD3G和SYK是肺缺血-再灌注损伤的核心基因。ceRNA网络提示miR-146a-3p、miR-28-5p和miR-593-3p与CD3G的表达相关;miR-149-3p、miR-342-5p、miR-873-5p和miR-491-5p与IL2RG表达相关;miR-194-3p、miR-512-3p、miR-377-3p和miR-590-3p与SYK表达相关;miR-590-3p和miR-875-3p与CD8A表达相关;miR-143-5p、miR-1231、miR-590-3p、miR-875-3p与STAT1表达相关。CD3G有13种靶向药物,IL2RG有4种靶向药物,SYK有28种靶向药物,lncRNA MUC2有3种靶向药物,未发现CD8A、STAT1和其他ceRNA网络基因的靶向药物。结论CD8A、IL2RG、STAT1、CD3G和SYK是肺缺血-再灌注损伤的核心基因,对核心基因进行研究分析可能有助于肺缺血-再灌注损伤的诊断,并提供新的研究思路和治疗靶点。 展开更多
关键词 肺移植 缺血-再灌注损伤 核心基因 竞争性内源rna(cerna) 微小rna 长链非编码rna 环状rna 信号通路
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lncRNA-TUG1作为竞争性内源RNA在心血管疾病中的研究进展 被引量:1
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作者 常晨 苏强 《中国病理生理杂志》 CAS CSCD 北大核心 2024年第3期557-563,共7页
长链非编码RNA(long no-coding RNA,lncRNA)是指长度超过200个核苷酸的RNA分子,虽然本身并不具备直接编码蛋白质的作用,却可通过参与多种生物过程,包括细胞增殖、分化、凋亡等介导疾病的发生[1]。lncRNA-牛磺酸上调基因1(taurine up-reg... 长链非编码RNA(long no-coding RNA,lncRNA)是指长度超过200个核苷酸的RNA分子,虽然本身并不具备直接编码蛋白质的作用,却可通过参与多种生物过程,包括细胞增殖、分化、凋亡等介导疾病的发生[1]。lncRNA-牛磺酸上调基因1(taurine up-regulated gene 1,TUG1)被认为与人类疾病进展密切[2]。此外,过表达lncRNA-TUG1是心血管疾病后心脏预后不良的生物标志物[3]。 展开更多
关键词 牛磺酸上调基因1 竞争性内源rna 心血管疾病
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精神分裂症患者外周血中差异表达circRNA、miRNA、mRNA筛选及核心竞争性内源RNA网络构建
5
作者 王艺梦 邰旭光 +3 位作者 李小龙 刘鹏 王越 祁冬冬 《山东医药》 CAS 2024年第33期30-34,共5页
目的筛选精神分裂症患者外周血中差异表达的circRNA、miRNA、mRNA,并构建核心竞争性内源RNA(ceRNA)网络,解析精神分裂症发生发展的分子机制。方法精神分裂症患者6例记为精神分裂症组,同期体检健康的人群4例记为健康对照组。采集两组研... 目的筛选精神分裂症患者外周血中差异表达的circRNA、miRNA、mRNA,并构建核心竞争性内源RNA(ceRNA)网络,解析精神分裂症发生发展的分子机制。方法精神分裂症患者6例记为精神分裂症组,同期体检健康的人群4例记为健康对照组。采集两组研究对象的外周血,提取总RNA后构建cDNA文库并进行高通量测序,采用R软件筛选精神分裂症患者外周血中差异表达circRNA、miRNA、mRNA。采用miRanda和qTar数据库共同预测与差异表达miRNA相互作用的circRNA和mRNA,与差异表达的circRNA、mRNA取交集后,采用R软件构建差异表达的ceRNA网络。基于DAVID数据库对精神分裂症患者差异表达ceRNA网络中差异mRNA进行GO和KEGG富集分析。采用string数据库构建精神分裂症患者差异表达ceRNA网络中差异mRNA之间的PPI网络,选用cytoscape软件中cytoHubba插件筛选影响精神分裂症发生发展的核心mRNA,选择与核心mRNA存在相互作用关系的miRNA和circRNA构建精神分裂症患者外周血中差异表达的核心ceRNA网络。结果相比健康对照组,精神分裂症组患者外周血中差异表达circRNA、miRNA、mRNA分别为31、213、2624个。构建了由差异表达的5个circRNA、4个miRNA和57个mRNA组成的ceRNA网络。