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无线传感器网络中一种基于高斯马尔可夫移动模型的自适应定位方法(英文) 被引量:12
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作者 钟智 罗大庸 +2 位作者 刘少强 樊晓平 瞿志华 《自动化学报》 CSCD 北大核心 2010年第11期1557-1568,共12页
This paper proposes an adaptive localization approach for wireless sensor networks based on Gauss-Markov mobility model. In the approach,the perpendicular bisector strategy,the virtual repulsive strategy,and the veloc... This paper proposes an adaptive localization approach for wireless sensor networks based on Gauss-Markov mobility model. In the approach,the perpendicular bisector strategy,the virtual repulsive strategy,and the velocity adjustment strategy are properly combined to enhance localization effciency. The velocity adjustment strategy causes that the mobile anchor node automatically tunes its velocity. The perpendicular bisector strategy locally adjusts trajectory for the mobile anchor node,which ensures that unknown nodes obtain enough non-collinear anchor coordinates as soon as possible. The virtual repulsive strategy impels that the mobile anchor node rapidly leaves the communication range of location-aware nodes or returns to the surveillance region after the mobile anchor node was out of the boundary. Both theoretical analysis and simulation studies show that this approach can increase localization accuracy,consume less energy,and cover more surveillance region during the same period than virtual beacons-energy ratios localization scheme using the Gauss-Markov mobility model. 展开更多
关键词 无线传感器网络 高斯马尔可夫移动模型 自适应定位方法 计算方法
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基于平滑高斯半马尔可夫模型的移动无线传感器网络生成树算法 被引量:1
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作者 田杰 王子豪 魏玉宏 《计算机测量与控制》 2016年第6期323-325,329,共4页
