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酪氨酸氨基转移酶基因在肝细胞癌中诊疗价值及其底物酪氨酸的孟德尔随机化研究
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作者 李雅菲 隋丽娜 +2 位作者 宋承桂 郭添福 刘志平 《赣南医科大学学报》 2025年第2期107-116,共10页
目的:利用GEO、TCGA和STRING数据集研究酪氨酸氨基转移酶基因(Tyrosine aminotransferase gene,TAT)在肝细胞癌(Hepatocellular carcinoma,HCC)中的临床价值和潜在功能。方法:使用GEO、TCGA、STRING、LinkedOmics、TargetScan、miRDB、m... 目的:利用GEO、TCGA和STRING数据集研究酪氨酸氨基转移酶基因(Tyrosine aminotransferase gene,TAT)在肝细胞癌(Hepatocellular carcinoma,HCC)中的临床价值和潜在功能。方法:使用GEO、TCGA、STRING、LinkedOmics、TargetScan、miRDB、miRWalk和GEPIA数据库分析HCC患者TAT基因表达与预后、临床分期和免疫细胞浸润之间的相关性,并获得了与TAT直接相互作用的分子。免疫组织化学(Immunohistochemistry,IHC)染色证实TAT在HCC中的表达情况。GO和KEGG富集分析TAT在HCC中的潜在作用。通过2个样本的孟德尔随机化分析TAT底物(酪氨酸)与HCC之间的因果关系。结果:IHC证实TAT在HCC样品中显著低表达。共表达和差异分析得到11个共表达基因,这些基因主要参与氨基酸的代谢。其中PCK1、SDS、BHMT、CYP2A6和CTH可与TAT直接相互作用。生存分析显示,TAT、CTH或BHMT低表达患者的总生存率显著降低。发现miR-212对TAT的表达有显著影响。免疫细胞浸润的分析揭示了10种免疫细胞类型,在高和低TAT表达组之间有显著差异。双样本孟德尔分析发现,TAT可能不是直接通过调节酪氨酸水平来抑制HCC。结论:TAT可作为HCC的诊断标志物,为HCC的诊断和治疗提供新的理论依据。 展开更多
关键词 酪氨酸氨基转移酶 肝细胞癌 孟德尔随机化
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紫苏酪氨酸氨基转移酶基因片段的克隆及表达分析 被引量:8
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作者 吕晓玲 郝磊 +1 位作者 王芳 黄晨 《中国农学通报》 CSCD 2012年第24期207-212,共6页
为获得紫苏迷迭香酸合成途径中的酪氨酸氨基转移酶基因,本研究采用同源克隆的方法,根据已报道的其他物种的TAT基因序列设计并合成简并引物,成功克隆得到了紫苏TAT基因片段(GenBank登录号:JN032113.1),该片段长为579bp,共编码193个氨基... 为获得紫苏迷迭香酸合成途径中的酪氨酸氨基转移酶基因,本研究采用同源克隆的方法,根据已报道的其他物种的TAT基因序列设计并合成简并引物,成功克隆得到了紫苏TAT基因片段(GenBank登录号:JN032113.1),该片段长为579bp,共编码193个氨基酸残基,并命名为PfTAT。氨基酸序列比对分析发现其与彩叶草、丹参、拟南芥和罂粟的一致性分别为97%、94%、69%和58%,系统进化树分析表明PfTAT与唇形科植物的亲缘关系最近。采用半定量RT-PCR法分析PfTAT在紫苏的根、茎、叶中均有表达,且叶中的表达量较高,内源性植物激素信号分子对PfTAT表达量影响的实验表明,脱落酸、水杨酸处理均能够不同程度得上调PfTAT转录水平的表达。 展开更多
关键词 紫苏 迷迭香 酪氨酸氨基转移酶 基因克隆 序列分析 表达
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大豆酪氨酸氨基转移酶基因的克隆与表达分析 被引量:1
