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四川S.suis 2强毒株溶血素样蛋白HLP序列信息分析及克隆表达产物活性检测 被引量:1
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作者 孙雯 郑峰 《成都大学学报(自然科学版)》 2016年第3期209-214,共6页
对四川猪链球菌2型(S.suis 2)强毒株05ZYH33溶血素样蛋白(hemolysin-like protein,HLP)编码基因hlp进行序列信息分析、分子克隆表达及溶血活性检测,深入探讨HLP的致病机制.用Blast和Clustal X程序对HLP进行基因同源性分析,用Signal P 4.... 对四川猪链球菌2型(S.suis 2)强毒株05ZYH33溶血素样蛋白(hemolysin-like protein,HLP)编码基因hlp进行序列信息分析、分子克隆表达及溶血活性检测,深入探讨HLP的致病机制.用Blast和Clustal X程序对HLP进行基因同源性分析,用Signal P 4.1和TMHMM Server 2.0分析HLP氨基酸序列.设计合成hlp引物进行PCR扩增,先后将hlp克隆入p MD-18T载体和p ET30a表达载体中,构建p ET30a::hly原核表达质粒.将重组质粒转化至E.coli BL21中诱导表达,并对重组HLP蛋白进行纯化和溶血活性检测.同源性分析表明HLP与多种具有溶血活性的蛋白相似性较高.氨基酸序列分析发现HLP具有信号肽和跨膜区,且由DUF21、CBS和Cor CHly C 3部分组成.序列测定显示hly片段全长1 335 bp,编码445个氨基酸.重组质粒经诱导表达和纯化后电泳显示,HLP分子量约为70 k Da,具有溶血活性.结果表明,HLP是一个膜结合蛋白,不同于能够分泌到细胞外的溶血素Suilysin.重组HLP具有一定的溶血效价,此可能与致病相关. 展开更多
关键词 猪链球菌2型(S.suis 2) 溶血素样蛋白 同源性分析 分子克隆 溶血活性
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2型猪链球菌RevS基因敲除突变株生物学特征及致病性研究
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作者 孙雯 郑峰 《安徽大学学报(自然科学版)》 CAS 北大核心 2018年第1期86-93,共8页
比较2型猪链球菌(S.suis 2)ΔRevS突变株和05ZY/H33野生株生物学特性及致病性的差异.首先,通过吸光值测定和革兰染色比较△RevS突变株和05ZY/H33野生株的生长速度和菌体形态.分别对Balb/c及ICR(CD1)小鼠腹腔注射109 CFU·mL^(-1)的0... 比较2型猪链球菌(S.suis 2)ΔRevS突变株和05ZY/H33野生株生物学特性及致病性的差异.首先,通过吸光值测定和革兰染色比较△RevS突变株和05ZY/H33野生株的生长速度和菌体形态.分别对Balb/c及ICR(CD1)小鼠腹腔注射109 CFU·mL^(-1)的05ZY/H33菌液,评估两种品系小鼠对S.suis 2的易感性.分别对Balb/c小鼠腹腔注射2.5×10~9,5.0×10~8,1.0×108,2.0×10~7,4.0×10~6 CFU·mL^(-1)的05ZY/H33菌液,采用Reed法计算半数致死量.对Balb/c小鼠腹腔注射5.0×108 CFU·mL^(-1)的ΔRevS突变株和05ZY/H33野生株菌液,观察野生株和突变株对小鼠的影响.对仔猪耳缘静脉注射10~9 CFU·mL^(-1)的05ZY/H33野生株和ΔRevS突变株菌液,观察野生株和突变株对仔猪的影响.体外生物学特征分析表明,与野生株相比,突变株的生长速率和形态染色并未发现显著变化;Balb/c小鼠对S.suis 2 05ZY/H33的敏感性高于ICR(CD1)小鼠,05ZY/H33对Balb/c小鼠的LD50为4.2×10~7 CFU·mL^(-1).Balb/c小鼠攻毒试验结果显示,ΔRevS对小鼠的致病性明显减弱.仔猪攻毒试验结果显示,野生株和突变株都引发仔猪全部死亡,但ΔRevS引发仔猪死亡时间较晚.△RevS突变株保持了菌株的基本生物学特征,但对小鼠和仔猪两种动物模型的致病作用差异较大. 展开更多
关键词 猪链球菌2型(S.suis 2) 二元调控转导系统 生长曲线 动物模型 半数致死量
