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荧光PCR熔解曲线法检测幽门螺杆菌克拉霉素、喹诺酮耐药基因的性能验证
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作者 杨昕澄 范柏月 +4 位作者 何帮顺 聂珍琳 韦静 万芳 蔺昕 《临床检验杂志》 CAS 2024年第11期845-850,共6页
目的探讨采用荧光PCR熔解曲线法检测粪便样本中的幽门螺杆菌(Helicobacter pylori,Hp)克拉霉素(23S rRNA)及喹诺酮(gyrA)耐药相关基因突变在临床诊断中的应用价值。方法纳入胃镜检查Hp快速尿素酶阳性且未经治疗的1176例患者,收集患者胃... 目的探讨采用荧光PCR熔解曲线法检测粪便样本中的幽门螺杆菌(Helicobacter pylori,Hp)克拉霉素(23S rRNA)及喹诺酮(gyrA)耐药相关基因突变在临床诊断中的应用价值。方法纳入胃镜检查Hp快速尿素酶阳性且未经治疗的1176例患者,收集患者胃黏膜组织及粪便样本用于对比研究,针对同一阳性病例,采用E-test法分析胃黏膜组织中Hp克拉霉素、喹诺酮耐药表型,荧光PCR熔解曲线法检测粪便样本中Hp克拉霉素、喹诺酮耐药基因型,Kappa检验分析两种方法检测结果的一致性;对于阳性病例的粪便样本提取2份核酸,分别采用荧光PCR熔解曲线法及一代测序法检测Hp 23S rRNA、gyrA耐药突变基因,并比较两种方法检测结果的一致性。结果在克拉霉素耐药研究中,最终获得有效样本934例,其中耐药阳性表型453例,耐药阳性基因型481例,阳性符合率为93.38%(95%CI:90.70%~95.32%);在喹诺酮耐药研究中,最终获得有效样本909例,其中表型耐药阳性426例,基因型耐药阳性413例,阳性符合率为86.85%(95%CI:83.31%~89.74%)。在对比研究中,23S rRNA基因检测有效样本986例,其中荧光PCR熔解曲线法检测耐药阳性514例,测序检测耐药阳性509例,阳性符合率为96.27%(95%CI:94.24%~97.60%),gyrA基因检测有效样本895例,其中荧光PCR熔解曲线法检测耐药阳性422例,测序检测耐药阳性405例,阳性符合率为95.80%(95%CI:93.38%~97.36%)。结论基于粪便样本的荧光PCR熔解曲线法检测Hp 23S rRNA、gyrA对预测Hp的耐药性具有一定的临床应用价值。 展开更多
关键词 幽门螺杆菌 荧光pcr熔解曲线 克拉霉素 喹诺酮 耐药 基因型
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荧光PCR熔解曲线法在检测临床标本结核分枝杆菌及其耐药性中的应用 被引量:7
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作者 张汇征 李桓 +7 位作者 张珍 李俊刚 王静 廖传玉 周刚 陈耀凯 严晓峰 罗明 《中国实验诊断学》 2021年第3期354-356,共3页
目的评价荧光PCR熔解曲线法检测临床标本结核分枝杆菌及其对利福平和异烟肼敏感性的性能。方法收集重庆市公共卫生医疗救治中心2016年7月至2018年7月进行过荧光PCR熔解曲线法结核检测的病例,分别与结核菌培养和Genexpert比较检测结核菌... 目的评价荧光PCR熔解曲线法检测临床标本结核分枝杆菌及其对利福平和异烟肼敏感性的性能。方法收集重庆市公共卫生医疗救治中心2016年7月至2018年7月进行过荧光PCR熔解曲线法结核检测的病例,分别与结核菌培养和Genexpert比较检测结核菌的灵敏度,与比例法药敏比较药敏结果。结果在结核菌检测上,荧光PCR熔解曲线法阳性率与结核菌培养相近,低于Genexpert;与比例法药敏相比,检测利福平药敏的灵敏度为93.2%,特异度为80.2%,符合率为84.3%;检测异烟肼药敏的灵敏度为92.6%,特异度为86.3%,符合率为88.6%。结论荧光PCR熔解曲线法可以高灵敏地直接对临床样本快速检测结核菌及其耐药性。 展开更多
关键词 荧光pcr熔解曲线法 结核分枝杆菌 耐药性 临床样本
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荧光PCR熔解曲线法对痰样本结核分枝杆菌耐药性检测价值及耐药特征分析 被引量:4
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作者 吴燕飞 徐丽霞 +3 位作者 赖聪娟 季柏林 周琛博 许河南 《浙江中西医结合杂志》 2022年第10期949-952,共4页
随着抗结核药物广泛、长期以及不规范使用等因素影响,结核分枝杆菌耐药问题越来越复杂,耐药结核病尤其耐多药结核病(MDR-TB)的发病率日趋增高,耐药性的产生使其具有病程长、病情复杂、治愈率低、病死率高等危害。2020年全球上报耐多药/... 随着抗结核药物广泛、长期以及不规范使用等因素影响,结核分枝杆菌耐药问题越来越复杂,耐药结核病尤其耐多药结核病(MDR-TB)的发病率日趋增高,耐药性的产生使其具有病程长、病情复杂、治愈率低、病死率高等危害。2020年全球上报耐多药/利福平耐药结核(MDR/RR-TB)13.2万例,准广泛耐药或广泛耐药结核病2.6万例,合计约15.8例,较2019年下降22%,据估算我国耐药结核病发病率居全球前三位[1]。2017年,《肺结核诊断标准》把结核分枝杆菌(MTB)分子生物学检查纳入结核病病原学诊断范围[2]。 展开更多
