柯乐猪OPN基因多态性及其与繁殖性状的关联分析 被引量：1

1

作者 吴燕 罗华伦 +7 位作者 杨红文 杨齐心 王春源 向进 丁义杰 付红梅 赵永 张依裕 《中国畜牧杂志》 CAS CSCD 北大核心 2024年第8期262-269,共8页

本文旨在研究柯乐猪骨调素(Osteopontin,OPN)基因多态性及其与繁殖性状的关系,为该品种的遗传改良和优化繁殖计划提供理论依据。采用PCR产物直接测序法检测200头柯乐猪OPN基因第6外显子的单核苷酸多态性(Single Nucleotide Polymorphism... 本文旨在研究柯乐猪骨调素(Osteopontin,OPN)基因多态性及其与繁殖性状的关系,为该品种的遗传改良和优化繁殖计划提供理论依据。采用PCR产物直接测序法检测200头柯乐猪OPN基因第6外显子的单核苷酸多态性(Single Nucleotide Polymorphism,SNP)位点,通过RNAfold预测OPN基因突变前后的mRNA二级结构,并利用SPSS 26.0软件分析OPN基因SNP位点与柯乐猪繁殖性状的相关性。结果显示,在OPN基因第6外显子中筛查到5个SNPs位点,分别为g.131083657 A>G、g. 131083770 A>G、g.131083791A>C、g.131083805C>T和g.131083806G>C位点,均产生3种基因型,且均为中度多态,其中g.131083657 A>G和g.131083806G>C位点属于错义突变,分别导致丙氨酸突变为络氨酸、缬氨酸突变为丙氨酸。卡方检验结果显示,5个SNPs位点均符合Hardy-Weinberg平衡,且5个SNPs位点两两之间存在强连锁不平衡。5个SNPs联合产生4种单倍型和5种双倍型,突变后单倍型H3(GAACG)的mRNA二级结构稳定性增加,而H4(GGATC)和H1(AAACG)稳定性减弱,突变后单倍型H1、H3在三级结构第109个氨基酸前后和158个氨基酸处有明显变化。关联分析结果表明,各位点与产活仔猪数、断奶仔猪数和断奶窝重呈显著相关,g.131083657 A>G、g.131083770 A>G和g.131083791A>C位点有利基因型均为AA,g.131083805C>T、g.131083806G>C位点有利基因型分别为CC和GG。双倍型H1H1(AAAAAACCGG)个体产活仔猪数和断奶仔猪数优于双倍型H1H2(AGAGACCTCG)及H3H3个体(GGAAAACCGG)(P<0.05),H1H1和H2H3(GGAGACCTCG)断奶平均重显著低于H1H2。本研究揭示OPN基因第6外显子上的5个突变位点与柯乐猪的产活仔猪数、断奶仔猪数和断奶窝重3个繁殖性能指标均存在显著关联,可作为柯乐猪繁殖性状选择的候选分子标记。 展开更多

