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基于DNA条形码技术的珠江口春季鱼卵和仔稚鱼种类组成和分布特征的研究
被引量:
5
1
作者
孔啸兰
张帅
+3 位作者
陈作志
林昭进
蒋佩文
江艳娥
《海洋学报》
CAS
CSCD
北大核心
2023年第3期52-65,共14页
采用线粒体COⅠ和12S rRNA基因片段作为DNA条形码,分析珠江口春季鱼卵和仔稚鱼种类组成和分布特征,并探究两种条形码在鱼卵和仔稚鱼种类鉴定中的适用性。研究共扩增样本391个,成功鉴定的鱼卵和仔稚鱼共7目25科42属60种(2种未鉴定到种)...
采用线粒体COⅠ和12S rRNA基因片段作为DNA条形码,分析珠江口春季鱼卵和仔稚鱼种类组成和分布特征,并探究两种条形码在鱼卵和仔稚鱼种类鉴定中的适用性。研究共扩增样本391个,成功鉴定的鱼卵和仔稚鱼共7目25科42属60种(2种未鉴定到种)。其中,以鲈形目(Perciformes)种类和数量最多,种类数占比为51.6%,数量占比为47.91%;其次为鲱形目(Clupeiformes),种类数占比为25%,数量占比为34.56%。优势种10种,其中凤鲚(Coilia mystus)优势度最高,为0.071;棘头梅童鱼(Collichthys lucidus)最低,为0.014。COⅠ和12S rRNA基因片段扩增结果显示,鱼卵和仔稚鱼12S rRNA基因片段扩增成功率(95.60%)明显高于COⅠ基因(43.22%)。遗传距离和ABGD分析显示,COⅠ基因种内遗传距离为0~0.005(平均0.003),种间遗传距离为0.061~0.376(平均0.253),两者间存在明显的“条形码间隙”,ABGD划分结果与数据库比对结果一致;12S r RNA基因种内遗传距离为0~0.011(平均0.007),种间遗传距离为0.007~0.487(平均0.283),龟(Chelon haematocheila)和前鳞龟(Chelon affinis)种间遗传距离与种内遗传距离不形成“条形码间隙”,ABGD将其划分为同一种。系统发育分析显示,在种的分类阶元,所有物种均能聚为独立分支,得到有效区分。综上,线粒体COⅠ和12S rRNA条形码可有效鉴定珠江口大多数鱼卵和仔稚鱼,但是COⅠ基因扩增成功率较低,12S rRNA基因部分近缘物种存在区分困难的情况,两种基因结合使用更能提高鱼卵和仔稚鱼种类鉴定的成功率和准确性。
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关键词
COⅠ基因
12S
rRNA基因
鱼卵和仔稚鱼
DNA条形码
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职称材料
福建东山湾春、夏季鱼卵和仔稚鱼丰度分布特征及其与环境因子的关系
被引量:
9
2
作者
郑惠东
《应用海洋学学报》
CSCD
北大核心
2016年第1期87-94,共8页
根据2011年5月(春季)、8月(夏季)福建东山湾海域生态环境调查资料,对东山湾鱼卵和仔稚鱼的生态分布特征及其与环境因子关系进行了研究.结果表明,春、夏两季共鉴定出鱼卵和仔稚鱼34种,隶属4目15科22属,其中鲈形目种类最多,共19种;鯡形目...
根据2011年5月(春季)、8月(夏季)福建东山湾海域生态环境调查资料,对东山湾鱼卵和仔稚鱼的生态分布特征及其与环境因子关系进行了研究.结果表明,春、夏两季共鉴定出鱼卵和仔稚鱼34种,隶属4目15科22属,其中鲈形目种类最多,共19种;鯡形目次之,共9种;鲽形目4种;鲀形目1种.其生态类型主要为近岸中上层鱼类、近岸底层鱼类、沿岸浅水中下层鱼类和港湾河口型鱼类4个生态类型.春、夏两季鱼卵和仔稚鱼优势种变化不明显,但丰度变化较大,春季丰度为夏季的2.3倍.丰度平面分布呈现湾顶、湾中高而湾口低的分布特点.鱼卵和仔稚鱼丰度平面分布与水温无相关性(p>0.05);鱼卵丰度平面分布与盐度呈显著负相关(p<0.05),而仔稚鱼丰度平面分布与盐度无相关性(p>0.05);春季,鱼卵和仔稚鱼丰度平面分布与浮游动物存在极显著相关性(p<0.01).东山湾鱼类繁殖的关键时期为春季,关键区域为大霜屿附近海域.