关键词 荧光pcr熔解曲线法 痰样本 耐药结核分枝杆菌 耐药性
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荧光PCR熔解曲线法检测结核分枝杆菌耐药性的临床价值评估 被引量:7
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作者 包晶晶 宋怡蒙 +4 位作者 贺文从 刘春法 刘东鑫 赵雁林 高飞 《内蒙古民族大学学报(自然科学版)》 2020年第2期147-153,共7页
目的:分析评价荧光PCR熔解曲线技术检测结核分枝杆菌异烟肼、利福平、氟喹诺酮类、注射类二线药耐药性的临床应用价值.方法:收集2013年黑龙江省耐药监测结核分枝杆菌临床分离株215例,运用荧光PCR熔解曲线法检测其对异烟肼、利福平、氟... 目的:分析评价荧光PCR熔解曲线技术检测结核分枝杆菌异烟肼、利福平、氟喹诺酮类、注射类二线药耐药性的临床应用价值.方法:收集2013年黑龙江省耐药监测结核分枝杆菌临床分离株215例,运用荧光PCR熔解曲线法检测其对异烟肼、利福平、氟喹诺酮类、注射类二线药物的耐药性,以微孔板药敏试验结果为金标准,评估熔解曲线快速检测耐药的灵敏度、特异度、阳性预测值、阴性预测值、符合率.结果:荧光PCR熔解曲线法检测利福平的灵敏度90.9%(20/22)、特异度95.85%(185/193)、阳性预测值71.42%(20/28)、阴性预测值98.93(185/187)、符合率95.34%(205/215);检测异烟肼的灵敏度为83.33%(35/42)、特异度91.9%(159/173)、阳性预测值71.42%(35/49)、阴性预测值95.78%(159/166)、符合率90.23%(194/215);检测氧氟沙星的灵敏度为90%(9/10)、特异度100%(205/205)、阳性预测值100%(9/9)、阴性预测值99.51%(205/206)、符合率99.53%(214/215);检测莫西沙星的灵敏度为88.88%(8/9)、特异度100%(206/206)、阳性预测值100%(8/8)、阴性预测值99.51%(206/207)、符合率99.51%(214/215);检测阿米卡星的灵敏度100%(3/3)、特异度100%(212/212)、阳性预测值100%(3/3)、阴性预测值100%(212/212)、符合率100%(215/215);检测卡那霉素的灵敏度80%(4/5)、特异度100%(210/210)、阳性预测值100%(4/4)、阴性预测值99.52%(210/211)、符合率99.53%(214/215).结论:荧光PCR熔解曲线技术检测结核分枝杆菌对异烟肼、利福平、氟喹诺酮类、注射类二线药的耐药性有较好的灵敏性、特异性,检测时间短,可用于辅助耐药结核分枝杆菌快速诊断筛查. 展开更多
关键词 分枝杆菌 荧光pcr熔解曲线法 耐药突变 异烟肼 利福平 氟喹诺酮类 注射类二线药
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荧光PCR熔解曲线法对抗结核药物异烟肼、乙胺丁醇、左氧氟沙星耐药性的诊断价值 被引量:8
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作者 史剑权 高珊 王隽 《中国医药导报》 CAS 2022年第4期37-40,44,共5页
目的评价荧光PCR熔解曲线法对抗结核药物异烟肼、乙胺丁醇、左氧氟沙星耐药性的诊断价值。方法回顾性分析2018年1月至2019年12月首都医科大学附属北京胸科医院收治的肺结核患者170例,对表型药物敏感性试验(DST)和荧光PCR熔解曲线法对抗... 目的评价荧光PCR熔解曲线法对抗结核药物异烟肼、乙胺丁醇、左氧氟沙星耐药性的诊断价值。方法回顾性分析2018年1月至2019年12月首都医科大学附属北京胸科医院收治的肺结核患者170例,对表型药物敏感性试验(DST)和荧光PCR熔解曲线法对抗结核药物耐药性进行比较。以表型DST结果为金标准,分析荧光PCR熔解曲线法对抗结核药物耐药性的诊断价值。评价指标包括:敏感度、特异度、符合率、Kappa值、曲线下面积(AUC)值。同时进一步比较喹诺酮类药物(左氧氟沙星和莫西沙星)的耐药性。结果荧光PCR熔解曲线法DST敏感而表型DST耐药的例数,在异烟肼、乙胺丁醇、左氧氟沙星分别为5、5、3例。荧光PCR熔解曲线法DST耐药而表型DST敏感的例数,在异烟肼、乙胺丁醇、左氧氟沙星分别为9、16、24例。两种方法的总体不一致率,在异烟肼、乙胺丁醇、左氧氟沙星分别为8.24%、12.35%、15.88%。荧光PCR熔解曲线法检测异烟肼耐药性的敏感性、特异性、符合率、Kappa值、AUC值分别是91.53%、91.89%、91.76%、0.821、0.917;对乙胺丁醇的敏感性、特异性、符合率、Kappa值、AUC值分别是77.27%、89.19%、87.65%、0.548、0.832;对左氧氟沙星的敏感性、特异性、符合率、Kappa值、AUC值分别是89.66%、82.98%、84.12%、0.564、0.863。莫西沙星对结核杆菌的耐药率为2.94%,明显低于左氧氟沙星的17.06%(P<0.01)。结论荧光PCR溶解曲线法对异烟肼、乙胺丁醇、左氧氟沙星的耐药性有较好的辅助诊断价值。 展开更多
