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利用系统进化树对H7N9大数据预测传播模型的评估
被引量:
7
1
作者
杜鹏程
于伟文
+3 位作者
陈禹保
闫鹏程
安云鹤
陈晨
《中国生物工程杂志》
CAS
CSCD
北大核心
2014年第11期18-23,共6页
活禽贸易和H7N9禽流感病毒传播之间存在关联,应用大数据技术分析活禽交易网络数据,可进行疫情溯源并预测未来传播趋势。从流感研究数据库中获取了截止至2013年分离得到的H7N9毒株的血凝素基因核酸序列,构建系统进化树推断2013年上半年...
活禽贸易和H7N9禽流感病毒传播之间存在关联,应用大数据技术分析活禽交易网络数据,可进行疫情溯源并预测未来传播趋势。从流感研究数据库中获取了截止至2013年分离得到的H7N9毒株的血凝素基因核酸序列,构建系统进化树推断2013年上半年疫情中H7N9在各省及城市间的传播情况,并与大数据推断结果进行对比分析。结果表明,系统进化树推断结果更为准确,但大数据分析能够提供更多地区的信息且具有更好的时效性,同时推断的传播模型准确度较高,在H7N9疫情的应对中具有较高的应用价值。
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关键词
H7N9型禽流感
系统进化树
大数据
传播模型
原文传递
题名
利用系统进化树对H7N9大数据预测传播模型的评估
被引量:
7
1
作者
杜鹏程
于伟文
陈禹保
闫鹏程
安云鹤
陈晨
机构
中国疾病预防控制中心传染病预防控制所传染病预防控制国家重点实验室
感染性疾病诊治协同创新中心
北京市计算中心
北京市理化分析测试中心
出处
《中国生物工程杂志》
CAS
CSCD
北大核心
2014年第11期18-23,共6页
基金
国家"863"计划(2014AA021505)
国家自然科学基金(81201322
81301402)资助项目
文摘
活禽贸易和H7N9禽流感病毒传播之间存在关联,应用大数据技术分析活禽交易网络数据,可进行疫情溯源并预测未来传播趋势。从流感研究数据库中获取了截止至2013年分离得到的H7N9毒株的血凝素基因核酸序列,构建系统进化树推断2013年上半年疫情中H7N9在各省及城市间的传播情况,并与大数据推断结果进行对比分析。结果表明,系统进化树推断结果更为准确,但大数据分析能够提供更多地区的信息且具有更好的时效性,同时推断的传播模型准确度较高,在H7N9疫情的应对中具有较高的应用价值。
关键词
H7N9型禽流感
系统进化树
大数据
传播模型
Keywords
htn9 avian influenza phylogenetic tree big data transmission model
分类号
R181 [医药卫生—流行病学]
原文传递
题名
作者
出处
发文年
被引量
操作
1
利用系统进化树对H7N9大数据预测传播模型的评估
杜鹏程
于伟文
陈禹保
闫鹏程
安云鹤
陈晨
《中国生物工程杂志》
CAS
CSCD
北大核心
2014
7
原文传递
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参考文献
引证文献
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