期刊文献+
共找到14篇文章
< 1 >
每页显示 20 50 100
水稻OsMPK15的cDNA克隆和转录水平分析 被引量:1
1
作者 石佳 杨丹丹 +2 位作者 葛慧雯 杜京尧 梁卫红 《生物技术通报》 CAS CSCD 北大核心 2018年第6期66-72,共7页
MAPK基因参与水稻的生物与非生物胁迫应答及生长发育过程,通过克隆水稻OsMPK15并初步研究其表达特性,为后续功能研究奠定基础。采用RT-PCR技术从日本晴水稻的根组织中克隆OsMPK15的cDNA编码区,并采用实时荧光定量PCR(qRT-PCR)技术分析Os... MAPK基因参与水稻的生物与非生物胁迫应答及生长发育过程,通过克隆水稻OsMPK15并初步研究其表达特性,为后续功能研究奠定基础。采用RT-PCR技术从日本晴水稻的根组织中克隆OsMPK15的cDNA编码区,并采用实时荧光定量PCR(qRT-PCR)技术分析OsMPK15在不同组织中以及不同非生物胁迫下的表达特性。结果表明,从日本晴水稻根组织中克隆的OsMPK15的cDNA编码区序列与生物信息学预测的结果一致,OsMPK15的第13-304位为丝氨酸/苏氨酸激酶结构域,属于水稻MAPK家族E组。qRT-PCR结果表明,该基因在水稻幼穗期各组织表达存在差异,主要在叶和叶鞘中表达。干旱和盐胁迫均可诱导OsMPK15在水稻幼苗根中表达量的上调,但表达模式具有不同的规律。同时,OsMPK15对3种胁迫相关激素ABA、JA和SA处理均产生应答,其中以ABA诱导OsMPK15表达上调幅度最大。 展开更多
关键词 水稻 OsMPK15 转录水平表达特性 非生物胁迫 植物激素
在线阅读 下载PDF
CAV-1感染MDCK中各IFN及受体分子表达谱的差异 被引量:1
2
作者 孟兴 佟相慧 +1 位作者 陈洪岩 韩凌霞 《实验动物科学》 2020年第3期1-5,共5页
目的分析犬肾细胞系(MDCK)感染犬腺病毒1型(CAV-1)后各种干扰素(IFN)亚型及其受体分子转录水平的表达情况。方法建立犬IFN-β、IFN-β受体(IFNAR1)、IFN-λ1、IFN-λ1受体(IFN-λ1R)、IFN-λ3和IFN-λ3受体(IFN-λ3R)的染料法定量PCR方... 目的分析犬肾细胞系(MDCK)感染犬腺病毒1型(CAV-1)后各种干扰素(IFN)亚型及其受体分子转录水平的表达情况。方法建立犬IFN-β、IFN-β受体(IFNAR1)、IFN-λ1、IFN-λ1受体(IFN-λ1R)、IFN-λ3和IFN-λ3受体(IFN-λ3R)的染料法定量PCR方法,分析了MDCK在PolyⅠ∶C处理和接种CAV-1后细胞内各IFN及受体分子转录水平的相对含量。结果正常MDCK细胞内存在较高含量的IFN-λ3R且含量显著高于其他IFN及受体分子的转录水平;用PolyⅠ∶C处理MDCK细胞24 h后,IFN-λ1R、IFN-λ3和IFN-λ3R的表达量均显著性上调,而IFN-β、IFN-λ1和IFNAR1几乎没变化;接种CAV-1后,IFN-α的含量急剧上升至6倍。结论MDCK细胞存在不同水平浓度的IFN分子及其受体转录产物,且在PolyⅠ∶C刺激和腺病毒感染时受体分子的表达谱不同。 展开更多
关键词 犬肾细胞系 干扰素受体 转录表达水平
在线阅读 下载PDF
牛分枝杆菌感染巨噬细胞(THP-1)全基因表达谱变化的研究
3
作者 高峰 李卫民 +5 位作者 李传友 刘毅 孙照刚 张建源 姜平 范伟兴 《结核病与胸部肿瘤》 2009年第1期15-21,共7页
目的分析可用于牛结核病免疫学诊断的后选靶标,同时初步探讨由牛分枝杆菌(Mycobacterium bovis)引起人结核病的免疫学发病机制。方法牛分枝杆菌(AF2212/97)和结核分枝杆菌(Mycobacterium tuberculosis(H37Rv))感染人的模式巨... 目的分析可用于牛结核病免疫学诊断的后选靶标,同时初步探讨由牛分枝杆菌(Mycobacterium bovis)引起人结核病的免疫学发病机制。方法牛分枝杆菌(AF2212/97)和结核分枝杆菌(Mycobacterium tuberculosis(H37Rv))感染人的模式巨噬细胞(THP-1),采用含有22000个基因全长的基因芯片分析感染72个小时后的THP-1细胞全基因组在转录水平的表达谱变化。在确定所分析的芯片的特异性和稳定性均达到要求的基础上,通过GO显著性统计分析,研究表达变化的基因所对应蛋白的分子功能、生物过程以及细胞组分;进一步采用Pathway显著性统计分析,研究表达差异蛋白之间的相互作用。结果感染H37Rv后的THP-1细胞,存在290个差异基因表达,其中170个上调表达,120个下调表达,与以往的结果类似。牛分枝杆菌感染的THP-1细胞中有1899(8.6%)个基因差异表达,其中1075个基因被上调表达(56.6%),其它43.4%被下调。1899个基因中1674个在GenBank有记录,263个是新基因,基质金属蛋白酶12(H200000442)被上调达60.4921倍;下调幅度最大的蛋白丝氨酸/半胱氨酸抑制酶(H200006177)被下调6.29倍。采用GO分析发现,这些基因对应的多为炎症因子蛋白、凋亡蛋白、细胞外基质蛋白、T细胞受体信号通路相关蛋白等。其中与炎症相关的的蛋白有47个,如TNF、IL8、CXCL3、CCL8、CCL7、IFNK、IL-26、CCL28等。随后的Pathway分析差异表达基因对应的2014个蛋白,展示了一系列引起结核病发病的重要信号传导通路。结论基因表达谱研究可为牛结核病发病机制及其诊断研究提供大量有益的生物学信息。 展开更多