精神分裂症患者差异表达ceRNA网络中mRNA主要参与化学刺激的感官知觉、多细胞生物生长的负调控等生物过程,涉及泛素-泛素连接酶活性、鸟苷酸结合、酶结合等分子功能,以及细胞质、肌动蛋白细胞骨架、轴突末端等细胞成分,ceRNA网络中mRNA显著富集于NF-κB信号通路、PI3K-Akt信号通路、Ras信号通路、泛素介导的蛋白水解等代谢通路。构建的精神分裂症患者差异表达ceRNA网络中mRNA PPI网络共包含23个节点和22条边,筛选获得影响精神分裂症发生发展的2个核心mRNA为BRCA1、GNAS。构建的精神分裂症患者外周血中差异表达的核心ceRNA网络包含5个节点和4条边。5个节点中包含2个核心mRNA:BRCA1、GNAS,1个miRNA:hsa-miR-502-5p,2个circRNA:hsa_circ_0001423、hsa_circ_0008494。4条边分别为hsa_circ_0001423/hsa-miR-502-5p/BRCA1、hsa_circ_0001423/hsa-miR-502-5p/GNAS、hsa_circ_0008494/hsa-miR-502-5p/BRCA1和hsa_circ_0008494/hsa-miR-502-5p/GNAS。结论与健康对照人群相比,精神分裂症患者外周血中有差异表达的circRNA 31个、miRNA 213个、mRNA 2624个,最终构建了包含5个节点和4条边的核心ceRNA网络。 展开更多
关键词 精神分裂症 circrna-mirna-mrna网络 竞争性内源rna网络 环状rna 微小rna 信使rna
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长链非编码RNA及竞争性内源RNA网络在银屑病中调控机制的研究进展
6
作者 何月 段妍 +1 位作者 李睿亚 莎娜 《临床皮肤科杂志》 CAS CSCD 北大核心 2024年第6期382-384,共3页
银屑病是一种慢性炎症性皮肤病,发病机制复杂。该文通过综述长链非编码RNA(Long non-coding RNA,lncRNA)及竞争性内源RNA(Competitive endogenous RNA,ceRNA)网络在银屑病中调控机制的进展,寻找银屑病的发病机制及相关调控通路,对控制... 银屑病是一种慢性炎症性皮肤病,发病机制复杂。该文通过综述长链非编码RNA(Long non-coding RNA,lncRNA)及竞争性内源RNA(Competitive endogenous RNA,ceRNA)网络在银屑病中调控机制的进展,寻找银屑病的发病机制及相关调控通路,对控制病情和改善预后具有重要意义,为进一步阐明该疾病的遗传学发病机制、基因诊断以及下一步的基因治疗等奠定理论基础。 展开更多
关键词 银屑病 长链非编码rna 竞争性内源rna
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长链非编码RNA作为竞争性内源RNA在卵巢癌中的研究进展
7
作者 陈卓静 徐王昕 牛丽娜 《癌症进展》 2024年第17期1881-1886,共6页
卵巢癌是一种致死率高的妇科恶性肿瘤。早期卵巢癌缺乏典型临床症状,因此大多数患者确诊时已处于疾病晚期,从而错失最佳手术时机,导致患者预后差。竞争性内源RNA(ceRNA)网络可以预测卵巢癌患者的病理变化,能为预测患者预后提供新的分子... 卵巢癌是一种致死率高的妇科恶性肿瘤。早期卵巢癌缺乏典型临床症状,因此大多数患者确诊时已处于疾病晚期,从而错失最佳手术时机,导致患者预后差。竞争性内源RNA(ceRNA)网络可以预测卵巢癌患者的病理变化,能为预测患者预后提供新的分子标志物。长链非编码RNA(lncRNA)在卵巢癌的发生、侵袭、转移和耐药中发挥重要作用。故本文对lncRNA作为ceRNA在卵巢癌中的研究进展进行综述,以期为卵巢癌的机制研究提供新思路,为临床诊断、治疗卵巢癌提供理论依据。 展开更多
关键词 长链非编码rna 竞争性内源rna 卵巢癌
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竞争性内源RNA:一种全新的基因表达调控模式 被引量:9
8
作者 夏天 肖丙秀 郭俊明 《中国生物化学与分子生物学报》 CAS CSCD 北大核心 2012年第12期1075-1081,共7页
