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水牛Novel-miR-57对Bcap-37和BMECs细胞DOK4基因的调控作用
被引量:
2
1
作者
蔡小艳
李雅辉
+6 位作者
鲍正潘
陈秋萍
李胜
周宇
邓凯
石德顺
刘庆友
《南方农业学报》
CAS
CSCD
北大核心
2021年第2期269-279,共11页
【目的】筛选Novel-miR-57调控靶基因,并明确其对靶基因的调控作用及生物功能,为揭示水牛乳腺上皮细胞(BMECs)的分化机理提供科学依据。【方法】利用MiRscan预测Novel-miR-57二级结构;以自编软件Ensembl(v80)注释的水牛mRNA截取3'-...
【目的】筛选Novel-miR-57调控靶基因,并明确其对靶基因的调控作用及生物功能,为揭示水牛乳腺上皮细胞(BMECs)的分化机理提供科学依据。【方法】利用MiRscan预测Novel-miR-57二级结构;以自编软件Ensembl(v80)注释的水牛mRNA截取3'-非翻译区(3'-UTR)作为预测数据库,采用Miranda(v3.3a)对Novel-miR-57进行靶基因预测;运用实时荧光定量PCR筛选重点靶基因。以化学合成的Novel-miR-57模拟物Mimics和抑制剂Inhibitor,分别转染人类乳腺癌细胞(Bcap-37)及BMECs细胞,以验证Novel-miR-57与靶基因的表达相关性。【结果】Novel-miR-57前体序列形成7个茎环结构,成熟序列位于第1、2和3个茎环结构间,其结合自由能为-53.70 kcal/mol。以结合自由能低于-20.00 kcal/mol为标准,最终筛选出34个可能的靶基因,共与42条KEGG信号通路存在关联,其富集的信号通路主要有代谢通路(ID:bta01100)、PI3K-Akt信号通路(ID:bta04151)、MAPK信号通路(ID:bta04010)和细胞因子—细胞因子受体相互作用(ID:bta04060)等;经实时荧光定量PCR检测分析发现DLX3、CANCNG3、DOK4、NFKBID、C17orf53、RTN1和FBXO10等7个靶基因在非泌乳期的相对表达量极显著高于泌乳期(P<0.01),二者间相差100.0倍以上,且与NovelmiR-57的相对表达量呈负相关。7个靶基因中仅DOK4基因与Novel-miR-57的表达具相关性,以200 nmol/L Inhibitor转染B-cap37细胞能显著提高DOK4基因表达(P<0.05,下同),添加100 nmol/L Mimics则显著抑制DOK4基因表达。以100 nmol/L Mimics转染BMECs细胞,Novel-miR-57和DOK4基因的相对表达量显著提高;而以200 nmol/L Inhibitor转染BMECs细胞,Novel-miR-57和DOK4基因的表达均受到显著抑制。【结论】Novel-miR-57含有7个茎环结构,且其成熟序列位于第1~3个茎环上。Novel-miR-57过表达可下调Bcap-37细胞DOK4基因表达或上调BMECs细胞DOK4基因表达,即Novel-miR-57对靶基因的调控作用因乳腺细胞生理状态不同而存在差异。
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关键词
水牛
Novel-miR-57
靶基因
BMECs细胞
Bcap-37细胞
调控作用
在线阅读
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职称材料
植物miR159靶向MYB基因家族的调控作用及其跨界调控哺乳动物生理功能的研究进展
被引量:
1
2
作者
段红娟
孟桂智
+4 位作者
刘宝宝
贾晶莹
马燕芬
马云
蔡小艳
《畜牧与饲料科学》
2022年第5期48-54,60,共8页
植物miR159靶向MYB基因家族在植物的生长发育、新陈代谢、逆境响应及病原防御等多种生理过程中发挥关键作用。植物miR159可以跨界调控哺乳动物的生理功能,如抑制肿瘤生长、改善能量代谢、抗氧化应激、调节机体免疫功能等。阐述了miR159...
