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植物基因组表达序列标签(EST)计划研究进展 被引量:84
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作者 骆蒙 贾继增 《生物化学与生物物理进展》 SCIE CAS CSCD 北大核心 2001年第4期494-497,共4页
植物表达序列标签 (EST)计划是随机挑选cDNA克隆 ,并对其 3′或 5′端进行大规模一次性测序 ,将得到的 15 0~ 5 0 0bp长度的DNA片段与数据库中的序列进行比较 ,获得对基因组结构、组织、表达等认识的基因组研究策略 .就近年来国际植物... 植物表达序列标签 (EST)计划是随机挑选cDNA克隆 ,并对其 3′或 5′端进行大规模一次性测序 ,将得到的 15 0~ 5 0 0bp长度的DNA片段与数据库中的序列进行比较 ,获得对基因组结构、组织、表达等认识的基因组研究策略 .就近年来国际植物EST计划的实施情况、植物EST计划的研究范围、生物信息学在EST研究中的应用、EST数据库及查询。 展开更多
关键词 植物基因组 表达序列标签 生物信息学
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小麦抗白粉病侵染初期的表达序列标签分析 被引量:21
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作者 骆蒙 孔秀英 +2 位作者 霍纳新 周荣华 贾继增 《Acta Genetica Sinica》 SCIE CAS CSCD 北大核心 2002年第6期525-530,共6页
以抗白粉病品系“百农 32 17×Mardler” BC5F4为材料 ,构建了一个白粉病菌接种初期的抑制消减杂交cDNA文库 ,测序获得 76 0条ESTs。与GenBank序列进行BLASTx分析 ,获功能已知ESTs 2 71条。通过分析抗病相关基因 ,推测G蛋白介导的... 以抗白粉病品系“百农 32 17×Mardler” BC5F4为材料 ,构建了一个白粉病菌接种初期的抑制消减杂交cDNA文库 ,测序获得 76 0条ESTs。与GenBank序列进行BLASTx分析 ,获功能已知ESTs 2 71条。通过分析抗病相关基因 ,推测G蛋白介导的信号传导途径、SA信号传递系统、MAP相关信号传递系统等参与了小麦抗白粉病过程。SAR基因在抗病相关ESTs中的种类与数量最多。数据显示苯丙烷代谢途径、细胞壁结构修饰作用、细胞保卫机制参与了抗病过程。未知功能ESTs与GenBank序列进行BLASTn分析 ,其中许多与病原菌、非病原菌诱导cDNA文库来源的ESTs同源 ;新ESTs占全部ESTs的 16 6 %。 展开更多
关键词 小麦 抗白粉病 侵染初期 表达序列标签 消减抑制杂交 抗病相关EST
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小麦白粉病抗性QTL分析 被引量:18
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作者 霍纳新 周荣华 +1 位作者 张丽芳 贾继增 《作物学报》 CAS CSCD 北大核心 2005年第6期692-696,共5页
本研究以国际小麦作图组织提供的(W7984×Opata85)重组近交群体为材料,2001-2002年对其亲本和114个株系进行了人工接种条件下的抗白粉病鉴定,并利用基于混合线性模型的复合区间作图软件QTLMAPER,进行了抗白粉病QTL分析,共检测到3个... 本研究以国际小麦作图组织提供的(W7984×Opata85)重组近交群体为材料,2001-2002年对其亲本和114个株系进行了人工接种条件下的抗白粉病鉴定,并利用基于混合线性模型的复合区间作图软件QTLMAPER,进行了抗白粉病QTL分析,共检测到3个与小麦白粉病抗性相关的加性QTL,分别位于3B、5D、7D染色体上,可以解释42.8%的表型变异。其中位于7D染色体的QTL贡献最大,可解释抗性变异的29.6%。另有2对互作基因可以解释12.0%的表型变异。 展开更多
关键词 小麦 白粉病 QTL
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几种cDNA差减文库构建方法的比较 被引量:12
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作者 骆蒙 孔秀英 贾继增 《生物技术通报》 CAS CSCD 2000年第6期14-15,共2页
cDNA差减文库的构建是研究基因差异表达、缩小目的基因筛选范围的理想方法。近年来报道了多种构建方法 ,并形成了两个发展趋势 ,但目前还无一种方法被普遍认可。现就几种常见方法的原理、思路及优缺点进行了比较 ,以供借鉴。
关键词 差减文库 差减杂交 策略 CDNA 构建方法
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用抑制差减杂交法分离小麦幼苗水分胁迫诱导表达的cDNA 被引量:13
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作者 王转 贾晋平 景蕊莲 《生物技术通报》 CAS CSCD 2003年第5期36-39,共4页
