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基于TCGA数据库的扶正消积进展方抑制结直肠癌肝转移机制网络药理学研究
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作者 李琼 陈敬贤 +9 位作者 武渊 吕玲玲 应海峰 朱文华 徐佳悦 阮铭 郭元彪 朱伟荣 殷世鹏 郑岚 《甘肃中医药大学学报》 2023年第3期1-11,共11页
目的基于癌症基因组图谱计划(TCGA)数据库,采用网络药理学的方法探究扶正消积进展方抑制结直肠癌肝转移的作用机制,为扶正消积进展方进一步的临床应用及转化提供依据。方法采用中药系统药理学数据库与分析平台(TCMSP)和中草药数据库(TCM... 目的基于癌症基因组图谱计划(TCGA)数据库,采用网络药理学的方法探究扶正消积进展方抑制结直肠癌肝转移的作用机制,为扶正消积进展方进一步的临床应用及转化提供依据。方法采用中药系统药理学数据库与分析平台(TCMSP)和中草药数据库(TCMID)筛选药物的有效成分,采用BATMAN数据库预测有效成分的目标靶点,利用TCGA数据库及R语言Mfuzz包预测、筛选结直肠癌肝转移的疾病靶点,药物有效成分的目标靶点与疾病靶点相交获得交集靶点;对交集靶点进行基因本体(GO)功能富集分析与京都基因与基因组百科全书(KEGG)通路富集分析;通过STRING10.0数据库、Cytoscape3.7.2软件对交集靶点进行蛋白质-蛋白质相互作用(PPI)网络构建,进而筛选出核心靶点;采用Cytoscape3.7.2的“Merge”功能构建“药物-有效成分-靶点-作用通路”网络图。结果共筛选获得扶正消积进展方有效成分282个,交集靶标152个;涉及13类生物功能,139个分子功能,80个细胞功能;通过PPI网络发掘出OXTR、GNA15、F2、COX5A、COX5B、ATP5B、COX4I1、COX7C、COX7B、ATP5A1等10个核心靶点,KEGG信号通路主要富集在多种神经退行性变的途径、神经活性配体受体相互作用、钙信号通路等方面。结论扶正消积进展方可通过多种有效成分,多途径、多靶点抑制结直肠癌肝转移。 展开更多
关键词 扶正消积进展方 结直肠癌肝转移 网络药理学 癌症基因组图谱计划数据库 有效成分 核心靶点 信号通路
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