针对以往移动无线传感器网络研究只是单纯地对移动群体进行分簇而没有充分利用组群移动的内部稳定性的问题,结合组移动模型中节点运动的规律和内聚性原理,采用平滑高斯半马尔可夫移动模型刻画组内单个节点移动特征,构建了一种适合移动... 针对以往移动无线传感器网络研究只是单纯地对移动群体进行分簇而没有充分利用组群移动的内部稳定性的问题,结合组移动模型中节点运动的规律和内聚性原理,采用平滑高斯半马尔可夫移动模型刻画组内单个节点移动特征,构建了一种适合移动网络的稳定生成树算法(GM-base stable spanning tree algorithm,GSST);实验证明,该算法从单个节点运动变化入手,在预测未来节点运动情况,选择稳定的链路构建网络结构方面,提高了移动网络的稳定性;同时,利用树的分层特征,简化移动网络的组网过程,并实现网络重组局部化;该算法有效延长节点存活率,均衡数据传输量。 展开更多
关键词 移动无线传感器网络 平滑高斯马尔可夫移动模型 内聚性
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基于隐马尔可夫高斯随机场模型的模糊聚类高分辨率遥感影像分割算法 被引量:22
3
作者 赵雪梅 李玉 赵泉华 《电子学报》 EI CAS CSCD 北大核心 2016年第3期679-686,共8页
本文利用隐马尔可夫随机场和高斯模型分别建立标号场和特征场的邻域关系,提出了基于隐马尔可夫高斯随机场模型的模糊聚类分割算法.该算法用隐马尔可夫随机场模型定义先验概率,并将该先验概率作为尺度控制因子引入到KL(Kullback-Lerbler... 本文利用隐马尔可夫随机场和高斯模型分别建立标号场和特征场的邻域关系,提出了基于隐马尔可夫高斯随机场模型的模糊聚类分割算法.该算法用隐马尔可夫随机场模型定义先验概率,并将该先验概率作为尺度控制因子引入到KL(Kullback-Lerbler)信息中,在目标函数的定义中,KL信息作为规则化项,其系数表示算法的模糊程度.在基于高斯模型的后验概率中,像素相关性被定义在空间和谱间,并用该概率的负对数值表征像素点到聚类中心的非相似性测度.通过对合成遥感影像和高分辨率遥感影像进行分割实验,证明了算法的有效性和普适性. 展开更多
关键词 遥感影像分割 马尔可夫随机场 高斯模型 模糊C均值算法
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结合高斯回归模型和隐马尔可夫随机场的模糊聚类图像分割 被引量:28
4
作者 赵雪梅 李玉 赵泉华 《电子与信息学报》 EI CSCD 北大核心 2014年第11期2730-2736,共7页
为了克服经典模糊聚类图像分割算法对图像噪声的敏感性,该文提出结合高斯回归模型(GRM)和隐马尔科夫随机场(HMRF)的模糊聚类图像分割算法。该算法用信息熵正则化模糊C均值(FCM)的目标函数,再用KL(Kullback-Leibler)信息加以改进,并将HMR... 为了克服经典模糊聚类图像分割算法对图像噪声的敏感性,该文提出结合高斯回归模型(GRM)和隐马尔科夫随机场(HMRF)的模糊聚类图像分割算法。该算法用信息熵正则化模糊C均值(FCM)的目标函数,再用KL(Kullback-Leibler)信息加以改进,并将HMRF和GRM模型应用到该目标函数中,其中HMRF模型通过先验概率建立标号场邻域关系,而GRM模型则在中心像素标号与其邻域像素标号一致的基础上建立特征场邻域关系。利用提出的算法和其它经典算法分别对模拟图像、真实SAR图像以及纹理图像进行了分割实验,并对分割结果进行精度评价。实验结果表明,该文提出的算法具有更高的分割精度。 展开更多
关键词 图像处理 图像分割 模糊聚类 马尔可夫随机场 高斯回归模型 KL(Kullback-Leibler)信息
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基于高斯马尔可夫随机场混合模型的纹理图像分割 被引量:17
5
作者 余鹏 张震龙 侯至群 《测绘学报》 EI CSCD 北大核心 2006年第3期224-228,共5页
针对以高斯马尔可夫随机场中的邻域像素互作用参数为特征、以高斯混合模型为分类器的二步纹理图像分割方法,提出一个两者相互结合的一步模型———高斯马尔可夫随机场混合模型,并给出其EM算法的迭代计算公式。利用该模型进行纹理图像的... 针对以高斯马尔可夫随机场中的邻域像素互作用参数为特征、以高斯混合模型为分类器的二步纹理图像分割方法,提出一个两者相互结合的一步模型———高斯马尔可夫随机场混合模型,并给出其EM算法的迭代计算公式。利用该模型进行纹理图像的分割实验,发现该算法在纹理图像分割的精度上比前者有较大程度的提高。 展开更多
