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裂分适配体传感器在小分子检测领域中的应用
被引量:
1
1
作者
姜岩
孙岐峰
杨咏洁
《分析试验室》
EI
CAS
CSCD
北大核心
2023年第8期1116-1126,共11页
裂分适配体(SPA)传感器是由2条或以上的寡核苷酸序列组装而成的一种新型生物传感装置。该装置必须在特异性靶标诱导下才能被成功组装,可以避免假阳性结果,故具有高度的特异性和灵敏度。SPA适用于各类型靶标的检测,尤其是小分子靶标,展...
裂分适配体(SPA)传感器是由2条或以上的寡核苷酸序列组装而成的一种新型生物传感装置。该装置必须在特异性靶标诱导下才能被成功组装,可以避免假阳性结果,故具有高度的特异性和灵敏度。SPA适用于各类型靶标的检测,尤其是小分子靶标,展现了极大的优势和潜力。然而,SPA传感器的开发及应用也极具挑战性,特别是如何改善SPA-靶标复合体的稳定性是目前主要难点。本文对SPA、裂分策略及其应用于小分子检测的研究现状进行了综述,以期为开发新型灵敏且特异的适配体传感器提供思路。
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关键词
裂分适配体
裂分策略
小分子化合物
生物传感器
原文传递
RUNX1-RUNX1T1融合转录本及WT1转录本水平检测的室间比对研究
被引量:
1
2
作者
秦亚溱
朱立文
+26 位作者
林樉
耿素霞
刘生伟
程辉
邬成业
肖敏
李小青
胡瑞萍
王丽丽
刘海燕
马道新
关涛
叶远馨
牛挺
岑建农
卢利莎
孙黎
杨同华
王云贵
李涛
王玥
李庆华
赵晓甦
李玲娣
陈文敏
龙玲玉
黄晓军
《中华血液学杂志》
CAS
CSCD
北大核心
2019年第11期889-894,共6页
目的通过室间比对了解国内RUNX1-RUNX1T1融合转录本及WT1转录本检测现状和真实表现。方法北京大学人民医院(简称PKUPH)制备比对样品,即用RUNX1-RUNX1T1(-)患者与RUNX1-RUNX1T1(+)患者新鲜骨髓/外周血有核细胞进行不同比例的稀释,制备出1...
目的通过室间比对了解国内RUNX1-RUNX1T1融合转录本及WT1转录本检测现状和真实表现。方法北京大学人民医院(简称PKUPH)制备比对样品,即用RUNX1-RUNX1T1(-)患者与RUNX1-RUNX1T1(+)患者新鲜骨髓/外周血有核细胞进行不同比例的稀释,制备出14种比对样本,每种样本各制备23份平行样本,加入TRIzol均质化后-70℃保存。各家中心采用RT-PCR技术同时检测各样本的RUNX1-RUNX1T1融合转录本及WT1转录本水平,统一以目的基因拷贝数/ABL拷贝数×100%的形式报告结果。通过Spearman相关分析计算各家中心与PKUPH检测结果之间的相关系数。结果①RUNX1-RUNX1T1比对:9份为阳性、5份为阴性样本,参与的20家实验室的假阳性率为5%(5/100),假阴性率为0(0/180)。每份阳性样本各家检测值均不相同,9份阳性样本各家报告的结果中位值为0.060%~176.7%,共覆盖3.5个log的范围,各份样本最高与最低报告结果的比值为5.5~12.3(去除1份明显偏离的结果)。85%(17/20)的实验室与PKUPH结果之间的相关系数≥0.98。②WT1比对:14份样本各家报告结果均不相同,中位值为0.16%~67.6%,覆盖2.6个log的范围,各样本检测最高值与最低值的比值为5.3~13.7.62%(13/21)的实验室与PKUPH结果的相关系数≥0.98。③两个转录本每家与PKUPH报告结果的相对关系不一致,2家均低于、7家均高于PKUPH,另11家为1个高于另一个低于PKUPH。结论同一样本各家中心报告的RUNX1-RUNX1T1及WT1转录本水平不同,大多数实验室与PKUPH报告的结果具有很高的一致性,实验室间不同转录本水平的相对关系不一定相同。
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关键词
融合蛋白质类
RUNX1-RUNX1T1
WT1
实时聚合酶链反应
室间比对
原文传递
题名
裂分适配体传感器在小分子检测领域中的应用
被引量:
1
1
作者
姜岩
孙岐峰
杨咏洁
机构
延边大学农学院食品与生物科学系
北京海思特医学检验实验室有限公司
出处
《分析试验室》
EI
CAS
CSCD
北大核心
2023年第8期1116-1126,共11页
基金
国家自然科学基金(31602126)
吉林省教育厅基金(JJKH20180901KJ)
+1 种基金
延边大学青年基金(602017020)
延边大学应用基础研究项目(602021007)资助。
文摘
