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新型三维氨基酸结构描述符的研究及其在多肽QSAR中的应用 被引量:23
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作者 丁俊杰 丁晓琴 +1 位作者 赵立峰 陈冀胜 《药学学报》 CAS CSCD 北大核心 2005年第4期340-346,共7页
目的 建立一套新型的氨基酸残基结构描述符,用此描述符进行多肽的定量构效关系研究。方法 通过理论计算得出 167个氨基酸结构描述参数,再对 167个参数进行主成分分析,从中提取出与氨基酸残基的三维结构性质密切相关的三个结构描述参数... 目的 建立一套新型的氨基酸残基结构描述符,用此描述符进行多肽的定量构效关系研究。方法 通过理论计算得出 167个氨基酸结构描述参数,再对 167个参数进行主成分分析,从中提取出与氨基酸残基的三维结构性质密切相关的三个结构描述参数c1,c2,c3 scales。然后采用G/PLS算法,建立氨基酸残基结构描述符c scales与多肽生物活性之间的函数关系,确定多肽的QSAR模型。结果 用此方法建立的苦味二肽、ACE抑制剂二肽和缓激肽增效剂五肽的QSAR模型,均有较好的拟合和预测能力,交叉验证相关系数和相关系数都在 0 70以上。结论 氨基酸残基结构描述符c scales能定量的描述氨基酸的三维结构性质,而且利用此描述符能建立预测能力较强的多肽QSAR模型。 展开更多
关键词 氨基酸残基结构描述符 多肽定量构效关系 主成分分析 遗传偏最小二乘算法
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基于多维结构描述符的中药“性-构”关系研究 被引量:5
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作者 付先军 王振国 李学博 《世界科学技术-中医药现代化》 CSCD 2017年第4期549-555,共7页
目的:为了解析中药寒热药性与其成分之间的相关关系,从物质基础层面诠释中药寒热药性的科学内涵。方法:筛选《中国药典》第一部明确有主要有效成分记载的植物类中药共计334种,中药主要成分280种,计算每种成分的分子描述符(包括一维、二... 目的:为了解析中药寒热药性与其成分之间的相关关系,从物质基础层面诠释中药寒热药性的科学内涵。方法:筛选《中国药典》第一部明确有主要有效成分记载的植物类中药共计334种,中药主要成分280种,计算每种成分的分子描述符(包括一维、二维、三维及半经验量化计算分子描述符),通过广义规则归纳算法(Generalized Rule Induction,GRI)筛选强相关的分子描述符。结果:与中药寒热药性相关性较强的主要成分分子结构描述符多与分子的能量状态有关系,分子能量状态越高,与中药热性关联关系越大;而分子能量越低,与中药寒性关联关系越大;而平性中药不明显。除分子能量状态外,中药药性还可能与其主要成分的脂水分配系数、拓扑分子极性表面积,碳、氢、氧原子数,氢键供体数目等分子结构描述符具有一定的关联关系。结论:中药药性确实与中药主要成分的分子结构具有一定的关联关系,其中最重要的分子描述符是三维分子描述符中的分子能量,提示中药药性作用可能与中药主要有效成分的分子能量状态以及对机体能量代谢的影响而产生的综合效应有关。 展开更多
关键词 中药寒热药性 结构描述符 关联规则 “性-构”关系
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基于角度结构描述符的彩色图像检索系统
3
作者 徐国清 谭景之 《南阳理工学院学报》 2018年第6期55-60,共6页
设计开发了一套基于角度结构描述符的彩色图像检索系统。角度结构描述符利用角度结构一种特征描述图像颜色、纹理、形状和空间布局信息等。它在HSV颜色空间根据图像块相邻像素之间的内部相关性提取方向的多样性,形成图像特征向量。利用M... 设计开发了一套基于角度结构描述符的彩色图像检索系统。角度结构描述符利用角度结构一种特征描述图像颜色、纹理、形状和空间布局信息等。它在HSV颜色空间根据图像块相邻像素之间的内部相关性提取方向的多样性,形成图像特征向量。利用MATLAB语言搭建基于角度结构描述符的彩色图像检索系统,系统具有图像特征提取、查询图像选取、图像相似性计算及优化、图像检索结果显示及性能评价等功能。在公开的Corel-1k图像库对系统进行图像检索性能测试,结果表明该系统可以有效检索出相似的图像。 展开更多