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关键词
海洋生物学
鱼卵和仔稚鱼
生态分布
回归分析
东山湾
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职称材料
鱼卵和仔稚鱼鉴定技术研究进展
被引量:
5
3
作者
金雨婷
蒋日进
+2 位作者
赵进
刘志坚
管峰
《安徽农业科学》
CAS
2019年第15期18-20,39,共4页
鱼卵和仔稚鱼是鱼类繁殖的早期幼体形态,其分布、数量和种类对于渔业资源的可持续发展和生物学研究具有重要意义,鱼卵和仔稚鱼鉴定是这一研究的重要环节。鱼卵和仔稚鱼的鉴定先后历经了形态学鉴定和分子鉴定两个技术发展阶段。简述鱼卵...
鱼卵和仔稚鱼是鱼类繁殖的早期幼体形态,其分布、数量和种类对于渔业资源的可持续发展和生物学研究具有重要意义,鱼卵和仔稚鱼鉴定是这一研究的重要环节。鱼卵和仔稚鱼的鉴定先后历经了形态学鉴定和分子鉴定两个技术发展阶段。简述鱼卵和仔稚鱼鉴定在渔业资源普查和科学研究中的重要意义以及2种主要鉴定技术的研究进展,为鱼卵和仔稚鱼鉴定研究提供基础知识。
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关键词
鱼卵和仔稚鱼
物种鉴定
形态学
分子鉴定
DNA条形码
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职称材料
题名
基于DNA条形码技术的珠江口春季鱼卵和仔稚鱼种类组成和分布特征的研究
被引量:
5
1
作者
孔啸兰
张帅
陈作志
林昭进
蒋佩文
江艳娥
机构
中国水产科学研究院南海水产研究所农业农村部外海渔业可持续利用重点实验室
南方海洋科学与工程广东省实验室(广州)
出处
《海洋学报》
CAS
CSCD
北大核心
2023年第3期52-65,共14页
基金
广东省重点领域研发计划(2020B1111030001)
南方海洋科学与工程广东省实验室(广州)人才团队引进重大专项(GML2019ZD0605)
中国水产科学研究院中央级公益性科研院所基本科研业务费专项(2020TD05)。
文摘
采用线粒体COⅠ和12S rRNA基因片段作为DNA条形码,分析珠江口春季鱼卵和仔稚鱼种类组成和分布特征,并探究两种条形码在鱼卵和仔稚鱼种类鉴定中的适用性。研究共扩增样本391个,成功鉴定的鱼卵和仔稚鱼共7目25科42属60种(2种未鉴定到种)。其中,以鲈形目(Perciformes)种类和数量最多,种类数占比为51.6%,数量占比为47.91%;其次为鲱形目(Clupeiformes),种类数占比为25%,数量占比为34.56%。优势种10种,其中凤鲚(Coilia mystus)优势度最高,为0.071;棘头梅童鱼(Collichthys lucidus)最低,为0.014。COⅠ和12S rRNA基因片段扩增结果显示,鱼卵和仔稚鱼12S rRNA基因片段扩增成功率(95.60%)明显高于COⅠ基因(43.22%)。遗传距离和ABGD分析显示,COⅠ基因种内遗传距离为0~0.005(平均0.003),种间遗传距离为0.061~0.376(平均0.253),两者间存在明显的“条形码间隙”,ABGD划分结果与数据库比对结果一致;12S r RNA基因种内遗传距离为0~0.011(平均0.007),种间遗传距离为0.007~0.487(平均0.283),龟(Chelon haematocheila)和前鳞龟(Chelon affinis)种间遗传距离与种内遗传距离不形成“条形码间隙”,ABGD将其划分为同一种。系统发育分析显示,在种的分类阶元,所有物种均能聚为独立分支,得到有效区分。综上,线粒体COⅠ和12S rRNA条形码可有效鉴定珠江口大多数鱼卵和仔稚鱼,但是COⅠ基因扩增成功率较低,12S rRNA基因部分近缘物种存在区分困难的情况,两种基因结合使用更能提高鱼卵和仔稚鱼种类鉴定的成功率和准确性。
关键词
COⅠ基因
12S
rRNA基因
鱼卵和仔稚鱼
DNA条形码
Keywords
COⅠgene
12S rRNA gene
fish eggs and larvae
DNA barcoding
分类号
S932.4 [农业科学—渔业资源]
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职称材料