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基于数据库挖掘分析CKMT1A在非小细胞肺癌化疗耐药性中的作用 被引量:2
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作者 江山 李辉 +2 位作者 邓智霞 钱韬 严慧深 《中国现代应用药学》 CAS CSCD 北大核心 2021年第11期1368-1373,共6页
目的探讨线粒体肌酸激酶1A(creatine kinase mitochondrial 1A,CKMT1A)在非小细胞肺癌(non-small cell lung cancer,NSCLC)化疗耐药性中的作用。方法通过HPA、GEPIA、GEO等数据库或在线分析工具分析CKMT1A在NSCLC及顺铂耐药性NSCLC细胞... 目的探讨线粒体肌酸激酶1A(creatine kinase mitochondrial 1A,CKMT1A)在非小细胞肺癌(non-small cell lung cancer,NSCLC)化疗耐药性中的作用。方法通过HPA、GEPIA、GEO等数据库或在线分析工具分析CKMT1A在NSCLC及顺铂耐药性NSCLC细胞系的表达,运用非配对t检验分析组间差异;通过STRING结合DAVID 6.8分析CKMT1A互作基因的通路富集,运用Fisher Exact Test计算富集P值;microRNA.org结合Targetscan进行miRNA-mRNA互作分析进一步证明CKMT1A在NSCLC化疗耐药性中的作用;运用COREMINE工具进行文本挖掘分析显著富集的通路与NSCLC化疗耐药性的关系,以及microRNA与NSCLC化疗耐药性的关系;通过Kaplan Meier-plotter运用log-rank检验分析CKMT1A表达量、microRNA表达量与NSCLC患者总生存率(overall survival,OS)的相关性,以及CKMT1A表达量与NSCLC化疗患者OS的相关性。结果CKMT1A在NSCLC患者及顺铂耐药性的NSCLC细胞系中的表达量显著升高(P=0.000),而且与患者的OS显著相关(P<0.05);代谢途径,尤其是精氨酸和脯氨酸代谢途径在CKMT1A互作基因中具有显著性富集(P<0.05),而且与NSCLC化疗耐药性密切相关;hsa-miR-103和hsa-miR-107靶向于CKMT1A,而且与NSCLC患者OS和化疗耐药性相关。结论高表达CKMT1A影响NSCLC的预后及化疗耐药性,而且有可能通过精氨酸和脯氨酸代谢途径或者microRNA转录后调控介导NSCLC化疗耐药性。 展开更多
关键词 线粒体肌酸激酶1A 非小细胞肺癌 化疗耐药性 数据挖掘
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猪链球菌2型强毒株sly基因敲除株构建及生物学特征分析
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作者 孙雯 郑峰 《生物技术》 CAS 北大核心 2017年第1期45-52,共8页
[目的]构建猪链球菌2型05ZYH33溶血素sly基因敲除突变株,比较突变株与野生株生物学特征。[方法]分别克隆sly上游序列L、下游序列R和壮观霉素抗性基因spcr,构建基因敲除质粒p UC18-LSR,并电转化入05ZYH33感受态细菌。用多重PCR、RT-PCR及... [目的]构建猪链球菌2型05ZYH33溶血素sly基因敲除突变株,比较突变株与野生株生物学特征。[方法]分别克隆sly上游序列L、下游序列R和壮观霉素抗性基因spcr,构建基因敲除质粒p UC18-LSR,并电转化入05ZYH33感受态细菌。用多重PCR、RT-PCR及Southern杂交对sly基因敲除突变株进行鉴定。比较突变株与野生株的生长速率和溶血现象。[结果]多重PCR和RT-PCR分别显示,野生株DNA和c DNA都能扩增出579 bp的sly内部片段,而突变株DNA和c DNA都未能扩增出此片段。Southern杂交显示,突变株中未见sly探针杂交条带。突变株生长速率较野毒株迟缓,溶血能力减弱,但依然存在。[结论]建立了高效稳定的电转化方法,成功构建出溶血能力减弱的双交换同源重组sly基因敲除突变株。 展开更多
关键词 猪链球菌2型 溶血素 基因敲除 突变株 野生株 生长曲线 溶血
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