关键词 高斯马尔可夫随机场 高斯混合模型 图像分割 纹理图像
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结合马尔可夫高斯模型的双邻域模糊聚类分割算法 被引量:9
6
作者 赵雪梅 李玉 赵泉华 《计算机辅助设计与图形学学报》 EI CSCD 北大核心 2016年第4期615-623,共9页
针对传统模糊C均值(FCM)算法采用欧几里得测度描述像素与聚类间的非相似性对噪声和异常值敏感的问题,提出基于马尔可夫-高斯模型、且包含特征场和标号场双邻域的模糊聚类分割算法.首先根据马尔可夫模型能够结合邻域像素作用的特点在标... 针对传统模糊C均值(FCM)算法采用欧几里得测度描述像素与聚类间的非相似性对噪声和异常值敏感的问题,提出基于马尔可夫-高斯模型、且包含特征场和标号场双邻域的模糊聚类分割算法.首先根据马尔可夫模型能够结合邻域像素作用的特点在标号场上建立与邻域像素相关联的能量函数,确保相同邻域系统内的像素属于相同类别的概率较之不在相同邻域系统内的像素更大,最终实现标号场邻域系统的建立;而后在特征场上利用Gaussian模型描述像素与聚类间的非相似性测度,并结合相邻像素对非相似性的影响构建特征场邻域模型,即利用中心像素和邻域像素特征与聚类均值矢量的差异代替传统像素特征与均值矢量的差异构建Gaussian模型;最后结合标号场和特征场邻域构建包含双邻域的模糊聚类分割模型,实现高精度模糊聚类分割.通过与现有多种典型FCM算法对模拟影像和真实彩色影像的实验以及分割结果的对比分析,证明了文中算法的有效性. 展开更多
关键词 模糊C均值算法 影像分割 邻域系统 马尔可夫高斯模型
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一种采用高斯隐马尔可夫随机场模型的遥感图像分类算法 被引量:5
7
作者 黄宁 朱敏慧 张守融 《电子与信息学报》 EI CSCD 北大核心 2003年第1期50-53,共4页
该文研究了无监督遥感图像分类问题。文中构造了图像的隐马尔可夫随机场模型(HiddenMarkov Random Fleid,HMRF),并且提出了基于该模型的图像分类算法。该文采用有限高斯混合模型(Finite Gaussian Mixture,FGM)描述图像像素灰度的条件概... 该文研究了无监督遥感图像分类问题。文中构造了图像的隐马尔可夫随机场模型(HiddenMarkov Random Fleid,HMRF),并且提出了基于该模型的图像分类算法。该文采用有限高斯混合模型(Finite Gaussian Mixture,FGM)描述图像像素灰度的条件概率分布,使用EM(Expectation-Maximization)算法解决从不完整数据中估计概率模型参数问题。针对遥感图像分布的不均匀特性,该文提出的算法没有采用固定的马尔可夫随机场模型参数,而是在递归分类算法中分级地调整模型参数以适应区域的变化。实验结果表明了该文算法的有效性,分类算法处理精度高于C-Means聚类算法.。 展开更多
关键词 高斯马尔可夫随机场 模型 遥感图像 分类 算法 EM算法 有限高斯混合模型
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基于隐马尔可夫模型和高斯混合模型结合的声音转换方法 被引量:5
8
作者 岳振军 邹翔 王浩 《数据采集与处理》 CSCD 北大核心 2009年第3期285-289,共5页
针对隐马尔可夫模型较强的语音信号表征能力和高斯混合模型良好的声音转换效果,提出了一种了隐马尔可夫模型和高斯混合模型相结合转换线谱频率的方法,给出了理论推导和算法流程,并利用高斯建模实现了韵律特征的转换。利用所述算法对录... 针对隐马尔可夫模型较强的语音信号表征能力和高斯混合模型良好的声音转换效果,提出了一种了隐马尔可夫模型和高斯混合模型相结合转换线谱频率的方法,给出了理论推导和算法流程,并利用高斯建模实现了韵律特征的转换。利用所述算法对录制的两段语音进行了仿真实验,转换语音有较好的自然度和清晰度,ABX测试结果显示,文中算法得到的语音在听觉上有90.2%的概率更接近目标说话人语音。 展开更多