关键词 荧光pcr熔解曲线 药物敏感性试验 结核 耐药 同义突变 异质性耐药
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荧光PCR熔解曲线法在结核分枝杆菌耐药基因检测中的应用 被引量:4
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作者 李媛媛 苏东栋 《中国实用医药》 2021年第9期210-212,共3页
目的探讨气管镜刷检物实时荧光PCR熔解曲线耐药法检测对复治结核病耐药早期诊断的价值,同时根据支气管刷检深部痰液结核菌耐药检测结果,进一步分析指导可疑耐药结核病治疗,规范临床合理用药,为耐药结核病的诊断及治疗提供科学依据。方... 目的探讨气管镜刷检物实时荧光PCR熔解曲线耐药法检测对复治结核病耐药早期诊断的价值,同时根据支气管刷检深部痰液结核菌耐药检测结果,进一步分析指导可疑耐药结核病治疗,规范临床合理用药,为耐药结核病的诊断及治疗提供科学依据。方法纳入160例结核分枝杆菌(MTB)患者为本研究对象。每例患者采用同一标本进行绝对浓度法和熔解曲线法耐药基因检测,观察熔解曲线法对利福平、异烟肼的检测敏感度、特异度、准确度。结果同一标本应用两种方法检测时,绝对浓度法检出利福平21例耐药,139例敏感;检出异烟肼68例耐药,92例敏感。熔解曲线法检出利福平17例耐药,139例敏感,4例未检出结果;检出异烟肼61例耐药,99例敏感。熔解曲线法对利福平的检测准确度为96.15%、敏感度为87.50%、特异度为98.39%;对异烟腓的检测准确度为95.00%、敏感度为88.57%、特异度为96.80%。两种检验方法对利福平及异烟肼的耐药及敏感率比较,差异均无统计学意义(P>0.05)。结论荧光PCR熔解曲线法能够快速检测出MTB对药物的耐药基因检测,而且有良好的敏感度和特异度,有效节约时间、安全高效,是临床检验及诊治耐药结核的有效手段。 展开更多
关键词 荧光pcr熔解曲线法 结核分枝杆菌 利福平 异烟肼 耐药情况 敏感度 特异性
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微阵列芯片法与荧光PCR熔解曲线法在耳聋基因筛查中的比较分析
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作者 曹国梅 张陆岩 +1 位作者 黄春红 朱子成 《医学理论与实践》 2022年第12期2008-2011,共4页
目的:观察微阵列芯片法与荧光PCR熔解曲线法应用于新生儿耳聋基因筛查的效果,分析两种新生儿耳聋基因筛查方法的临床诊断价值。方法:选取20例干血斑样本(结果已知),分别使用微阵列芯片法、荧光PCR熔解曲线法进行筛查,验证两种筛查方法... 目的:观察微阵列芯片法与荧光PCR熔解曲线法应用于新生儿耳聋基因筛查的效果,分析两种新生儿耳聋基因筛查方法的临床诊断价值。方法:选取20例干血斑样本(结果已知),分别使用微阵列芯片法、荧光PCR熔解曲线法进行筛查,验证两种筛查方法的准确性、重复性以及检出限。结果:微阵列芯片法的准确率为100%,重复检测结果与临床已知结果相吻合,核酸浓度稀释到检测下限后的检测结果与已知结果的符合率为100%,满足临床基因筛查的需要。荧光PCR熔解曲线法的准确性验证结果为100%,重复性验证显示各通道Tm值的变异系数(CV)均≤5%,检出限样本的检测结果与已知结果吻合,符合临床筛查要求。结论:在新生儿耳聋基因筛查中,微阵列芯片法与荧光PCR熔解曲线法均能够满足临床筛查的需要,临床应用时可根据实际条件合理选取检测方法。 展开更多
关键词 耳聋 基因筛查 荧光pcr熔解曲线法 微阵列芯片
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实时荧光PCR熔解曲线法快速鉴定嗜肺军团菌 被引量:2
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作者 戈立秀 赵利伟 +2 位作者 陈文聪 朱庆义 吴尚为 《临床检验杂志》 CAS CSCD 北大核心 2012年第3期187-189,共3页
目的建立特异、快速、敏感的实时荧光PCR熔解曲线基因分型方法,并探讨该法在鉴定嗜肺军团菌中的应用价值。方法根据嗜肺军团菌16S rRNA基因保守序列设计引物和猝灭FRET探针建立实时荧光PCR熔解曲线方法,优化引物与探针浓度,用15株嗜肺... 目的建立特异、快速、敏感的实时荧光PCR熔解曲线基因分型方法,并探讨该法在鉴定嗜肺军团菌中的应用价值。方法根据嗜肺军团菌16S rRNA基因保守序列设计引物和猝灭FRET探针建立实时荧光PCR熔解曲线方法,优化引物与探针浓度,用15株嗜肺军团菌、30株非嗜肺军团菌及7株其他病原菌标准菌株验证该方法的特异性、敏感性和重复性,用该法检测117例临床痰标本并进行基因测序。结果 15株不同血清型的嗜肺军团菌Tm值均为57℃;7株非嗜肺军团菌Tm值为43℃,1株Tm值为45℃;其余22株非嗜肺军团菌和7株其他病原菌均无明显Tm值。该方法最低检出限可达0.1 pg/μL。检测117例痰标本发现3株嗜肺军团菌,与PCR基因测序法检测结果一致。结论实时荧光PCR熔解曲线法可特异、快速和敏感地检测嗜肺军团菌,适用于临床痰标本的嗜肺军团菌检测。 展开更多
