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天然虾青素治疗肾透明细胞癌的作用机制:基于网络药理学与生物信息学方法 被引量：1
1
作者 高俊杰 杨丹丹 +2 位作者 曹若雪 潘雪珊 夏俊 《南方医科大学学报》 CAS CSCD 北大核心 2021年第12期1763-1772,共10页
目的基于网络药理学和生物信息学研究天然虾青素(AST)治疗肾透明细胞癌(KIRC)的分子作用机制。方法利用PharmMapper数据库检索AST的作用靶点,TCGA数据库获得并筛选KIRC癌组织和癌旁组织中的差异基因,Cytoscape软件对靶基因进行分析并构... 目的基于网络药理学和生物信息学研究天然虾青素(AST)治疗肾透明细胞癌(KIRC)的分子作用机制。方法利用PharmMapper数据库检索AST的作用靶点,TCGA数据库获得并筛选KIRC癌组织和癌旁组织中的差异基因,Cytoscape软件对靶基因进行分析并构建“药物-靶点”网络图,String数据库构建可视化PPI网络,对核心作用靶点进行GO富集分析。接着,对筛选出的核心靶点胎盘生长因子(PGF)进行单基因生物信息学分析,采用CCK-8法验证AST对KIRC细胞活性的影响,分子对接技术验证AST与PGF结合情况,RT-qPCR和Westernblot验证AST对靶基因mRNA和蛋白表达的影响。结果分析得到AST作用靶点278个,KIRC相关作用靶点1081个,AST治疗KIRC的核心作用靶点7个,其中核心靶点PGF在KIRC中表达增高(P<0.001)且与预后不良相关(HR=1.37,P=0.043);分子对接显示AST与PGF的结合能为-5.43 kcal/mol;CCK-8显示当AST浓度为50μmol/L时即可以抑制KIRC细胞的增殖且AST浓度越高抑制作用越显著;RT-qPCR结果显示,AST处理KIRC后PGF的mRNA表达水平显著降低;Westernblot结果显示,经AST处理后KIRC中PGF的蛋白表达受到了明显抑制。结论AST可以抑制KIRC的增殖并抑制其细胞中PGF的表达。 展开更多
关键词 网络药理学 生物信息学 天然虾青素 肾透明细胞癌 胎盘生长因子
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长链非编码RNA NBR2在乳腺癌患者血清中的表达水平及临床意义 被引量：1
2
作者 杨靖瑞 高榴 +4 位作者 许颖 金鑫 高宇 金齐力 禹莉 《热带医学杂志》 CAS 2023年第7期890-894,共5页
目的分析血清长链非编码RNA(LncRNA)NBR2的表达在乳腺癌组与健康体检组之间的差异是否具有统计学意义,检测LncRNA NBR2的表达水平对评估罹患乳腺癌风险的价值及其与临床相关指标的分析。方法用实时荧光定量PCR法检测2022年5-12月蚌埠医... 目的分析血清长链非编码RNA(LncRNA)NBR2的表达在乳腺癌组与健康体检组之间的差异是否具有统计学意义,检测LncRNA NBR2的表达水平对评估罹患乳腺癌风险的价值及其与临床相关指标的分析。方法用实时荧光定量PCR法检测2022年5-12月蚌埠医学院第一附属医院收治的31例未予手术和放化疗治疗的乳腺癌患者血清,另选取同期蚌埠医学院第二附属医院31名健康体检者的血清作为对照,分析乳腺癌组与对照组LncRNA NBR2表达的差异,并分析乳腺癌患者血清中LncRNA NBR2的表达水平与年龄、肿块大小、组织学分级、TNM分期、淋巴结转移、雌激素受体(ER)、孕激素受体(PR)、人表皮生长因子受体2(HER-2)及Ki67的差异,采用ROC曲线分析LncRNA NBR2的表达水平对诊断乳腺癌是否具有临床价值。结果乳腺癌组血清LncRNA NBR2的相对表达水平[0.985(0.488,1.004)]明显低于对照组[1.224(1.087,1.847)],差异有统计学意义(U=174,P<0.001)。LncRNA NBR2的表达水平与患者年龄、ER、HER-2、Ki67无关(P>0.05),而与肿块大小、组织学分级、TNM分期、淋巴结远处转移及PR有关(P<0.05)。ROC曲线分析显示,LncRNA NBR2的ROC曲线下面积为0.771(95%CI:0.651~0.891),当最佳cut-off值为0.548时,LncRNA NBR2诊断乳腺癌的灵敏度为74.2%,特异度为80.6%。结论LncRNA NBR2可能是乳腺癌的一个潜在生物标志物,检测其在血清中的表达有助于乳腺癌的早期筛查及患病风险评估。 展开更多
关键词 长链非编码RNA NBR2 乳腺癌 血清
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