竞争性内源RNA(ceRNA)假说是一种全新的基因表达调控模式:mRNA、假基因转录物和长链非编码RNA等转录物通过microRNA应答元件竞争结合相同的microRNA来调控各自的表达水平,从而影响细胞的功能.迄今为止,多家实验室已从生物信息学、细胞... 竞争性内源RNA(ceRNA)假说是一种全新的基因表达调控模式:mRNA、假基因转录物和长链非编码RNA等转录物通过microRNA应答元件竞争结合相同的microRNA来调控各自的表达水平,从而影响细胞的功能.迄今为止,多家实验室已从生物信息学、细胞生物学和动物实验等层面验证了该假说.本文追溯了ceRNA假说提出的历程,讨论了ceRNA调控网络的影响因素,并提出了一些有待进一步完善的内容.ceRNA假说大大拓展了人类基因组中功能遗传信息的范畴,也为解析一些人类疾病发生的机制提供了新线索. 展开更多
关键词 基因表达调控 竞争性内源rna(cerna) 转录物 microrna应答元件
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竞争性内源RNA的生物学功能及其调控 被引量:11
9
作者 李静秋 杨杰 +2 位作者 周平 乐燕萍 龚朝辉 《遗传》 CAS CSCD 北大核心 2015年第8期756-764,共9页
最新研究表明,RNA之间可以通过竞争结合共同的microRNA反应元件(micro RNA response element,MRE)实现相互调节,这种调控模式构成竞争性内源RNA(Competing endogenous RNA,ceRNA)。已发现的ceRNA包括蛋白编码mRNA和非编码RNA,其中后者... 最新研究表明,RNA之间可以通过竞争结合共同的microRNA反应元件(micro RNA response element,MRE)实现相互调节,这种调控模式构成竞争性内源RNA(Competing endogenous RNA,ceRNA)。已发现的ceRNA包括蛋白编码mRNA和非编码RNA,其中后者包括假基因转录物、长链非编码RNA(Long non-coding RNA,lncRNA)、环状RNA(Circular RNA,circ RNA)等。文章主要从ceRNA分类的角度,阐述各类ceRNA构成的调控网络发挥的生物学功能在病理和生理相关过程中的作用,以及可能影响ceRNA调控有效性的因素。 展开更多
关键词 竞争性内源rna rna反应元件 假基因 长链非编码rna 环状rna
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lncRNA作为竞争性内源RNA调控胃癌进程的研究进展 被引量:8
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作者 董宪喆 胡园 +1 位作者 刘屏 路玉盼 《中国药理学通报》 CAS CSCD 北大核心 2016年第9期1185-1189,共5页
长链非编码RNA(long non-coding RNAs,lncRNAs)是一类长度大于200 nt的非编码RNA,参与多种疾病进程。近年来的研究表明,lncRNAs可作为竞争性内源RNA(competing endogenous RNAs,ceRNAs),与胃癌发生发展进程密切相关的驱动基因竞争miRNA... 长链非编码RNA(long non-coding RNAs,lncRNAs)是一类长度大于200 nt的非编码RNA,参与多种疾病进程。近年来的研究表明,lncRNAs可作为竞争性内源RNA(competing endogenous RNAs,ceRNAs),与胃癌发生发展进程密切相关的驱动基因竞争miRNA反应元件(miRNA response elements,MREs),削弱miRNA对靶基因的抑制作用,间接调节靶基因表达水平,进而参与调控胃癌进程。该文从lncRNA作为ceRNA发挥生物学功能的角度,概述了相关lnRNAs在胃癌发生发展进程中的作用及机制,为胃癌的诊断和治疗提供新思路。 展开更多
关键词 长链非编码rna 竞争性内源rna 胃癌 microR-NAs mirna反应元件 靶基因
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竞争性内源RNA在肝癌中的研究进展 被引量:6
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作者 张德元 曹金玉 刘繁荣 《临床与实验病理学杂志》 CAS CSCD 北大核心 2016年第10期1145-1148,共4页