关键词 分枝杆菌 牛分枝杆菌 结核人巨噬细胞THP-1全基因组表达转录水平
在线阅读 下载PDF
基于平滑LDA的RNA-Seq数据表达分析研究 被引量:1
4
作者 欧书华 刘学军 张礼 《计算机科学与探索》 CSCD 北大核心 2016年第3期381-388,共8页
RNA-Seq是目前转录组研究的一种重要技术,针对RNA-Seq数据分析中读段的多源映射,参考序列分布的不均匀性,一些转录本中外显子分布稀疏以及跨结合区读段处理问题,提出了一个新的转录组表达研究模型sLDASeqQ该模型根据基因中转录本注释信... RNA-Seq是目前转录组研究的一种重要技术,针对RNA-Seq数据分析中读段的多源映射,参考序列分布的不均匀性,一些转录本中外显子分布稀疏以及跨结合区读段处理问题,提出了一个新的转录组表达研究模型sLDASeqQ该模型根据基因中转录本注释信息对模型参数进行约束,对跨结合区的读段按长度分配处理,解决了读段非均匀分布和跨结合区问题;在模型中增加一个超参数,从而解决了外显子的稀疏问题。将该模型应用到3个真实的数据集上,并与其他主流方法进行比较,结果表明该模型获得了较为准确的基因以及转录本表达水平计算结果。 展开更多
关键词 RNA-SEQ 基因转录表达水平 平滑LDA 结合区 多源映射 非均匀性
在线阅读 下载PDF
脱水对条斑紫菜叶状体psbA和psbD基因表达量的影响 被引量:1
5
作者 杨芳 王广策 +2 位作者 张宝玉 陈张帆 潘光华 《海洋科学》 CAS CSCD 北大核心 2011年第4期61-66,共6页
从处于不同脱水复水阶段的条斑紫菜(Porphyra yezoensis Ueda)叶状体中提取总RNA,用荧光定量PCR技术检测条斑紫菜不同脱水和复水过程中psbA和psbD基因的转录水平上的相对表达量的变化。实验结果表明,psbA和psbD基因转录水平上的相对表... 从处于不同脱水复水阶段的条斑紫菜(Porphyra yezoensis Ueda)叶状体中提取总RNA,用荧光定量PCR技术检测条斑紫菜不同脱水和复水过程中psbA和psbD基因的转录水平上的相对表达量的变化。实验结果表明,psbA和psbD基因转录水平上的相对表达量的变化趋势相似但变化幅度不一致。在相对含水量约为71%时两种基因转录水平上的相对表达量分别增加了6.18倍和2.13倍。说明在条斑紫菜叶状体脱水过程中两种基因的转录并非同比例完成;在轻度脱水状态下psbA和psbD基因转录水平上的相对表达量的快速增大可能是藻体暴露在空气中时适应陆地环境的初始响应。 展开更多
关键词 条斑紫菜(Porphyra YEZOENSIS Ueda) 脱水复水 PSBA psbD 转录水平上的相对表达
在线阅读 下载PDF
GPR50在小鼠卵母细胞体外成熟进程中的表达及亚细胞定位
6
作者 王甜 黄显朋 +4 位作者 朱洪阳 吉文汇 付伟 殷实 兰道亮 《西南民族大学学报(自然科学版)》 CAS 2023年第3期245-254,共10页
旨在探究GPR50在小鼠卵母细胞体外成熟进程中的表达规律及亚细胞定位.通过卵母细胞体外培养技术、qPCR技术及免疫荧光技术测定GPR50在小鼠不同时期卵母细胞的转录水平及亚细胞定位.结果表明,所建立的qPCR方法敏感性高、特异性强、重复... 旨在探究GPR50在小鼠卵母细胞体外成熟进程中的表达规律及亚细胞定位.通过卵母细胞体外培养技术、qPCR技术及免疫荧光技术测定GPR50在小鼠不同时期卵母细胞的转录水平及亚细胞定位.结果表明,所建立的qPCR方法敏感性高、特异性强、重复性好且检测效率高,可用于测定GPR50在小鼠卵母细胞中转录水平的表达;GPR50在不同阶段小鼠卵母细胞中均有表达,生发泡破裂(GVBD)后,GPR50的表达量显著高于GV期(P<0.05);随着卵母细胞的发育,其表达量不断增高,到MII期达到顶峰,极显著高于GV、GVBD及MI期(P<0.01).随着卵母细胞的发育,GPR50大量表达于细胞质和细胞膜,但在成熟卵母细胞中,GPR50主要集中分布于细胞膜.以上结果说明,GPR50在小鼠卵母细胞体外成熟中发挥重要的作用,为解析GPR50在哺乳动物卵母细胞体外成熟进程的分子机制奠定了基础. 展开更多
关键词 GPR50 小鼠卵母细胞 体外成熟 转录水平表达 亚细胞定位
在线阅读 下载PDF
四环素抗生素对污泥中四环素抗性基因丰度和表达水平的作用影响 被引量:8
7
作者 阮晓慧 钱雅洁 +1 位作者 薛罡 高品 《环境科学》 EI CAS CSCD 北大核心 2020年第2期823-830,共8页
为研究四环素(TC)抗生素对其抗性基因(TC-ARGs)转录表达的作用影响,以从活性污泥中筛选获得的四环素抗性细菌(TRB)作为研究对象,采用荧光定量PCR和逆转录PCR方法检测了7种TC-ARGs,包括tet A、tet C、tet G、tet M、tet O、tet W和tet X... 为研究四环素(TC)抗生素对其抗性基因(TC-ARGs)转录表达的作用影响,以从活性污泥中筛选获得的四环素抗性细菌(TRB)作为研究对象,采用荧光定量PCR和逆转录PCR方法检测了7种TC-ARGs,包括tet A、tet C、tet G、tet M、tet O、tet W和tet X基因的丰度和表达水平,并探讨了TC与TC-ARGs丰度及其表达水平之间的相关关系.结果表明,在整个培养周期内,tet A、tet G和tet W基因丰度随TC暴露浓度的增大总体呈现上升趋势,但其余TC-ARGs基因丰度整体波动较大.TC胁迫对不同TC-ARGs的转录表达水平作用影响差别较大,其中,tet A基因表达水平相对稳定,且随TC浓度的升高而上调,在TC浓度为100 mg·L^-1时,其上调倍数高达5.3倍.在短期(1 d)TC胁迫下,TC-ARGs转录表达水平随TC浓度的升高整体呈现上调趋势.由相关性分析可知,tet A和tet W基因丰度与其转录表达水平之间存在显著的线性相关性,表明其基因丰度可在一定程度上衡量和评价其抗性表达水平,进而反映其功能活性和环境风险. 展开更多