关键词 柯乐猪 OPN基因 SNP 繁殖性状

在线阅读 下载PDF 职称材料

NCG对山羊性腺轴组织中ITGB8、IGFBP3基因相对表达量的影响

2

作者 张劲松 韦仕南 +2 位作者 骆金红 吴大江 陈祥 《黑龙江畜牧兽医》 CAS 北大核心 2024年第7期43-48,共6页

为了探究妊娠早期饲喂N-氨甲酰谷氨酸(N-Carbamylglutamate,NCG)提高山羊产羔数的繁殖机制,试验采用实时荧光定量PCR方法检测了ITGB8、IGFBP3基因在空白组和NCG组(0.15%NCG)卵巢、子宫、输卵管、垂体、下丘脑等性腺轴组织中的相对表达... 为了探究妊娠早期饲喂N-氨甲酰谷氨酸(N-Carbamylglutamate,NCG)提高山羊产羔数的繁殖机制,试验采用实时荧光定量PCR方法检测了ITGB8、IGFBP3基因在空白组和NCG组(0.15%NCG)卵巢、子宫、输卵管、垂体、下丘脑等性腺轴组织中的相对表达量。结果表明:ITGB8和IGFBP3基因在贵州白山羊5个组织中均有不同程度表达。相同组别不同组织比较,ITGB8基因在空白组的相对表达量为下丘脑>垂体>输卵管>子宫>卵巢,在NCG组的相对表达量为垂体>子宫>下丘脑>输卵管>卵巢;IGFBP3基因在空白组和NCG组中的表达趋势均为子宫>卵巢>输卵管>下丘脑>垂体。相同组织不同组间比较,ITGB8基因在NCG组垂体、卵巢、输卵管、子宫组织中的相对表达量极显著低于空白组(P<0.01),在下丘脑中两组间差异不显著(P>0.05);IGFBP3基因在NCG组垂体、卵巢、输卵管、子宫组织中的相对表达量均极显著低于空白组(P<0.01),在下丘脑中两组间差异不显著(P>0.05)。说明给山羊饲喂NCG能提高ITGB8基因和降低IGFBP3基因的相对表达量,NCG可能通过调控ITGB8和IGFBP3基因的表达影响山羊繁殖性能。 展开更多

关键词 山羊 NCG ITGB8基因 IGFBP3基因 差异表达量

原文传递

山羊腺苷单磷酸脱氨酶1基因启动子区单核苷酸多态性研究 被引量：1

3

作者 王德凤 杨永强 韩勇 《中国畜牧兽医》 CAS 北大核心 2013年第7期127-132,共6页

为筛选腺苷单磷酸脱氨酶1(adenosine monophosphate deaminase 1,AMPD1)基因启动子区单核苷酸多态性(SNP)及研究其对启动子功能元件的影响,试验选择小香羊、黔北麻羊、努比山羊构建不同DNA池,直接测序结合BLAST筛选SNP位点。结果表明,AM... 为筛选腺苷单磷酸脱氨酶1(adenosine monophosphate deaminase 1,AMPD1)基因启动子区单核苷酸多态性(SNP)及研究其对启动子功能元件的影响,试验选择小香羊、黔北麻羊、努比山羊构建不同DNA池,直接测序结合BLAST筛选SNP位点。结果表明,AMPD1基因启动子区存在5个SNPs位点,分别为:T-614A、G-326A、G-309A、T-287C和T-165C。生物信息学软件预测得到AMPD1基因核心启动子区和转录因子结合位点,SNPs位点导致9个转录因子结合位点消失,而产生7个新的转录因子结合位点。AMPD1基因RNA二级结构在突变后显著改变,但未检测到CpG岛区域。 展开更多

关键词 腺苷单磷酸脱氨酶1 单核苷酸多态性 启动子 小香羊 黔北麻羊 努比山羊

在线阅读 下载PDF 职称材料

牛JAK2基因启动子区多态及生物信息学研究

4

作者 龚俞 杨永强 +2 位作者 焦仁刚 惠嫣婷 刘若余 《生物技术通报》 CAS CSCD 北大核心 2013年第6期104-109,共6页

为筛选JAK2基因启动子区SNP及研究其对启动子功能元件的影响,选择品种差异较大的贵州荷斯坦奶牛和务川黑牛构建不同DNA池,直接测序筛选SNP位点。结果表明,JAK2基因5'调控区及第1外显子存在2个SNPs位点,分别为G+5A、G+104A。生物信... 为筛选JAK2基因启动子区SNP及研究其对启动子功能元件的影响,选择品种差异较大的贵州荷斯坦奶牛和务川黑牛构建不同DNA池,直接测序筛选SNP位点。结果表明,JAK2基因5'调控区及第1外显子存在2个SNPs位点,分别为G+5A、G+104A。生物信息学软件预测得到JAK2基因核心启动子区,SNP位点导致9个转录因子结合位点消失,而产生1个新的转录因子结合位点。G+5A对转录因子结合位点、RNA二级结构和CpG岛均有显著影响。 展开更多

