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基于m5C修饰相关基因的肺腺癌预后模型的建立与验证
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作者 杨帆 王浓燕 +3 位作者 方蒙 章莹姣 胡海燕 方鹏 《肿瘤防治研究》 2025年第3期208-216,共9页
目的基于m5C修饰相关基因构建并验证肺腺癌(LUAD)预后模型,并探讨其临床应用价值。方法基于TCGA和GSE30219、GSE31210、GSE50081等LUAD数据集资料,通过单因素Cox、Lasso、多因素Cox回归分析筛选预后相关基因并构建模型,通过绘制Kaplan-M... 目的基于m5C修饰相关基因构建并验证肺腺癌(LUAD)预后模型,并探讨其临床应用价值。方法基于TCGA和GSE30219、GSE31210、GSE50081等LUAD数据集资料,通过单因素Cox、Lasso、多因素Cox回归分析筛选预后相关基因并构建模型,通过绘制Kaplan-Meier曲线、ROC曲线及Cox回归观察模型的稳健性和预后性能,并探讨模型与临床病理特征的相关性。结果构建了由CDK1、CDKN1A、NOP2、RRM2、TCL6、TLR8、TRDMT1、YTHDF2等8个m5C修饰相关基因组成的预后模型。风险评分是LUAD患者预后的独立危险因素,其联合T分期和N分期的列线图能更准确地预测患者的预后。高风险组患者中巨噬细胞、CD4^(+)/CD8^(+)T细胞等浸润显著减少。LUAD组织中风险评分显著高于正常组织,且与T分期、N分期正相关。吸烟、EGFR野生型患者的风险评分显著升高。结论基于m5C修饰相关基因构建的预后模型,对预测LUAD患者的预后评估具有较好的准确性和稳定性,且与患者的临床特征、驱动基因突变、免疫浸润等密切相关,可为LUAD的治疗与预后评估提供潜在依据。 展开更多
关键词 肺腺癌 甲基化修饰 m5C 预后模型 风险评分 列线图
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基于机器学习的肺腺癌细胞焦亡预后模型构建与验证
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作者 陈少明 胡艳 +2 位作者 洪旭东 郑伟 胡旭钢 《中华全科医学》 2025年第1期21-25,共5页
目的基于细胞焦亡相关基因(PRGs),构建肺腺癌预后模型,并评估其与免疫调节的关联。方法从TCGA数据库中获取肺腺癌基因表达和临床数据,通过DESeq2法获得差异表达PRGs;将患者分层抽样后按7∶3的比例划分为训练集和验证集,通过Cox回归和La... 目的基于细胞焦亡相关基因(PRGs),构建肺腺癌预后模型,并评估其与免疫调节的关联。方法从TCGA数据库中获取肺腺癌基因表达和临床数据,通过DESeq2法获得差异表达PRGs;将患者分层抽样后按7∶3的比例划分为训练集和验证集,通过Cox回归和Lasso回归筛选目标因子并构建预后模型;在训练集、验证集和3个测试集(GSE30219、GSE31210和GSE50081)中通过生存分析、ROC曲线、Cox回归分析等评估预后模型的预测能力;绘制列线图观察预后模型联合临床特征在预后评估中的作用;分析预后模型与免疫细胞浸润的相关性。结果本研究构建了由CPA3、FAT1、MST1和TFAP2A等4个PRGs组成的肺腺癌预后模型。根据预后模型计算患者的风险评分,以中位值为界将患者分为高风险组和低风险组。高风险组患者预后较差(P<0.05);预后模型风险评分对肺腺癌患者具有良好的生存预测价值,并可作为独立的不良预后因素;基于预后模型和临床特征建立的列线图可有效预测患者的生存状态。免疫浸润分析表明高风险组患者处于免疫失调状态,CD274、CD276等免疫检查点分子表达显著升高。结论基于CPA3、FAT1、MST1和TFAP2A的预后模型可有效预测肺腺癌患者的预后,并与患者的免疫状态相关,可作为患者治疗及预后评价的指标。 展开更多
关键词 肺腺癌 细胞焦亡 预后模型 列线图 免疫浸润
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