关键词 四环素抗生素 四环素抗性基因 基因丰度 转录表达水平 活性污泥
原文传递
Pluronic L-81 ameliorates diabetic symptoms in db/db mice through transcriptional regulation of microsomal triglyceride transfer protein 被引量:1
8
作者 Wo-Shing Au Li-Wei Lu +8 位作者 Sidney Tam Otis King Hung Ko Billy KC Chow Ming-Liang He Samuel S Ng Chung-Man Yeung Ching-Chiu Liu Hsiang-Fu Kung Marie C Lin 《World Journal of Gastroenterology》 SCIE CAS CSCD 2009年第24期2987-2994,共8页
AIM: To test whether oral L-81 treatment could im-prove the condition of mice with diabetes and to investigate how L-81 regulates microsomal triglyceride transfer protein (MTP) activity in the liver. METHODS: Genetica... AIM: To test whether oral L-81 treatment could im-prove the condition of mice with diabetes and to investigate how L-81 regulates microsomal triglyceride transfer protein (MTP) activity in the liver. METHODS: Genetically diabetic (db/db) mice were fed on chow supplemented with or without L-81 for 4 wk. The body weight, plasma glucose level, plasma lipid profile, and adipocyte volume of the db/db mice were assessed after treatment. Toxicity of L-81 was also evaluated. To understand the molecular mecha-nism, HepG2 cells were treated with L-81 and the effects on apolipoprotein B (apoB) secretion and mRNA level of the MTP gene were assessed.RESULTS: Treatment of db/db mice with L-81 sig-nificantly reduced and nearly normalized their body weight, hyperphagia and polydipsia. L-81 also markedly decreased the fasting plasma glucose level, improved glucose tolerance, and attenuated the elevated levels of plasma cholesterol and triglyceride. At the effective dosage, little toxicity was observed. Treatment of HepG2 cells with L-81 not only inhibited apoB secretion, but also signif icantly decreased the mRNA level of the MTP gene. Similar to the action of insulin, L-81 exerted its effect on the MTP promoter. CONCLUSION: L-81 represents a promising candidate in the development of a selective insulin-mimetic mol-ecule and an anti-diabetic agent. 展开更多
关键词 Pluronic L-81 db/db mice Animal models diabetes Microsomal triglyceride protein
在线阅读 下载PDF
CXCR4/SDF-1 axis is involved in lymph node metastasis of gastric carcinoma 被引量:30
9