关键词 图像检索 角度结构描述符 特征向量 图像相似性
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基于差异结构描述符与自适应侧抑制的红外弱小目标检测算法 被引量:3
4
作者 黄莉 王文波 《电子测量与仪器学报》 CSCD 北大核心 2018年第7期68-75,共8页
为了提高复杂背景下的弱小目标的检测精度,提出了基于差异结构描述符与自适应侧抑制的红外弱小目标检测技术。首先,引入非局部均值滤波,对红外图像进行预处理,降低噪声的干扰;随后,计算输入滤波红外图像的梯度值,引入奇异值分解方法,在... 为了提高复杂背景下的弱小目标的检测精度,提出了基于差异结构描述符与自适应侧抑制的红外弱小目标检测技术。首先,引入非局部均值滤波,对红外图像进行预处理,降低噪声的干扰;随后,计算输入滤波红外图像的梯度值,引入奇异值分解方法,在梯度域内获取特征信息,从而确定主方向;为了能够根据红外图像的信息变化来自适应增强弱小目标与抑制背景,利用奇异值分解获取的主方向来计算侧抑制系数;并利用特征信息,构建差异结构描述符,联合改进的侧抑制系数,形成了一个自适应侧抑制滤波器,降低其对噪声的敏感性,以更好地对红外图像中的每个像素进行处理;最后,定义像素灰度补偿函数,完成弱小目标检测。实验结果显示:与当前红外弱小目标检测技术相比,在噪声与复杂背景情况下,所提算法能够准确完整地检测出弱小目标,具有更高的信杂比增益与背景抑制因子,呈现出更理想的ROC曲线。 展开更多
关键词 红外弱小目标检测 差异结构描述符 侧抑制 主方向 灰度补偿函数 信杂比增益
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新一套分子结构描述符的建立及其应用
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作者 姚树文 陶建中 孙用明 《河南职业技术师范学院学报》 2000年第4期66-70,共5页
从化合物结构出发 ,提出了一套不依赖于分子的实验性质和其它计算性质的分子结构描述符。对环烃化合物以不同原子间距离为基础 ,辅助有描述共轭效应的 π电子个数组成描述符集 ,用人工神经网络的优势关联分子结构与分子性质的关系 ,计... 从化合物结构出发 ,提出了一套不依赖于分子的实验性质和其它计算性质的分子结构描述符。对环烃化合物以不同原子间距离为基础 ,辅助有描述共轭效应的 π电子个数组成描述符集 ,用人工神经网络的优势关联分子结构与分子性质的关系 ,计算了收集到的和环烃化合物的摩尔生成焓 ,采用“留一法”预报结果满意 ,相关系数 r=0 .950 展开更多
关键词 分子结构描述符 环烃 生成焓 计算
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颜色描述符提取算法在图像检索算法中的应用 被引量:2
6
作者 刘丽萍 《科技资讯》 2015年第8期21-21,共1页
分析当前基于内容的检索方法,设计了基于多种颜色描述符提取算法的检索系统。将主颜色描述符、颜色结构描述符及空间主颜色描述符相结合,用户可根据需要,选择合适的算法进行多次检索,取得更好的检索结果。
关键词 基于内容的图像检索 特征提取 主颜色描述符 颜色结构描述符 空间主颜色描述符
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基于颜色描述符的图像检索系统
7
作者 崔宁海 《信息系统工程》 2017年第3期39-39,共1页
MPEG-7标准中推荐了多种描述符,本文以通过对主颜色描述符和颜色结构描述符进行分析研究,以两种描述符为主要算法,设计构建基于颜色描述符的图像检索系统。实验表明该系统完善了多媒体资源信息管理系统对图像的检索功能。
关键词 主颜色描述符 颜色结构描述符 图像检索
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颜色和纹理混合描述符图像检索方法 被引量:5
8
作者 严宇 宋威 《计算机科学与探索》 CSCD 北大核心 2017年第11期1816-1825,共10页