关键词 声音转换 线谱频率 马尔可夫模型 高斯混合模型 主观评价
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灰色马尔可夫预测模型和加权加增长率移动平均法预测精度的比较 被引量:7
9
作者 刘璞 王萌 +1 位作者 马苓 石盛卿 《统计与决策》 CSSCI 北大核心 2018年第22期11-15,共5页
文章通过建立灰色马尔可夫预测模型和加权加增长率移动平均法,对制度环境进行预测,并对预测结果的精度进行比较。为了进一步验证这一结果的可信性,从全国选择14个省份进行预测,预测结果表明灰色马尔科夫预测结果优于加权加增长率移动平... 文章通过建立灰色马尔可夫预测模型和加权加增长率移动平均法,对制度环境进行预测,并对预测结果的精度进行比较。为了进一步验证这一结果的可信性,从全国选择14个省份进行预测,预测结果表明灰色马尔科夫预测结果优于加权加增长率移动平均法。 展开更多
关键词 制度环境 灰色马尔可夫预测模型 加权加增长率移动平均法
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基于高斯-马尔可夫模型的海洋环境辨识方法 被引量:3
10
作者 杜金燕 潘俊阳 孙超 《计算机仿真》 CSCD 北大核心 2009年第12期12-15,229,共5页
在解决海洋中的信号处理问题时,海洋环境的复杂性和多变性严重影响了信号处理系统的性能。为了在信号处理之前辨识出海洋环境参数,并将其融入信号处理框架中,则有希望提高信号处理器的性能。将海洋环境建模为高斯-马尔可夫模型,利用声... 在解决海洋中的信号处理问题时,海洋环境的复杂性和多变性严重影响了信号处理系统的性能。为了在信号处理之前辨识出海洋环境参数,并将其融入信号处理框架中,则有希望提高信号处理器的性能。将海洋环境建模为高斯-马尔可夫模型,利用声速梯度数据和由Kraken模型得到的声压场数据,结合扩展卡尔曼滤波器算法,实现了对海洋环境的辨识。利用模基处理方法,简正波传播模型,可以辨识模函数和水平波数,并能估计出基阵所在位置的声压场。仿真数据和模型数据吻合较好,说明算法能够较好地估计海洋环境参数,为滤波、检测、定位、跟踪等应用提供了基础。 展开更多
关键词 模基辨识器 高斯-马尔可夫模型 简正波 扩展卡尔曼滤波器
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基于混合高斯模型的三马尔可夫场红外图像分割 被引量:1
11
作者 徐红 牛秦洲 《激光与红外》 CAS CSCD 北大核心 2008年第11期1177-1180,共4页
针对马尔可夫随机场在红外图像分割方面存在的问题,给出了一种基于混合高斯模型的三马尔可夫场红外图像分割算法。三马尔可夫场在马尔可夫随机场的基础上通过引入一个附加随机场和全体随机变量服从马尔可夫性假设,克服了马尔可夫场算法... 针对马尔可夫随机场在红外图像分割方面存在的问题,给出了一种基于混合高斯模型的三马尔可夫场红外图像分割算法。三马尔可夫场在马尔可夫随机场的基础上通过引入一个附加随机场和全体随机变量服从马尔可夫性假设,克服了马尔可夫场算法中对条件概率分布相互独立的要求,并赋予该附加随机场对目标和背景区域的标识作用,其中采用混合高斯模型作为三马尔可夫随机场的先验模型。仿真结果表明,文中提出的基于混合高斯模型的三马尔可夫场红外图像分割算法能够实现复杂背景的红外图像准确分割,得到较为理想的分割效果。 展开更多
关键词 红外图像分割 马尔可夫随机场 马尔可夫 混合高斯模型
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基于混合高斯隐马尔可夫模型的带式输送机堆煤时刻预测方法 被引量:1
12
作者 钱建生 李小斌 +1 位作者 秦文光 秦海初 《工矿自动化》 北大核心 2014年第11期26-30,共5页
