探讨IL-1β对胶质瘤患者预后的影响及潜在机制。方法:从TCGA数据库下载胶质瘤患者的临床资料数据集以及基因表达数据集,筛选出患者共625例,按照IL-1β表达的水平高低进行排序,将IL-1β表达水平排在前50%的312名患者设为高表达组,剩余31...探讨IL-1β对胶质瘤患者预后的影响及潜在机制。方法:从TCGA数据库下载胶质瘤患者的临床资料数据集以及基因表达数据集,筛选出患者共625例,按照IL-1β表达的水平高低进行排序,将IL-1β表达水平排在前50%的312名患者设为高表达组,剩余313名患者设置为低表达组。比较两组患者平均生存时间。将625患者的每一种RNA的相对表达水平逐一与IL-1β相对表达水平做相关性分析,选取与IL-1β呈相关性,且相关系数绝对值最高的100个基因,进行后续富集分析。结果:IL-1β低表达组患者中位生存时间长于高表达组,差异有统计学意义(2235d vs. 1209d,P<0.05); KEGG富集分析可见与IL-1β相关的基因,主要富集的信号通路为对脂多糖的反应、对生物刺激的反应、白细胞趋化性;GO富集分析可见相关基因主要富集的生物学过程包括为对刺激的反应,主要富集的细胞组分为膜系统;主要富集的分子功能为蛋白质结合。结论:IL-1β低表达与胶质瘤患者较长的生存时间有关。展开更多
文摘探讨IL-1β对胶质瘤患者预后的影响及潜在机制。方法:从TCGA数据库下载胶质瘤患者的临床资料数据集以及基因表达数据集,筛选出患者共625例,按照IL-1β表达的水平高低进行排序,将IL-1β表达水平排在前50%的312名患者设为高表达组,剩余313名患者设置为低表达组。比较两组患者平均生存时间。将625患者的每一种RNA的相对表达水平逐一与IL-1β相对表达水平做相关性分析,选取与IL-1β呈相关性,且相关系数绝对值最高的100个基因,进行后续富集分析。结果:IL-1β低表达组患者中位生存时间长于高表达组,差异有统计学意义(2235d vs. 1209d,P<0.05); KEGG富集分析可见与IL-1β相关的基因,主要富集的信号通路为对脂多糖的反应、对生物刺激的反应、白细胞趋化性;GO富集分析可见相关基因主要富集的生物学过程包括为对刺激的反应,主要富集的细胞组分为膜系统;主要富集的分子功能为蛋白质结合。结论:IL-1β低表达与胶质瘤患者较长的生存时间有关。
