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一种基于粗糙遗传算法的缩放模式双聚类分析方法
被引量:
3
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作者
李刚
苗夺谦
王睿智
《计算机科学》
CSCD
北大核心
2010年第1期225-228,共4页
研究了基因表达数据的缩放模式发现问题,给出了一种缩放模式双聚类评价函数,并提出了一种基于粗糙遗传算法的双聚类分析方法。该方法先以启发式算法及随机方法生成初始种群,再基于粗糙遗传算法对种群进行迭代,以达到全局优化的目的。在Y...
研究了基因表达数据的缩放模式发现问题,给出了一种缩放模式双聚类评价函数,并提出了一种基于粗糙遗传算法的双聚类分析方法。该方法先以启发式算法及随机方法生成初始种群,再基于粗糙遗传算法对种群进行迭代,以达到全局优化的目的。在Yeast数据集上进行的测试表明,该算法能对启发式算法的结果进行良好的修正。生物显著性分析表明所发现的缩放模式双聚类具有生物学意义。
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关键词
双聚类分析
缩放模式
粗糙遗传算法
基因表达数据
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题名
一种基于粗糙遗传算法的缩放模式双聚类分析方法
被引量:
3
1
作者
李刚
苗夺谦
王睿智
机构
同济大学计算机科学与技术系国家高性能计算机工程中心同济分中心同济大学嵌入式系统与服务计算教育部重点实验室
出处
《计算机科学》
CSCD
北大核心
2010年第1期225-228,共4页
基金
国家自然科学基金项目(60475019
60775036)
高等学校博士学科点专项科研基金(20060247039)资助
文摘
研究了基因表达数据的缩放模式发现问题,给出了一种缩放模式双聚类评价函数,并提出了一种基于粗糙遗传算法的双聚类分析方法。该方法先以启发式算法及随机方法生成初始种群,再基于粗糙遗传算法对种群进行迭代,以达到全局优化的目的。在Yeast数据集上进行的测试表明,该算法能对启发式算法的结果进行良好的修正。生物显著性分析表明所发现的缩放模式双聚类具有生物学意义。
关键词
双聚类分析
缩放模式
粗糙遗传算法
基因表达数据
Keywords
biclustering
,
scaling patterns
,
genetic rough algorithm
,
gene expression data
分类号
O159 [理学—基础数学]
O242.23 [理学—计算数学]
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题名
作者
出处
发文年
被引量
操作
1
一种基于粗糙遗传算法的缩放模式双聚类分析方法
李刚
苗夺谦
王睿智
《计算机科学》
CSCD
北大核心
2010
3
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