目的探讨肺腺癌患者和肺移植供者下呼吸道内菌群变化。方法通过收集12例肺腺癌患者叶支气管及5例肺移植供者健康肺气管组织,提取肺部气道菌群DNA,对测序区域进行PCR扩增,构建文库后,利用Illumina Mi Seq测序平台,对细菌的16S r DNA基因V...目的探讨肺腺癌患者和肺移植供者下呼吸道内菌群变化。方法通过收集12例肺腺癌患者叶支气管及5例肺移植供者健康肺气管组织,提取肺部气道菌群DNA,对测序区域进行PCR扩增,构建文库后,利用Illumina Mi Seq测序平台,对细菌的16S r DNA基因V4区进行高通量测序,并对测序结果进行生物信息学分析。结果 (1)两组患者下呼吸道菌群以Proteobacteria,Firmicutes,Bacteroidetes和Acidobacteria菌门为主,菌属水平以Burkholderia、Sediminibacterium、Lactobacillus、Acinetobacter、Pseudomonas、Lactococcus、Caulobacter、Ralstonia属为主;(2)健康对照组(H)呼吸道内菌群α多样性要显著高于疾病组(DT),从Chao1和ACE指数上看,H组明显高于DT组(P<0.01)。两组在主要的菌门及菌属丰度两组间差异明显,Proteobacteria和Firmicutes在H组丰度明显高于DT组(P<0.01),Bacteroidetes和Acidobacteria在DT组丰度明显高于H组(P<0.01);Lactobacillus、Erysipelotrichaceae、Oscillospira、Caulobacter、Flavobacterium、Thermoactinomyces、Ruminococcus、Coprobacillus、Dorea等菌属在H组丰度明显高于DT组;(3)根据预测,菌群脂质及氨基酸等代谢功能在H对照组要高于DT组,能量及碳水化合物等代谢功能在DT组要高于H对照组。结论和健康肺相比,腺癌患者下呼吸道内菌群多样性下降,主要的菌门和菌属存在明显变化。展开更多
文摘目的探讨肺腺癌患者和肺移植供者下呼吸道内菌群变化。方法通过收集12例肺腺癌患者叶支气管及5例肺移植供者健康肺气管组织,提取肺部气道菌群DNA,对测序区域进行PCR扩增,构建文库后,利用Illumina Mi Seq测序平台,对细菌的16S r DNA基因V4区进行高通量测序,并对测序结果进行生物信息学分析。结果 (1)两组患者下呼吸道菌群以Proteobacteria,Firmicutes,Bacteroidetes和Acidobacteria菌门为主,菌属水平以Burkholderia、Sediminibacterium、Lactobacillus、Acinetobacter、Pseudomonas、Lactococcus、Caulobacter、Ralstonia属为主;(2)健康对照组(H)呼吸道内菌群α多样性要显著高于疾病组(DT),从Chao1和ACE指数上看,H组明显高于DT组(P<0.01)。两组在主要的菌门及菌属丰度两组间差异明显,Proteobacteria和Firmicutes在H组丰度明显高于DT组(P<0.01),Bacteroidetes和Acidobacteria在DT组丰度明显高于H组(P<0.01);Lactobacillus、Erysipelotrichaceae、Oscillospira、Caulobacter、Flavobacterium、Thermoactinomyces、Ruminococcus、Coprobacillus、Dorea等菌属在H组丰度明显高于DT组;(3)根据预测,菌群脂质及氨基酸等代谢功能在H对照组要高于DT组,能量及碳水化合物等代谢功能在DT组要高于H对照组。结论和健康肺相比,腺癌患者下呼吸道内菌群多样性下降,主要的菌门和菌属存在明显变化。
