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变性梯度凝胶电泳检测阴道菌群实验方法的建立及优化
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作者 高维娇 陈霄迟 高雨农 《中国病原生物学杂志》 CSCD 北大核心 2014年第5期417-421,共5页
目的建立并优化应用变性梯度凝胶电泳(DGGE)检测阴道菌群的技术路线。方法2011年5~6月存北京大学肿瘤医院妇科门诊就诊的16名成年女性,其中6名女性取阴道穹隆分泌物,10名女性分别取阴道中段和阴道穹窿部分泌物,提取阴道菌群总DNA... 目的建立并优化应用变性梯度凝胶电泳(DGGE)检测阴道菌群的技术路线。方法2011年5~6月存北京大学肿瘤医院妇科门诊就诊的16名成年女性,其中6名女性取阴道穹隆分泌物,10名女性分别取阴道中段和阴道穹窿部分泌物,提取阴道菌群总DNA,采用巢式聚合酶链式反应扩增细菌16SrRNA基因的V2V3可变区,DNA扩增产物分别在30%~60%和40%~70%浓度梯度变性凝胶下进行DGGE。结果DGGE图像分析显示阴道中段和阴道穹窿分泌物阴道菌群构成相同,平均条带数为2.5,差异无统计学意义(P〉0.05)。变性凝胶浓度梯度为30%~60%时,阴道菌群的DGGE图像中各条带较分散,易于条带识别和分析,但有部分条带电泳出凝胶范围;变性凝胶浓度梯度为40%~70%时,阴道菌群的DGGE条带密集但均较清晰。结论巢式聚合酶链式反应与DGGE相结合具有高效、快速、精确的特点,可用于阴道菌群检测。 展开更多
关键词 聚合酶链式反应 变性梯度凝胶电泳 阴道菌群
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SELEX技术筛选变形链球菌UA159适配子可行性的研究 被引量:2
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作者 黄博 彭磊 +2 位作者 王帅 刘筱娣 郭丽宏 《现代生物医学进展》 CAS 2012年第21期4001-4005,共5页
目的:研究SELEX技术用于筛选口腔致龋菌适配子的可行性。方法:化学合成长度为35mer的随机ssDNA文库,利用SE-LEX技术,分别以变形链球菌UA159(以下简称变链UA159)、乳杆菌和离心管作为靶物质,筛选适配子,不对称PCR扩增筛选产物,所得适配... 目的:研究SELEX技术用于筛选口腔致龋菌适配子的可行性。方法:化学合成长度为35mer的随机ssDNA文库,利用SE-LEX技术,分别以变形链球菌UA159(以下简称变链UA159)、乳杆菌和离心管作为靶物质,筛选适配子,不对称PCR扩增筛选产物,所得适配子进行克隆、测序,分析其二级结构,并对其二级结构进行了初步分析。结果:显示各个靶物质的筛选产物在第二轮筛选时就已经表现出具有特征性的二级结构。结论:SELEX技术可以用于口腔致龋菌适配子的筛选。 展开更多
关键词 SELEX 变形链球菌UA159 乳杆菌 适配子 二级结构
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