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一种面向不确定数据流的模体发现算法 被引量：3
1
作者 王菊 刘付显 +1 位作者 靳春杰 李祯东 《电子科技大学学报》 EI CAS CSCD 北大核心 2017年第1期81-87,共7页
借鉴生物信息学中序列模式发现思想,提出了基于MEME(multiple expectation-maximization for motif elicitation)的不确定数据流模体发现算法。该算法根据不确定数据流的特点,设计了不确定滑动窗口的简化计算方法,改进了SAX(symbolic ag... 借鉴生物信息学中序列模式发现思想,提出了基于MEME(multiple expectation-maximization for motif elicitation)的不确定数据流模体发现算法。该算法根据不确定数据流的特点,设计了不确定滑动窗口的简化计算方法,改进了SAX(symbolic aggregate approximation)的符号化策略,用防空反导情报传感器网络中的一组不确定数据流验证了其可行性,通过植入不同数目模体的方法测试了其准确性,并在元组存在概率为1的条件下与已有算法进行比较,验证其有效性。 展开更多
关键词 meme算法 模体发现 SAX 不确定数据流 不确定滑动窗口
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一种关于蛋白质模体的自动识别算法
2
作者 蔡振辉 戈晓斐 +1 位作者 胡磊 黄晓 《微机发展》 2004年第10期123-126,共4页
随着生物信息学的发展,模体识别已经成为一种能够从生物序列中提取有用生物信息的方法。文中介绍了有关模体的一些概念,讨论了模体识别算法(MEME)的基础,即EM(expectationmaximization)算法,由于MEME算法是建立在EM算法的基础上的,所以... 随着生物信息学的发展,模体识别已经成为一种能够从生物序列中提取有用生物信息的方法。文中介绍了有关模体的一些概念,讨论了模体识别算法(MEME)的基础,即EM(expectationmaximization)算法,由于MEME算法是建立在EM算法的基础上的,所以又由此引出了MEME算法,并对MEME算法的一些基本问题比如时间复杂度、算法性能等进行了详细讨论,对算法的局限性和有待改进的地方作了说明。实践证明,MEME是一个较好的模体识别算法,它能够识别出蛋白质或者DNA序列中单个或多个模体,具有很大的灵活性。 展开更多
关键词 模体 算法 最大期望值算法 meme算法
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