关键词 嗜肺军团菌 实时荧光pcr熔解曲线 猝灭FRET探针
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荧光PCR熔解曲线法在地中海贫血基因突变类型分析中的应用
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作者 杨冬梅 杨玉梅 +1 位作者 宫茂源 罗咏钰 《中文科技期刊数据库(引文版)医药卫生》 2022年第4期208-212,共5页
用荧光PCR熔解曲线法,检测人基因组DNA中缺失型α地贫、非缺失型α地贫和β地贫的常见基因缺失和突变,了解受检者地中海贫血基因突变类型检测阳性率及科室分布情况,分析地贫基因分型结果在贫血诊断、正常妊娠监督产前筛查、遗传咨询中... 用荧光PCR熔解曲线法,检测人基因组DNA中缺失型α地贫、非缺失型α地贫和β地贫的常见基因缺失和突变,了解受检者地中海贫血基因突变类型检测阳性率及科室分布情况,分析地贫基因分型结果在贫血诊断、正常妊娠监督产前筛查、遗传咨询中的应用。 方法 利用荧光PCR熔解曲线法对 2017年8月至2021年12月于贵阳市第二人民医院就诊的2401例需做地中海贫血基因检查的患者进行检测,分析地贫基因型的阳性率、基因突变类型及科室分布情况。 结果 2401例患者中缺失型α地贫基因检出319例,检出率13.29%;非缺失型α地贫基因检出34例,检出率1.42%;β地贫基因检出278例,检出率11.58%;缺失型α地贫基因中出现率最高的是 --SEA/αα基因型,非缺失型α地贫基因中出现率最高的是c.427T>C基因型,β地贫基因中出现率最高的是 c.52A>T基因型;其中,缺失型α地贫中有4例复合杂合缺失型(--SEA/-α3.7),有19例α缺失合并β突变;β地贫基因中有1例突变类型不在β地贫试剂盒检测覆盖范围内。 结论 用荧光PCR熔解曲线法检测人外周全血地贫基因,可以明确检测出常见地贫基因突变类型。通过对妊娠期产检孕妇进行地贫基因的遗传筛查,可以发现地贫致病基因携带者,找出有地贫发生高风险的家庭,在产前诊断、遗传咨询、预防疾病、优生优育、提高人口出生质量上有指导作用;除此之外,地贫基因检测还是控制重症地贫患者出生及疾病遗传的有效手段,为寻找贫血原因、制定治疗方案提供科学明确的依据。 展开更多
关键词 荧光pcr熔解曲线法 地中海贫血 产前筛查 遗传咨询
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实时荧光PCR熔解曲线法在β地中海贫血基因诊断和产前诊断中的临床应用评价 被引量:2
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作者 严提珍 罗世强 +5 位作者 唐宁 钟青燕 聂昌君 李伍高 王秋华 蔡稔 《柳州医学》 2014年第1期10-15,共6页
目的对荧光PCR熔解曲线法用于β地中海贫血(β地贫)基因诊断和产前诊断进行临床评价。方法收集2011年1至8月柳州市妇幼保健院优生遗传实验室外周血标本451份,其中经血液学表型分析为β地贫阳性表型标本372份,β地贫阴性表型标本79... 目的对荧光PCR熔解曲线法用于β地中海贫血(β地贫)基因诊断和产前诊断进行临床评价。方法收集2011年1至8月柳州市妇幼保健院优生遗传实验室外周血标本451份,其中经血液学表型分析为β地贫阳性表型标本372份,β地贫阴性表型标本79份。同时收集2011年6—9月夫妇双方经PCR—RDB针法确诊为β地贫基因携带者,在我院行β地贫产前诊断的胎儿绒毛、羊水及脐带血标本共84份,其中孕10~β周胎儿绒毛标本16份、孕16—24周羊水标本64份、孕17周以上胎儿脐血标本4份。按双盲对照试验,分别采用荧光PCR熔解曲线法(可检测24种β珠蛋白基因突变)、PCR-反向点杂交(RDB探针法(可检测17种β-珠蛋白基因突变)和DNA测序法同时对451份外周血标本和84份胎儿绒毛、羊水、脐带血产前诊断标本进行检测。计算荧光PCR熔解曲线法和RDBPCR探针法、DNA基因测序法检测结果的野生型符合率、突变型符合率和总符合率。结果利用荧光熔解曲线法在451份外周血标本中共检出β种突变类型、19种基因型,其中有447份标本与PCR—RDB针法的基因型检测结果相符,符合率为99.1%(447/451),902个等位基因位点检出符合率为99.6%(898/902),有4份标本与PCR—RDB针法的基因型检测结果不相符,经DNA测序法验证,有3份标本与荧光熔解曲线法的检测结果完全一致,1份标本的β珠蛋白基因突变不在荧光熔解曲线法检测范围而未被检出。450份外周血标本的荧光熔解曲线法检测结果与DNA测序法相符,符合率为99.8%(450/451)。利用荧光熔解曲线法在84份产前诊断胎儿标本中共检出8种突变类型、18种基因型,168个等位基因位点的检测结果与PCR—RDB针法和DNA基因测序法检测结果符合率为100%。结论荧光PCR熔解曲线法可同时检测多份待测标本,并可准确检出多种基因突变类型,可用于β地中海贫血的基因诊断和产前诊断。 展开更多