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作者 胡英考 李晓晓 +1 位作者 李雅轩 蔡民华 《西北植物学报》 CAS CSCD 北大核心 2010年第6期1092-1098,共7页
采用电子克隆与实验克隆相结合的方法获得了大豆酪氨酸氨基转移酶基因的cDNA序列,GenBank登录号为DQ003328。序列分析结果表明,该cDNA序列含有一个编码425个氨基酸的完整的开放读码框,5′非翻译区具有多个同框终止密码子,3′端具有3个... 采用电子克隆与实验克隆相结合的方法获得了大豆酪氨酸氨基转移酶基因的cDNA序列,GenBank登录号为DQ003328。序列分析结果表明,该cDNA序列含有一个编码425个氨基酸的完整的开放读码框,5′非翻译区具有多个同框终止密码子,3′端具有3个加尾信号和polyA尾巴。启动子区除含有通用核心元件外,还含有许多与光反应有关的作用元件。氨基酸序列比对和系统发育分析结果显示,不同物种之间酪氨酸氨基转移酶的氨基酸序列同源性较高。电子表达分析和RT-PCR组织表达分析结果表明,该基因的表达量与组织中叶绿体含量具有很高的关联,强光逆境能够上调该基因的表达。 展开更多
关键词 大豆 酪氨酸氨基转移酶 基因克隆 电子表达分析
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番木瓜酪氨酸氨基转移酶基因CpTAT的分离与分析 被引量:1
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作者 申艳红 陈永萍 +1 位作者 杨菲颖 鲁娜 《热带作物学报》 CSCD 北大核心 2016年第6期1141-1146,共6页
番木瓜酪氨酸氨基转移酶(Tyrosine aminotransferase,TAT)是维生素E合成途径中的一个关键酶。在已有番木瓜果实成熟差异基因片段序列的基础上,采用RACE技术克隆了TAT基因的全长c DNA序列,命名为Cp TAT。该基因全长包含5′非编码区98 bp,... 番木瓜酪氨酸氨基转移酶(Tyrosine aminotransferase,TAT)是维生素E合成途径中的一个关键酶。在已有番木瓜果实成熟差异基因片段序列的基础上,采用RACE技术克隆了TAT基因的全长c DNA序列,命名为Cp TAT。该基因全长包含5′非编码区98 bp,3′非编码区232 bp,开放性阅读框1 266 bp,编码421个氨基酸。序列分析表明,该基因为谷草转氨酶超家族成员,催化活性位点为第253位的赖氨酸,编码蛋白与毛果杨、野草莓、桃、拟南芥和水稻的TAT蛋白同源性分别为83.69%、81.09%、80.76%、78.87%、54.67%。荧光定量分析表明,Cp TAT基因在根中的表达量最高,在茎和果实中的表达较低,在叶中的表达量最低。与对照相比,外源乙烯处理能诱导番木瓜果实中Cp TAT基因表达量升高,而1-MCP处理则抑制了该基因表达,在果实衰老期表达量升高,该基因可能在番木瓜果实成熟衰老中起作用。 展开更多
关键词 番木瓜 酪氨酸氨基转移酶 基因克隆 RACE 维生素E
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丹参多倍体开花前后丹酚酸生物合成关键酶活性的变化 被引量:1
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作者 吴顺 马晓静 +3 位作者 邱云 孙健鹏 翟茜 刘奇 《中国农学通报》 2022年第19期73-76,共4页
