Lyon IARC多瘤病毒(LIPyV)是2017年于人类皮肤样本中新发现的病毒,为更加了解其致病性和流行病学状况,本试验拟建立一种灵敏度高、可快速检测LIPyV的SYBR Green I实时荧光定量PCR方法,并对该方法的特异性、灵敏性和重复性进行评价。结...Lyon IARC多瘤病毒(LIPyV)是2017年于人类皮肤样本中新发现的病毒,为更加了解其致病性和流行病学状况,本试验拟建立一种灵敏度高、可快速检测LIPyV的SYBR Green I实时荧光定量PCR方法,并对该方法的特异性、灵敏性和重复性进行评价。结果显示:该检测方法的Ct值与标准品模板线性关系良好,相关系数为0.9989;利用该方法检测CBoV、FBoV、AGV2这几种病毒的基因组均没有出现非特异性扩增;敏感性比普通PCR检测方法高100倍;组内和组间重复性试验的变异系数小于1%;通过60份样本检测发现LIPyV阳性率为6.67%,比普通PCR更灵敏可靠。结果表明,本试验建立的SYBR Green I实时荧光定量PCR方法可用于LIPyV的快速检测。展开更多
为了建立高效、灵敏的猪流行性腹泻病毒(PEDV)检测方法,本研究从GenBank数据库中获取PEDV N基因序列,扩增出PEDV N基因标准质粒,并在N基因的保守区域内设计了一对特异性荧光定量引物,成功建立了SYBR Green I实时荧光定量PCR检测方法。...为了建立高效、灵敏的猪流行性腹泻病毒(PEDV)检测方法,本研究从GenBank数据库中获取PEDV N基因序列,扩增出PEDV N基因标准质粒,并在N基因的保守区域内设计了一对特异性荧光定量引物,成功建立了SYBR Green I实时荧光定量PCR检测方法。经过一系列试验表明,该检测方法线性关系良好,R^(2)值为0.99;特异性强,敏感性高,最低可检测至2.23 copies/μL,比普通PCR灵敏约100倍;重复性好,组内变异系数为0.25%~0.43%,组间变异系数为0.67%~0.97%;对于各地区96份临床样品检测出PEDV阳性率为25%。本研究建立的实时荧光定量PCR检测方法为PEDV的临床诊断、流行病学调查以及定量研究提供了有效的检测工具。展开更多
根据克隆得到的迟缓爱德华氏菌gyrB基因序列设计并合成一对特异性引物,通用性和特异性检测结果显示所设计的引物具有良好的种间特异性和种内通用性,构建含gyrB基因的重组质粒作为标准品,经过反应体系优化后建立了检测迟缓爱德华氏菌的SY...根据克隆得到的迟缓爱德华氏菌gyrB基因序列设计并合成一对特异性引物,通用性和特异性检测结果显示所设计的引物具有良好的种间特异性和种内通用性,构建含gyrB基因的重组质粒作为标准品,经过反应体系优化后建立了检测迟缓爱德华氏菌的SYBR Green I实时荧光定量PCR检测方法。结果显示,该方法线性关系良好,在T m为63℃时,扩增产物的熔解曲线仅有一个单特异峰,扩增所得标准曲线为y=-3.32x+39.38,相关系数为0.998,扩增效率为1.00,最低能检测到60个拷贝。应用建立的方法对人工感染的大菱鲆病样进行了检测,3个被检样品均呈阳性反应,证明该方法具有较好的适用性。研究表明,所建立的实时荧光定量PCR方法具有特异、敏感、快速、定量的优点,可用于迟缓爱德华氏菌病的快速检测。展开更多
本研究根据牛传染性鼻气管炎病毒毒(IBRV)gB基因序列设计合成了引物,PCR扩增得到目的基因片段并克隆到PGM-T载体得到质粒标准品。通过对荧光定量PCR反应条件的优化,建立了SYBR Green I荧光定量PCR检测IBRV的方法。该方法的检测敏感性达...本研究根据牛传染性鼻气管炎病毒毒(IBRV)gB基因序列设计合成了引物,PCR扩增得到目的基因片段并克隆到PGM-T载体得到质粒标准品。通过对荧光定量PCR反应条件的优化,建立了SYBR Green I荧光定量PCR检测IBRV的方法。该方法的检测敏感性达到360copies/25μL,并具有较好的重复性和特异性。本试验方法的建立对于加强进出口牛IBRV的检验检疫具有十分重要的意义。展开更多
为建立猪繁殖与呼吸综合征病毒（PRRSV）SYBR Green I实时荧光定量PCR检测方法，采用RT—PCR扩增PRRSVN基因266bp片段，并克隆到pMD18-T载体中，以纯化的重组质粒为模板进行荧光定量PCR扩增，建立了PRRSV荧光定量PCR检测方法，该方法检...为建立猪繁殖与呼吸综合征病毒（PRRSV）SYBR Green I实时荧光定量PCR检测方法，采用RT—PCR扩增PRRSVN基因266bp片段，并克隆到pMD18-T载体中，以纯化的重组质粒为模板进行荧光定量PCR扩增，建立了PRRSV荧光定量PCR检测方法，该方法检测灵敏度可达1．3×101拷贝／uL，与猪瘟病毒（CSFV）、猪传染性胃肠炎病毒（TGEV）、猪流行性腹泻病毒（PEDV）和猪日本脑炎病毒（JEV）均不发生交叉反应，具有很好的特异性和重复性。展开更多