关键词 Β-地中海贫血 实时荧光pcr 熔解曲线分析 基因诊断 产前诊断
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应用荧光PCR熔解曲线法分析结核分枝杆菌耐药反应的可行性探究
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作者 陈建仁 陈菊 洪颖雯 《黑龙江医药》 CAS 2023年第5期1027-1030,共4页
目的:分析荧光聚合酶链反应(PCR)熔解曲线法(MC)检测结核分枝杆菌(MTB)耐药反应的可行性。方法:选取本院2021年9月至2023年1月本院收治的结核病患者120例,收集患者痰标本进行菌株培养和鉴定,最终纳入102例(株)为本研究观察对象。每份样... 目的:分析荧光聚合酶链反应(PCR)熔解曲线法(MC)检测结核分枝杆菌(MTB)耐药反应的可行性。方法:选取本院2021年9月至2023年1月本院收治的结核病患者120例,收集患者痰标本进行菌株培养和鉴定,最终纳入102例(株)为本研究观察对象。每份样本均进行罗氏固体药敏试验和荧光PCR-MC检测MTB菌株耐药性。对于耐药性检测结果不一致标本,采用基因芯片法进行验证。结果:102株MTB,经罗氏固体药敏试验检出异烟肼耐药菌株18株(17.65%),检出利福平耐药菌株33株(32.35%);荧光PCR-MC法检测异烟肼耐药菌株16株(15.69%),检测利福平耐药菌株37例(36.27%)。以罗氏固体药敏试验检测结果作为金标准,荧光PCR-MC法检测异烟肼耐药性的Kappa值为0.718,敏感度为72.22%,特异度为92.16%,一致性分析基本一致;荧光PCR-MC法检测利福平耐药性的Kappa值为0.783,敏感度为90.91%,特异度为89.96%,一致性分析基本一致。荧光PCR-MC法检测结果显示,对异烟肼耐药的2例MTB菌株均为katG 315位密码子突变;对利福平耐药的7例中,1例ropB 511位密码子、1例ropB 526位密码子和5例ropB 531位密码子突变。基因芯片法耐药基因检测结果与荧光PCR-MC检测结果一致。结论:荧光PCR-MC检测MTB菌株耐药性(异烟肼和利福平)检测具有良好的效能。 展开更多
关键词 荧光聚合酶链反应熔解曲线 结核分枝杆菌 耐药性 可行性
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荧光PCR熔解曲线法对抗结核药物耐药性的诊断价值
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作者 李浩 范大鹏 +5 位作者 岳永宁 商学钗 李奂谕 周锦阳 刘立宾 蔡龙 《浙江实用医学》 2023年第1期9-12,30,共5页
目的 评价荧光PCR熔解曲线法对抗结核药物利福平、异烟肼、氟喹诺酮、二线注射类药物(卡那霉素、阿米卡星、卷曲霉素)耐药性的诊断价值。方法 收集2018年1月~2019年5月在浙江大学医学院附属杭州市胸科医院收治的培养阳性且具有荧光PCR... 目的 评价荧光PCR熔解曲线法对抗结核药物利福平、异烟肼、氟喹诺酮、二线注射类药物(卡那霉素、阿米卡星、卷曲霉素)耐药性的诊断价值。方法 收集2018年1月~2019年5月在浙江大学医学院附属杭州市胸科医院收治的培养阳性且具有荧光PCR熔解曲线和BACTEC MGIT 960药敏结果的205例资料。以BACTEC MGIT960药敏结果为金标准,评价荧光PCR熔解曲线法对抗结核药物利福平、异烟肼、氟喹诺酮、二线注射类药物耐药性的诊断价值。结果 荧光PCR熔解曲线法敏感而BACTEC MGIT960药敏耐药的例数,在利福平、异烟肼、氟喹诺酮、二线注射类分别为1、9、1、1例。荧光PCR熔解曲线法耐药而BACTEC MGIT960药敏敏感的例数,在利福平、异烟肼、氟喹诺酮、二线注射类分别为2、1、2、0例。两种技术方法的总体符合率,在利福平、异烟肼、氟喹诺酮、二线注射类分别为98.54%、95.12%、98.54%、99.51%。荧光PCR熔解曲线法检测利福平耐药性的敏感性、特异性、阳性预测值、阴性预测值、Kappa值分别是96.96%、98.84%、94.12%、99.42%、0.946,对异烟肼耐药性的敏感性、特异性、阳性预测值、阴性预测值、Kappa值分别是80.43%、99.37%、97.37%、94.61%、0.851,对氟喹诺酮耐药性的敏感性、特异性、阳性预测值、阴性预测值、Kappa值分别是93.33%、98.94%、87.50%、99.47%、0.895,对二线注射类药物耐药性的敏感性、特异性、阳性预测值、阴性预测值、Kappa值分别是85.71%、100.00%、100.00%、99.50%、0.921。结论 荧光PCR熔解曲线法对利福平、异烟肼、氟喹诺酮、二线注射类药物的耐药性有较好的辅助诊断价值,适合临床结核病患者的早期耐药性筛查。 展开更多
关键词 抗结核药物 耐药性 荧光pcr熔解曲线 BACTEC MGIT960药敏
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荧光PCR熔解曲线法检测结核分枝杆菌对氟喹诺酮类耐药性的临床研究