如何从数据庞大的图像数据库中建立索引并准确检索出相关图像是现阶段急需解决的问题。从图像的局部2×2像素网格提取图像的颜色和纹理特征,其中颜色特征从经过非均匀量化的HSV颜色空间提取,定义了5类新颖的纹理结构描述符用来描述... 如何从数据庞大的图像数据库中建立索引并准确检索出相关图像是现阶段急需解决的问题。从图像的局部2×2像素网格提取图像的颜色和纹理特征,其中颜色特征从经过非均匀量化的HSV颜色空间提取,定义了5类新颖的纹理结构描述符用来描述图像的纹理。通过分别提取每个颜色值的纹理特征结构得到最终的具有旋转和尺寸不变性的颜色和纹理混合特征描述符(color and texture hybrid descriptor,CTHD)。在Corel标准图片库和Corel-5K图片库中进行了实验,经过与其他图像检索方法对比,所提方法具有更好的检索准确率。 展开更多
关键词 颜色特征 纹理特征 结构元素描述符 旋转和尺寸不变性
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烃基酚类化合物结构与毒性关系研究 被引量:5
9
作者 廖立敏 卿东红 +3 位作者 李建凤 朱俊 谢永红 雷光东 《环境化学》 CAS CSCD 北大核心 2011年第2期495-499,共5页
有机化合物通常由电性各异的氢、碳、氮、氧、硫及卤素等原子以共价键结合而成,从分子的三维空间结构出发,按照不同类型原子之间电性相互作用得到一种分子结构表达方法——三维分子电性相互作用矢量(three dimensional molecular electr... 有机化合物通常由电性各异的氢、碳、氮、氧、硫及卤素等原子以共价键结合而成,从分子的三维空间结构出发,按照不同类型原子之间电性相互作用得到一种分子结构表达方法——三维分子电性相互作用矢量(three dimensional molecular electronegativity interaction vector,3D-MEIV).利用该矢量对41种烃基酚类化合物进行结构表达,通过逐步回归的方法建立了2变量毒性模型,复相关系数(R)为0.9438,均方根误差(RMS)为0.2541.再用留一法(Leave-one-out,LOO)交互检验对模型进行了评价,得到的复相关系数(R(CV))为0.9349,均方根误差(RMS(CV))为0.2728.结果表明3D-MEIV能较好地表征烃基酚类化合物的分子结构,所建模型具有较好的稳定性和预测能力. 展开更多
关键词 三维分子电性相互作用矢量 结构描述符 定量结构-活性相关 烃基酚
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饮用水中挥发性有机物结构与色谱保留时间的关系 被引量:6
10
作者 廖立敏 李建凤 雷光东 《环境化学》 CAS CSCD 北大核心 2017年第4期710-715,共6页
将有机化合物分子中的非氢原子分为4类,将不同非氢原子自身及非氢原子之间的关系作为结构描述符,对部分饮用水中挥发性有机物分子结构进行了参数化表达.采用逐步回归(SMR)与偏最小二乘回归(PLS)相结合的方法构建了化合物结构与色谱保留... 将有机化合物分子中的非氢原子分为4类,将不同非氢原子自身及非氢原子之间的关系作为结构描述符,对部分饮用水中挥发性有机物分子结构进行了参数化表达.采用逐步回归(SMR)与偏最小二乘回归(PLS)相结合的方法构建了化合物结构与色谱保留时间(t_R)之间的关系模型,模型的建模相关系数(R^2)为0.955,"留一法"交互检验的相关系数(Q^2)为0.894,标准偏差(SD)为0.803.结果表明结构描述符能较好地表征化合物分子结构特征,所建模型稳定性好、预测能力强,对于挥发性有机污染物QSRR研究具有一定的参考价值. 展开更多
关键词 挥发性有机物 色谱保留时间 结构描述符 结构与性质的关系
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柠檬皮香气成分结构表征与色谱保留指数预测 被引量:5
11
作者 廖立敏 李建凤 雷光东 《天然产物研究与开发》 CAS CSCD 北大核心 2016年第1期90-95,共6页
