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2021年广东省猪流行性腹泻病毒分子监测和部分S基因序列分析 被引量：3
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作者 陈胜男 胡柱祺 +11 位作者 林金森 邵洋洋 钟汝情 张杰 谢莹 焦思思 欧阳慧敏 卢嘉贤 许伟锋 邹育根 张建峰 翟少伦 《中国动物保健》 2022年第9期101-103,共3页
广东省是生猪消费大省,也是养猪大省。猪流行性腹泻病毒引起的猪流行性腹泻严重威胁着生猪健康,尤其是对产床仔猪危害巨大,严重者可引起仔猪100%死亡。本研究对2021年采集的来自广东省主要地市养猪场的379份样品进行监测,样品阳性率13.... 广东省是生猪消费大省,也是养猪大省。猪流行性腹泻病毒引起的猪流行性腹泻严重威胁着生猪健康,尤其是对产床仔猪危害巨大,严重者可引起仔猪100%死亡。本研究对2021年采集的来自广东省主要地市养猪场的379份样品进行监测,样品阳性率13.19%。对获得的8株S基因与参考序列进行比较,发现其与疫苗株(CV777、DR13、AJ1102、LW、ZJ08)同源性较低,而与流行株(SDFQ、SDSJ、SXZJ、JXTQ)同源性较高;遗传进化树分析也显示本研究获得的毒株多与流行毒株在同一分支。综上分析,通过一年的监测表明猪流行性腹泻病毒仍然在猪场流行,并且多以流行毒株为主,揭示今后仍要做好猪流行性腹泻病毒流行毒株的预防和控制。 展开更多
关键词 猪流行性腹泻 猪流行性腹泻病毒 广东省 病毒监测 S基因 野毒株
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不同谱系D型流感病毒HEF蛋白N-糖基化位点和B细胞表位预测分析
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作者 蒋智勇 周霞 +6 位作者 李春玲 楚品品 勾红潮 李艳 卞志标 刘建营 翟少伦 《中国动物保健》 2024年第10期123-128,共6页
D型流感病毒(IDV)是一种近年来新发现的正粘病毒科D型流感病毒属成员,可引起牛、猪、豚鼠等多种动物的呼吸道疾病,具有潜在的人兽共患性。基于HEF基因遗传多样性,IDV可分为5个不同的谱系,分别是D/OK、D/660、D/Yama2016、D/Yama2019和D/... D型流感病毒(IDV)是一种近年来新发现的正粘病毒科D型流感病毒属成员,可引起牛、猪、豚鼠等多种动物的呼吸道疾病,具有潜在的人兽共患性。基于HEF基因遗传多样性,IDV可分为5个不同的谱系,分别是D/OK、D/660、D/Yama2016、D/Yama2019和D/CA2019谱系。不同于甲型、乙型流感病毒,IDV的潜在N-糖基化位点主要集中分布在HEF基因上。为系统了解不同谱系毒株HEF蛋白的N-糖基化位点和B细胞表位,从Gen Bank数据库获得151条全长HEF基因序列,通过使用MEGA-X生物信息学软件构建遗传进化树,并用在线工具进行各毒株N-糖基化位点和线性B细胞表位预测分析。结果表明IDV的HEF蛋白具有6~8个潜在的N-糖基化位点,其中有2个N-糖基化位点(N146和N613)在不同谱系间相同,有6个N-糖基化位点(N28、N54、N249、N346、N390和N513)在不同谱系间存在差异。B细胞表位在不同谱系间有3个保守的表位和8~9个各谱系独特的表位。线性B细胞表位的预测将有助于设计激活体液反应的多表位疫苗,预测结果还需要体外和体内实验证实来证明该应用的可行性。 展开更多
关键词 D型流感病毒 谱系 HEF蛋白 N-糖基化位点 B细胞表位 预测
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