未知功能域(DUF,domain of unknown function)是一种未被表征功能的蛋白质结构域,DUFs基因在植物的生长、发育、繁殖和物质代谢进程中发挥着至关重要的作用。在拟南芥中有9个DUF620同源基因(BDR1~BDR9),该研究利用生物信息学、人工加速...未知功能域(DUF,domain of unknown function)是一种未被表征功能的蛋白质结构域,DUFs基因在植物的生长、发育、繁殖和物质代谢进程中发挥着至关重要的作用。在拟南芥中有9个DUF620同源基因(BDR1~BDR9),该研究利用生物信息学、人工加速老化、亚细胞定位及酵母双杂交等技术对拟南芥BDR6基因进行了功能分析与研究。结果显示:拟南芥9个BDR蛋白的基序分布十分相近,具有相似的结构域;系统进化分析发现BDR6与杨树基因Potri.010G195200和Potri.008G062500亲缘关系较近,与BDR1处于同一大类分支;氨基酸结构预测发现BDR6由α-螺旋、延伸链和不规则卷曲组成,是不稳定的非跨膜的具有内在无序区域的亲水蛋白,定位于细胞质和细胞核中,在拟南芥种子发育的中后期显著表达;BDR6基因不具有转录因子结构域,启动子序列上具有特异的光响应元件G-box等多种顺式作用元件。人工加速老化结果显示,bdr6突变体种子发芽率显著高于野生型,说明BDR6负调控种子寿命。种子GUS染色和亚细胞定位结果均与生信预测结果一致。利用酵母双杂交技术筛选到5个与BDR6互作的蛋白,并进行一对一验证,结果发现EML3与BDR6蛋白有较强的互作。以上结果为研究BDR6基因的功能及其在拟南芥种子寿命中的调控作用提供了重要的理论基础。展开更多
文摘未知功能域(DUF,domain of unknown function)是一种未被表征功能的蛋白质结构域,DUFs基因在植物的生长、发育、繁殖和物质代谢进程中发挥着至关重要的作用。在拟南芥中有9个DUF620同源基因(BDR1~BDR9),该研究利用生物信息学、人工加速老化、亚细胞定位及酵母双杂交等技术对拟南芥BDR6基因进行了功能分析与研究。结果显示:拟南芥9个BDR蛋白的基序分布十分相近,具有相似的结构域;系统进化分析发现BDR6与杨树基因Potri.010G195200和Potri.008G062500亲缘关系较近,与BDR1处于同一大类分支;氨基酸结构预测发现BDR6由α-螺旋、延伸链和不规则卷曲组成,是不稳定的非跨膜的具有内在无序区域的亲水蛋白,定位于细胞质和细胞核中,在拟南芥种子发育的中后期显著表达;BDR6基因不具有转录因子结构域,启动子序列上具有特异的光响应元件G-box等多种顺式作用元件。人工加速老化结果显示,bdr6突变体种子发芽率显著高于野生型,说明BDR6负调控种子寿命。种子GUS染色和亚细胞定位结果均与生信预测结果一致。利用酵母双杂交技术筛选到5个与BDR6互作的蛋白,并进行一对一验证,结果发现EML3与BDR6蛋白有较强的互作。以上结果为研究BDR6基因的功能及其在拟南芥种子寿命中的调控作用提供了重要的理论基础。