通过有机化合物分子顶点及顶点原子之间的关系对柠檬皮香气成分中的67个化合物进行了结构表征,采用多元线性回归(MLR)和偏最小二乘回归(PLS)建立了化合物结构与色谱保留指数关系(QSRR)模型,模型稳定性及预测能力经内部及外部双重检验进... 通过有机化合物分子顶点及顶点原子之间的关系对柠檬皮香气成分中的67个化合物进行了结构表征,采用多元线性回归(MLR)和偏最小二乘回归(PLS)建立了化合物结构与色谱保留指数关系(QSRR)模型,模型稳定性及预测能力经内部及外部双重检验进行了评价。两模型的建模复相关系数(R)分别为0.951和0.938,留一法交互检验复相关系数(R_(CV))分别为0.925和0.900,外部预测的复相关系数(Rtest)分别为0.955和0.940。结果表明所采用的分子结构描述符具有较强的分子结构表达能力,两模型具有良好的估计能力、稳定性和外部预测能力。 展开更多
关键词 柠檬皮 香气成分 结构描述符 定量结构保留相关
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部分有机污染物灰/水分配系数的定量结构性质关系研究 被引量:4
12
作者 廖立敏 黄茜 雷光东 《南京理工大学学报》 EI CAS CSCD 北大核心 2017年第1期116-122,共7页
为研究有机污染物结构与灰/水分配系数的关系,选用了部分有机污染物为研究样本,以分子顶点关系指数为结构描述符,对研究样本进行了结构表征。通过多元线性回归和偏最小二乘回归的方法建立了该类化合物结构与灰/水分配系数之间的关系模型... 为研究有机污染物结构与灰/水分配系数的关系,选用了部分有机污染物为研究样本,以分子顶点关系指数为结构描述符,对研究样本进行了结构表征。通过多元线性回归和偏最小二乘回归的方法建立了该类化合物结构与灰/水分配系数之间的关系模型,两模型的复相关系数分别为0.946和0.945。采用"留一法"交互检验对模型的稳健性和预测能力进行了评价,交互检验的复相关系数分别为0.926和0.908。结果表明,分子结构描述符能较好地表达有机污染物结构特征,所建模型具有良好的稳健性和预测能力,该文对于有机污染物的定量结构性质关系研究具有一定的参考价值。 展开更多
关键词 灰/水分配系数 结构描述符 持久性有机污染物 定量结构性质关系 定量构效关系
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基于邻域结构和高斯混合模型的非刚性点集配准算法 被引量:2
13
作者 彭磊 李光耀 +2 位作者 肖莽 王刚 谢力 《电子与信息学报》 EI CSCD 北大核心 2016年第1期47-52,共6页
非刚性点集配准算法在实际应用中要求对噪声、遮挡或异常点具有很好的鲁棒性。该文采用高斯混合模型并结合点的邻域结构信息实现非刚性点集配准。使用高斯混合模型表示模型点集,通过高斯径向基函数构建变换模型。并根据点的邻域结构信... 非刚性点集配准算法在实际应用中要求对噪声、遮挡或异常点具有很好的鲁棒性。该文采用高斯混合模型并结合点的邻域结构信息实现非刚性点集配准。使用高斯混合模型表示模型点集,通过高斯径向基函数构建变换模型。并根据点的邻域结构信息决定高斯混合模型中每个高斯组成部分所占的比例。在EM算法的期望步(E-step)阶段求解点的对应关系,在最大化步(M-step)阶段求解异常点比例系数和变换的闭合形式解,直至算法收敛得到最优解。通过在合成数据和实际的视网膜图像上的实验,与目前几种先进的点集配准方法进行了比较,证明该算法具有较好的配准效果和鲁棒性。 展开更多
关键词 图像配准 非刚性点集配准 高斯混合模型 结构描述符
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含氯苯酚类化合物结构表征与毒性预测 被引量:4
14
作者 廖立敏 李建凤 雷光东 《生态毒理学报》 CAS CSCD 北大核心 2017年第6期266-272,共7页
将有机化合物中的不同非氢原子及非氢原子之间的关系参数化得到新的结构描述符,运用该描述符对部分含氯苯酚类化合物分子结构进行了参数化表征。采用偏最小二乘回归(PLS)方法构建了化合物结构与毒性(-lg IC50)之间的关系模型,模型的建... 将有机化合物中的不同非氢原子及非氢原子之间的关系参数化得到新的结构描述符,运用该描述符对部分含氯苯酚类化合物分子结构进行了参数化表征。采用偏最小二乘回归(PLS)方法构建了化合物结构与毒性(-lg IC50)之间的关系模型,模型的建模相关系数(R2)为0.948,"留一法"交互检验的相关系数(Q2)为0.922,标准偏差(SD)为0.184。结果表明结构描述符能较好地表征化合物分子结构特征,所建模型稳定性好、预测能力强,对于酚类化合物QSAR研究具有一定的参考价值。 展开更多
