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Cav1.2钙离子通道三维结构的同源建模及其应用
被引量:
4
1
作者
雷明
苏敬阳
+4 位作者
李卓
晏珊
孙雪菲
朱彤
郝丽英
《中国药理学通报》
CAS
CSCD
北大核心
2017年第1期90-94,共5页
目的构建心肌Cav1.2钙离子通道三维结构模型,检验模型的准确性与可靠性。方法利用SWISS-MODEL同源建模服务器,对豚鼠心肌细胞Cav1.2通道α1亚基进行同源建模,建模结果提交至加州大学蛋白质结构在线检测服务器进行检测评估,并对结构模型...
目的构建心肌Cav1.2钙离子通道三维结构模型,检验模型的准确性与可靠性。方法利用SWISS-MODEL同源建模服务器,对豚鼠心肌细胞Cav1.2通道α1亚基进行同源建模,建模结果提交至加州大学蛋白质结构在线检测服务器进行检测评估,并对结构模型进行打分。利用MOE软件分子对接程序模拟阻断剂或药物与Cav1.2通道模型的结合,进一步验证通道模型的准确性与可靠性。结果在SWISS-MODEL服务器上搜寻到的模板序列Cav1.1α1S与目标序列Cav1.2α1C均为L型钙通道,序列比对结果显示其同源性高达71.5%,选择自动模式(automated mode)进行同源建模。L型钙通道阻断剂维拉帕米、硝苯地平、地尔硫卓能结合到Cav1.2通道三维结构模型的特定区域,而钠通道特异性阻断剂河豚毒素并未与该模型相结合,中药有效成份白花前胡甲素和小檗碱与该模型也有一定的结合。结论成功构建了心肌Cav1.2钙离子通道三维结构模型,为后续研究提供了可靠样本,也为同源建模在研究离子通道三维结构预测中的应用奠定了基础。
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关键词
离子通道
三维结构
同源建模
MOE软件
L型钙通道阻断剂
分子对接
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职称材料
Cav1.2通道CT1片断突变体的质粒构建和蛋白表达
2
作者
雷明
赵美眯
+4 位作者
封瑞
王红梅
毛楠
朱彤
郝丽英
《中国医科大学学报》
CAS
CSCD
北大核心
2015年第9期837-839,843,共4页
目的构建心肌Cav1.2通道CT1片段及其突变体与谷胱甘肽转移酶(GST)重组的融合蛋白原核表达载体,并进行蛋白表达和纯化。方法以豚鼠Cav1.2通道CT1质粒(p GEX-6p-3/CT1)为模板,采用定点突变技术构建CT1 T1603A和CT1 T1603D两种突变体质粒...
目的构建心肌Cav1.2通道CT1片段及其突变体与谷胱甘肽转移酶(GST)重组的融合蛋白原核表达载体,并进行蛋白表达和纯化。方法以豚鼠Cav1.2通道CT1质粒(p GEX-6p-3/CT1)为模板,采用定点突变技术构建CT1 T1603A和CT1 T1603D两种突变体质粒。转化大肠杆菌BL21感受态细胞,大量培养后用IPTG诱导GST融合蛋白表达,分离纯化后采用SDS-PAGE检测CT1及其突变体蛋白的相对分子量和纯度。结果 CT1片段及其突变体融合蛋白得到了正确、大量表达,提取纯化后的CT1片段及其突变体融合蛋白具有较高的纯度。结论成功构建了Cav1.2通道CT1片断及其突变体融合蛋白原核表达载体,获得了CT1突变体融合蛋白,为深入研究CT1片断在Cav1.2通道调节中的作用和机制奠定基础。
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关键词
融合蛋白
CT1
突变体
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职称材料
题名
Cav1.2钙离子通道三维结构的同源建模及其应用
被引量:
4
1
作者
雷明
苏敬阳
李卓
晏珊
孙雪菲
朱彤
郝丽英
机构
中国医科
大学
药学院药物毒理
教研室
东北大学环境生物学教研室
出处
《中国药理学通报》
CAS
CSCD
北大核心
2017年第1期90-94,共5页
