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我国尖音库蚊复合组蚊虫核糖体DNA第2内转录间隔区序列测定与分析 被引量：14
1
作者 宋社吾 赵彤言 +1 位作者 蒋书楠 陆宝麟 《寄生虫与医学昆虫学报》 CAS 2003年第2期74-82,共9页
通过对我国尖音库蚊复合组蚊虫及三带喙库蚊核糖体DNA第二内转录间隔区 (rDNA ITS2 )的序列测定 ,表明rDNA ITS2序列在我国尖音库蚊复合组种内亚种间和亚种内的变异存在有重叠现象。分子系统关系分析没有发现与形态学亚种阶元分类地位... 通过对我国尖音库蚊复合组蚊虫及三带喙库蚊核糖体DNA第二内转录间隔区 (rDNA ITS2 )的序列测定 ,表明rDNA ITS2序列在我国尖音库蚊复合组种内亚种间和亚种内的变异存在有重叠现象。分子系统关系分析没有发现与形态学亚种阶元分类地位的一致性 ,但在种间差异明显。 展开更多
关键词 尖音库蚊复合组 核糖体DNA第2内转录间隔区 序列测定 序列分析 RDNA-ITS2
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微小按蚊rDNA内转录间隔2区序列差异 被引量：11
2
作者 王学忠 Harold Townson +1 位作者 王丕玉 李菊升 《中国媒介生物学及控制杂志》 CAS CSCD 2001年第1期24-27,共4页
目的 :比较不同地株微小按蚊核糖体DNA(rDNA)内转录间隔 2区 (ITS2 )序列差异。方法 :通过对PCR扩增rDNAITS2片段测序 ,比较其不同地株差异。结果 :对 6株微小按蚊测序比较 ,存在有微小按蚊A和C型。结论 :rDNAITS2序列差异可用于建立A。
关键词 微波按蚊 DNA 核糖体 第2内转录间隔区
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广东国境口岸五种蚊种核糖体基因第2内转录间隔区分子鉴定方法研究 被引量：7
3
作者 师永霞 幸芦琴 +5 位作者 洪烨 李小波 郭波旋 相大鹏 黄吉城 郑夔 《中国国境卫生检疫杂志》 CAS 2008年第1期24-28,共5页
〔目的〕建立国境口岸不同蚊种的核糖体基因第2内转录间隔区(rDNA-ITS2)分子鉴定方法及其系统进化关系。〔方法〕针对蚊虫的rDNA核酸序列保守性,设计扩增rDNA-ITS2编码区的PCR引物,对广州机场、江门和湛江等国境口岸采集的致倦库蚊、三... 〔目的〕建立国境口岸不同蚊种的核糖体基因第2内转录间隔区(rDNA-ITS2)分子鉴定方法及其系统进化关系。〔方法〕针对蚊虫的rDNA核酸序列保守性,设计扩增rDNA-ITS2编码区的PCR引物,对广州机场、江门和湛江等国境口岸采集的致倦库蚊、三带喙库蚊、白纹伊蚊、中华按蚊、骚扰阿蚊等成蚊和实验室喂养的蚊幼虫进行PCR扩增和序列测定,并与GenBank中已知蚊虫的rDNA-ITS2进行同源性比较和系统进化分析。〔结果〕不同蚊虫的rDNA-ITS2扩增片断长度不同,M2引物对致倦库蚊、三带喙库蚊、白纹伊蚊、骚扰阿蚊和中华按蚊的扩增片断分别为447bp～520bp、432bp～438bp、527bp～586bp、439bp～448bp和644bp。序列分析和系统进化关系显示,尖音库蚊组和三带喙库蚊聚类为库蚊属,再与白纹伊蚊和骚扰阿蚊聚类为库蚊亚科,库蚊亚科再与中华按蚊进行聚类,分子进化与蚊虫形态学鉴定的亲缘关系保持一致。〔结论〕建立的rDNA-ITS2分子鉴别技术可成功地应用于国境口岸范围内成蚊和幼蚊的亚科、属和种的区分和确定系统发育关系。这可以弥补蚊虫形态特征信息量的不足等传统分类系统的缺点,对国境口岸范围外来的或新发现的蚊种的鉴别提供了分子水平的技术依据。 展开更多
关键词 蚊 DNA 核糖体 第2内转录间隔区 聚合酶链反应 序列分析 系统进化树
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不同地区微小按蚊rDNA-ITS2序列差异 被引量：20
4
作者 周水森 汤林华 +1 位作者 顾政诚 王漪 《中国寄生虫学与寄生虫病杂志》 CAS CSCD 北大核心 2002年第1期29-31,共3页
