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基于网络药理学探讨三子养亲汤治疗非小细胞肺癌的作用机制
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作者 戴伟民 孙燕旭 +2 位作者 汪鸣霄 李若尘 周洵 《贵州科学》 2025年第1期11-16,共6页
目的:基于网络药理学探讨三子养亲汤治疗非小细胞肺癌的作用机制。方法:运用中药系统药理数据库与分析平台(TCMSP)收集三子养亲汤的主要化学成分,根据药物口服利用度和类药性筛选药物活性成分,并获取对应靶点;从Drugbank、GeneCards和O... 目的:基于网络药理学探讨三子养亲汤治疗非小细胞肺癌的作用机制。方法:运用中药系统药理数据库与分析平台(TCMSP)收集三子养亲汤的主要化学成分,根据药物口服利用度和类药性筛选药物活性成分,并获取对应靶点;从Drugbank、GeneCards和OMIM数据库获取非小细胞肺癌(NSCLC)的相关靶点,并去除重复值,使用STRING数据库进行蛋白质相互作用分析,构建PPI网络;利用Cytoscape3.7.1构建“三子养亲汤-非小细胞肺癌靶点-通路”网络。并利用Cytoscape3.7.1软件筛选出排名靠前的核心靶点;使用微生信平台对三子养亲汤与NSCLC共同靶点进行基因本体(GO)功能及京都基因和基因组(KEGG)信号通路富集分析。结果:获得106个三子养亲汤药物靶点,4083个非重复的非小细胞肺癌疾病靶点,两者取交集,共获得84个交集靶点。通过Cytoscape3.7.1获取排名前5的核心药物靶点,分别为木犀草素、β-谷甾醇、β-胡萝卜素、(+)-儿茶素、青风藤碱,通过STRING数据库分析确立TP53、ESR1、CASP3、AKT1、TNF为关键的靶点。结论:三子养亲汤通过多靶点、多途径发挥治疗非小细胞肺癌的作用。 展开更多
关键词 三子养亲汤 网络药理学 非小细胞肺癌 全国名老中医
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基于网络药理学及分子对接探讨二至丸对非小细胞肺癌的作用机制
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作者 李若尘 田津 +1 位作者 汪鸣霄 周洵 《贵州科学》 2024年第1期33-39,共7页
目的:基于网络药理学及分子对接探讨二至丸对非小细胞肺癌的作用机制,为新型抗癌中医药物的研发提供科学依据。方法:通过中药系统药理数据库和分析平台(TCMSP)收集墨旱莲、女贞子的主要化学成分,根据药物分布、吸收、代谢、排泄(ADME)... 目的:基于网络药理学及分子对接探讨二至丸对非小细胞肺癌的作用机制,为新型抗癌中医药物的研发提供科学依据。方法:通过中药系统药理数据库和分析平台(TCMSP)收集墨旱莲、女贞子的主要化学成分,根据药物分布、吸收、代谢、排泄(ADME)筛选药物活性成分,并获取对应靶点;通过Drugbank、Genecards、OMIM数据库获得非小细胞肺癌(non-small cell lung cancer,NSCLC)的重要靶点并去除重复值,利用String数据库进行蛋白质相互作用分析,构建PPI网络;使用Cytoscape3.7.1构建“二至丸成分-非小细胞肺癌靶点”网络,最后通过进行分子对接验证。并利用Cytoscape3.7.1软件筛选出排名靠前的核心靶点;使用R语言对PPI中的靶点进行基因本体(GO)功能及京都基因和基因组(KEGG)信号通路富集分析。结果:二至丸检索获得21个活性成分,去重之后获得205个药物靶点,NSCLC检索取得1935个疾病靶点,两者取交集,共获得132个共同交集靶点。PPI分析得到TP53、AKT1、MAPK1、RELA为核心的基因靶点,经过分子对接,发现二至丸中的槲皮素、木犀草素、山奈酚、β-谷甾醇、金合欢素与TP53、AKT1、MAPK1、RELA靶点结合良好,匹配度高。结论:二至丸可能是通过AGE-RAGE通路、IL-17信号通路、TNF信号通路参与调节非小细胞肺癌。 展开更多