作者 Bao-Cheng Zhao Zhen-Jun Wang +4 位作者 Wei-Zheng Mao Hua-Chong Ma Jia-Gang Han Bo Zhao Hui-Min Xu 《World Journal of Gastroenterology》 SCIE CAS CSCD 2011年第19期2389-2396,共8页
AIM:To investigate the role of CXC chemokine receptor-4 (CXCR4) and stromal cell-derived factor-1 (SDF-1) in lymph node metastasis of gastric carcinoma.METHODS:In 40 cases of gastric cancer,expression of CXCR4 mRNA in... AIM:To investigate the role of CXC chemokine receptor-4 (CXCR4) and stromal cell-derived factor-1 (SDF-1) in lymph node metastasis of gastric carcinoma.METHODS:In 40 cases of gastric cancer,expression of CXCR4 mRNA in cancer and normal mucous membrane and SDF-1 mRNA in lymph nodes around the stomach was detected using quantitative polymerase chain reaction (PCR) (TaqMan) and immunohistochemistric assay.SGC-7901 and MGC80-3 cancer cells were used to investigate the effect of SDF-1 on cell proliferation and migration.RESULTS:Quantitative reverse transcription PCR and immunohistochemistry revealed that the expression level of CXCR4 in gastric cancer was significantly higher than that in normal mucous membrane (1.6244 ± 1.3801 vs 1.0715 ± 0.5243,P < 0.05).The expression level of CXCR4 mRNA in gastric cancer with lymph node metastasis was also significantly higher than that without lymph node metastasis (0.823 ± 0.551 vs 0.392 ± 0.338,P < 0.05).CXCR4 expression was significantly related to poorly differentiated,high tumor stage and lymph node metastasis.Significant differences in the expression level of SDF-1 mRNA were found between lymph nodes in metastatic gastric cancer and normal nodes (0.5432 ± 0.4907 vs 0.2640 ± 0.2601,P < 0.05).The positive expression of SDF-1 mRNA in lymph nodes of metastatic gastric cancer was consistent with the positive expression of CXCR4 mRNA in gastric cancer (r=0.776,P < 0.01).Additionally,human gastric cancer cell lines expressed CXCR4 and showed vigorous proliferation and migratory responses to SDF-1.AMD3100 (a specific CXCR4 antagonist) was also found to effectively reduce the migration of gastric cancer cells.CONCLUSION:The CXCR4/SDF-1 axis is involved in the lymph node metastasis of gastric cancer.CXCR4 is considered as a potential therapeutic target in the treatment of gastric cancer. 展开更多
关键词 Gastric carcinoma CHEMOKINES Stromal cell-derived factor-1 CXC chemokine receptor-4 Lymph node metastasis
在线阅读 下载PDF
Expression of Endogenous Beta Retroviruses and Hyal-2 mRNA in Immune Organs of Fetuses and Lambs 被引量:5