关键词 JAK2SNP 启动子 贵州荷斯坦奶牛 务川黑牛

在线阅读 下载PDF 职称材料

威宁黄牛CIS基因外显子区多态性与生长性状的关联性

5

作者 蒋会梅 向程举 +5 位作者 袁军 刘章忠 张贵祥 张义玲 刘若余 杨永强 《贵州农业科学》 CAS 北大核心 2014年第8期139-141,146,共4页

为进一步了解细胞因子诱导SH2蛋白(CIS)基因的遗传变异情况和威宁黄牛选育改良的分子标记奠定基础,选择106头威宁黄牛作为研究对象,利用PCR-SSCP、DNA测序方法分析CIS基因外显子区多态性(SNP)与生长性状的关联性。结果表明:在威宁黄牛... 为进一步了解细胞因子诱导SH2蛋白(CIS)基因的遗传变异情况和威宁黄牛选育改良的分子标记奠定基础,选择106头威宁黄牛作为研究对象,利用PCR-SSCP、DNA测序方法分析CIS基因外显子区多态性(SNP)与生长性状的关联性。结果表明:在威宁黄牛公、母畜CIS基因外显子区A4560G位点表现出AA、AG和GG基因型,该位点均与胸围有显著关联;AG杂合子的基因型频率最高,公、母畜分别为0.529 4和0.436 2;AG基因型个体的胸围均值最高,公、母畜分别为165.69cm和161.77cm。A4560G突变可能是重要的功能突变位点,CIS基因可作为威宁黄牛选种选育的候选基因。 展开更多

关键词 细胞因子诱导SH2蛋白 多态性 外显子 威宁黄牛

在线阅读 下载PDF 职称材料

不同饲草配比对威宁黄牛育肥、胴体和肉质性状的影响 被引量：4

6

作者 吴燕 向进 +1 位作者 王春梅 张依裕 《饲料工业》 CAS 北大核心 2023年第11期54-62,共9页

试验旨在评估不同饲草配比日粮对威宁黄牛育肥、胴体和肉质的影响。选取健康体重相近的(24±1)月龄威宁黄牛84头(公、母牛各半),均分为7组,饲喂不同饲草调配的日粮,T1组(17%巨菌草+18%黑麦草+12%金荞麦+18%青贮玉米)、T2组(25%巨菌... 试验旨在评估不同饲草配比日粮对威宁黄牛育肥、胴体和肉质的影响。选取健康体重相近的(24±1)月龄威宁黄牛84头(公、母牛各半),均分为7组,饲喂不同饲草调配的日粮,T1组(17%巨菌草+18%黑麦草+12%金荞麦+18%青贮玉米)、T2组(25%巨菌草+18%黑麦草+12%金荞麦+10%青贮玉米)、T3组(45%巨菌草+20%黑麦草+12%玉米)、T4组(25%黑麦草+40%金荞麦)、T5组(20%玉米秸秆+45%黑麦草)、T6组(20%干稻草+45%黑麦草)、T7组(30%黑麦草+35%青贮玉米)。预试期15 d,正试期60 d。结果表明:不同饲草配比对威宁黄牛的采食量、平均日增重、净肉率、肌肉氨基酸和脂肪酸组成有显著影响(P<0.05),而对肌肉化学组成和常规肉品质的影响未达显著水平(P>0.05)。T7组育肥性能和胴体性状效果最优,T4组次之,T5组最差。T1组肌肉中鲜味氨基酸含量最高;日粮中含金荞麦的T1、T2、T4组肌肉中抗氧化氨基酸含量均高于其他组,含黑麦草最高的T5组和T6组肌肉中必需氨基酸和支链氨基酸含量均高于其他组;T4组肌肉中芳香族氨基酸含量最高;T7组肌肉中总氨基酸和甜味氨基酸含量最高。T4组肌肉中必需脂肪酸含量最高,T2组次之,T5组最低。说明不同的饲草配比能影响肉牛的育肥和胴体性状,也能影响肌肉中氨基酸和脂肪酸的组成,肉牛养殖者可通过调整饲草配比改善肉牛育肥、胴体和肉质性状。 展开更多