目的　比较我国云南、海南省、广西壮族自治区及泰国等不同地区微小按蚊核糖体 DNA第 2内转录间隔区 (ITS2 )序列差异。　方法　取单只雌蚊蚊腿消化提取 DNA,PCR特异扩增 r DNA- ITS2片段 ,并对其扩增产物纯化、测序及分析。　结果　发... 目的　比较我国云南、海南省、广西壮族自治区及泰国等不同地区微小按蚊核糖体 DNA第 2内转录间隔区 (ITS2 )序列差异。　方法　取单只雌蚊蚊腿消化提取 DNA,PCR特异扩增 r DNA- ITS2片段 ,并对其扩增产物纯化、测序及分析。　结果　发现 2种不同的 ITS2序列 (Gen Bank登录号 :AF4 16 783,AF4 16 784 ) ,分别与微小按蚊 A和 C同源 ,ITS2序列长度及 GC含量分别为 4 81bp,5 4 .0 4 %和 4 83bp,5 4 .2 3% ,两者无显著性差异 ;但 2 2个固定位点存在碱基置换和插入 /缺失 ,序列差异为 5 .8%。　结论　研究区内微小按蚊存在 A和 展开更多
关键词 微小按蚊 核糖体DNA 第2内转录间隔区 RDNA-ITS2 序列差异
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深圳市白纹伊蚊rDNA ITS2区克隆及SNP分析 被引量：6
5
作者 张仁利 耿艺介 +4 位作者 黄达娜 高世同 庾蕾 黄继莲 宋红改 《中国热带医学》 CAS 2007年第1期1-3,9,共4页
目的克隆和序列分析深圳市白纹伊蚊核糖体DNA(rDNA)第2内转录间隔区(ITS2),并探明其rDNA ITS2核酸的特异性及不同个体在rDNA ITS2区的单核甘酸的多态性(Single Nuclear Polymorphism,SNP),以便利用ITS2基因的高度保守性及其蚊媒不种群在... 目的克隆和序列分析深圳市白纹伊蚊核糖体DNA(rDNA)第2内转录间隔区(ITS2),并探明其rDNA ITS2核酸的特异性及不同个体在rDNA ITS2区的单核甘酸的多态性(Single Nuclear Polymorphism,SNP),以便利用ITS2基因的高度保守性及其蚊媒不种群在ITS2片段的多态性来分子鉴别白纹伊蚊。方法PCR特异扩增白纹伊蚊rDNA ITS2,利用QIAquick技术从琼脂糖胶上回收纯化扩增的目的ITS2 DNA片段,纯化后的目的ITS2 DNA片段被连接到TA载体上,在含有青霉素的琼脂糖胶平面上筛选含目的ITS2 DNA片段的阳性克隆,阳性克隆经含有青霉素的LB液体培养基培养,用Ultrapure^(TM)质粒提取试剂盒提取克隆质粒,用双酶切鉴定插入的片段大小,DNA序列分析仪分析每个蚊rDNA ITS2的序列,用生物信息系统进行白纹伊蚊rDNA ITS2 SNP的差异分析。结果518bp全长的深圳市白纹伊蚊rDNA ITS2被克隆和序列分析,深圳市四个不同地理的白纹伊蚊rDNA ITS2的同一性为97％,而两个地方之间的比较有99％的同一性,其rDNA ITS2基因单核苷酸存在转换、颠换和缺失,在518bp的范围内有6个C→T,2个A→G的转换,3A→T,一个A→C的颠换,3个CG和一个AC缺失。结论白纹伊蚊rDNA ITS2有高度的保守性,不同个体也表现了单核苷酸的多态性。 展开更多
关键词 白纹伊蚊 rDNA第2内转录间隔区 基因克隆 单核苷酸多态性
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新疆6种蚊虫的rDNA-ITS2区序列分析 被引量：5
6
作者 马雅军 瞿逢伊 柴君杰 《地方病通报》 2001年第2期66-70,共5页
测定并分析了新疆 ４种伊蚊和 ２种按蚊的 ｒＤＮＡ—ＩＴＳ２区序列，新疆伊蚊、刺扰伊蚊ＩＴＳ２区长度分别为 ２３１ｂｐ～２５６ ｂｐ、２５０ｂｐ或 ２５３ｂｐ，其克隆间、种内序列差异分别为 ０．３％～４．３％、０．８％～１... 测定并分析了新疆 ４种伊蚊和 ２种按蚊的 ｒＤＮＡ—ＩＴＳ２区序列，新疆伊蚊、刺扰伊蚊ＩＴＳ２区长度分别为 ２３１ｂｐ～２５６ ｂｐ、２５０ｂｐ或 ２５３ｂｐ，其克隆间、种内序列差异分别为 ０．３％～４．３％、０．８％～１．４％；里梅伊蚊与长刀伊蚊的长度为３３０ ｂｐ、２５１ ｂｐ，种内序列无差异；４种伊蚊种间序列差异明显大于种内差异水平，为１２．３％～３３．５％；赫坎按蚊和米赛按蚊的 ＩＴＳ２区序列长度分别为 ４６３ｂｐ、３１１ｂｐ，种内个体间无差异，而种间的差异为 ３０．８％．结果显示 ｒＤＮＡ－ＩＴＳ２区序列差异，为形态上易混淆蚊种提供了有意义的分子鉴别特征。 展开更多