10
作者 Jing-wei Qi Xiao-li Wu +1 位作者 Shu-ying Liu Gui-fang Cao 《Virologica Sinica》 CAS CSCD 2012年第2期83-92,共10页
Endogenous beta retroviruses (enJSRV) are highly homologous with Jaagsiekte sheep retrovirus (exJSRV),this exogenous retrovirus is the aetiological agent of ovine pulmonary adenocarcinoma (OPA). The aim of this study ... Endogenous beta retroviruses (enJSRV) are highly homologous with Jaagsiekte sheep retrovirus (exJSRV),this exogenous retrovirus is the aetiological agent of ovine pulmonary adenocarcinoma (OPA). The aim of this study was to clarify the function of enJSRV and the immunological mechanisms of its corresponding antibody, that is undetectable in JSRV-infected ovine serum. The expression of enJSRV envelope protein and Hyal-2 mRNA in immune organs and lungs of ovine fetuses and lambs were analyzed by Real-Time reverse transcription PCR and In Situ Hybridization using specific probes. In Situ Hybridization results indicated that the enJSRV envelope protein and Hyal-2 mRNA were expressed in thymus, spleen, mesenteric lymph nodes and lungs at different times, while no positive signals were detected in the negative controls. On the other hand, results from Real-Time reverse transcription PCR analysis showed that in 130d fetuses and 3d newborn lambs the enJSRV mRNA levels were much higher in organs associated with the immune system than that in lungs, especially in the thymus and spleen, but levels of Hyal-2 mRNA expression was not significantly different in all collected tissue. These results provided evidence from an immunology point of view to understand why the circulating antibodies against exJSRV are undetectable in JSRV-infected ovine, and will help to unravel the pathogenesis of JSRV-infected ovine. 展开更多
关键词 OVINE ENJSRV Hyal-2 In Situ Hybridization Real-Time PCR
在线阅读 下载PDF
Effect of low-dose X-ray radiation on adaptive response in gastric cancer cell
11
作者 Shukai Wang Gang Jiang +2 位作者 Hongsheng Yu Xiangping Liu Chang Xu 《The Chinese-German Journal of Clinical Oncology》 CAS 2013年第4期171-174,共4页
