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鸭源鸡杆菌外膜蛋白A基因克隆及结构与功能分析 被引量:1
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作者 王艳 王继洋 +3 位作者 王坤芃 彭志锋 杨霞 王川庆 《河南农业科学》 CSCD 北大核心 2017年第8期147-151,共5页
为筛选鸭源鸡杆菌(G.anatis)潜在的保护性抗原基因,参考Gen Bank中G.anatis UMN179的外膜蛋白A(OmpA)基因序列设计1对引物,对鸭源鸡杆菌PDS-RZ-1-SLG(RZ)株的OmpA基因进行克隆,并应用相关软件对其核苷酸及氨基酸序列进行生物信息学分析... 为筛选鸭源鸡杆菌(G.anatis)潜在的保护性抗原基因,参考Gen Bank中G.anatis UMN179的外膜蛋白A(OmpA)基因序列设计1对引物,对鸭源鸡杆菌PDS-RZ-1-SLG(RZ)株的OmpA基因进行克隆,并应用相关软件对其核苷酸及氨基酸序列进行生物信息学分析。结果显示,OmpA基因大小为1 083 bp,编码360个氨基酸;鸭源鸡杆菌RZ株的OmpA与UMN179、F149及12656/12的OmpA氨基酸相似性分别为93.2%、95.2%、92.7%;OmpA蛋白分子质量为38.4 ku,等电点为6.77,具有稳定性,N端有1个疏水性的α螺旋信号肽。 展开更多
关键词 鸭源鸡杆菌 OmpA基因 克隆 结构与功能分析
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精氨酸加压素及其受体的结构与功能研究进展
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作者 姚菊霞 尹万超 《生物医学》 2025年第2期339-349,共11页
精氨酸加压素(Arginine Vasopressin, AVP),又称抗利尿激素(Antidiuretic Hormone, ADH),是一种由下丘脑合成的环状九肽神经激素,在机体水盐平衡和血压稳态调节中发挥核心调控作用。AVP通过特异性结合G蛋白偶联受体(G Protein-Coupled R... 精氨酸加压素(Arginine Vasopressin, AVP),又称抗利尿激素(Antidiuretic Hormone, ADH),是一种由下丘脑合成的环状九肽神经激素,在机体水盐平衡和血压稳态调节中发挥核心调控作用。AVP通过特异性结合G蛋白偶联受体(G Protein-Coupled Receptor, GPCR)家族成员V1受体(Vasopressin type 1 receptor, V1R)和V2受体(Vasopressin type 2 receptor, V2R)介导其生理功能:V1R主要分布于血管平滑肌,参与调控血管张力及血小板活化;V2R则高表达于肾脏集合管和远端肾小管,通过调节水通道蛋白2 (Aquaporin-2, AQP2)的膜转运介导水的重吸收。近年来,随着冷冻电子显微镜(Cryogenic Electron Microscopy, Cryo-EM)等结构生物学技术的突破,研究人员成功解析了AVP受体复合物的高分辨率三维结构,为阐明其配体识别机制和信号转导途径提供了重要的结构基础。这些研究成果不仅深化了对AVP信号通路的分子机制理解,也为基于结构的精准药物设计提供了新思路。基于V1R和V2R结构特征开发的高选择性配体有望为高血压、尿崩症等疾病的治疗提供更安全有效的治疗方案。Arginine vasopressin (AVP), also known as antidiuretic hormone (ADH), is a cyclic nonapeptide neurohormone synthesized in the hypothalamus, playing a critical role in maintaining water-electrolyte balance and blood pressure homeostasis. AVP mediates its effects through specific binding to G protein-coupled receptors (GPCRs), primarily V1R and V2R. V1R is predominantly expressed in vascular smooth muscle, where it regulates vascular tone and platelet activation, V2R is highly expressed in the renal collecting ducts and distal nephron, where V2R orchestrates water reabsorption by modulating the membrane trafficking of aquaporin-2 (AQP2). In recent years, with the breakthroughs in structural biology techniques such as Cryogenic Electron Microscopy (Cryo-EM), researchers