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题名葡萄HCT基因家族鉴定及其对低温胁迫的响应
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作者
颜伟
陈慧婷
叶青
刘广超
刘新
侯丽霞
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机构
青岛农业大学生命科学学院山东省高校植物生物技术重点实验室
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出处
《生物技术通报》
北大核心
2025年第2期175-186,共12页
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基金
山东省自然科学基金面上项目(ZR2023MC074)
青岛市自然科学基金原创探索项目(23-2-1-178-zyyd-jch)
山东省重点研发计划项目(2022LZGC0Y019)。
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文摘
【目的】羟基肉桂酰转移酶(hydroxycinnamoyl-CoA:shikimate hydroxycinnamoyl transferase,HCT)是双子叶植物中催化绿原酸合成的关键酶,广泛参与植物非生物胁迫应答。在葡萄全基因组中鉴定VvHCT基因家族成员,分析相关基因低温胁迫下表达模式,为后续研究提供理论基础。【方法】基于葡萄全基因组信息,利用生物信息学方法对VvHCT家族进行鉴定,并对家族成员理化性质、染色体分布、基因结构、蛋白保守结构、系统进化、启动子顺式作用元件以及组织表达特性进行分析,进一步利用荧光定量PCR检测VvHCT基因在低温胁迫下表达模式,最后通过瞬时转化方法对VvHCT8功能进行验证。【结果】在葡萄全基因组中鉴定到VvHCT的11个家族成员,编码398-457个氨基酸,分布于4条染色体上;按系统发育特征分为3个亚族;启动子顺式作用元件分析显示,VvHCT家族成员启动子上含有光响应元件、激素响应元件、应激响应元件、组织特异性元件和昼夜节律响应元件等;不同VvHCT家族成员表达模式存在较大差异;低温胁迫处理后VvHCT5表达量下调,其他10个家族成员表达量均上调;瞬时过表达葡萄叶片结果显示,VvHCT8能通过降低丙二醛和活性氧含量,缓解低温对葡萄叶片叶绿素和细胞膜的损伤。【结论】VvHCT8参与葡萄抵御低温过程,可作为葡萄抗寒候选基因。
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关键词
葡萄
vvhct基因家族
生物信息学
低温
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Keywords
grape
vvhct gene family
bioinformatics
low temperature
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分类号
S66
[农业科学—果树学]
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