Objective: We aimed to study the effect and mechanism of low-dose radiation (LDR) on adaptive response of gastric cancer cell. Methods: SGC7901 cells were cultured in vitro, and divided into 4 groups: control gro... Objective: We aimed to study the effect and mechanism of low-dose radiation (LDR) on adaptive response of gastric cancer cell. Methods: SGC7901 cells were cultured in vitro, and divided into 4 groups: control group (DO group), low-dose radiation group (D1 group, 75 mGy), high-dose radiation group (D2 group, 2 Gy), low-dose plus high-dose radiation group (D1 + D2 group, 75 mGy + 2 Gy, the interval of low and high-close radiation being 8 h). Cell inhibition rate was detected by cytometry and CCK8 method; the proportion of cell cycle at different times after irradiation was determined by using a flow cytometry. The ATM mRNA levels were detected by using quantitative real-time reverse transcription polymerase chain reaction (RT-PCR). Results: There was no significant different between groups DO and D1, groups D2 and D1 + D2 cell inhibition rate (P 〉 0.05). There was a significant increase G2/M arrest in groups D2 and D1 + D2 than groups DO and D1 after 6 h of radiation and did not recover at 48 h (P 〈 0.05). The ATM mRNA expression of group D2 and D1 + D2 increased highly than that of group DO and D1 (P 〈 0.05). However, differences between group D2 and D1 + D2, group DO and D1 were not statistical significant (P 〉 0.05). Conclusion: LDR cannot induce adaptive response in SGC7901 cells in vitro, which may be associated the regulation of cell cycle, and its ATM mRNA expression cannot be affected by 75 mGy X-ray radiation. 展开更多
关键词 low-dose radiation SGC7901 cells adaptive response cell cycle
在线阅读 下载PDF
犬腺病毒1型感染普通级比格犬中Ⅰ和Ⅲ型干扰素及其受体分子表达量的比较
12
作者 孟兴 问婉欣 +2 位作者 佟相慧 陈洪岩 韩凌霞 《中国兽医科学》 CAS CSCD 北大核心 2021年第5期552-561,共10页
比较普通级比格犬感染犬腺病毒1型(CAV-1)后外周血和肝内Ⅰ型和Ⅲ型干扰素(IFN)及其受体分子的转录水平,同时评估CAV-2疫苗免疫对CAV-1感染试验的影响。对3只2月龄普通级比格犬后肢肌肉注射105.7TCID50CAV-1纯化病毒,在攻毒后12 d内记... 比较普通级比格犬感染犬腺病毒1型(CAV-1)后外周血和肝内Ⅰ型和Ⅲ型干扰素(IFN)及其受体分子的转录水平,同时评估CAV-2疫苗免疫对CAV-1感染试验的影响。对3只2月龄普通级比格犬后肢肌肉注射105.7TCID50CAV-1纯化病毒,在攻毒后12 d内记录体温变化,每日采集咽拭子和肛拭子,于攻毒后第3、6、9、12天采集前腔静脉血,利用常规PCR检测CAV-1和CAV-2核酸,利用间接免疫荧光试验(IFA)检测血清抗体效价。攻毒后第12天进行安乐死,采集心脏血和肝,利用定量PCR法检测血液和肝中IFN-α、IFN-β、IFNβR、IFN-λ1、IFNλ1R、IFNλ3和IFNλ3R等的转录水平。结果显示,31#犬的体温次日即升至39.7℃,出现便血和轻度腹泻,攻毒后第3天外周血中病毒核酸拷贝数达到峰值,随后在胸腺、腹股沟淋巴结、颌下淋巴结、肠系膜淋巴结和肝等组织中检测到CAV-1核酸,攻毒后第12天肝中IFN-λ1R的转录水平显著高于其他分子,IFA效价为1∶320。34#犬和35#犬的体温变化、临床症状、病毒血症、血清抗体效价和干扰素表达量均低于31#犬。实验早期犬的咽拭子和肛拭子中均检测到不同含量的CAV-2核酸。结果表明,CAV-1感染犬血液中的Ⅰ型和Ⅲ型干扰素表达规律不明显,肝是IFN-λ1主要的效应器官,同时CAV-2疫苗免疫对普通级实验犬的CAV-1感染研究具有一定的干扰。 展开更多
关键词 比格犬 犬腺病毒1型 干扰素 干扰素受体 转录表达水平
原文传递
致倦库蚊三个几丁质酶基因CqCht5-1,CqCht5-2和CqCht5-3的分析和表达 被引量:1
13