植物miR159靶向MYB基因家族在植物的生长发育、新陈代谢、逆境响应及病原防御等多种生理过程中发挥关键作用。植物miR159可以跨界调控哺乳动物的生理功能,如抑制肿瘤生长、改善能量代谢、抗氧化应激、调节机体免疫功能等。阐述了miR159通过调控MYB基因家族参与多种植物营养生长、逆境胁迫、开花和果实发育过程,以及外源性植物miR159跨界调控哺乳动物生理功能和对乳腺癌的调控作用,以期为后续深入研究植物miR159的调控网络以及跨物种调控机制提供参考。
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关键词
miR159
MYB家族
跨界调控
生理功能
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职称材料
题名
水牛Novel-miR-57对Bcap-37和BMECs细胞DOK4基因的调控作用
被引量:
2
1
作者
蔡小艳
李雅辉
鲍正潘
陈秋萍
李胜
周宇
邓凯
石德顺
刘庆友
机构
宁夏大学农学院/宁夏反刍动物分子细胞育种重点实验室
广西
大学
/亚热带农业生物资源保护与利用国家
重点
实验室
出处
《南方农业学报》
CAS
CSCD
北大核心
2021年第2期269-279,共11页
基金
国家自然科学基金项目(31960680)
宁夏重点研发计划项目(2018BEB04031)。
文摘
【目的】筛选Novel-miR-57调控靶基因,并明确其对靶基因的调控作用及生物功能,为揭示水牛乳腺上皮细胞(BMECs)的分化机理提供科学依据。【方法】利用MiRscan预测Novel-miR-57二级结构;以自编软件Ensembl(v80)注释的水牛mRNA截取3'-非翻译区(3'-UTR)作为预测数据库,采用Miranda(v3.3a)对Novel-miR-57进行靶基因预测;运用实时荧光定量PCR筛选重点靶基因。以化学合成的Novel-miR-57模拟物Mimics和抑制剂Inhibitor,分别转染人类乳腺癌细胞(Bcap-37)及BMECs细胞,以验证Novel-miR-57与靶基因的表达相关性。【结果】Novel-miR-57前体序列形成7个茎环结构,成熟序列位于第1、2和3个茎环结构间,其结合自由能为-53.70 kcal/mol。以结合自由能低于-20.00 kcal/mol为标准,最终筛选出34个可能的靶基因,共与42条KEGG信号通路存在关联,其富集的信号通路主要有代谢通路(ID:bta01100)、PI3K-Akt信号通路(ID:bta04151)、MAPK信号通路(ID:bta04010)和细胞因子—细胞因子受体相互作用(ID:bta04060)等;经实时荧光定量PCR检测分析发现DLX3、CANCNG3、DOK4、NFKBID、C17orf53、RTN1和FBXO10等7个靶基因在非泌乳期的相对表达量极显著高于泌乳期(P<0.01),二者间相差100.0倍以上,且与NovelmiR-57的相对表达量呈负相关。7个靶基因中仅DOK4基因与Novel-miR-57的表达具相关性,以200 nmol/L Inhibitor转染B-cap37细胞能显著提高DOK4基因表达(P<0.05,下同),添加100 nmol/L Mimics则显著抑制DOK4基因表达。以100 nmol/L Mimics转染BMECs细胞,Novel-miR-57和DOK4基因的相对表达量显著提高;而以200 nmol/L Inhibitor转染BMECs细胞,Novel-miR-57和DOK4基因的表达均受到显著抑制。【结论】Novel-miR-57含有7个茎环结构,且其成熟序列位于第1~3个茎环上。Novel-miR-57过表达可下调Bcap-37细胞DOK4基因表达或上调BMECs细胞DOK4基因表达,即Novel-miR-57对靶基因的调控作用因乳腺细胞生理状态不同而存在差异。
关键词
水牛
Novel-miR-57
靶基因
BMECs细胞
Bcap-37细胞
调控作用
Keywords
buffalo
Novel-miR-57
target gene
BMECs cell
Bcap-37 cell
regulating effects
分类号
S823.83 [农业科学—畜牧学]
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职称材料
题名
植物miR159靶向MYB基因家族的调控作用及其跨界调控哺乳动物生理功能的研究进展
被引量:
1
2
作者
段红娟
孟桂智
刘宝宝
贾晶莹
马燕芬
马云
蔡小艳
机构
宁夏大学农学院/宁夏反刍动物分子细胞育种重点实验室
出处
《畜牧与饲料科学》
2022年第5期48-54,60,共8页
基金
国家自然科学基金项目(31960680)
宁夏回族自治区重点研发计划项目(引才专项)(2018BEB04031)
宁夏大学引进人才科研启动费(30900002218)。
文摘
植物miR159靶向MYB基因家族在植物的生长发育、新陈代谢、逆境响应及病原防御等多种生理过程中发挥关键作用。植物miR159可以跨界调控哺乳动物的生理功能,如抑制肿瘤生长、改善能量代谢、抗氧化应激、调节机体免疫功能等。阐述了miR159通过调控MYB基因家族参与多种植物营养生长、逆境胁迫、开花和果实发育过程,以及外源性植物miR159跨界调控哺乳动物生理功能和对乳腺癌的调控作用,以期为后续深入研究植物miR159的调控网络以及跨物种调控机制提供参考。
关键词
miR159
MYB家族
跨界调控
生理功能
Keywords
miR159
MYB family
cross-kingdom regulation
physiological functions
分类号
S814.2 [农业科学—畜牧学]
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职称材料
题名
作者
出处
发文年
被引量
操作
1
水牛Novel-miR-57对Bcap-37和BMECs细胞DOK4基因的调控作用
蔡小艳
李雅辉
鲍正潘
陈秋萍
李胜
周宇
邓凯
石德顺
刘庆友
《南方农业学报》
CAS
CSCD
北大核心
2021
2
在线阅读
下载PDF
职称材料
2
植物miR159靶向MYB基因家族的调控作用及其跨界调控哺乳动物生理功能的研究进展
段红娟
孟桂智
刘宝宝
贾晶莹
马燕芬
马云
蔡小艳
《畜牧与饲料科学》
2022
1
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职称材料
已选择
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