肝细胞癌(hepatocellular carcinoma,HCC)是常见的消化系统恶性肿瘤之一,肝癌发生、发展机制不清是制约肝癌诊疗的重要原因。近年研究发现,RNA在肝癌的调控机制中发挥重要作用,某些长链非编码RNA(lncRNA)、环状RNA(circRNA)、假基因以及... 肝细胞癌(hepatocellular carcinoma,HCC)是常见的消化系统恶性肿瘤之一,肝癌发生、发展机制不清是制约肝癌诊疗的重要原因。近年研究发现,RNA在肝癌的调控机制中发挥重要作用,某些长链非编码RNA(lncRNA)、环状RNA(circRNA)、假基因以及mRNA拥有microRNA应答元件(microRNA response element,MRE),通过竞争性结合microRNA,发挥相互调控作用。这类RNA称为竞争性内源性RNA(competing endogenous RNA,ceRNA)。该文将按照ceRNA分类,对其在肝癌发生、发展机制中的生物学功能及临床意义进行系统综述。 展开更多
关键词 竞争性内源rna MICROrna lncrna circrna Mrna 文献综述
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云南宣威地区肺癌长链非编码RNA、mRNA基因表达谱检测与竞争性内源RNA分析 被引量:3
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作者 胡家伦 王玉明 +3 位作者 陈冉 肖成 郎昆 柳杰 《医学研究生学报》 CAS 北大核心 2018年第8期818-823,共6页
目的云南宣威地区是中国乃至世界肺癌高发区,探究长链非编码RNA(lncRNA)和mRNA的差异表达,构建竞争性内源RNA(ceRNA)共表达网络,为宣威地区肺癌的分子诊断和治疗提供新思路。方法采用晶芯lncRNA+mRNA表达谱芯片对10对宣威地区肺癌组织... 目的云南宣威地区是中国乃至世界肺癌高发区,探究长链非编码RNA(lncRNA)和mRNA的差异表达,构建竞争性内源RNA(ceRNA)共表达网络,为宣威地区肺癌的分子诊断和治疗提供新思路。方法采用晶芯lncRNA+mRNA表达谱芯片对10对宣威地区肺癌组织及癌旁正常组织进行检测,用生物信息学的方法(GO,Pathway和networkanalysis)对差异表达的mRNAs进行分析。结果通过肺癌标本与癌旁正常组织对比,从中找到差异表达的lncRNA有384条(差异倍数≥2.0,P<0.05),其中表达上调的有78条,表达下调的有306条。上调表达差异最大的是ab Parts(差异倍数:7.522),下调表达差异最大的是XLOC_012046(差异倍数:9.001)。946条差异表达的mRNA(差异倍数≥2.0,P<0.05),其中上调和下调最具意义的是SPP1(差异倍数:16.500)和AGER(差异倍数:14.377)。lncRNA和mRNA在宣威地区肺癌中呈现出高低表达的两种趋势,差异表达的mRNA在生物过程、分子功能、细胞组成中分别以单一生物过程、结合和膜功能方面的数目差异最明显。上调表达的mRNA主要参与的信号通路有钙离子信号通路、吞噬体、造血细胞谱系等,下调表达差异的mRNA主要参与了造血细胞谱系、钙离子信号通路等方面的通路。lncRNA和mRNA之间呈一对一或一对多的相关,其中p14245(LINC00472)与Q9H8W2和XLOC_005764共表达。ENSG00000244513.2(ceRNA-score:0.461)和ENSG00000257424.1(ceRNA-score:0.372)所调节的SEMA5A和SEMA6A在mRNA表达谱中都呈下调表达。SEMA5A主要参与细胞黏附、生物黏附、脉管系统发展等功能,SEMA6A主要参与细胞表面受体连锁信号转导、细胞运动、细胞骨架组织等功能。结论通过微阵列找到宣威地区肺癌组织中差异表达的lncRNA表达谱可能会成为宣威地区肺癌的新型生物标志物或治疗靶点。 展开更多
关键词 宣威地区 肺癌 长链非编码rna 竞争性内源rna 基因芯片
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竞争性内源RNA在胃癌发生发展中的作用 被引量:2
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作者 徐芳 龚文倩 +1 位作者 李婷园 张烁 《世界华人消化杂志》 CAS 2016年第11期1676-1681,共6页
胃癌是常见的消化系肿瘤之一,在全球癌症死亡中排名第2位.其发病与遗传、环境及生活习惯等多种因素有关.近几年研究发现竞争性内源RNA成员中微小RNA和长链非编码RNA在胃癌的发生发展起着重要作用.本文就竞争性内源RNA在胃癌中作用作一综述.