关键词 含氯苯酚类化合物 毒性值(-lgIC50) 结构描述符 结构与活性的关系(QSAR)
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部分含氯芳烃结构与孔雀鱼半数致死浓度(-logLC_(50))定量活性相关研究 被引量:3
15
作者 李建凤 黄茜 雷光东 《生态毒理学报》 CAS CSCD 北大核心 2017年第3期732-738,共7页
构建了不同类型的分子顶点之间的电性关系作为结构描述符,对部分含氯芳烃化合物结构进行了参数化表征,共得到7个与化合物结构密切相关的结构描述符。逐步回归(SMR)筛选变量后,分别运用多元线性回归(MLR)和偏最小二乘回归(PLS)建立了化... 构建了不同类型的分子顶点之间的电性关系作为结构描述符,对部分含氯芳烃化合物结构进行了参数化表征,共得到7个与化合物结构密切相关的结构描述符。逐步回归(SMR)筛选变量后,分别运用多元线性回归(MLR)和偏最小二乘回归(PLS)建立了化合物结构与孔雀鱼半数致死浓度(-log LC50)之间的关系模型,两模型建模相关系数(r2)分别为0.871、0.862;"留一法"交互检验的相关系数(Q2)分别为0.808、0.589。结果表明分子结构描述符能恰当地表征化合物结构特征,所建模型具有良好的稳定性和预测能力。 展开更多
关键词 含氯芳烃化合物 结构描述符 半数致死浓度 结构与性质的关系
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醛酮化合物结构与保留指数关系的研究 被引量:10
16
作者 廖立敏 《化学研究与应用》 CAS CSCD 北大核心 2015年第5期617-623,共7页
以非氢原子自身及非氢原子之间的关系为分子结构描述符,对35个醛酮类化合物进行了结构表征。采用多元线性回归和偏最小二乘回归的方法建立了该类化合物结构与色谱保留指数之间的关系模型,两模型的复相关系数(R)分别为0.987和0.981,标准... 以非氢原子自身及非氢原子之间的关系为分子结构描述符,对35个醛酮类化合物进行了结构表征。采用多元线性回归和偏最小二乘回归的方法建立了该类化合物结构与色谱保留指数之间的关系模型,两模型的复相关系数(R)分别为0.987和0.981,标准偏差(SD)分别为25.259和32.240。采用"留一法"交互检验和外部样本预测的方法对模型的稳健性和预测能力进行了评价,交互检验的复相关系数(RCV)分别为0.981和0.958,标准偏差(SDCV)分别为34.292和39.652;外部预测的复相关系数(Rtest)分别为0.991和0.990,标准偏差(SDtest)分别为25.749和26.776。结果表明所构建的分子结构描述符能够恰当表现该类化合物结构特征,所建模型具有良好的稳健性和预测能力。 展开更多
关键词 醛酮化合物 结构描述符 色谱保留指数 结构与性质
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有机污染物结构与生物活性关系研究 被引量:1
17
作者 廖立敏 李建凤 雷光东 《环境污染与防治》 CAS CSCD 北大核心 2017年第6期653-657,663,共6页
将有机污染物分子中的非氢原子分为4类,将不同非氢原子及非氢原子之间的关系作为分子结构描述符,对49种有机污染物分子结构进行了参数化表达。采用逐步回归(SMR)与偏最小二乘回归(PLS)方法构建了有机污染物结构与生物活性之间的关系模型... 将有机污染物分子中的非氢原子分为4类,将不同非氢原子及非氢原子之间的关系作为分子结构描述符,对49种有机污染物分子结构进行了参数化表达。采用逐步回归(SMR)与偏最小二乘回归(PLS)方法构建了有机污染物结构与生物活性之间的关系模型,模型的相关系数(R^2)为0.869,"留一法"交互检验相关系数(Q^2)为0.821,可见模型稳定性好、预测能力强,非偶然因素所致。 展开更多
关键词 有机污染物 生物活性 结构描述符