小麦种子水培 ,幼苗长至一叶一心后 ,在 2 0℃生长箱中水培 4 8h作为对照组 (Driver) ,PEG 6 0 0 0水溶液胁迫培养 4 8h作为处理组 (Tester)。进行抑制差减杂交 ,构建包含 15 0 0个独立克隆的SSH文库。以正向和反向差减杂交后的cDNA为探... 小麦种子水培 ,幼苗长至一叶一心后 ,在 2 0℃生长箱中水培 4 8h作为对照组 (Driver) ,PEG 6 0 0 0水溶液胁迫培养 4 8h作为处理组 (Tester)。进行抑制差减杂交 ,构建包含 15 0 0个独立克隆的SSH文库。以正向和反向差减杂交后的cDNA为探针 ,筛选SSH文库 ,得到 181个阳性克隆 ,测序后获不重复EST 10 1个。 展开更多
关键词 差减杂交 小麦 幼苗 水分胁迫 诱导表达 CDNA
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山羊草属五个基本基因组系统发育的RAPD分析 被引量:9
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作者 孔秀英 葛春民 +1 位作者 贾继增 董玉琛 《Acta Botanica Sinica》 CSCD 1999年第4期393-397,共5页
利用RAPD技术,从OPE、OPF、OPG、OPU、OPX、OPY和OPZ共7组随机引物中筛选出28个能产生基因组特异带的稳定引物,对山羊草属(AegilopsL.)的5个基本基因组及普通小麦“中国春”的DNA进行随... 利用RAPD技术,从OPE、OPF、OPG、OPU、OPX、OPY和OPZ共7组随机引物中筛选出28个能产生基因组特异带的稳定引物,对山羊草属(AegilopsL.)的5个基本基因组及普通小麦“中国春”的DNA进行随机扩增,根据扩增的488条DNA片段绘制出系统发育图。普通小麦ABD基因组与S基因组亲缘关系最近,C与U基因组具有比较近的亲缘关系。 展开更多
关键词 山羊草属 基因组 RAPD 系统发育
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Analysis of Resistance to Powdery Mildew in Wheat Based on Expressed Sequence Tags (EST) Technique 被引量:4
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作者 骆蒙 孔秀英 +3 位作者 姜涛 贾川 周荣华 贾继增 《Acta Botanica Sinica》 CSCD 2002年第5期567-572,共6页
Powdery mildew is a serious disease of wheat in China. As part of ITEC (International Triteace EST cooperation), EST (expressed sequence tags) technique was used to explore the gene expression in leaf induced by Ery... Powdery mildew is a serious disease of wheat in China. As part of ITEC (International Triteace EST cooperation), EST (expressed sequence tags) technique was used to explore the gene expression in leaf induced by Erysiphe graminis DC. A conventional cDNA library was constructed, and a total of 1 500 clones picked randomly from the library were sequenced, three hundred and eighty_seven ESTs of them were unique, which got the Accession Number in GenBank. About 49.4% ESTs showed significant similarity to functions of known sequences in GenBank. There are 196 ESTs' with functions not able to be determined, and eighty_four ESTs were demonstrated to be novel sequences. High_density dot membranes from unique clones were produced, and several disease resistance related genes were screened by differential hybridization. 展开更多
关键词 WHEAT Erysiphe graminis expressed sequence tags disease resistance gene
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Construction and Characterization of a Bacterial Artificial Chromosome Library for Triticum boeoticum 被引量:5