关键词 竞争性内源rna 微小rna 长链非编码rna 环状rna 胃癌
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结直肠癌中LncRNA介导的内源性竞争性RNA调控网络 被引量:3
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作者 邓巧玲 柳家翠 +1 位作者 喻明霞 李胜 《西部医学》 2020年第2期166-170,共5页
目的构建结直肠癌RNA调控网络,探讨结直肠癌中分子调控机制。方法从TCGA数据库中提取结直肠癌转录水平表达数据,筛选差异表达RNAs,结合miRDB,miRcode,miRTarBase和TargetScan数据库靶基因预测结果,整合LncRNA-miRNA、miRNA-mRNA关系对,... 目的构建结直肠癌RNA调控网络,探讨结直肠癌中分子调控机制。方法从TCGA数据库中提取结直肠癌转录水平表达数据,筛选差异表达RNAs,结合miRDB,miRcode,miRTarBase和TargetScan数据库靶基因预测结果,整合LncRNA-miRNA、miRNA-mRNA关系对,基于ceRNA假说及LncRNA细胞内定位,筛选出胞质表达并介导该网络调控的LncRNA,重建结直肠癌中lncRNA-miRNA-mRNA作用网络。结果在结直肠癌差异表达基因分析中初步筛选出119个LncRNA、32个miRNA以及59个mRNA;识别777对LncRNA-miRNA与77对miRNA-mRNA,基于ceRNA假说以及LncRNA在细胞内定位,最后筛选出15个上调LncRNA、3个下调miRNA(hsa-mir-145,hsa-mir-193b,hsa-mir-150)以及5个上调mRNA重建ceRNA网络。结论成功构建结直肠癌中LncRNA介导调控的ceRNA网络,识别出预后相关的潜在靶点,为结直肠癌治疗研究提供了新的参考依据。 展开更多
关键词 结直肠癌 TCGA 肿瘤标志物 内源竞争性rna
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竞争性内源性RNA在急性髓系白血病中的研究进展 被引量:4
15
作者 刘睿 王玉明 《现代检验医学杂志》 CAS 2022年第3期198-204,共7页
急性髓系白血病(acute myeloid leukemia,AML)是多种因素引起的造血系统恶性疾病,具有很高的复发率及死亡率。非编码RNA在AML的发生发展过程中发挥着重要作用。竞争性内源性RNA(competing endogenous RNA,ceRNA)观点指出,不同的非编码RN... 急性髓系白血病(acute myeloid leukemia,AML)是多种因素引起的造血系统恶性疾病,具有很高的复发率及死亡率。非编码RNA在AML的发生发展过程中发挥着重要作用。竞争性内源性RNA(competing endogenous RNA,ceRNA)观点指出,不同的非编码RNA可通过作用于相同的miRNA反应元件(MRE)从而调控基因的表达。目前越来越多的研究表明,非编码RNA作为ceRNA在调控AML的增殖、凋亡、侵袭和耐药等生物学过程中发挥关键作用。该文主要对ceRNA在AML生物学过程中的调控作用,以及治疗和预后中的临床意义作一综述。 展开更多
关键词 急性髓系白血病 竞争性内源rna
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竞争性内源RNA在不同类型肿瘤中的作用 被引量:1
16
作者 魏炎 李锴男 +1 位作者 李梦岩 毕经旺 《生物技术通讯》 CAS 2015年第6期862-866,共5页
竞争性内源RNA(ce RNA)是一种相互作用的RNA转录本,通过竞争性结合并降低靶标微小RNA(mi RNA)的水平,解除信使RNA(m RNA)的抑制作用。肿瘤相关性ce RNA在多种肿瘤的形成过程中发挥关键作用。我们对肿瘤相关性ce RNA做简要综述,并简单分... 竞争性内源RNA(ce RNA)是一种相互作用的RNA转录本,通过竞争性结合并降低靶标微小RNA(mi RNA)的水平,解除信使RNA(m RNA)的抑制作用。肿瘤相关性ce RNA在多种肿瘤的形成过程中发挥关键作用。我们对肿瘤相关性ce RNA做简要综述,并简单分析其与靶标mi RNA的相互作用,为进一步理解ce RNA介导的肿瘤生成分子机制提供新思路。 展开更多
关键词 竞争性内源rna 微小rna 长链非编码rna 肿瘤
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竞争性内源性RNA在神经退行性疾病中作用的研究进展 被引量:1
17
作者 赵丽 马慧 孙艳 《癌变.畸变.突变》 CAS 2020年第3期238-240,共3页