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作者 秦娅莉 陈静 +4 位作者 李军 王明栋 欧维正 邱继瑶 彭燕清 《重庆医学》 CAS 2024年第16期2414-2420,共7页
目的评估荧光PCR熔解曲线法早期诊断结核病患者对氟喹诺酮类(FQs)耐药性的效能,分析FQs耐药情况及特征,为利福平耐药/耐多药结核病(RR/MDR-TB)、准广泛耐药结核病(pre-XDR-TB)规范诊断和选择合理治疗方案提供依据。方法收集2021年1月至2... 目的评估荧光PCR熔解曲线法早期诊断结核病患者对氟喹诺酮类(FQs)耐药性的效能,分析FQs耐药情况及特征,为利福平耐药/耐多药结核病(RR/MDR-TB)、准广泛耐药结核病(pre-XDR-TB)规范诊断和选择合理治疗方案提供依据。方法收集2021年1月至2022年8月贵阳市公共卫生救治中心1094例门诊和住院患者涂片阳性标本,行罗氏固体培养法、菌种鉴定,最终589例结核病患者均进行表型药敏试验与荧光PCR熔解曲线法,对利福平(RFP)、异烟肼(INH)、乙胺丁醇(EMB)、FQs耐药性进行检测;以表型药敏试验为标准,评估荧光PCR熔解曲线法的诊断效能,根据表型药敏试验结果分析患者FQs耐药情况和临床特征的关系。结果荧光PCR熔解曲线法检测结核病患者对FQs耐药性的灵敏度、特异度、符合率、Kappa值分别为91.30%、97.69%、96.94%、0.86,曲线下面积(AUC)为0.945,高于RFP、INH、EMB的0.924、0.923、0.850。RR/MDR-TB患者中FQs耐药率为22.80%,荧光PCR熔解曲线法检测患者对FQs耐药性的Kappa值为0.83,一致性较好,AUC为0.936。荧光PCR熔解曲线法检测不同细菌载量结核病患者对FQs耐药性的灵敏度、特异度、符合率差异均无统计学意义(P>0.05)。治疗类型、抗结核史、肺部空洞、MDR-TB与FQs耐药有关(P<0.05)。结论荧光PCR熔解曲线法对结核病患者FQs耐药性有较好的诊断效能。 展开更多
关键词 耐多药结核病 耐药性 荧光pcr熔解曲线法 氟喹诺酮类 准广泛耐药结核病
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荧光定量PCR探针熔解曲线法在结核分枝杆菌耐药基因检测中的应用研究
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作者 张东浩 《中文科技期刊数据库(文摘版)医药卫生》 2024年第3期0185-0188,共4页
探讨在结核分枝杆菌耐药基因检测中,对其予以荧光定量PCR探针熔解曲线法,观察分析应用价值。方法 本研究的时长段在2022年6月到2023年6月,统共1000例结核患者接受治疗,所有病患都拓展了抗结核药物的测验,且每一位患者的标本均予以荧光定... 探讨在结核分枝杆菌耐药基因检测中,对其予以荧光定量PCR探针熔解曲线法,观察分析应用价值。方法 本研究的时长段在2022年6月到2023年6月,统共1000例结核患者接受治疗,所有病患都拓展了抗结核药物的测验,且每一位患者的标本均予以荧光定量PCR探针熔解曲线法检测,药物敏感性测定结果为黄金基准,考察判辨荧光定量PCR探针熔解曲线法对利福平医药品、异烟肼医药品、乙胺丁醇医药品、链霉素医药品的诊断效能。结果 针对1000例的标本中,经过液体药敏试验检测显示对利福平药物耐药例数250例,役使溶解曲线观察耐药性包含了240例患者;对异烟肼医药有耐药性的液体药敏试验500例,应用溶解曲线检测耐药性包含了470例;经过液体药敏试验检测显示对乙胺丁醇药物耐药例数170例,予以熔解曲线法显示耐药140例。经过液体药敏试验检测显示对乙胺丁醇药物耐药例数300例,役使溶解曲线观察耐药性包含了240例患者。熔解曲线法对利福平医药品、异烟肼医药品、乙胺丁醇医药品、链霉素医药品的灵敏度分别为84.00%、84.00%、47.06%、66.67%;特异度分别为96.00%、90.00%、84.34%、94.29%;准确度分别为93.00%、97.00%、91.00%、86.00%。结论 在结核分枝杆菌耐药基因检测中,对其予以荧光定量PCR探针熔解曲线法,可得到较高的应用价值,灵敏度、特异度、准确度较高,可筛查结核病患者对利福平、异烟肼、乙胺丁醇等药物的耐药性,为临床治疗疾病提供可靠的依据。 展开更多
关键词 结核病 结核分枝杆菌 耐药基因检测 荧光定量pcr探针熔解曲线 应用价值
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荧光PCR熔解曲线法检测结核分枝杆菌耐药性价值及耐药特征分析 被引量:4
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作者 徐丽霞 雷永良 +3 位作者 吴燕飞 王炜 赖聪娟 许河南 《中国卫生检验杂志》 CAS 2022年第11期1318-1321,共4页