题名
福建东山湾春、夏季鱼卵和仔稚鱼丰度分布特征及其与环境因子的关系
被引量:
9
2
作者
郑惠东
机构
福建省水产研究所、福建省海洋生物增养殖与高值化利用重点实验室
出处
《应用海洋学学报》
CSCD
北大核心
2016年第1期87-94,共8页
基金
国家海洋局海洋公益性行业科研专项资助项目(201005012
201305043)
+1 种基金
福建省科技厅省属公益类科研院所基本科研专项资助项目(2014R1003-3)
福建省海洋生物增养殖与高值化利用重点实验室资助项目
文摘
根据2011年5月(春季)、8月(夏季)福建东山湾海域生态环境调查资料,对东山湾鱼卵和仔稚鱼的生态分布特征及其与环境因子关系进行了研究.结果表明,春、夏两季共鉴定出鱼卵和仔稚鱼34种,隶属4目15科22属,其中鲈形目种类最多,共19种;鯡形目次之,共9种;鲽形目4种;鲀形目1种.其生态类型主要为近岸中上层鱼类、近岸底层鱼类、沿岸浅水中下层鱼类和港湾河口型鱼类4个生态类型.春、夏两季鱼卵和仔稚鱼优势种变化不明显,但丰度变化较大,春季丰度为夏季的2.3倍.丰度平面分布呈现湾顶、湾中高而湾口低的分布特点.鱼卵和仔稚鱼丰度平面分布与水温无相关性(p>0.05);鱼卵丰度平面分布与盐度呈显著负相关(p<0.05),而仔稚鱼丰度平面分布与盐度无相关性(p>0.05);春季,鱼卵和仔稚鱼丰度平面分布与浮游动物存在极显著相关性(p<0.01).东山湾鱼类繁殖的关键时期为春季,关键区域为大霜屿附近海域.
关键词
海洋生物学
鱼卵和仔稚鱼
生态分布
回归分析
东山湾
Keywords
marine biology
fish eggs and larvae
ecological distribution
regression analysis
Dongshan Bay
分类号
P735 [天文地球—海洋生物学]
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职称材料
题名
鱼卵和仔稚鱼鉴定技术研究进展
被引量:
5
3
作者
金雨婷
蒋日进
赵进
刘志坚
管峰
机构
中国计量大学生命科学学院
浙江省海洋水产研究所
温州市渔业技术推广站
出处
《安徽农业科学》
CAS
2019年第15期18-20,39,共4页
基金
浙江省科技计划项目(2017C32081,2017F50015)
文摘
鱼卵和仔稚鱼是鱼类繁殖的早期幼体形态,其分布、数量和种类对于渔业资源的可持续发展和生物学研究具有重要意义,鱼卵和仔稚鱼鉴定是这一研究的重要环节。鱼卵和仔稚鱼的鉴定先后历经了形态学鉴定和分子鉴定两个技术发展阶段。简述鱼卵和仔稚鱼鉴定在渔业资源普查和科学研究中的重要意义以及2种主要鉴定技术的研究进展,为鱼卵和仔稚鱼鉴定研究提供基础知识。
关键词
鱼卵和仔稚鱼
物种鉴定
形态学
分子鉴定
DNA条形码
Keywords
Fish eggs and larvae
Species identification
Morphology
Molecular identification
DNA barcoding
分类号
S917 [农业科学—水产科学]
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职称材料
题名
作者
出处
发文年
被引量
操作
1
基于DNA条形码技术的珠江口春季鱼卵和仔稚鱼种类组成和分布特征的研究
孔啸兰
张帅
陈作志
林昭进
蒋佩文
江艳娥
《海洋学报》
CAS
CSCD
北大核心
2023
5
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职称材料
2
福建东山湾春、夏季鱼卵和仔稚鱼丰度分布特征及其与环境因子的关系
郑惠东
《应用海洋学学报》
CSCD
北大核心
2016
9
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职称材料
3
鱼卵和仔稚鱼鉴定技术研究进展
金雨婷
蒋日进
赵进
刘志坚
管峰
《安徽农业科学》
CAS
2019
5
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职称材料
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