基金
国家自然科学基金资助项目(No 31471091)
文摘
目的构建心肌Cav1.2钙离子通道三维结构模型,检验模型的准确性与可靠性。方法利用SWISS-MODEL同源建模服务器,对豚鼠心肌细胞Cav1.2通道α1亚基进行同源建模,建模结果提交至加州大学蛋白质结构在线检测服务器进行检测评估,并对结构模型进行打分。利用MOE软件分子对接程序模拟阻断剂或药物与Cav1.2通道模型的结合,进一步验证通道模型的准确性与可靠性。结果在SWISS-MODEL服务器上搜寻到的模板序列Cav1.1α1S与目标序列Cav1.2α1C均为L型钙通道,序列比对结果显示其同源性高达71.5%,选择自动模式(automated mode)进行同源建模。L型钙通道阻断剂维拉帕米、硝苯地平、地尔硫卓能结合到Cav1.2通道三维结构模型的特定区域,而钠通道特异性阻断剂河豚毒素并未与该模型相结合,中药有效成份白花前胡甲素和小檗碱与该模型也有一定的结合。结论成功构建了心肌Cav1.2钙离子通道三维结构模型,为后续研究提供了可靠样本,也为同源建模在研究离子通道三维结构预测中的应用奠定了基础。
关键词
离子通道
三维结构
同源建模
MOE软件
L型钙通道阻断剂
分子对接
Keywords
ion channels
3D structure
homology modeling
MOE software
L-type calcium channel blocker
molecular docking
分类号
R322.11 [医药卫生—人体解剖和组织胚胎学]
R329.25 [医药卫生—人体解剖和组织胚胎学]
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职称材料
题名
Cav1.2通道CT1片断突变体的质粒构建和蛋白表达
2
作者
雷明
赵美眯
封瑞
王红梅
毛楠
朱彤
郝丽英
机构
中国医科
大学
药学院药物毒理学
教研室
东北大学环境生物学教研室
出处
《中国医科大学学报》
CAS
CSCD
北大核心
2015年第9期837-839,843,共4页
基金
国家自然科学基金(31071004)
文摘
目的构建心肌Cav1.2通道CT1片段及其突变体与谷胱甘肽转移酶(GST)重组的融合蛋白原核表达载体,并进行蛋白表达和纯化。方法以豚鼠Cav1.2通道CT1质粒(p GEX-6p-3/CT1)为模板,采用定点突变技术构建CT1 T1603A和CT1 T1603D两种突变体质粒。转化大肠杆菌BL21感受态细胞,大量培养后用IPTG诱导GST融合蛋白表达,分离纯化后采用SDS-PAGE检测CT1及其突变体蛋白的相对分子量和纯度。结果 CT1片段及其突变体融合蛋白得到了正确、大量表达,提取纯化后的CT1片段及其突变体融合蛋白具有较高的纯度。结论成功构建了Cav1.2通道CT1片断及其突变体融合蛋白原核表达载体,获得了CT1突变体融合蛋白,为深入研究CT1片断在Cav1.2通道调节中的作用和机制奠定基础。
关键词
融合蛋白
CT1
突变体
Keywords
fusion protein
CT1
mutant
分类号
R966 [医药卫生—药理学]
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职称材料
题名
作者
出处
发文年
被引量
操作
1
Cav1.2钙离子通道三维结构的同源建模及其应用
雷明
苏敬阳
李卓
晏珊
孙雪菲
朱彤
郝丽英
《中国药理学通报》
CAS
CSCD
北大核心
2017
4
在线阅读
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职称材料
2
Cav1.2通道CT1片断突变体的质粒构建和蛋白表达
雷明
赵美眯
封瑞
王红梅
毛楠
朱彤
郝丽英
《中国医科大学学报》
CAS
CSCD
北大核心
2015
0
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职称材料
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