目的 评价荧光PCR熔解曲线法(熔解曲线法)对结核分枝杆菌(MTB)耐药性检测价值。方法 采用熔解曲线法与传统液体药敏法同时检测156例临床分离培养MTB对抗结核药物利福平(RFP)、异烟肼(INH)、乙胺丁醇(EMB)、链霉素(SM)和氟喹诺酮类药物... 目的 评价荧光PCR熔解曲线法(熔解曲线法)对结核分枝杆菌(MTB)耐药性检测价值。方法 采用熔解曲线法与传统液体药敏法同时检测156例临床分离培养MTB对抗结核药物利福平(RFP)、异烟肼(INH)、乙胺丁醇(EMB)、链霉素(SM)和氟喹诺酮类药物耐药情况,并对2种检测方案结果进行比较。结果 与液体药敏检测相比,熔解曲线法对5种抗结核药物耐药性检测结果差异无统计学意义(P> 0.05),以液体药敏检测为金标准,熔解曲线法检测RFP、INH、EMB、SM以及氟喹诺酮类药物耐药性的灵敏度分别为100.00%、75.86%、61.54%、75.00%、90.00%,特异度分别为97.10%、95.28%、99.30%、96.21%、100.00%,Kappa值分别为0.885、0.721、0.707、0.724、0.944,表明2种检测方法一致性好。结论 荧光PCR熔解曲线法对抗结核药物RFP、INH、EMB、SM及氟喹诺酮类的耐药性与液体药敏法检测效果一致,灵敏度、特异度均较高,具有较好的临床应用价值。 展开更多
关键词 荧光pcr熔解曲线法 结核分枝杆菌 耐药性 突变特征
原文传递
高分辨熔解曲线技术结合荧光实时PCR法同时检测鸡肉中4种食源性致病菌 被引量:9
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作者 张静 周倩 +5 位作者 唐梦君 张小燕 唐修君 陆俊贤 高玉时 顾荣 《现代食品科技》 CAS 北大核心 2021年第6期296-303,共8页
建立高分辨熔解曲线技术同时快速检测鸡肉中沙门氏菌、单增李斯特菌、金黄色葡萄球菌和空肠弯曲菌。本研究分别以上述4种菌的fimY、hly、nuc和orfC特异性基因为靶基因,建立能同时检测多种食源性致病菌的多重HRM-real time PCR检测体系,... 建立高分辨熔解曲线技术同时快速检测鸡肉中沙门氏菌、单增李斯特菌、金黄色葡萄球菌和空肠弯曲菌。本研究分别以上述4种菌的fimY、hly、nuc和orfC特异性基因为靶基因,建立能同时检测多种食源性致病菌的多重HRM-real time PCR检测体系,并对反应的特异性、灵敏度、重复性以及在人工染菌样品进行了评价。所建立的HRM-real time PCR检测体系对沙门氏菌、单增李斯特菌、金黄色葡萄球菌和空肠弯曲菌均产生特异性熔解曲线,Tm值分别为82.2℃、78.2℃、75.5℃和73.5℃;多重HRM-real time PCR反应体系检测单一致病菌菌液的灵敏度均为102拷贝数/mL,检测多种致病菌菌液的灵敏度为102拷贝数/mL;该反应体系重复性的试验内CV值在0.03%~0.32%之间,试验间CV值在0.45%~2.12%;人工染菌样本对4种菌的检测限均能达到5 CFU/25 g。结果表明该多重HRM-real time PCR检测体系可对上述4种禽肉中常见致病菌进行有效的检测与区分,特异性强,灵敏度高,反应重复性好,有望在食源性致病菌检测分析中发挥作用。 展开更多
关键词 高分辨熔解曲线 食源性致病菌 荧光pcr 鸡肉
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应用荧光定量PCR-探针熔解曲线法快速鉴定分枝杆菌菌种方法的建立及初步评价 被引量:2
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作者 张俊仙 王杰 +5 位作者 孙伟民 梁艳 阳幼荣 王兰 殷铭俊 吴雪琼 《中国医刊》 CAS 2016年第4期74-78,共5页
目的应用荧光定量PCR-探针熔解曲线法建立一种快速、简便、高效的分枝杆菌菌种鉴定新方法,为临床医师正确诊断提供理论依据。方法以DNA直接测序法为对照,通过荧光定量PCR技术-探针熔解曲线法(包括反应A、B、C)分析22种分枝杆菌标准株、1... 目的应用荧光定量PCR-探针熔解曲线法建立一种快速、简便、高效的分枝杆菌菌种鉴定新方法,为临床医师正确诊断提供理论依据。方法以DNA直接测序法为对照,通过荧光定量PCR技术-探针熔解曲线法(包括反应A、B、C)分析22种分枝杆菌标准株、11种非分枝杆菌标准株和32株分枝杆菌临床分离株的菌种。结果应用荧光定量PCR-探针熔解曲线法分析22种分枝杆菌标准株和11种非分枝杆菌标准株,结果与标准株DNA测序一致,成功地建立鉴定方法。32株分枝杆菌临床分离株中,经DNA测序和荧光定量PCR-探针熔解曲线法分析显示,4株为结核分枝杆菌复合群(mycobacterium tuberculosis complex,MTC),7株为胞内分枝杆菌,6株为龟分枝杆菌脓肿亚种,4株为瘰疬分枝杆菌,4株为偶然分枝杆菌,3株为堪萨斯和胃分枝杆菌,2株为戈登分枝杆菌;另有2株分离株反应A的熔解曲线显示为分枝杆菌属的熔解温度(melting temperature,Tm)值,反应B和C的熔解曲线Tm值与22株分枝杆菌标准株的Tm值均不同,经DNA测序证实与戈登分枝杆菌标准株序列不同,与报道的戈登分枝杆菌分离株一致。结论用荧光定量PCR-探针熔解曲线法可简便、快速、灵敏、特异地将大多数分枝杆菌鉴定到种,提高分枝杆菌病的正确诊断率,指导临床合理用药。 展开更多
关键词 分枝杆菌 菌种鉴定 荧光定量pcr 探针熔解曲线 DNA测序
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一种基于熔解曲线的实时荧光定量PCR仪校准方法 被引量:7