关键词 核糖体DNA 第2内转录间隔区 伊蚊属 按蚊属 新疆
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嗜人按蚊rDNA-ITS2基因的克隆鉴定及SNP分析 被引量：1
7
作者 耿艺介 黄达娜 +3 位作者 高世同 庾蕾 黄继莲 张仁利 《热带医学杂志》 CAS 2007年第1期38-41,共4页
目的克隆和分析嗜人按蚊核糖体DNA(rDNA)第2内转录间隔区(ITS2)序列,研究嗜人按蚊rDNA-ITS2序列的种属特异性及不同个体rDNA-ITS2序列的单核苷酸多态性(Single Nuclear Polymorphism,SNP)。方法用DNA提取试剂盒从嗜人按蚊中提取DNA摸板... 目的克隆和分析嗜人按蚊核糖体DNA(rDNA)第2内转录间隔区(ITS2)序列,研究嗜人按蚊rDNA-ITS2序列的种属特异性及不同个体rDNA-ITS2序列的单核苷酸多态性(Single Nuclear Polymorphism,SNP)。方法用DNA提取试剂盒从嗜人按蚊中提取DNA摸板,利用蚊虫5.8S和28S序列的保守性设计特异引物进行聚合酶链反应以扩增嗜人按蚊rDNA-ITS2基因,扩增产物经回收纯化后连接到TA载体,经amp+LB固体平板筛选的阳性克隆,经amp+LB液体培养基培养后进行PCR鉴定、EcoRI酶切鉴定和序列分析。结果经PCR反应扩增出全长556bp的嗜人按蚊rDNA-ITS2基因,纯化后重组克隆经PCR鉴定可重现556bp的特异性条带,其酶切产物亦与目的基因PCR产物位置相同。嗜人按蚊6个克隆的同一性为99.6%,其rDNA-ITS2基因单核苷酸存在颠换和插入,在556的范围内有一个A→T,一个G→T的颠换;一个T的插入。结论嗜人按蚊rDNA-ITS2序列在种间高度保守,但不同个体间也存在一定的SNP多态性。 展开更多
关键词 嗜人按蚊 rDNA第2内转录间隔区 聚合酶链反应 单核苷酸多态性
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基于rDNA-ITS2序列的中国按蚊属按蚊亚属部分种类的系统发育关系研究(双翅目:蚊科) 被引量：4
8
作者 马颖 马雅军 +1 位作者 林琳 王琰 《中国媒介生物学及控制杂志》 CAS CSCD 2013年第5期382-388,共7页
目的阐明中国按蚊属按蚊亚属蚊种的亲缘关系。方法根据核糖体DNA第2内转录间隔区（rDNA-ITS2）序列,采用邻接法（NJ）、最大简约法（MP）、最小进化法（ME）和最大似然法（ML）,对采自中国的按蚊亚属22种（分子型）蚊虫进行系统发育关... 目的阐明中国按蚊属按蚊亚属蚊种的亲缘关系。方法根据核糖体DNA第2内转录间隔区（rDNA-ITS2）序列,采用邻接法（NJ）、最大简约法（MP）、最小进化法（ME）和最大似然法（ML）,对采自中国的按蚊亚属22种（分子型）蚊虫进行系统发育关系重建。结果rDNA-ITS2序列的长度范围为340~1754 bp,种内的p遗传距离均小于0.004,种间为0.009~0.420,平均值为0.224。各种方法重建的系统发育树均显示分为3大支,分别对应赫坎按蚊种团和须喙按蚊种团各一支,以及林氏按蚊与五斑按蚊种团聚为的一支,三者为并系关系;赫坎按蚊种团成员种分为主要的4支,其种间关系与形态分类结果一致,但分子型spLL1和spLL2的聚类位置不稳定。结论重建的分子系统发育树客观地阐明了中国按蚊属按蚊亚属各种团及蚊种之间的亲缘关系,序列具有足够的信息贡献量。 展开更多
关键词 按蚊属 按蚊亚属 核糖体DNA第2内转录间隔区 系统发育
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