为探讨开花对丹参多倍体丹酚酸积累的影响,以丹参多倍体为材料,探讨花蕾期、盛花期、衰败期叶片中丹酚酸合成关键酶活性的变化。结果表明,可溶性蛋白随着丹参花期的进行,表现出先升后降,在盛花期达到峰值,而5号丹参可溶性蛋白含量在各... 为探讨开花对丹参多倍体丹酚酸积累的影响,以丹参多倍体为材料,探讨花蕾期、盛花期、衰败期叶片中丹酚酸合成关键酶活性的变化。结果表明,可溶性蛋白随着丹参花期的进行,表现出先升后降,在盛花期达到峰值,而5号丹参可溶性蛋白含量在各时期均较其他丹参高。从酪氨酸氨基转移酶(TAT)、肉桂酸-4-羟化酶(C4H)和苯丙氨酸裂解酶(PAL)酶活性变化看,不同丹参在花蕾期TAT酶活性比开花后高,尤其是在盛花期时酶活性明显降低;PAL酶活性基本呈逐渐上升趋势;C4H酶活性变化随着花期的进行先降低后升高;但5号丹参比其他丹参的3种酶活性在各时期高,这可能是其丹酚酸含量较其他丹参高的原因之一。 展开更多
关键词 丹参多倍体 开花 丹酚 酪氨酸氨基转移酶 肉桂-4-羟化 苯丙裂解
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3-(4-羟基苯基)丙酸在酿酒酵母中的生物合成
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作者 江晶洁 庄以彬 +2 位作者 殷华 刘涛 刘少伟 《生物技术通报》 CAS CSCD 北大核心 2017年第9期184-190,共7页
3-(4-羟基苯基)丙酸(HPPA)是一种芳香类化合物,作为中间体主要应用于医药、食品、化学领域,具有重要的经济价值。旨在实现HPPA在酿酒酵母中的从头合成,通过在酿酒酵母中过表达约氏黄杆菌来源的酪氨酸转移酶(Fj TAL)、拟南芥来源的对香... 3-(4-羟基苯基)丙酸(HPPA)是一种芳香类化合物,作为中间体主要应用于医药、食品、化学领域,具有重要的经济价值。旨在实现HPPA在酿酒酵母中的从头合成,通过在酿酒酵母中过表达约氏黄杆菌来源的酪氨酸转移酶(Fj TAL)、拟南芥来源的对香豆酰辅酶A连接酶(At4CL),同时利用酿酒酵母BY4742自身来源的超长链烯酰辅酶A还原酶(Sc TSC13)、硫酯水解酶,实现了在酿酒酵母中从头合成HPPA,产量约为70 mg/L左右。在以4 mmol/L酪氨酸为前体、半乳糖诱导Fj TAL过表达、30℃发酵培养72 h的条件下,约36%的酪氨酸转化生成对香豆酸;在以4 mmol/L对香豆酸或咖啡酸为前体,半乳糖诱导At4CL过表达,同时利用酵母内源Sc TSC13、硫酯水解酶,30℃发酵培养72 h的条件下,约94%的对香豆酸被还原成HPPA,约91%的咖啡酸被还原成3,4-二羟基苯丙酸(DHPPA),为进一步生物合成HPPA及其衍生物奠定了基础。 展开更多
关键词 酿酒酵母 3-(4-羟基苯基)丙(HPPA) 生物合成 酪氨酸氨基转移酶 对香豆酰辅A连接
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水杨酸对丹参培养细胞中迷迭香酸生物合成及其相关酶的影响 被引量:20
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作者 焦蒙丽 曹蓉蓉 +2 位作者 陈红艳 郝文芳 董娟娥 《生物工程学报》 CAS CSCD 北大核心 2012年第3期320-328,共9页
迷迭香酸(RA)是丹参中一种重要的酚酸类次生代谢物。为探讨水杨酸(SA)诱导子对丹参悬浮培养细胞中RA的生物合成及其相关酶的影响,考察了SA诱导子和酪氨酸氨基转移酶(TAT)的竞争性抑制剂(AOPP)对RA合成积累量、苯丙氨酸解氨酶(PAL)和TAT... 迷迭香酸(RA)是丹参中一种重要的酚酸类次生代谢物。为探讨水杨酸(SA)诱导子对丹参悬浮培养细胞中RA的生物合成及其相关酶的影响,考察了SA诱导子和酪氨酸氨基转移酶(TAT)的竞争性抑制剂(AOPP)对RA合成积累量、苯丙氨酸解氨酶(PAL)和TAT活性的影响。发现在培养的第6天用浓度为6.25 mg/L的SA处理后,PAL活性在诱导后4 h出现高峰,为对照组水平的124%;RA的积累量在诱导后8 h出现峰值(5.914±0.296)mg/g。用浓度为0.1μmol/L的AOPP处理,6 h后AOPP对TAT活性影响较小(与对照组无显著差异),但明显抑制了PAL活性(为对照组水平的44%),且在PAL活性明显降低的同时RA的积累量显著减少(4.709±0.204)mg/g。进一步用0.1μmol/L AOPP和6.25 mg/L SA共处理,AOPP对PAL的抑制作用可得到一定程度的缓解,且RA的积累量较AOPP单独处理的高。表明SA可以诱导丹参悬浮培养细胞中RA积累量的增加,且在RA合成过程中PAL的限速作用比TAT明显。 展开更多