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灯盏花挥发性组分结构与保留时间关系研究 被引量:1
18
作者 李建凤 廖立敏 《天然产物研究与开发》 CAS CSCD 2021年第2期236-245,共10页
通过对有机化合物非氢原子进行分类、参数化染色、建立非氢原子之间的关系得到新的结构描述符。对灯盏花的64种挥发性有机化合物结构进行了参数化表征,运用多元线性回归(MLR)和偏最小二乘回归(PLS)方法构建了化合物结构与色谱保留时间... 通过对有机化合物非氢原子进行分类、参数化染色、建立非氢原子之间的关系得到新的结构描述符。对灯盏花的64种挥发性有机化合物结构进行了参数化表征,运用多元线性回归(MLR)和偏最小二乘回归(PLS)方法构建了化合物结构与色谱保留时间的关系模型。通过“留一法”交互检验对模型的稳定性进行了评价,利用外部样本集对模型的预测能力进行了检验。两模型的相关系数(R^(2))、交互检验的相关系数(R_(CV)^(2))、外部预测的相关系数(R_(test)^(2))值均较为理想,表明所建模型具有良好的拟合能力、稳定性和外部预测能力。分析了影响化合物色谱保留时间的结构因素,结果表明化合物的伯、仲碳原子越多,该化合物可能具有较大的色谱保留时间(tR)值。本文对于天然产物中的挥发性有机化合物结构与性质关系研究具有一定的参考价值。 展开更多
关键词 灯盏花 挥发性化合物 结构描述符 结构表征 模拟预测
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酚类化合物结构与醇/水分配系数(logK_(ow))关系研究 被引量:4
19
作者 廖立敏 《生态毒理学报》 CAS CSCD 北大核心 2017年第3期710-716,共7页
将不同非氢原子自身及非氢原子之间的关系参数化并构建出新的结构描述符,对部分酚类化合物分子结构进行了参数化表达。采用逐步回归(SMR)与多元线性回归(MLR)相结合的方法建立了化合物结构与醇/水分配系数(log Kow)之间的关系模型,模型... 将不同非氢原子自身及非氢原子之间的关系参数化并构建出新的结构描述符,对部分酚类化合物分子结构进行了参数化表达。采用逐步回归(SMR)与多元线性回归(MLR)相结合的方法建立了化合物结构与醇/水分配系数(log Kow)之间的关系模型,模型的建模相关系数(r)为0.988,标准偏差(SD)为0.121;"留一法"交互检验的相关系数(Q2)为0.966,标准偏差(SDCV)为0.148。结果表明结构描述符能较好地表征化合物分子结构特征,所建模型稳定性好,预测能力强,对于酚类化合物QSPR研究具有一定的参考价值。 展开更多
关键词 酚类化合物 醇/水分配系数(logKow) 结构描述符 结构与性质
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脐橙果酒香气成分结构与色谱保留时间的关系 被引量:1
20
作者 廖立敏 《食品与发酵工业》 CAS CSCD 北大核心 2015年第2期212-216,共5页
通过有机化合物分子非氢原子自身及非氢原子之间的关系构建了新的分子结构描述符,对脐橙果酒香气成分中的30个化合物进行了结构表征,采用多元线性回归(MLR)和逐步回归(SMR)建立了化合物结构与色谱保留时间的关系(QSRR)模型,同时采用&qu... 通过有机化合物分子非氢原子自身及非氢原子之间的关系构建了新的分子结构描述符,对脐橙果酒香气成分中的30个化合物进行了结构表征,采用多元线性回归(MLR)和逐步回归(SMR)建立了化合物结构与色谱保留时间的关系(QSRR)模型,同时采用"留一法"对所得模型稳健性及预测能力进行了评价。模型相关系数(R)为0.947,标准偏差(SD)为2.943;"留一法"交叉验证系数(Q2)为0.847,标准偏差(SDCV)为2.943。结果表明所构建的分子结构描述符具有较强的分子结构表达能力,模型具有良好的稳健性和预测能力,可以揭示分子结构的微观参数与保留时间的递变规律,对于预测食品中的挥发性化合物色谱保留时间、选择分离条件、探索色谱保留机理及对化合物定性识别具有重要意义。 展开更多
关键词 脐橙 果酒 香气成分 结构描述符 定量结构保留相关
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