提出了一种基于混合高斯隐马尔可夫模型的带式输送机堆煤时刻预测方法。该方法根据传感器采集的带式输送机功率时序数据建立带式输送机运行状态的混合高斯隐马尔可夫模型,基于该模型采用基于图的状态序列遍历算法和基于切普曼-柯尔莫哥... 提出了一种基于混合高斯隐马尔可夫模型的带式输送机堆煤时刻预测方法。该方法根据传感器采集的带式输送机功率时序数据建立带式输送机运行状态的混合高斯隐马尔可夫模型,基于该模型采用基于图的状态序列遍历算法和基于切普曼-柯尔莫哥罗夫方程的概率转移算法对带式输送机堆煤时刻进行预测:基于图的状态序列遍历算法通过寻找当前状态到堆煤状态的通路确定剩余时间;基于切普曼-柯尔莫哥罗夫方程的概率转移算法通过粒子群优化算法及切普曼-柯尔莫哥罗夫方程交叉验证来获取训练样本上失败状态的概率阈值,并计算当前的状态迁移到超过失败状态概率阈值的转移次数来确定剩余时间。基于煤矿生产实际数据集的实验验证了该方法可有效预测带式输送机的堆煤发生时刻。 展开更多
关键词 带式输送机 堆煤时刻 堆煤预测 剩余寿命 马尔可夫模型 混合高斯马尔科夫模型 切普曼-柯尔莫哥罗夫方程
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基于高斯-马尔可夫随机场模型的运动目标自动分割 被引量:3
13
作者 仲兴荣 肖圣兵 《苏州大学学报(自然科学版)》 CAS 2003年第3期78-83,共6页
提出了一种基于高斯 马尔可夫随机场(GMRF:GaussianMarkovRandomField)模型的运动目标自动分割算法.该算法采用有限高斯混合模型描述视频序列帧差图像的概率分布.在此基础上建立马尔可夫随机场模型,构造系统相应的能量函数.然后通过Metr... 提出了一种基于高斯 马尔可夫随机场(GMRF:GaussianMarkovRandomField)模型的运动目标自动分割算法.该算法采用有限高斯混合模型描述视频序列帧差图像的概率分布.在此基础上建立马尔可夫随机场模型,构造系统相应的能量函数.然后通过Metroplis优化算法求解能量函数的最优解,得出标记场,提取出运动目标.实验结果证明,该算法对运动目标分割具有很好的分割效果. 展开更多
关键词 图像处理 图像分割 运动目标 自动分割 高斯-马尔可夫随机场模型 能量函数
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基于移动平均-马尔可夫链模型的上海市机场旅客吞吐量预测研究 被引量:1
14
作者 申瑞娜 樊重俊 《科技与管理》 2014年第5期51-54,59,共5页
为了更多的挖掘数据的信息,本文将移动平均与马尔可夫链模型结合,对马尔可夫链模型进行改进,以拟合结果为动态基准线来构建动态的马尔可夫链,并进行预测及平稳分布研究。利用上海市机场2008年1月至2013年10月的各月数据进行模型拟合,将... 为了更多的挖掘数据的信息,本文将移动平均与马尔可夫链模型结合,对马尔可夫链模型进行改进,以拟合结果为动态基准线来构建动态的马尔可夫链,并进行预测及平稳分布研究。利用上海市机场2008年1月至2013年10月的各月数据进行模型拟合,将拟合结果作为动态基准线,进行系统状态划分,确定状态转移概率矩阵。预测未来4个月的中值和区间,并根据马尔可夫链的遍历性和稳定性求出状态的平稳分布。实证表明,该方法的预测精度更高,并且具有较强的适用性和泛化性,具有较强的实用价值。 展开更多
关键词 旅客吞吐量 马尔可夫模型 移动平均-马尔可夫链预测模型
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基于小波域隐马尔可夫树的焊缝图像去噪方法研究
15
作者 宋涛 张柏诚 +1 位作者 王春雷 姜正鹤 《焊接技术》 2025年第2期127-130,共4页
针对机器视觉中CCD相机在PVD真空腔体焊缝拍照后图像噪声严重、并且传统算法去噪不明显的现象,提出了一种基于小波域隐马尔可夫树的图像去噪算法。该算法首先将图像等二维信号转换到小波域以使得时频关系更加明显,之后用隐状态下的高斯... 针对机器视觉中CCD相机在PVD真空腔体焊缝拍照后图像噪声严重、并且传统算法去噪不明显的现象,提出了一种基于小波域隐马尔可夫树的图像去噪算法。该算法首先将图像等二维信号转换到小波域以使得时频关系更加明显,之后用隐状态下的高斯混合密度构造每个系数的边缘密度概率函数,然后匹配隐马尔可夫树模型得到小波系数的关系,最后将马尔可夫的最大期望值算法应用于真空腔体焊缝图像,经过小波重建得到去噪后的图像。结果表明,小波域隐马尔可夫树在图像去噪中有较明显的效果,比小波软阈值法的峰值信噪比(PSNR)高7%左右,重建后的图像在信噪比和视觉效果上都有较大改进,更加适合PVD真空腔体焊缝图像去噪。 展开更多
