目的探讨靶向高通量测序(tNGS)在儿童呼吸道感染病原体筛查中的价值。方法回顾性分析2023年1至12月在温州市人民医院住院治疗的2449例呼吸道感染患儿,通过tNGS检测96种常见呼吸道病原体及15种耐药基因,分析病原体分布特征。结果共检测...目的探讨靶向高通量测序(tNGS)在儿童呼吸道感染病原体筛查中的价值。方法回顾性分析2023年1至12月在温州市人民医院住院治疗的2449例呼吸道感染患儿,通过tNGS检测96种常见呼吸道病原体及15种耐药基因,分析病原体分布特征。结果共检测出39种病原体,总检出率93.26%(2284/2449)。细菌检出率最高为卡他莫拉菌21.27%(521/2449);病毒检出率最高为鼻病毒21.85%(535/2449);非典型病原体检出率最高为肺炎支原体39.00%(955/2449)。病原体多重感染检出率为68.96%(1575/2284),以肺炎支原体合并鼻病毒感染最多,为14.86%(234/1575)。仅检测到大环内酯类耐药基因23S核蛋白体RNA(23S r RNA)突变797例,突变率83.46%(797/955),且不同年龄和病原体载量患儿23S rRNA基因突变率比较差异均有统计学意义(均P<0.01)。结论tNGS在临床上作为传统检测方法的一种补充性且必要的检测手段,相比传统培养敏感性更高,比聚合酶链比较反应法的靶标更全,比宏基因组高通量测序更经济,更适用于儿童病原学的初筛。展开更多
文摘目的探讨靶向高通量测序(tNGS)在儿童呼吸道感染病原体筛查中的价值。方法回顾性分析2023年1至12月在温州市人民医院住院治疗的2449例呼吸道感染患儿,通过tNGS检测96种常见呼吸道病原体及15种耐药基因,分析病原体分布特征。结果共检测出39种病原体,总检出率93.26%(2284/2449)。细菌检出率最高为卡他莫拉菌21.27%(521/2449);病毒检出率最高为鼻病毒21.85%(535/2449);非典型病原体检出率最高为肺炎支原体39.00%(955/2449)。病原体多重感染检出率为68.96%(1575/2284),以肺炎支原体合并鼻病毒感染最多,为14.86%(234/1575)。仅检测到大环内酯类耐药基因23S核蛋白体RNA(23S r RNA)突变797例,突变率83.46%(797/955),且不同年龄和病原体载量患儿23S rRNA基因突变率比较差异均有统计学意义(均P<0.01)。结论tNGS在临床上作为传统检测方法的一种补充性且必要的检测手段,相比传统培养敏感性更高,比聚合酶链比较反应法的靶标更全,比宏基因组高通量测序更经济,更适用于儿童病原学的初筛。