have successfully determined the high-resolution three-dimensional structure of the arginine vasopressin (AVP) receptor complex. This achievement provides a crucial structural foundation for elucidating the ligand recognition mechanism and signal transduction pathway of the AVP receptor. These research findings not only deepen our understanding of the molecular mechanisms underlying the AVP signaling pathway but also offer novel insights into structure-based precision drug design. Highly selective ligands developed based on the structural characteristics of V1R (vasopressin receptor 1) and V2R (vasopressin receptor 2) hold great promise for providing safer and more effective therapeutic strategies for diseases such as hypertension and diabetes insipidus. 展开更多
关键词 精氨酸加压素 V1a受体 V1b受体 V2受体 结构与功能分析
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鸭源鸡杆菌外膜蛋白W基因克隆及结构与功能分析 被引量:2
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作者 敬文宪 彭志锋 +5 位作者 王新卫 常洪涛 刘红英 王川庆 卢彩景 杨霞 《中国兽医学报》 CAS CSCD 北大核心 2017年第1期47-53,共7页
参考GenBank中鸭源鸡杆菌(Gallibacterium anatis,G.anatis)UMN179的外膜蛋白W(outer membrane protein W,OmpW)基因序列设计1对引物,对鸭源鸡杆菌PDS-RZ-1-SLG株的OmpW基因进行克隆、测序,并通过生物信息学软件对该蛋白结构与功能进行... 参考GenBank中鸭源鸡杆菌(Gallibacterium anatis,G.anatis)UMN179的外膜蛋白W(outer membrane protein W,OmpW)基因序列设计1对引物,对鸭源鸡杆菌PDS-RZ-1-SLG株的OmpW基因进行克隆、测序,并通过生物信息学软件对该蛋白结构与功能进行分析及预测。结果显示:OmpW基因大小为705bp,编码234个氨基酸;与鸭源鸡杆菌UMN179株、F149株及12656/12株的OmpW氨基酸同源性分别为88.9%、78.7%和79.6%;OmpW相对分子质量为25 300,等电点为7.88,是能够稳定存在的蛋白,N端有1个疏水性的α螺旋信号肽,C端有1个疏水性的β折叠区域,并且在外膜表面存在1个保守性的B细胞线性表位。本试验成功克隆了鸭源鸡杆菌PDS-RZ-1-SLG株的OmpW基因,并对其结构与功能进行初步分析和预测,为进一步研究其生物学功能及其应用奠定基础。 展开更多
关键词 鸭源鸡杆菌 OmpW基因 克隆 结构与功能分析
原文传递
小鼠骨骼肌肌球蛋白重链生物信息学特性比较
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作者 史银斌 孙丽君 奚耕思 《陕西师范大学学报(自然科学版)》 CAS CSCD 北大核心 2017年第4期71-78,共8页
应用生物信息学软件对MyHCs蛋白不同亚型的基因序列进行比较分析,并根据比对结果建构系统进化树,对其蛋白进行结构与功能分析。结果表明:MyHC在体内以多种蛋白形式存在,其理化性质基本一致;可能的翻译后糖基化修饰多为N-糖基化,且都存... 应用生物信息学软件对MyHCs蛋白不同亚型的基因序列进行比较分析,并根据比对结果建构系统进化树,对其蛋白进行结构与功能分析。结果表明:MyHC在体内以多种蛋白形式存在,其理化性质基本一致;可能的翻译后糖基化修饰多为N-糖基化,且都存在较多个位点,具有明显的Motor-domain Superfamily、MYSc、Myosin tail 1等多重保守结构域,并且N末端具有多个ATP结合位点等特异性功能区域。MyHCs蛋白二级结构均以α螺旋为主,辅以折叠和无规则卷曲等形式,其三级结构模式相似;系统进化树显示,MyHCⅡb、MyHCⅠ蛋白与其他蛋白有着较大的序列差异及较远的进化关系。MyHC蛋白不同亚型结构之间的细微差异为MyHC的重塑提供可能,进而在结构上与其功能相适应。 展开更多
关键词 肌球蛋白重链 序列比对 结构与功能分析 生物信息学
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