关键词 二至丸 非小细胞肺癌 网络药理学 靶点预测
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基于网络药理学探讨补体抗痨散治疗肺结核的作用机制
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作者 汪鸣霄 李若尘 周洵 《贵州科学》 2024年第2期41-45,共5页
目的:基于网络药理学探讨补体抗痨散对肺结核的作用机制。方法:通过中药系统药理数据库和分析平台(TCMSP)收集补体抗痨散的主要化学成分,根据药物分布、吸收、代谢、排泄(ADME)筛选出口服利用度筛选药物活性成分,并获取对应靶点;通过Dru... 目的:基于网络药理学探讨补体抗痨散对肺结核的作用机制。方法:通过中药系统药理数据库和分析平台(TCMSP)收集补体抗痨散的主要化学成分,根据药物分布、吸收、代谢、排泄(ADME)筛选出口服利用度筛选药物活性成分,并获取对应靶点;通过Drugbank、Genecards、OMIM数据库获得肺结核(pulmonary tuberculosis PTB)的重要靶点并去除重复值,利用String数据库进行蛋白质相互作用分析,构建PPI网络;使用Cytoscape3.7.1构建“补体抗痨散-肺结核靶点-通路”网络。并利用Cytoscape3.7.1软件筛选出排名靠前的核心靶点;使用微生信数据库对PPI中的靶点进行基因本体(GO)功能及京都基因和基因组(KEGG)信号通路富集分析。结果:筛选出补体抗痨散232个药物靶点,肺结核1452个非重复疾病靶点,两者取交集,共获得110个共同交集靶点。Cytoscape3.7.1筛选出排名前五的核心靶点:槲皮素、山奈酚、木犀草素、异鼠李素、常春藤皂苷元,PPI分析得到的RELA、TP53、TNF、AKT1、IL-6为核心的基因靶点。结论:补体抗痨散通过多靶点、多途径发挥其治疗肺结核的作用。 展开更多
关键词 补体抗痨散 网络药理学 肺结核
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基于网络药理学探讨加减消瘰丸治疗肺结节病的作用机制
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作者 李丹 汪鸣霄 周洵 《贵州科学》 2024年第6期27-32,共6页
目的:基于网络药理学探讨加减消瘰丸治疗肺结节病的作用机制。方法:通过中药系统药理数据库和分析平台(TCMSP)获取加减消瘰丸的主要化学成分及对应靶点,并使用UniProt数据库进行靶点与基因名称的转换;在OMIM、GeneCards数据库中检索肺... 目的:基于网络药理学探讨加减消瘰丸治疗肺结节病的作用机制。方法:通过中药系统药理数据库和分析平台(TCMSP)获取加减消瘰丸的主要化学成分及对应靶点,并使用UniProt数据库进行靶点与基因名称的转换;在OMIM、GeneCards数据库中检索肺结节病的疾病靶点并去重;通过Venny2.1.0在线工具进行映射取交集靶点;利用Cytoscape(v3.9.1)软件绘制“药物-化学成分-靶点”网络图,筛选发挥治疗作用的关键成分;利用STRING平台进行“加减消瘰丸-肺结节病”交集靶点互作分析,构建PPI网络,并使用Cytoscape(v3.9.1)对PPI网络处理,经分析得到加减消瘰丸作用于肺结节病的关键靶点;通过微生信平台对交集靶点进行GO和KEGG富集分析获知其潜在作用机制。结果:经筛选得到加减消瘰丸作用于肺结节病的有效成分42个和对应靶点225个,获得肺结节病的治疗靶点1530个,经靶点映射后得到加减消瘰丸治疗肺结节病的潜在靶点116个,关键成分有槲皮素、β-谷甾醇、山柰酚、柚皮素、豆甾醇、异鼠李素,关键靶点有TP53、AKT1、RELA、MAPK3、MAPK1、TNF、IL6等,关键通路包括TNF信号通路、IL-17信号通路、脂质与动脉粥样硬化通路等。结论:加减消瘰丸通过多成分、多靶点、多途径发挥治疗肺结节病的作用。 展开更多
关键词 加减消瘰丸 肺结节病 网络药理学
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