裂分适配体(SPA)传感器是由2条或以上的寡核苷酸序列组装而成的一种新型生物传感装置。该装置必须在特异性靶标诱导下才能被成功组装,可以避免假阳性结果,故具有高度的特异性和灵敏度。SPA适用于各类型靶标的检测,尤其是小分子靶标,展现了极大的优势和潜力。然而,SPA传感器的开发及应用也极具挑战性,特别是如何改善SPA-靶标复合体的稳定性是目前主要难点。本文对SPA、裂分策略及其应用于小分子检测的研究现状进行了综述,以期为开发新型灵敏且特异的适配体传感器提供思路。
关键词
裂分适配体
裂分策略
小分子化合物
生物传感器
Keywords
split aptamers
split strategy
small molecules
biosensor
分类号
TS201.6 [轻工技术与工程—食品科学]
原文传递
题名
RUNX1-RUNX1T1融合转录本及WT1转录本水平检测的室间比对研究
被引量:
1
2
作者
秦亚溱
朱立文
林樉
耿素霞
刘生伟
程辉
邬成业
肖敏
李小青
胡瑞萍
王丽丽
刘海燕
马道新
关涛
叶远馨
牛挺
岑建农
卢利莎
孙黎
杨同华
王云贵
李涛
王玥
李庆华
赵晓甦
李玲娣
陈文敏
龙玲玉
黄晓军
机构
北京
大学人民医院
北京海思特医学检验实验室有限公司
大连医科大学附属第一医院血液科
广东省人民医院(广东省
医学
科学院)血液科
哈尔滨血液病肿瘤研究所
海军军医大学附属长海医院血液内科
河南省人民医院血液病研究所
华中科技大学同济
医学
院附属同济医院血液科
华中科技大学同济
医学
院附属协和医院干细胞中心
吉林大学第一医院血液科
解放军总医院第一
医学
中心血液病科
南通大学附属医院血液科
山东大学齐鲁医院血液科
山西省肿瘤医院血液科
四川大学华西医院
实验
医学
科
四川大学华西医院血液科
苏州大学附属第一医院
天津协和华美
医学
诊断技术
有限公司
武汉康圣达
医学
检验
所
有限公司
云南省第一人民医院血液科
浙江大学
医学
院附属第一医院血液科
郑州大学第一附属医院血液科
中国医科大学附属第一医院
中国
医学
科学院血液病医院(血液学研究所)
出处
《中华血液学杂志》
CAS
CSCD
北大核心
2019年第11期889-894,共6页
基金
国家自然科学基金(81870125)。
文摘
目的通过室间比对了解国内RUNX1-RUNX1T1融合转录本及WT1转录本检测现状和真实表现。方法北京大学人民医院(简称PKUPH)制备比对样品,即用RUNX1-RUNX1T1(-)患者与RUNX1-RUNX1T1(+)患者新鲜骨髓/外周血有核细胞进行不同比例的稀释,制备出14种比对样本,每种样本各制备23份平行样本,加入TRIzol均质化后-70℃保存。各家中心采用RT-PCR技术同时检测各样本的RUNX1-RUNX1T1融合转录本及WT1转录本水平,统一以目的基因拷贝数/ABL拷贝数×100%的形式报告结果。通过Spearman相关分析计算各家中心与PKUPH检测结果之间的相关系数。结果①RUNX1-RUNX1T1比对:9份为阳性、5份为阴性样本,参与的20家实验室的假阳性率为5%(5/100),假阴性率为0(0/180)。每份阳性样本各家检测值均不相同,9份阳性样本各家报告的结果中位值为0.060%~176.7%,共覆盖3.5个log的范围,各份样本最高与最低报告结果的比值为5.5~12.3(去除1份明显偏离的结果)。85%(17/20)的实验室与PKUPH结果之间的相关系数≥0.98。②WT1比对:14份样本各家报告结果均不相同,中位值为0.16%~67.6%,覆盖2.6个log的范围,各样本检测最高值与最低值的比值为5.3~13.7.62%(13/21)的实验室与PKUPH结果的相关系数≥0.98。③两个转录本每家与PKUPH报告结果的相对关系不一致,2家均低于、7家均高于PKUPH,另11家为1个高于另一个低于PKUPH。结论同一样本各家中心报告的RUNX1-RUNX1T1及WT1转录本水平不同,大多数实验室与PKUPH报告的结果具有很高的一致性,实验室间不同转录本水平的相对关系不一定相同。
关键词
融合蛋白质类
RUNX1-RUNX1T1
WT1
实时聚合酶链反应
室间比对
Keywords
Fusion protein,RUNX1-RUNX1T1
WT1
Real-time quantitative PCR
Interlaboratory comparison
分类号
R4 [医药卫生—临床医学]
原文传递
题名
作者
出处
发文年
被引量
操作
1
裂分适配体传感器在小分子检测领域中的应用
姜岩
孙岐峰
杨咏洁
《分析试验室》
EI
CAS
CSCD
北大核心
2023
1
原文传递
2
RUNX1-RUNX1T1融合转录本及WT1转录本水平检测的室间比对研究
秦亚溱
朱立文
林樉
耿素霞
刘生伟
程辉
邬成业
肖敏
李小青
胡瑞萍
王丽丽
刘海燕
马道新
关涛
叶远馨
牛挺
岑建农
卢利莎
孙黎
杨同华
王云贵
李涛
王玥
李庆华
赵晓甦
李玲娣
陈文敏
龙玲玉
黄晓军
《中华血液学杂志》
CAS
CSCD
北大核心
2019
1
原文传递
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