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合成生物学:开启生命科学“会聚”研究新时代 被引量：78
1
作者 赵国屏 《中国科学院院刊》 CSCD 北大核心 2018年第11期1135-1149,共15页
自然科学各学科的研究对象在时空尺度上的差别与相连,既决定了学科间的差别,也决定了学科间的交叉。生物学在发展到以机理研究为主的"生命科学"阶段后,得益于学科交叉和技术创新,在20世纪"分子生物学"和"基因... 自然科学各学科的研究对象在时空尺度上的差别与相连,既决定了学科间的差别,也决定了学科间的交叉。生物学在发展到以机理研究为主的"生命科学"阶段后,得益于学科交叉和技术创新,在20世纪"分子生物学"和"基因组学"革命基础上,通过引入工程学理念,形成了"合成生物学",并迅速形成"会聚研究"的第三次革命。文章在阐述合成生物学的内涵并回顾其学科发展历程与取得成果的基础上,特别提出了合成生物学的科技支撑与社会治理问题,期望引起科学界、社会公众与政府管理层面的关注。 展开更多
关键词 学科交叉 生命科学 工程学 分子生物学 社会治理
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建设微生物组大数据中心 发挥长期科学影响 被引量：2
2
作者 张国庆 宁康 +5 位作者 职晓阳 刘婉 徐萍 周豪魁 胡黔楠 赵国屏 《中国科学院院刊》 CSCD 2017年第3期280-289,共10页
宏基因组研究的思想与技术推动了微生物组的兴起,积累了丰富的微生物基因组以及健康、动植物和环境相关的微生物宏基因组数据,形成了具备一定规模和影响力的数据库、标准化方法与分析工具。大多数平台聚焦于为项目或特定类型的微生物菌... 宏基因组研究的思想与技术推动了微生物组的兴起,积累了丰富的微生物基因组以及健康、动植物和环境相关的微生物宏基因组数据,形成了具备一定规模和影响力的数据库、标准化方法与分析工具。大多数平台聚焦于为项目或特定类型的微生物菌群提供数据支撑,难以满足更深入全面的微生物生物学研究需求。文章建议采用综合聚焦微生物分类单元总和的微生物系统组与聚焦特定生态位微生物种群总和的微生物组的思路,建设综合性的微生物组数据仓库,整合微生物分类、进化、生态以及相关"组学"数据与信息。在此基础上,进一步综合生命科学基础研究和系统合成生物学研究的数据,支撑经高水平质控的综合性参考数据库、标准化的拼接与注释以及一流的数据汇交、搜索分享、深度学习和分析挖掘方法的研究开发。由此,亦将进一步集成大型微生物组项目的元数据及数据,形成数据综合完整、管理安全高效,服务功能完备的微生物组大数据中心。 展开更多
关键词 微生物组 微生物系统组 分类 生态 合成生物学
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宏基因组大数据分析的质量控制流程规范 被引量：5
3
作者 郑广勇 杨桢 +3 位作者 曹瑞芳 刘婉 李亦学 张国庆 《大数据》 2018年第3期1-12,共12页
宏基因组数据具有数据量大、复杂度高的特点,从数据类型来看,其涵盖了元数据和测序数据。为了保证宏基因组数据后续功能分析的有效性和正确性,需要对这些元数据和测序数据进行严格的质量控制检测。详细描述了宏基因组数据的质量控制流程... 宏基因组数据具有数据量大、复杂度高的特点,从数据类型来看,其涵盖了元数据和测序数据。为了保证宏基因组数据后续功能分析的有效性和正确性,需要对这些元数据和测序数据进行严格的质量控制检测。详细描述了宏基因组数据的质量控制流程,包括元数据和测序数据的信息检查、低质量片段的过滤等过程,从而为宏基因组数据分析提供了预处理的规范,这将为微生物组大数据分析提供坚实的基础。 展开更多
关键词 微生物组 宏基因组 大数据分析 二代测序 质量控制
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