随着对人类基因组和非编码RNA的深入研究,竞争性内源性RNA(ce RNAs)假说被提出。该假说揭示了一种全新的基因表达调控模式,即信使RNA(m RNA)、长链非编码RNA(lnc RNA)、环状RNA(circ RNA)、假基因等RNA分子作为ce RNA相同的微小RNA应答... 随着对人类基因组和非编码RNA的深入研究,竞争性内源性RNA(ce RNAs)假说被提出。该假说揭示了一种全新的基因表达调控模式,即信使RNA(m RNA)、长链非编码RNA(lnc RNA)、环状RNA(circ RNA)、假基因等RNA分子作为ce RNA相同的微小RNA应答元件(MREs)竞争性结合或共享微小RNA(micro RNA)来调控靶基因并参与人类发育和相关疾病机制。神经退行性疾病是一类严重威胁人类健康的神经系统变性疾病。近年来的研究发现,ce RNAs参与了神经退行性疾病阿尔茨海默病(AD)和帕金森氏病(PD)的发生发展。因此,对ce RNAs的研究可能为神经退行性疾病的发病机制及诊疗方案提供新的线索与方向。本文拟对ce RNAs在神经退行性疾病中的作用进行综述。 展开更多
关键词 竞争性内源rna 长链非编码rna 环状rna 微小rna 神经退行性疾病
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头颈部鳞癌中FOXP3基因相关的竞争性内源性RNA网络分析
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作者 孙娟 王薇 +3 位作者 胡文良 孙学威 李玲香 崔晓波 《局解手术学杂志》 2017年第2期82-85,共4页
目的探索FOXP3基因在头颈部鳞癌中的作用机制。方法选取TCGA数据库中的279例头颈部鳞癌二代测序样本,利用cbioportal筛选样本中FOXP3的共表达基因;利用String数据库,建立FOXP3的共表达网络;利用DAVID数据库分析共表达网络功能;利用miRTa... 目的探索FOXP3基因在头颈部鳞癌中的作用机制。方法选取TCGA数据库中的279例头颈部鳞癌二代测序样本,利用cbioportal筛选样本中FOXP3的共表达基因;利用String数据库,建立FOXP3的共表达网络;利用DAVID数据库分析共表达网络功能;利用miRTar Base和Star Base数据库,筛选能够调控FOXP3的短链非编码RNA(microRNA)、长链非编码RNA(lncRNA)和环状非编码RNA(circRNA);最后,利用Cytoscape软件建立FOXP3的竞争性内源性RNA(ceRNA)网络。结果在TCGA数据库的头颈部鳞癌样本中共筛选出FOXP3的共表达基因950个。(Spearman分数大于0.5)功能分析结果显示这些共表达基因的功能主要为免疫应答,T细胞、淋巴细胞和粒细胞激活等免疫相关功能。ceRNA网络揭示miR-31-5p和miR-210-3p能够靶向调控FOXP3基因。此外,XIST、TUG1、JRK和LINC00473等42个lncRNA和ZNF223_hsa_circ_000898和ISY1_hsa_circ_001090等31个circRNA能够通过ceRNA作用调控FOXP3。结论成功建立FOXP3基因相关的ceRNA网络,并挖掘出42个lncRNA和31个circRNA可能通过ceRNA作用调控FOXP3,可为头颈部鳞状细胞癌的分子机制研究和分子靶向治疗提供新的切入点。 展开更多
关键词 喉鳞状细胞癌 FOXP3 长链非编码rna 环状非编码rna 竞争性内源rna 短链非编码rna 靶向治疗
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酒精性股骨头坏死竞争性内源RNA网络及潜在生物标志物的综合分析 被引量:3
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作者 钱晓芬 曾平 +4 位作者 刘金富 陈财 范思奇 农焦 邓伟 《中国组织工程研究》 CAS 北大核心 2022年第23期3670-3675,共6页
背景:酒精性股骨头坏死与饮酒具有高度的相关性,然而其具体发病机制尚不明确且存在一定的个体差异。目的:构建酒精性股骨头坏死的基因网络图谱,进一步探索酒精性股骨头坏死的潜在发病机制。方法:从广西中医药大学第一附属医院骨二科招募... 背景:酒精性股骨头坏死与饮酒具有高度的相关性,然而其具体发病机制尚不明确且存在一定的个体差异。目的:构建酒精性股骨头坏死的基因网络图谱,进一步探索酒精性股骨头坏死的潜在发病机制。方法:从广西中医药大学第一附属医院骨二科招募3例酒精性股骨头坏死患者和3名健康志愿者,通过对其外周血进行基因测序筛选具有差异表达的mRNA和lncRNA,通过预测lncRNA-miRNA和miRNA-mRNA的相互作用靶点,使用cytoscape软件构建竞争性内源RNA调控网络。结果与结论:①通过差异表达分析从酒精性股骨头坏死样本中鉴定出了差异lncRNA 127个、差异mRNA 921个,通过靶基因预测共预测出了205个miRNA及5184个mRNA靶点,最终构建了包含3个lncRNA(SNHG3、MUC19、LINC00476)、5个miRNA(hsa-miR-146b-5p、hsa-miR-139-5p、hsa-miR-126-3p、hsa-miR-193a-3p、hsa-miR-135a-5p)和11个mRNA(PEX5、ACTR3B、CHMP4B、CSMD1、MTRF1、ZNF3、HTR7、NR5A2、SYT14、CASK、ING5)的ceRNA网络,涉及干细胞分化、炎症反应、神经内分泌、基因多态性等多种生物学过程。②结果表明,通过构建竞争性内源网络筛选出了一系列酒精性股骨头坏死潜在的生物标志物,为进一步研究其分子机制及治疗靶点提供了新思路。 展开更多