关键词 饲草配比 威宁黄牛 育肥性状 胴体性状 肉质性状

在线阅读 下载PDF 职称材料

不同饲草料配比对安格斯牛生长发育、胴体性状和肉质性状的影响 被引量：4

7

作者 吴燕 邹茂华 +2 位作者 罗清云 王春梅 张依裕 《饲料研究》 CAS 北大核心 2022年第23期1-6,共6页

试验旨在研究不同饲草料配比对安格斯牛生长发育、胴体性状和肉质的影响。选取健康且体重相近的6月龄安格斯牛64头(公、母各半),随机分为4组,每组4重复,每个重复4头牛。各组牛分别饲喂不同饲草配比的全混合日粮。预试期15 d,正式试验期3... 试验旨在研究不同饲草料配比对安格斯牛生长发育、胴体性状和肉质的影响。选取健康且体重相近的6月龄安格斯牛64头(公、母各半),随机分为4组,每组4重复,每个重复4头牛。各组牛分别饲喂不同饲草配比的全混合日粮。预试期15 d,正式试验期360 d。结果显示:12月龄、18月龄试验1组公、母牛体重均显著高于试验3组和对照组(P<0.05),12月龄试验2组公牛体重显著高于试验3组(P<0.05),18月龄试验2组公牛体重显著高于试验3组和对照组。7月龄至12月龄试验1组公、母牛平均日增重均显著高于对照组和试验3组(P<0.05),13月龄至18月龄试验1组母牛平均日增重均显著高于试验3组(P<0.05),7月龄至18月龄试验1组公、母牛平均日增重显著高于试验3组(P<0.05)。试验1组公牛宰前重、胴体重和屠宰率均显著高于对照组和试验3组(P<0.05),试验1组的眼肌面积和背膘厚度显著高于其他组(P<0.05);试验1组和试验2组的肌肉和脂肪颜色显著低于对照组(P<0.05)。研究表明,试验1组的饲草料配比对提高安格斯牛生长发育和改善肉品质较好。 展开更多

关键词 安格斯牛 饲草料配比 生长发育 胴体性状 肉品质

在线阅读 下载PDF 职称材料

长顺绿壳蛋鸡ATP2B2基因多态性及其对蛋壳品质的影响

8

作者 王盈童 杨酸 +2 位作者 谭元成 王春源 张依裕 《中国畜牧杂志》 CAS CSCD 北大核心 2023年第7期137-142,共6页

为了探究钙离子转运ATP酶B2(ATP2B2)基因多态位点对长顺绿壳蛋鸡蛋壳品质的影响,本实验采用PCR产物直接测序和序列比对软件鉴定ATP2B2基因SNP位点,SPSS 22.0软件单因素方差分析检测SNP位点不同基因型蛋壳指标的差异。结果发现,3个SNP位... 为了探究钙离子转运ATP酶B2(ATP2B2)基因多态位点对长顺绿壳蛋鸡蛋壳品质的影响,本实验采用PCR产物直接测序和序列比对软件鉴定ATP2B2基因SNP位点,SPSS 22.0软件单因素方差分析检测SNP位点不同基因型蛋壳指标的差异。结果发现,3个SNP位点位于第4外显子的非编码区(UTR)、第15外显子的蛋白质编码区(CDS)和第25外显子的蛋白质编码区(CDS),分别为g.4030584 A>G、g.4144313 C>T和g.4193196 G>A,共存在6种单倍型和10种双倍型。卡方(χ^(2))检验结果表明:3个SNP位点所产生的基因型分布符合Hardy-Weinberg平衡(P>0.05)。关联性分析研究的结果显示:g.4030584 A>G、g.4144313 C>T突变位点显著影响个体蛋壳强度;3个SNP位点联合产生的双倍型H2H4个体的蛋壳厚度显著高于H1H1、H1H2;H1H1个体的蛋壳强度显著高于H2H3、H2H5、H2H6。综上结果表明,g.4030584 A>G、g.4144313 C>T突变可能是影响蛋壳强度的标记位点,双倍型H2H4可能是影响蛋壳厚度的有利双倍型,H1H1可能是影响蛋壳强度的有利双倍型。 展开更多