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作者 崔宏恩 张超 姚绍卫 《中国测试》 CAS 北大核心 2018年第A01期22-28,共7页
针对实时荧光定量PCR仪光学校准方法的不完善,通过对实时荧光定量PCR仪校准必要性、基本结构和数学原理的分析,基于熔解曲线从C_t值均匀度、C_t值精密度、通道峰值高度一致性、线性灵敏系数、熔解温度漂移和熔解温度比等方面对实时荧光... 针对实时荧光定量PCR仪光学校准方法的不完善,通过对实时荧光定量PCR仪校准必要性、基本结构和数学原理的分析,基于熔解曲线从C_t值均匀度、C_t值精密度、通道峰值高度一致性、线性灵敏系数、熔解温度漂移和熔解温度比等方面对实时荧光定量PCR仪校准方法进行分析。 展开更多
关键词 实时荧光定量pcr 熔解曲线 熔解温度
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SYBR Green II荧光定量PCR结合熔解曲线鉴别不同亚型兔病毒性出血症病毒方法的建立 被引量:2
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作者 谭永贵 刘腾 +7 位作者 朱杰 郭慧敏 吴巧梅 李琦 缪秋红 陈宗艳 李传峰 刘光清 《中国动物传染病学报》 CAS 北大核心 2017年第1期7-11,共5页
本研究建立了一种荧光定量PCR(Real-time fluorescence quantitative PCR)结合熔解曲线区分不同亚型兔病毒性出血症病毒(Rabbit hemorrhagic disease virus,RHDV)方法。根据GenBank数据库中已公布的不同亚型RHDV(经典RHDV和RHDV2)的衣... 本研究建立了一种荧光定量PCR(Real-time fluorescence quantitative PCR)结合熔解曲线区分不同亚型兔病毒性出血症病毒(Rabbit hemorrhagic disease virus,RHDV)方法。根据GenBank数据库中已公布的不同亚型RHDV(经典RHDV和RHDV2)的衣壳蛋白VP60序列保守区设计了1对特异性引物,利用SYBR Green II荧光染料,在实时荧光定量PCR方法的基础上结合熔解曲线进行分析,经典RHDV和RHDV2熔解温度(Tm)分别为(86.3±0.1)℃和(85.1±0.1)℃,扩增产物的熔解曲线分析均只出现单特异峰。结果表明,本研究建立的方法能够快速地鉴别经典RHDV和RHDV2。 展开更多
关键词 兔病毒性出血症病毒 荧光定量pcr 熔解曲线 鉴别
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荧光PCR探针熔解曲线技术在评估痰液结核分枝杆菌利福平耐药性的临床价值
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作者 郑丽丽 刘美岑 《农垦医学》 2024年第6期507-510,542,共5页
目的:探究荧光PCR探针熔解曲线(MeltPro)技术在评估痰液结核分枝杆菌(Mycobacteriumtuberculosis,MTB)对利福平(Rifampicin,RFP)耐药性中的临床应用价值。方法:回顾性分析本院2020年10月-2023年10月收治的60例结核病患者的临床资料,对... 目的:探究荧光PCR探针熔解曲线(MeltPro)技术在评估痰液结核分枝杆菌(Mycobacteriumtuberculosis,MTB)对利福平(Rifampicin,RFP)耐药性中的临床应用价值。方法:回顾性分析本院2020年10月-2023年10月收治的60例结核病患者的临床资料,对采样痰标本行涂片镜检+MTB分离培养,对培养阳性标本行RFP比例法药敏试验,同时直接应用GeneXpert MTB/RIF和MeltPro技术对采样痰标本行RFP耐药性检测。比较3种方法检测RFP耐药性的差异,并以比例法药敏试验结果为金标准判断MeltPro技术的诊断效能。结果:60例结核病患者临床共分离MTB 47株,非MTB 1株,总体分离率78.33%。47株MTB比例法药敏试验、MeltPro技术检出32株对RFP耐药,耐药率为68.09%;GeneXpert MTB/RIF技术检出31株对RFP耐药,耐药率为68.96%,3种药敏试验方法检测RFP耐药性差异无统计学意义(P>0.05)。以比例法药敏试验为金标准,GeneXpert MTB/RIF、MeltPro技术检测RFP耐药性的灵敏度、特异度、准确率、阳性预测值、阴性预测值、一致性分别为93.75%、93.33%、93.62%、96.77%、87.50%、0.856和96.88%、93.33%、95.74%、96.88%、93.33%、0.902。结论:MeltPro技术检测结核病患者检测MTB对RFP耐药性的灵敏度、特异度、准确率均较高,可用于快速准确筛查RFP耐药结核病,指导临床合理用药与治疗。 展开更多
关键词 荧光pcr探针熔解曲线技术 GeneXpert MTB/RIF技术 比例药敏试验 痰标本 结核分枝杆菌 利福平 耐药性
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