关键词 丹参 水杨 迷迭香 苯丙 酪氨酸氨基转移酶
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Ca^(2+)对丹参培养细胞中迷迭香酸合成及其相关酶活性的影响 被引量:11
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作者 刘连成 董娟娥 +3 位作者 张婧一 党小琳 行冰玉 杨喜玲 《生物工程学报》 CAS CSCD 北大核心 2012年第11期1359-1369,共11页
探究了外界Ca2+(0~50 mmol/L)对丹参培养细胞迷迭香酸合成及其相关酶活性的影响,并利用细胞膜钙离子通道抑制剂异搏定(Verpamil,VP)及钙离子载体A23187初步探讨了外界Ca2+浓度变化影响丹参培养细胞次生代谢的机制。结果显示:培养6 d时... 探究了外界Ca2+(0~50 mmol/L)对丹参培养细胞迷迭香酸合成及其相关酶活性的影响,并利用细胞膜钙离子通道抑制剂异搏定(Verpamil,VP)及钙离子载体A23187初步探讨了外界Ca2+浓度变化影响丹参培养细胞次生代谢的机制。结果显示:培养6 d时的丹参细胞中迷迭香酸积累量与外界Ca2+浓度显著相关,其中10 mmol/L Ca2+最有利于迷迭香酸的合成,迷迭香酸最大积累量达20.149 mg/g DW,比1 mmol/L和3 mmol/LCa2+处理分别高37.3%和20.4%。分析迷迭香酸合成的两条支路上的关键酶PAL和TAT活性变化发现,两种酶活性亦受外界Ca2+浓度影响,且活性变化先于迷迭香酸的积累,说明这两种酶均参与迷迭香酸的生物合成,但PAL比TAT促进作用更明显。进一步用VP和A23187处理发现,外界Ca2+影响迷迭香酸的合成是通过影响胞内Ca2+浓度实现的,胞外Ca2+内流可能参与了这一过程。 展开更多
关键词 丹参 迷迭香 钙离子 苯丙 酪氨酸氨基转移酶
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茉莉酸甲酯对丹参培养细胞中迷迭香酸生物合成及相关酶活性的影响 被引量:7
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作者 行冰玉 党小琳 +3 位作者 张婧一 汪波 陈子逸 董娟娥 《植物生理学报》 CAS CSCD 北大核心 2013年第12期1326-1332,共7页
茉莉酸甲酯是植物细胞响应外界刺激产生的重要信号分子,与植物次生代谢物的生物合成有关。本研究考察了茉莉酸甲酯(methyl jasmonate,MeJA)对丹参培养细胞中迷迭香酸(rosmarinic acid,RA)生物合成的影响。结果显示,10μmol·L-1的M... 茉莉酸甲酯是植物细胞响应外界刺激产生的重要信号分子,与植物次生代谢物的生物合成有关。本研究考察了茉莉酸甲酯(methyl jasmonate,MeJA)对丹参培养细胞中迷迭香酸(rosmarinic acid,RA)生物合成的影响。结果显示,10μmol·L-1的MeJA诱导24 h后可显著提高丹参愈伤细胞中RA的积累量及其相关酶(PAL、TAT)的活性,在48 h时RA积累量和酶活性达到最大。布洛芬(IBU)处理可抑制MeJA对RA积累量和相关酶活性的促进作用,外源施加MeJA可部分解除IBU对RA合成及其相关酶活性的抑制作用。说明MeJA可以显著促进丹参培养细胞中RA的生物合成,IBU抑制了MeJA合成、PAL和TAT活性,从而导致了RA合成受阻。 展开更多
关键词 丹参 茉莉甲酯 迷迭香 苯丙 酪氨酸氨基转移酶
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