关键词 酒精性股骨头坏死 竞争性内源rna(cerna)网络 lncrna Mrna MIrna 生物标志物
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长链非编码RNA介导的ceRNA网络在膀胱癌中的作用
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作者 赵红丽 丁佳君 李晓霞 《临床医学进展》 2025年第2期1369-1376,共8页
膀胱癌(Bladder Cancer, BC)位列全球最常见的十种癌症之中,其患病率与致死率均处于较高水平。长链非编码核糖核酸(lncRNAs, 即Long non-coding RNAs)指的是那些核苷酸数量在200至100,000个之间的核糖核酸分子,这类分子几乎不编码蛋白... 膀胱癌(Bladder Cancer, BC)位列全球最常见的十种癌症之中,其患病率与致死率均处于较高水平。长链非编码核糖核酸(lncRNAs, 即Long non-coding RNAs)指的是那些核苷酸数量在200至100,000个之间的核糖核酸分子,这类分子几乎不编码蛋白质或仅有极低的编码潜力,并且近年来已经成为了研究热点。近年来,lncRNA逐渐被发现参与到多种生理病理过程之中,并与多种疾病的发生发展有关,其中尤其以癌症为甚。在膀胱癌中,lncRNA同样起到了关键的作用。它既可作为肿瘤抑制基因,也可能成为肿瘤促进基因。有充分证据表明,lncRNA能作为竞争性内源RNA (Competing endogenous RNA, ceRNA)与微小RNA (microRNA, miRNA)结合,进而调控靶基因的表达。这已被认为在许多类型的肿瘤中发挥着不可或缺的作用。本文就lncRNA在膀胱癌中的ceRNA机制作一综述。Bladder cancer (BC) ranks among the top ten most prevalent cancers globally, characterized by high incidence and mortality rates. Long noncoding RNAs (lncRNAs) are a class of RNA molecules with transcript lengths ranging from 200 to 100,000 nucleotides;they either lack or have minimal protein-coding capacity. In recent years, lncRNAs have garnered significant attention due to their involvement in various physiological and pathological processes, and they are increasingly recognized as being closely associated with the pathogenesis of numerous diseases, particularly in oncology. Within the context of bladder cancer, lncRNAs play a pivotal role, functioning both as tumor suppressors and oncogenes. Mounting evidence suggests that lncRNAs can act as competitive endogenous RNAs (ceRNAs) by binding to microRNAs (miRNAs), thereby influencing and modulating the expression of target genes, a role considered essential in multiple types of tumors. This review examines the role of the lncRNA ceRNA mechanism in bladder cancer. 展开更多
关键词 膀胱癌 长链非编码rna 竞争性内源rna
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