【目的】建立基于SYBR Green I嵌合染料法的灌溉水源中沙门氏菌实时荧光定量PCR(Quantitative Real-time PCR,qPCR)检测方法。【方法】以沙门氏菌侵袭蛋白A(invA)基因为靶基因,设计1对特异性qPCR检测引物,在对qPCR反应体系和反应条件进...【目的】建立基于SYBR Green I嵌合染料法的灌溉水源中沙门氏菌实时荧光定量PCR(Quantitative Real-time PCR,qPCR)检测方法。【方法】以沙门氏菌侵袭蛋白A(invA)基因为靶基因,设计1对特异性qPCR检测引物,在对qPCR反应体系和反应条件进行优化后,通过特异性实验和灵敏度实验对qPCR方法进行验证,并制作灌溉水源中沙门氏菌qPCR定量标准曲线,最后与国标方法对比检测灌溉水源中沙门氏菌污染来验证该方法的准确性。【结果】经过优化的qPCR检测方法灵敏度检测结果显示最低检测限量为1×10^(−1)pg·μL^(−1),特异性检测结果显示具有良好的特异性,干扰菌株对本qPCR检测方法无影响,所制作的qPCR扩增标准曲线在2×100~2×10^(5)cfu·mL^(−1)有较好的线性关系,相关系数为0.9996,能对沙门氏菌进行准确的定量分析。该方法在与国标方法对比检测灌溉水源中沙门氏菌污染时具有同等准确性。【结论】本研究建立的基于SYBR Green I嵌合荧光法的实时荧光定量PCR检测方法,可以满足灌溉水源中沙门氏菌的定量检测要求。展开更多
文摘Lyon IARC多瘤病毒(LIPyV)是2017年于人类皮肤样本中新发现的病毒,为更加了解其致病性和流行病学状况,本试验拟建立一种灵敏度高、可快速检测LIPyV的SYBR Green I实时荧光定量PCR方法,并对该方法的特异性、灵敏性和重复性进行评价。结果显示:该检测方法的Ct值与标准品模板线性关系良好,相关系数为0.9989;利用该方法检测CBoV、FBoV、AGV2这几种病毒的基因组均没有出现非特异性扩增;敏感性比普通PCR检测方法高100倍;组内和组间重复性试验的变异系数小于1%;通过60份样本检测发现LIPyV阳性率为6.67%,比普通PCR更灵敏可靠。结果表明,本试验建立的SYBR Green I实时荧光定量PCR方法可用于LIPyV的快速检测。
文摘根据克隆得到的迟缓爱德华氏菌gyrB基因序列设计并合成一对特异性引物,通用性和特异性检测结果显示所设计的引物具有良好的种间特异性和种内通用性,构建含gyrB基因的重组质粒作为标准品,经过反应体系优化后建立了检测迟缓爱德华氏菌的SYBR Green I实时荧光定量PCR检测方法。结果显示,该方法线性关系良好,在T m为63℃时,扩增产物的熔解曲线仅有一个单特异峰,扩增所得标准曲线为y=-3.32x+39.38,相关系数为0.998,扩增效率为1.00,最低能检测到60个拷贝。应用建立的方法对人工感染的大菱鲆病样进行了检测,3个被检样品均呈阳性反应,证明该方法具有较好的适用性。研究表明,所建立的实时荧光定量PCR方法具有特异、敏感、快速、定量的优点,可用于迟缓爱德华氏菌病的快速检测。
文摘本研究根据牛传染性鼻气管炎病毒毒(IBRV)gB基因序列设计合成了引物,PCR扩增得到目的基因片段并克隆到PGM-T载体得到质粒标准品。通过对荧光定量PCR反应条件的优化,建立了SYBR Green I荧光定量PCR检测IBRV的方法。该方法的检测敏感性达到360copies/25μL,并具有较好的重复性和特异性。本试验方法的建立对于加强进出口牛IBRV的检验检疫具有十分重要的意义。
文摘为建立猪繁殖与呼吸综合征病毒（PRRSV）SYBR Green I实时荧光定量PCR检测方法，采用RT—PCR扩增PRRSVN基因266bp片段，并克隆到pMD18-T载体中，以纯化的重组质粒为模板进行荧光定量PCR扩增，建立了PRRSV荧光定量PCR检测方法，该方法检测灵敏度可达1．3×101拷贝／uL，与猪瘟病毒（CSFV）、猪传染性胃肠炎病毒（TGEV）、猪流行性腹泻病毒（PEDV）和猪日本脑炎病毒（JEV）均不发生交叉反应，具有很好的特异性和重复性。
文摘【目的】建立基于SYBR Green I嵌合染料法的灌溉水源中沙门氏菌实时荧光定量PCR(Quantitative Real-time PCR,qPCR)检测方法。【方法】以沙门氏菌侵袭蛋白A(invA)基因为靶基因,设计1对特异性qPCR检测引物,在对qPCR反应体系和反应条件进行优化后,通过特异性实验和灵敏度实验对qPCR方法进行验证,并制作灌溉水源中沙门氏菌qPCR定量标准曲线,最后与国标方法对比检测灌溉水源中沙门氏菌污染来验证该方法的准确性。【结果】经过优化的qPCR检测方法灵敏度检测结果显示最低检测限量为1×10^(−1)pg·μL^(−1),特异性检测结果显示具有良好的特异性,干扰菌株对本qPCR检测方法无影响,所制作的qPCR扩增标准曲线在2×100~2×10^(5)cfu·mL^(−1)有较好的线性关系,相关系数为0.9996,能对沙门氏菌进行准确的定量分析。该方法在与国标方法对比检测灌溉水源中沙门氏菌污染时具有同等准确性。【结论】本研究建立的基于SYBR Green I嵌合荧光法的实时荧光定量PCR检测方法,可以满足灌溉水源中沙门氏菌的定量检测要求。
