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用序列比对设计的茎环结构探针检测金黄色葡萄球菌
被引量:
1
1
作者
杨旭
肖潇
+2 位作者
陈章
李会东
邓乐
《微生物学通报》
CAS
CSCD
北大核心
2007年第6期1169-1173,共5页
基于金黄色葡萄球菌16S rRNA基因序列,采用序列比对设计了一种茎环结构的寡聚核苷酸探针。探针的环序列即为金黄色葡萄球菌16S rRNA基因序列的其中一个片段,同其他菌种的16S rRNA基因序列误配2个以上的核苷酸,因此能高度专一、灵敏的检...
基于金黄色葡萄球菌16S rRNA基因序列,采用序列比对设计了一种茎环结构的寡聚核苷酸探针。探针的环序列即为金黄色葡萄球菌16S rRNA基因序列的其中一个片段,同其他菌种的16S rRNA基因序列误配2个以上的核苷酸,因此能高度专一、灵敏的检测金黄色葡萄球菌16S rRNA。根据分子信标技术和酶联免疫分析的原理,评估一个实验方法,即利用能构象转换的、固定化的茎环结构探针酶联检测靶核酸。由于探针的特异性加强,这个检测系统能有效的排除假阳性即不会出现误配一个核苷酸的情况。采用微量浓度测定分析,最低下限可检测出大约4ng的金葡球菌16SrRNA。这种方法的灵敏度比其他常规检测方法高出了至少一个数量级。
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关键词
序列比对
茎环结构探针
16S核糖体核糖核酸
检测
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职称材料
耐甲氧西林金黄色葡萄球菌mecA基因分子探针杂交荧光观测
2
作者
陈庆海
王丰
+4 位作者
华兴
夏涵
孙悦
向阳
府伟灵
《中华医院感染学杂志》
CAS
CSCD
北大核心
2011年第10期1952-1955,共4页
目的针对耐甲氧西林金黄色葡萄球菌mecA基因扩增片段,设计一种茎环结构的DNA分子探针,运用荧光显微镜观测DNA分子探针与mecA基因扩增产物杂交后的荧光信号。方法采用Beacon designer 7.0软件对mecA基因的特异性扩增片段设计茎环结构的DN...
目的针对耐甲氧西林金黄色葡萄球菌mecA基因扩增片段,设计一种茎环结构的DNA分子探针,运用荧光显微镜观测DNA分子探针与mecA基因扩增产物杂交后的荧光信号。方法采用Beacon designer 7.0软件对mecA基因的特异性扩增片段设计茎环结构的DNA分子探针,应用荧光显微镜检测mecA基因扩增片段与探针杂交荧光信号。结果通过荧光显微镜观测出28株耐甲氧西林金黄色葡萄球菌和8株铜绿假单胞菌对照菌的特异性扩增片段,与DNA分子探针杂交后,荧光信号强度差异有统计学意义;该杂交条件优化:50℃为最佳杂交温度;10 h为最佳杂交时间。结论茎环结构DNA分子探针技术,结合荧光显微镜可高灵敏检测mecA基因的扩增片段,mecA基因是金黄色葡萄球菌耐甲氧西林的主要原因。
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关键词
耐甲氧西林金黄色葡萄球菌
MECA基因
茎
环
结构
分子
探针
荧光显微镜
原文传递
题名
用序列比对设计的茎环结构探针检测金黄色葡萄球菌
被引量:
1
1
作者
杨旭
肖潇
陈章
李会东
邓乐
机构
湖南师范大学生命科学学院
出处
《微生物学通报》
CAS
CSCD
北大核心
2007年第6期1169-1173,共5页
基金
湖南省教育厅重点资助项目(No.05A034)
文摘
基于金黄色葡萄球菌16S rRNA基因序列,采用序列比对设计了一种茎环结构的寡聚核苷酸探针。探针的环序列即为金黄色葡萄球菌16S rRNA基因序列的其中一个片段,同其他菌种的16S rRNA基因序列误配2个以上的核苷酸,因此能高度专一、灵敏的检测金黄色葡萄球菌16S rRNA。根据分子信标技术和酶联免疫分析的原理,评估一个实验方法,即利用能构象转换的、固定化的茎环结构探针酶联检测靶核酸。由于探针的特异性加强,这个检测系统能有效的排除假阳性即不会出现误配一个核苷酸的情况。采用微量浓度测定分析,最低下限可检测出大约4ng的金葡球菌16SrRNA。这种方法的灵敏度比其他常规检测方法高出了至少一个数量级。
关键词
序列比对
茎环结构探针
16S核糖体核糖核酸
检测
Keywords
Sequence comparisons, Stem-loop structured probe, 16S rRNA, Detection
分类号
R378.11 [医药卫生—病原生物学]
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职称材料
题名
耐甲氧西林金黄色葡萄球菌mecA基因分子探针杂交荧光观测
2
作者
陈庆海
王丰
华兴
夏涵
孙悦
向阳
府伟灵
机构
第三军医大学第一附属医院检验科
百傲科技有限公司
出处
《中华医院感染学杂志》
CAS
CSCD
北大核心
2011年第10期1952-1955,共4页
基金
国家自然科学基金(30970879
30927002)
+6 种基金
重庆市计生委课题(2008-5)
重庆市科委自然科学基金(CQCSTC2009BB5140)
全军医药卫生科研基金(06G073
08G089)
国家计生委课题(2009-GJKJS-017-019)
国家传染病重大专项分题(2008ZX10003-02
2008ZX10003-012)
文摘
目的针对耐甲氧西林金黄色葡萄球菌mecA基因扩增片段,设计一种茎环结构的DNA分子探针,运用荧光显微镜观测DNA分子探针与mecA基因扩增产物杂交后的荧光信号。方法采用Beacon designer 7.0软件对mecA基因的特异性扩增片段设计茎环结构的DNA分子探针,应用荧光显微镜检测mecA基因扩增片段与探针杂交荧光信号。结果通过荧光显微镜观测出28株耐甲氧西林金黄色葡萄球菌和8株铜绿假单胞菌对照菌的特异性扩增片段,与DNA分子探针杂交后,荧光信号强度差异有统计学意义;该杂交条件优化:50℃为最佳杂交温度;10 h为最佳杂交时间。结论茎环结构DNA分子探针技术,结合荧光显微镜可高灵敏检测mecA基因的扩增片段,mecA基因是金黄色葡萄球菌耐甲氧西林的主要原因。
关键词
耐甲氧西林金黄色葡萄球菌
MECA基因
茎
环
结构
分子
探针
荧光显微镜
Keywords
Methicillin-resistant Staphylococcus aureus
MecA gene
Stem-ring molecular probe
Fluorescence microscope
分类号
R378.11 [医药卫生—病原生物学]
原文传递
题名
作者
出处
发文年
被引量
操作
1
用序列比对设计的茎环结构探针检测金黄色葡萄球菌
杨旭
肖潇
陈章
李会东
邓乐
《微生物学通报》
CAS
CSCD
北大核心
2007
1
在线阅读
下载PDF
职称材料
2
耐甲氧西林金黄色葡萄球菌mecA基因分子探针杂交荧光观测
陈庆海
王丰
华兴
夏涵
孙悦
向阳
府伟灵
《中华医院感染学杂志》
CAS
CSCD
北大核心
2011
0
原文传递
已选择
0
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引证文献
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