关键词 ATP2B2基因 SNP位点 长顺绿壳蛋鸡 蛋壳品质 关联性分析

在线阅读 下载PDF 职称材料

基于RNA-Seq对柯乐猪正常和异常乳腺差异基因的挖掘研究

9

作者 王春源 向进 +3 位作者 吴燕 谭元成 杨酸 张依裕 《中国畜牧杂志》 CAS CSCD 北大核心 2023年第12期166-175,共10页

本研究旨在获取母猪异常和正常乳腺组织的差异表达基因。选择乳腺发育正常和异常的经产柯乐猪各3头,利用RNA-seq对正常和异常乳腺组织的差异基因进行筛选和生物信息学分析,结果显示:正常与异常乳腺相比较共筛选出1847个差异基因,其中上... 本研究旨在获取母猪异常和正常乳腺组织的差异表达基因。选择乳腺发育正常和异常的经产柯乐猪各3头,利用RNA-seq对正常和异常乳腺组织的差异基因进行筛选和生物信息学分析,结果显示:正常与异常乳腺相比较共筛选出1847个差异基因,其中上调基因767个,下调基因1080个;GO富集分析显示,生物学过程(Biological Process)差异表达基因主要富集在细胞过程(Cellular Process)和生物调节(Biological Regulation),细胞组分(CellularComponent)差异表达基因主要富集在细胞(Cell)、细胞部分(Cell Part)和膜(Membrane),分子功能(MolecularFunction)差异基因主要集中在粘合剂(Binding)和催化活性(Catalytic Activity)方面;KEGG富集分析显示,差异表达基因主要富集在神经活性配体-受体相互作用通路,其次为细胞因子与细胞因子受体的相互作用以及PI3K-Akt信号通路;上调的差异表达基因主要富集在细胞因子与细胞因子受体的相互作用,其次为神经活性配体-受体相互作用通路;下调的差异表达基因主要富集在人乳头瘤病毒感染和神经活性配体-受体相互作用信号通路,其次为PI3K-Akt信号通路和细胞周期等通路。在可变剪接分析中,正常发育乳腺组织的所有可变剪接事件多于发育不良的,A3SS和RI差异可变剪接事件都是上调,而SE、A5SS和MXE差异可变剪接事件中大部分下调。本研究通过对差异基因及其信号通路的功能注释分析,发现乳腺发育显著相关的193个差异基因,主要富集在细胞周期、Th1和Th2细胞的分化、PI3K-Akt信号通路和焦点粘连等信号通路,绘制了193个差异基因的网络互作图,筛选出关联度前10位的差异基因为CDC6、F2、E2F1、DRD2、KNG1、GHRL、LEP、IFNG、FN1、PPARG,且关联度最高的CDC6可调节多个信号通路。研究结果为进一步阐述哺乳动物乳腺发育的调控机制提供了一定的科学依据。 展开更多