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作者 陈凡国 张学勇 +1 位作者 夏光敏 贾继增 《Acta Botanica Sinica》 CSCD 2002年第4期451-456,共6页
A bacterial artificial chromosome library has been constructed for Triticum boeoticum Boiss (A bA b) using the bacterial artificial chromosome (BAC) vector pECBAC1. The library consists of about 170 000 clones. A ... A bacterial artificial chromosome library has been constructed for Triticum boeoticum Boiss (A bA b) using the bacterial artificial chromosome (BAC) vector pECBAC1. The library consists of about 170 000 clones. A random sampling analysis of 200 BAC clones indicates that the average insert size is 104 kb. Based on the genome size of T. boeoticum, the library is about three times as large as T. boeoticum haploid genome (5 600 Mb). Screening the BAC library with cpDNA sequence psbA gene and mtDNA sequence atp6 gene as probe shows that contamination of the library with chloroplast and mitochondrial clones is less than 1%. The library will be a useful platform in gene clone and genomic research of wheat. 展开更多
关键词 Triticum boeoticum BAC library GENOME
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用微卫星标记辅助鉴定几种小麦缺体—四体 被引量:4
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作者 李永强 何蓓如 +2 位作者 陈小燕 张凯 周荣华 《西北农业学报》 CAS CSCD 北大核心 2006年第3期9-11,共3页
用已准确定位到小麦染色体上的部分SSR标记辅助鉴定3个中国春缺体-四体材料:N2AT2B、N2BT2D、N2DT2A。以中国春小麦为对照,首先选用缺失染色体上的SSR引物,PCR扩增结果表明3个材料均缺失该对染色体;进一步用分布于小麦21条染色体上的SS... 用已准确定位到小麦染色体上的部分SSR标记辅助鉴定3个中国春缺体-四体材料:N2AT2B、N2BT2D、N2DT2A。以中国春小麦为对照,首先选用缺失染色体上的SSR引物,PCR扩增结果表明3个材料均缺失该对染色体;进一步用分布于小麦21条染色体上的SSR引物进行PCR扩增,发现除缺失染色体外的其余染色体均有扩增,说明该材料至少有其余20对染色体中的每一条;最后用缺体-四体材料对24个新开发未知位点的EST-SSRs标记进行染色体定位,结果其中10个EST-SSRs位点被分别定位在小麦2A、2B、2D染色体上。 展开更多
关键词 小麦 缺体-四体 SSRs标记
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用差减抑制杂交方法鉴定太谷核不育小麦花药败育过程中的特异表达基因 被引量:5
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作者 常青山 周荣华 +1 位作者 余增亮 贾继增 《高技术通讯》 EI CAS CSCD 2003年第3期30-33,共4页
以太谷核不育小麦败育花药为对照群体 ,可育花药为目标群体 ,进行抑制差减杂交。用经过败育花药差减的可育花药cDNA群体构建了一个差减抑制杂交文库。结果显示 ,插入片段的大小主要集中在 30 0~ 5 0 0bp之间。随机选取 8个克隆进行Nort... 以太谷核不育小麦败育花药为对照群体 ,可育花药为目标群体 ,进行抑制差减杂交。用经过败育花药差减的可育花药cDNA群体构建了一个差减抑制杂交文库。结果显示 ,插入片段的大小主要集中在 30 0~ 5 0 0bp之间。随机选取 8个克隆进行Northern杂交分析 ,结果其中 7个克隆在可育花药和不育花药之间的表达存在差异。对其中 16个插入cDNA片段测序后与GenBank同源性比较表明 ,共获得未重复序列 13条 ,占81% ,其中与已知功能基因同源的 3条 ,与EST库中的序列同源的 7条 ,新的cDNA片段 3条。 展开更多
关键词 差减抑制杂交方法 鉴定 太谷核不育小麦 花药 败育过程 特异表达基因 SSH技术 Northern杂交
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