作者 赵文静 刘萍 +3 位作者 吴慧 康哲 石彩群 张晶 《基因组学与应用生物学》 CAS CSCD 北大核心 2021年第2期563-568,共6页
昆虫几丁质酶5作为昆虫代谢的关键酶类之一,进化上相对保守,在昆虫的生长发育中起到关键作用。致倦库蚊广布于中国南方大部分地区,是多种病原体的传播媒介。对致倦库蚊几丁质酶5基因(CqCht5)进行深入研究,将有利于新型生物类杀虫剂的开... 昆虫几丁质酶5作为昆虫代谢的关键酶类之一,进化上相对保守,在昆虫的生长发育中起到关键作用。致倦库蚊广布于中国南方大部分地区,是多种病原体的传播媒介。对致倦库蚊几丁质酶5基因(CqCht5)进行深入研究,将有利于新型生物类杀虫剂的开发和研制,进而有利于预防医学工作的进行。本研究通过生物信息学方法分析了致倦库蚊三个基因即CqCht5-1、CqCht5-2和CqCht5-3的基因位置和结构,参考蛋白结构域组成,预测蛋白质二级结构组成及三级结构,并基于氨基酸序列构建系统发育树;利用RT-qPCR手段确定三个基因在致倦库蚊不同发育时期的表达水平,初步探讨了它们的基因特征和在生长发育中的生物学作用,为进一步研究致倦库蚊几丁质酶功能奠定基础。 展开更多
关键词 致倦库蚊 几丁质酶 生物信息学 转录水平表达
原文传递
Transcriptome profiling of the developing postnatal mouse testis using next-generation sequencing 被引量:9
14
作者 GONG Wei PAN LinLin +6 位作者 LIN Qiang ZHOU YuanYuan XIN ChengQi YU XiaoMin CUI Peng HU SongNian YU Jun 《Science China(Life Sciences)》 SCIE CAS 2013年第1期1-12,共12页
Mammalian testis development is a complex and highly sophisticated process. To study the dynamic change of normal testis development at the transcriptional level, we investigated mouse testes at three postnatal ages: ... Mammalian testis development is a complex and highly sophisticated process. To study the dynamic change of normal testis development at the transcriptional level, we investigated mouse testes at three postnatal ages: 6 days postnatal, 4 weeks old, and 10 weeks old, representing infant (PN1), juvenile (PN2), and adult (PN3) stages, respectively. Using ultra high-throughput RNA sequencing (RNA-seq) technology, we obtained 211 million reads with a length of 35 bp. We identified 18837 genes that were expressed in mouse testes, and found that genes expressed at the highest level were involved in spermatogenesis. The gene expression pattern in PN1 was distinct from that in PN2 and PN3, which indicates that spermatogenesis has commenced in PN2. We analyzed a large number of genes related to spermatogenesis and somatic development of the testis, which play important roles at different developmental stages. We also found that the MAPK, Hedgehog, and Wnt signaling pathways were significantly involved at different developmental stages. These findings further our understanding of the molecular mechanisms that regulate testis development. Our study also demonstrates significant advantages of RNA-seq technology for studying transcriptome during development. 展开更多
关键词 next-generation sequencing TRANSCRIPTOME mouse testis DEVELOPMENT
原文传递
上一页 1 下一页 到第
使用帮助 返回顶部