关键词 柯乐猪 RNA-seq技术 乳腺发育 差异基因

在线阅读 下载PDF 职称材料

利用DNA池技术研究猪GH基因启动子序列的多态性 被引量：4

10

作者 宋桃伟 李敬瑞 +2 位作者 刘若余 陈云华 吴仲超 《生物技术》 CAS CSCD 北大核心 2011年第6期43-46,共4页

目的:分析猪GH基因启动子区序列的多态性,期望筛选出对猪生长性状有显著影响的SNP位点,为地方猪种的选育及选种提供一定的理论依据。方法:以大约克、可乐猪、香猪和黔北黑猪为试验对象,构建品种DNA池,采用PCR产物直接测序法对猪GH基因... 目的:分析猪GH基因启动子区序列的多态性,期望筛选出对猪生长性状有显著影响的SNP位点,为地方猪种的选育及选种提供一定的理论依据。方法:以大约克、可乐猪、香猪和黔北黑猪为试验对象,构建品种DNA池,采用PCR产物直接测序法对猪GH基因启动子区-856～+171片段共1 027bp进行单核苷酸多态性检测。结果:除香猪外,在其他3个猪种5`-端侧翼序列发现5个SNP位点:C22T、A-26T、G-219A、T-385A和C-391T,并且在大约克GH基因启动子区-640处发现了一个12bp碱基序列(GGCAAAGTGTAG)的缺失。结论:DNA池结合PCR产物直接测序技术能够很好的筛选SNP位点,本研究采用该技术在猪GH基因启动子区-856～+171片段检测到了5个SNP位点。 展开更多

关键词 DNA池 猪 GH基因 启动子区

原文传递

超表达SRD5A2基因对山羊卵巢颗粒细胞增殖和产羔相关基因表达的影响 被引量：1

11

作者 洪磊 陈祥 +1 位作者 唐文 周志楠 《中国兽医学报》 CAS CSCD 北大核心 2021年第8期1620-1626,1633,共8页

旨在探究类固醇5α还原酶2(SRD5A2)基因对卵巢颗粒细胞增殖和山羊产羔性状相关基因表达的影响。选取健康黔北麻羊母羊6只,采集卵巢组织进行卵巢颗粒细胞培养及提取组织中的总RNA反转录为cDNA,克隆黔北麻羊SRD5A2基因CDS区全长序列,进一... 旨在探究类固醇5α还原酶2(SRD5A2)基因对卵巢颗粒细胞增殖和山羊产羔性状相关基因表达的影响。选取健康黔北麻羊母羊6只,采集卵巢组织进行卵巢颗粒细胞培养及提取组织中的总RNA反转录为cDNA,克隆黔北麻羊SRD5A2基因CDS区全长序列,进一步构建SRD5A2基因真核表达载体,转染至卵巢颗粒细胞。采用免疫荧光法鉴定培养细胞为卵巢颗粒细胞,CCK-8法检测细胞增殖情况,RT-qPCR检测SRD5A2、BMP15、GDF9、BMPR-1B和FSHB的mRNA表达水平。CCK-8结果发现,超表达SRD5A2基因在6,12,24 h显著促进细胞增殖(P<0.05),48 h达到极显著促进作用(P<0.01);RT-qPCR结果显示,转染试验组SRD5A2基因mRNA表达水平极显著高于空白组(P<0.01),产羔性状相关GDF9基因mRNA表达水平显著高于空白对照组(P<0.05),BMPR-1B、BMP15、FSHB基因mRNA表达水平极显著高于空白对照组(P<0.01)。推测超表达SRD5A2基因可促进产羔相关基因BMPR-1B、BMP15、GDF9、FSHB在卵巢颗粒细胞表达。本研究成功克隆黔北麻羊SRD5A2基因编码区,构建pEGFP-N3-SRD5A2真核表达载体,并成功在卵巢颗粒细胞中表达,检测SRD5A2基因对黔北麻羊卵巢颗粒细胞增殖及产羔性状相关基因表达的影响,为进一步研究SRD5A2基因对黔北麻羊产羔性状影响提供基础。 展开更多

关键词 黔北麻羊 SRD5A2 卵巢颗粒细胞 细胞增殖 产羔性状

原文传递