关键词 小波变换 马尔可夫树(HMT) 高斯密度模型 焊接过程检测 图像去噪
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基于通用高斯马尔可夫随机场模型的图像超分辨率重建
16
作者 黄华 李俊 +1 位作者 齐春 朱世华 《计算机科学》 CSCD 北大核心 2005年第11期195-197,共3页
提出了一种基于通用高斯马尔可夫随机场(GGMRF)模型的图像超分辨率重建方法,给出了求解过程和实验结果,并进行了分析。相对Compound Markov随机场模型和 Huber-Markov随机场模型,GGMRF模型不用判断边缘或者线过程,因此优化求解简单,大... 提出了一种基于通用高斯马尔可夫随机场(GGMRF)模型的图像超分辨率重建方法,给出了求解过程和实验结果,并进行了分析。相对Compound Markov随机场模型和 Huber-Markov随机场模型,GGMRF模型不用判断边缘或者线过程,因此优化求解简单,大大减少了运算量。实验结果表明在低噪声情况下,该方法重建图像视觉效果较好。 展开更多
关键词 超分辨率 图像重建 GGMRF模型 马尔可夫随机场 随机场模型 图像超分辨率 高斯 通用 MARKOV MRF模型
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基于高斯混合-隐马尔可夫模型的速差转向履带车辆横向控制驾驶员模型 被引量:17
17
作者 王博洋 龚建伟 +2 位作者 高天云 陈慧岩 席军强 《兵工学报》 EI CAS CSCD 北大核心 2017年第12期2301-2308,共8页
为解决基于离合器转向机的履带车辆在无人行驶条件下的横向控制问题,采用一种基于高斯混合-隐马尔可夫模型的统计学习方法构建驾驶员模型,以实现对驾驶员跟踪控制操控经验的表述。利用经过大量试验采集获得的经验驾驶员操控数据对模型... 为解决基于离合器转向机的履带车辆在无人行驶条件下的横向控制问题,采用一种基于高斯混合-隐马尔可夫模型的统计学习方法构建驾驶员模型,以实现对驾驶员跟踪控制操控经验的表述。利用经过大量试验采集获得的经验驾驶员操控数据对模型进行训练。以基于高斯混合模型表征的车辆速度和航向偏差作为隐马尔可夫模型的观测状态参量,并利用高斯混合模型对左右操纵杆位置进行转向模式划分,以转向模式作为隐马尔可夫模型的隐藏层状态参量,通过对模型的训练最终实现对于驾驶员操控经验以及车辆特性的统计学描述。利用上述模型对跟踪控制过程中的期望转向模式进行预测分析,结果表明该模型能够较准确地对转向模式进行预测。 展开更多
关键词 兵器科学与技术 履带车辆 横向控制 驾驶员模型 高斯混合-隐马尔可夫模型 机器学习 运动基元
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基于高阶马尔可夫链和高斯混合模型的光伏出力短期概率预测 被引量:34
18
作者 刘洁 林舜江 +2 位作者 梁炜焜 王琼 刘明波 《电网技术》 EI CSCD 北大核心 2023年第1期266-274,共9页
为提高光伏电站出力预测的准确性,给调度决策人员提供更丰富的预测信息,提出一种基于高阶马尔可夫链(high order Markov chain,HMC)和高斯混合模型(Gaussian mixture model,GMM)的光伏电站短期出力概率预测方法。首先对光伏电站的历史... 为提高光伏电站出力预测的准确性,给调度决策人员提供更丰富的预测信息,提出一种基于高阶马尔可夫链(high order Markov chain,HMC)和高斯混合模型(Gaussian mixture model,GMM)的光伏电站短期出力概率预测方法。首先对光伏电站的历史出力数据进行HMC建模,通过计算邻近时段光伏出力数据的Pearson相关系数确定马尔可夫链的阶数,并统计历史数据得到邻近时段光伏出力的状态转移概率矩阵。然后以此为基础建立GMM形式的光伏出力概率预测模型,并提出基于相似气象条件下的数据样本对GMM中各高斯分布的均值与方差进行修正,最终得到光伏电站出力的概率密度函数。以实际光伏电站数据为例进行分析,结果表明所提出的概率预测方法具有较高的准确性,且与传统的点预测方法相比,概率预测能够为电网运行决策提供更多有益信息。 展开更多
关键词 光伏出力 短期概率预测 高阶马尔可夫 高斯混合模型 相似气象
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移动卫星通信中基于马尔可夫链的两状态信道模型研究 被引量:3
19
作者 吴海龙 赵旦峰 廖希 《信息网络安全》 2015年第4期50-55,共6页
文章基于马尔可夫链提出两状态陆地移动卫星通信信道模型,该模型状态之间的转移被描述为马尔可夫(Markov)过程,且每状态内接收信号包络的概率密度函数服从不同参数集的Loo分布。同时对这一过程进行理论上的数学建模与仿真分析,得到包络... 文章基于马尔可夫链提出两状态陆地移动卫星通信信道模型,该模型状态之间的转移被描述为马尔可夫(Markov)过程,且每状态内接收信号包络的概率密度函数服从不同参数集的Loo分布。同时对这一过程进行理论上的数学建模与仿真分析,得到包络的一阶、二阶统计特性,并将其与同样环境下的实测数据相应的统计特性进行对比。仿真结果表明,在多种环境下,基于马尔可夫(Markov)链的两状态陆地移动卫星通信信道模型的统计特性与实测数据的统计特性非常接近,这证明了所建立的信道模型能够模拟实际环境中的卫星移动通信信道,为以后移动通信技术的评估以及系统的规划搭建有效的平台,同时也具有很广泛的适用性。 展开更多
关键词 移动卫星通信 两状态信道模型 马尔可夫 衰落统计特性
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基于增强采样构建的隐式马尔可夫状态模型分析GLP-1R激动剂对GLP-1R激活机制
20
作者 刘一卜 汤磊 范菊娣 《山东医药》 CAS 2024年第3期44-50,共7页
目的 基于增强采样构建的隐式马尔可夫状态模型,分析胰高血糖素样肽1受体(GLP-1R)激动剂PF-06882961激活GLP-1R的机制。方法 从PDB数据库中下载GLP-1R晶体结构(PDBID:6X1A),基于该晶体结构构建PF06882961与GLP-1R结合的高斯加速动力学(G... 目的 基于增强采样构建的隐式马尔可夫状态模型,分析胰高血糖素样肽1受体(GLP-1R)激动剂PF-06882961激活GLP-1R的机制。方法 从PDB数据库中下载GLP-1R晶体结构(PDBID:6X1A),基于该晶体结构构建PF06882961与GLP-1R结合的高斯加速动力学(GaMD)体系,模拟PF06882961与GLP-1R结合的动力学轨迹。使用工具包Pyemma读取PF06882961与GLP-1R结合的GaMD动力学轨迹,构建马尔可夫模型。然后分别从一级结构[关键氨基酸残基间的αC间距(Glu247-His180;Glu364-Arg190)]和二级结构[关键α螺旋间扭转角(Val365-Pro358-Ala350;Arg380-Phe390-Met397)]两个层面对构建的马尔可夫模型中PF-06882961与GLP-1R复合物若干构象进行聚类分析,得出5个结构具有差异的PF-06882961与GLP-1R复合物宏观态构象(S1、2、3、4、5),将其可视化后分析各个宏观态构象之间的结构差异,以明确PF-06882961激活GLP-1R的结构基础。结果 从二级结构层面进行聚类分析时,PF06882961与GLP-1R结合后,GLP-1R细胞外结构域部分与跨膜结构域间距离减小,GLP-1R下游的G蛋白发生了重要构象转变。从一级结构及二级结构层面进行聚类分析时,PF-06882961结合GLP-1R后,GLP-1R的跨膜结构域内关键氨基酸残基重排出新的极性网络(Glu364-Tyr241-His180-Glu247),细胞外结构域内由Phe385-Tyr203-Tyr148组成π-π堆叠网络。结论 PF-06882961与GLP-1R结合后,通过由Phe385-Tyr203-Tyr148组成的π-π堆叠网络、由Glu364-Tyr241-His180-Glu247重排而成的新极性网络分别稳定GLP-1R的细胞外结构域及跨膜结构域,从而激活GLP-1R。 展开更多
关键词 胰高血糖素样肽1受体激动剂 PF-06882961 胰高血糖素样肽1受体 马尔可夫状态模型 高斯加速动力学 分子动力学模拟
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